MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 98693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020891	GCG	2	6	47293	47298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832103
1502	NC_020891	CCG	2	6	47302	47307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832103
1503	NC_020891	TTC	2	6	47353	47358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832103
1504	NC_020891	CTC	2	6	47489	47494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_020891	CGA	2	6	47533	47538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020891	CGC	2	6	47596	47601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_020891	CG	3	6	47653	47658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_020891	GCA	2	6	47666	47671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_020891	GC	3	6	47677	47682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_020891	GCT	2	6	47712	47717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_020891	CTC	2	6	47723	47728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_020891	GTC	2	6	47800	47805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1513	NC_020891	GC	3	6	47823	47828	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1514	NC_020891	CGAG	2	8	47832	47839	25 %	0 %	50 %	25 %	473832104
1515	NC_020891	CCG	2	6	47847	47852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1516	NC_020891	GCGG	2	8	47859	47866	0 %	0 %	75 %	25 %	473832104
1517	NC_020891	CGG	2	6	47870	47875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1518	NC_020891	CGG	2	6	47895	47900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1519	NC_020891	CTC	2	6	47923	47928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832104
1520	NC_020891	CGA	2	6	47989	47994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1521	NC_020891	CGA	2	6	48075	48080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1522	NC_020891	CGAG	2	8	48087	48094	25 %	0 %	50 %	25 %	473832104
1523	NC_020891	CGT	3	9	48099	48107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1524	NC_020891	ACG	2	6	48116	48121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1525	NC_020891	GCG	2	6	48149	48154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1526	NC_020891	GCC	2	6	48173	48178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1527	NC_020891	CCG	2	6	48186	48191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1528	NC_020891	CGT	2	6	48198	48203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1529	NC_020891	GCCGC	2	10	48232	48241	0 %	0 %	40 %	60 %	473832104
1530	NC_020891	ACGA	2	8	48242	48249	50 %	0 %	25 %	25 %	473832104
1531	NC_020891	GGT	2	6	48265	48270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832104
1532	NC_020891	GTG	2	6	48379	48384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832104
1533	NC_020891	AGC	2	6	48401	48406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1534	NC_020891	CTCG	2	8	48409	48416	0 %	25 %	25 %	50 %	473832104
1535	NC_020891	TCG	2	6	48449	48454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1536	NC_020891	TGG	2	6	48474	48479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832104
1537	NC_020891	TCG	2	6	48497	48502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1538	NC_020891	GC	3	6	48504	48509	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1539	NC_020891	CGG	2	6	48531	48536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1540	NC_020891	GC	3	6	48549	48554	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1541	NC_020891	CGG	2	6	48600	48605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1542	NC_020891	CGG	2	6	48627	48632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1543	NC_020891	CGA	2	6	48636	48641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1544	NC_020891	GGA	2	6	48669	48674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832104
1545	NC_020891	CGA	2	6	48702	48707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1546	NC_020891	GCG	2	6	48719	48724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1547	NC_020891	TCC	2	6	48728	48733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832104
1548	NC_020891	CTC	2	6	48739	48744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832104
1549	NC_020891	GGT	2	6	48756	48761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832104
1550	NC_020891	GC	3	6	48792	48797	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1551	NC_020891	GGC	2	6	48855	48860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1552	NC_020891	GCGTCG	2	12	48866	48877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	473832104
1553	NC_020891	ACG	2	6	48890	48895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1554	NC_020891	GCC	2	6	48907	48912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1555	NC_020891	CCGG	2	8	48999	49006	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1556	NC_020891	GCC	2	6	49039	49044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1557	NC_020891	GCGCCG	2	12	49088	49099	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1558	NC_020891	GTC	2	6	49123	49128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1559	NC_020891	CGG	2	6	49158	49163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1560	NC_020891	GGTCG	2	10	49174	49183	0 %	20 %	60 %	20 %	473832104
1561	NC_020891	CCG	2	6	49262	49267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1562	NC_020891	CGG	3	9	49287	49295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1563	NC_020891	GAG	2	6	49318	49323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832104
1564	NC_020891	GCG	2	6	49331	49336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1565	NC_020891	CAC	2	6	49339	49344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832104
1566	NC_020891	TCG	2	6	49361	49366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1567	NC_020891	GC	3	6	49370	49375	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1568	NC_020891	GCG	2	6	49385	49390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1569	NC_020891	CTG	2	6	49405	49410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1570	NC_020891	CTC	2	6	49411	49416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832104
1571	NC_020891	GCG	2	6	49433	49438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1572	NC_020891	CGT	2	6	49503	49508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1573	NC_020891	CGA	2	6	49530	49535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
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1575	NC_020891	GCG	2	6	49595	49600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
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1582	NC_020891	CCGGT	2	10	49826	49835	0 %	20 %	40 %	40 %	473832104
1583	NC_020891	TCG	2	6	49847	49852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1584	NC_020891	CGG	2	6	49860	49865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
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1590	NC_020891	CGA	2	6	49974	49979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
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1592	NC_020891	CGT	2	6	50016	50021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
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1595	NC_020891	CCGC	2	8	50143	50150	0 %	0 %	25 %	75 %	473832104
1596	NC_020891	CG	3	6	50155	50160	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1597	NC_020891	GGTC	2	8	50169	50176	0 %	25 %	50 %	25 %	473832104
1598	NC_020891	CCG	2	6	50181	50186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1599	NC_020891	CG	3	6	50185	50190	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1600	NC_020891	GCC	2	6	50209	50214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1601	NC_020891	GGC	2	6	50215	50220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1602	NC_020891	GCC	2	6	50223	50228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1603	NC_020891	GCT	2	6	50229	50234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1604	NC_020891	CCT	2	6	50247	50252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832104
1605	NC_020891	CG	3	6	50271	50276	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1606	NC_020891	TCGG	2	8	50291	50298	0 %	25 %	50 %	25 %	473832104
1607	NC_020891	GTC	2	6	50314	50319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1608	NC_020891	GGTC	2	8	50334	50341	0 %	25 %	50 %	25 %	473832104
1609	NC_020891	GCC	2	6	50362	50367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832104
1610	NC_020891	GAG	2	6	50390	50395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832104
1611	NC_020891	CGA	2	6	50433	50438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1612	NC_020891	CGG	2	6	50451	50456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
1613	NC_020891	TGC	2	6	50529	50534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
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1615	NC_020891	CGA	2	6	50619	50624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
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1620	NC_020891	CGA	2	6	50763	50768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832104
1621	NC_020891	GC	3	6	50790	50795	0 %	0 %	50 %	50 %	473832104
1622	NC_020891	CGCGGT	2	12	50860	50871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	473832104
1623	NC_020891	CGG	2	6	50895	50900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832104
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1625	NC_020891	TGC	2	6	51014	51019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832104
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1996	NC_020891	CGA	2	6	62281	62286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1997	NC_020891	CCGTC	2	10	62303	62312	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1998	NC_020891	GTGC	3	12	62313	62324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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