MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 98693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020891	GCGG	2	8	17353	17360	0 %	0 %	75 %	25 %	473832076
502	NC_020891	GGT	2	6	17374	17379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832076
503	NC_020891	GC	4	8	17411	17418	0 %	0 %	50 %	50 %	473832076
504	NC_020891	ATG	2	6	17462	17467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832076
505	NC_020891	GAC	2	6	17491	17496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832076
506	NC_020891	CG	3	6	17500	17505	0 %	0 %	50 %	50 %	473832076
507	NC_020891	TGA	2	6	17580	17585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832076
508	NC_020891	GAG	2	6	17593	17598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832076
509	NC_020891	GAC	2	6	17662	17667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832076
510	NC_020891	TGG	2	6	17697	17702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832076
511	NC_020891	GC	3	6	17713	17718	0 %	0 %	50 %	50 %	473832076
512	NC_020891	CCT	2	6	17730	17735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832076
513	NC_020891	GGA	2	6	17781	17786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832076
514	NC_020891	CAG	2	6	17857	17862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832076
515	NC_020891	GCC	2	6	17881	17886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832076
516	NC_020891	TCG	2	6	17918	17923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_020891	CGAG	2	8	18068	18075	25 %	0 %	50 %	25 %	473832077
518	NC_020891	CGGGG	2	10	18093	18102	0 %	0 %	80 %	20 %	473832077
519	NC_020891	GCC	2	6	18123	18128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
520	NC_020891	GCC	3	9	18132	18140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
521	NC_020891	GCC	2	6	18144	18149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
522	NC_020891	GCC	2	6	18165	18170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
523	NC_020891	TCC	2	6	18174	18179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
524	NC_020891	GGC	2	6	18195	18200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
525	NC_020891	GACGGT	2	12	18204	18215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	473832077
526	NC_020891	TGC	2	6	18221	18226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832077
527	NC_020891	TCG	2	6	18326	18331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832077
528	NC_020891	CGG	2	6	18413	18418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
529	NC_020891	GTCG	2	8	18468	18475	0 %	25 %	50 %	25 %	473832077
530	NC_020891	GCG	2	6	18499	18504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
531	NC_020891	TGG	2	6	18542	18547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832077
532	NC_020891	CTC	3	9	18594	18602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
533	NC_020891	GCG	2	6	18613	18618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
534	NC_020891	TGA	2	6	18626	18631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832077
535	NC_020891	TCT	2	6	18674	18679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832077
536	NC_020891	GTC	2	6	18696	18701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832077
537	NC_020891	GGTG	2	8	18726	18733	0 %	25 %	75 %	0 %	473832077
538	NC_020891	TGG	2	6	18782	18787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832077
539	NC_020891	GCCGGG	2	12	18796	18807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
540	NC_020891	CGT	2	6	18809	18814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832077
541	NC_020891	GAG	2	6	18837	18842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832077
542	NC_020891	CGA	2	6	18848	18853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832077
543	NC_020891	CCA	2	6	18860	18865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832077
544	NC_020891	GC	3	6	18898	18903	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
545	NC_020891	GC	3	6	18910	18915	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
546	NC_020891	CTC	2	6	18918	18923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
547	NC_020891	CTC	2	6	18927	18932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
548	NC_020891	GTC	2	6	18933	18938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832077
549	NC_020891	GAG	2	6	18948	18953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832077
550	NC_020891	GC	3	6	18973	18978	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
551	NC_020891	GGA	3	9	18984	18992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832077
552	NC_020891	CGG	2	6	19016	19021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
553	NC_020891	GCG	2	6	19081	19086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
554	NC_020891	CCGCGA	2	12	19100	19111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	473832077
555	NC_020891	CGC	2	6	19130	19135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
556	NC_020891	GCGCG	2	10	19148	19157	0 %	0 %	60 %	40 %	473832077
557	NC_020891	CG	4	8	19154	19161	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
558	NC_020891	CGGC	2	8	19187	19194	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
559	NC_020891	TTC	2	6	19195	19200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832077
560	NC_020891	GGC	2	6	19258	19263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
561	NC_020891	GCG	2	6	19317	19322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
562	NC_020891	CGA	2	6	19343	19348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832077
