MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 98693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_020891	TCG	2	6	32121	32126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1003	NC_020891	CGT	3	9	32194	32202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1004	NC_020891	CGC	2	6	32205	32210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832089
1005	NC_020891	CGCC	2	8	32253	32260	0 %	0 %	25 %	75 %	473832089
1006	NC_020891	GCC	2	6	32263	32268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832089
1007	NC_020891	CG	4	8	32269	32276	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1008	NC_020891	GAG	2	6	32309	32314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
1009	NC_020891	GGA	2	6	32329	32334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
1010	NC_020891	GC	3	6	32340	32345	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1011	NC_020891	AGC	2	6	32367	32372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1012	NC_020891	GC	3	6	32375	32380	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1013	NC_020891	GTC	2	6	32387	32392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1014	NC_020891	GC	3	6	32405	32410	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1015	NC_020891	GTG	2	6	32423	32428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832089
1016	NC_020891	CGA	2	6	32431	32436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1017	NC_020891	CGT	2	6	32451	32456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1018	NC_020891	CGG	2	6	32491	32496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832089
1019	NC_020891	CCG	2	6	32519	32524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832089
1020	NC_020891	GAG	2	6	32573	32578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
1021	NC_020891	GAG	2	6	32660	32665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
1022	NC_020891	GCG	2	6	32674	32679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832089
1023	NC_020891	CG	3	6	32678	32683	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1024	NC_020891	TCG	2	6	32685	32690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1025	NC_020891	CGT	2	6	32695	32700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1026	NC_020891	CGA	2	6	32761	32766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832089
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1029	NC_020891	CGAGCG	2	12	32821	32832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	473832089
1030	NC_020891	GTC	2	6	32870	32875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832089
1031	NC_020891	GCC	2	6	32938	32943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832089
1032	NC_020891	TAC	2	6	32960	32965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832089
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1034	NC_020891	GC	3	6	32977	32982	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1035	NC_020891	GCCG	2	8	32998	33005	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
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1038	NC_020891	GC	3	6	33059	33064	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1039	NC_020891	CGGC	2	8	33071	33078	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
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1041	NC_020891	GGCG	2	8	33112	33119	0 %	0 %	75 %	25 %	473832089
1042	NC_020891	CGGC	2	8	33134	33141	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1043	NC_020891	GC	3	6	33154	33159	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1044	NC_020891	GC	3	6	33170	33175	0 %	0 %	50 %	50 %	473832089
1045	NC_020891	GCG	2	6	33183	33188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832089
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1052	NC_020891	GCC	3	9	33366	33374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832089
1053	NC_020891	GAG	2	6	33398	33403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
1054	NC_020891	GA	3	6	33410	33415	50 %	0 %	50 %	0 %	473832089
1055	NC_020891	GAG	2	6	33464	33469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
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1057	NC_020891	CGA	2	6	33511	33516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832089
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1059	NC_020891	GGA	3	9	33580	33588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
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1061	NC_020891	AGG	2	6	33612	33617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832089
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1066	NC_020891	CCG	2	6	33677	33682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_020891	TGTGA	2	10	33698	33707	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_020891	ACC	2	6	35320	35325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832091
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1131	NC_020891	CCG	2	6	35495	35500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832091
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1249	NC_020891	CG	4	8	39273	39280	0 %	0 %	50 %	50 %	473832095
1250	NC_020891	ACC	2	6	39302	39307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832095
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1253	NC_020891	CGG	2	6	39414	39419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832095
1254	NC_020891	CGCC	2	8	39428	39435	0 %	0 %	25 %	75 %	473832095
1255	NC_020891	CTC	2	6	39436	39441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832095
1256	NC_020891	TGC	2	6	39512	39517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832095
1257	NC_020891	TCG	2	6	39536	39541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832095
1258	NC_020891	GCC	2	6	39543	39548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832095
1259	NC_020891	CGACGT	2	12	39594	39605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	473832095
1260	NC_020891	CGC	2	6	39606	39611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832095
1261	NC_020891	CGC	3	9	39618	39626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832095
1262	NC_020891	CGT	2	6	39642	39647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832095
1263	NC_020891	CGA	2	6	39654	39659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832095
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1268	NC_020891	TCGACC	2	12	39841	39852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	473832096
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1273	NC_020891	CGAGAT	2	12	39923	39934	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	473832096
1274	NC_020891	CGT	2	6	39935	39940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832096
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1276	NC_020891	CGGC	2	8	39974	39981	0 %	0 %	50 %	50 %	473832096
1277	NC_020891	TCG	2	6	39985	39990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832096
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1284	NC_020891	CGA	2	6	40177	40182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832096
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1293	NC_020891	TCG	2	6	40495	40500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832096
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1295	NC_020891	CAGC	2	8	40559	40566	25 %	0 %	25 %	50 %	473832096
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1352	NC_020891	GAG	2	6	42785	42790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832098
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1366	NC_020891	CGG	2	6	43390	43395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1367	NC_020891	GGC	2	6	43428	43433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1368	NC_020891	CCGCGC	2	12	43462	43473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1369	NC_020891	CGA	2	6	43479	43484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1370	NC_020891	GC	3	6	43488	43493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1375	NC_020891	CCCG	2	8	43773	43780	0 %	0 %	25 %	75 %	473832100
1376	NC_020891	GC	3	6	43791	43796	0 %	0 %	50 %	50 %	473832100
1377	NC_020891	CGG	2	6	43851	43856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832100
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