563	NC_020891	GC	3	6	19470	19475	0 %	0 %	50 %	50 %	473832077
564	NC_020891	TGA	2	6	19514	19519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832077
565	NC_020891	GCG	2	6	19567	19572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
566	NC_020891	GAT	2	6	19596	19601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832077
567	NC_020891	CGCGCT	2	12	19628	19639	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	473832077
568	NC_020891	TGG	2	6	19646	19651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832077
569	NC_020891	TCC	2	6	19699	19704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832077
570	NC_020891	GCG	2	6	19750	19755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832077
571	NC_020891	GCC	2	6	19878	19883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832077
572	NC_020891	GCGAT	2	10	19888	19897	20 %	20 %	40 %	20 %	473832077
573	NC_020891	TTC	2	6	19971	19976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832078
574	NC_020891	GCG	2	6	19986	19991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
575	NC_020891	TCGTCC	2	12	20012	20023	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	473832078
576	NC_020891	GCC	2	6	20024	20029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
577	NC_020891	GACCGC	2	12	20042	20053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	473832078
578	NC_020891	CCG	3	9	20065	20073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
579	NC_020891	GTC	2	6	20105	20110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
580	NC_020891	CGACG	2	10	20171	20180	20 %	0 %	40 %	40 %	473832078
581	NC_020891	CGT	2	6	20191	20196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
582	NC_020891	ATC	3	9	20199	20207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832078
583	NC_020891	CGG	2	6	20221	20226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
584	NC_020891	GCTC	2	8	20275	20282	0 %	25 %	25 %	50 %	473832078
585	NC_020891	CGA	2	6	20305	20310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
586	NC_020891	CGC	2	6	20329	20334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
587	NC_020891	GCCG	2	8	20345	20352	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
588	NC_020891	GC	3	6	20379	20384	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
589	NC_020891	CGT	2	6	20422	20427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
590	NC_020891	TGA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
591	NC_020891	GTGCCG	2	12	20640	20651	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	473832078
592	NC_020891	CGG	2	6	20666	20671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
593	NC_020891	GCA	2	6	20677	20682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
594	NC_020891	GGC	3	9	20714	20722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832078
595	NC_020891	TGA	2	6	20728	20733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
596	NC_020891	CGGG	2	8	20749	20756	0 %	0 %	75 %	25 %	473832078
597	NC_020891	CG	3	6	20771	20776	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
598	NC_020891	CGA	2	6	20810	20815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
599	NC_020891	CTG	2	6	20822	20827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
600	NC_020891	CG	3	6	20834	20839	0 %	0 %	50 %	50 %	473832078
601	NC_020891	CGT	2	6	20950	20955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
602	NC_020891	CGC	2	6	20957	20962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
603	NC_020891	CTG	2	6	20963	20968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
604	NC_020891	CGAC	2	8	20992	20999	25 %	0 %	25 %	50 %	473832078
605	NC_020891	GAA	2	6	21044	21049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	473832078
606	NC_020891	CGT	2	6	21076	21081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
607	NC_020891	GTA	2	6	21122	21127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
608	NC_020891	GGA	2	6	21169	21174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832078
609	NC_020891	GTC	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832078
610	NC_020891	GAG	2	6	21201	21206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832078
611	NC_020891	CGA	2	6	21223	21228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
612	NC_020891	GAT	2	6	21260	21265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832078
613	NC_020891	GAC	2	6	21308	21313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832078
614	NC_020891	CGC	2	6	21326	21331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832078
615	NC_020891	ACC	2	6	21401	21406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832079
616	NC_020891	GGA	2	6	21441	21446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832079
617	NC_020891	GAT	2	6	21457	21462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832079
618	NC_020891	CAG	2	6	21472	21477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832079
619	NC_020891	CCGC	2	8	21485	21492	0 %	0 %	25 %	75 %	473832079
620	NC_020891	CGT	2	6	21505	21510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832079
621	NC_020891	CGC	2	6	21540	21545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832079
622	NC_020891	CGATGA	2	12	21546	21557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	473832079
623	NC_020891	ACGA	2	8	21575	21582	50 %	0 %	25 %	25 %	473832079
624	NC_020891	AGC	2	6	21596	21601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832079
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