MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 35495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020887	GGT	2	6	30	35	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020887	TGC	2	6	50	55	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020887	AAG	2	6	104	109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020887	GGA	2	6	206	211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020887	AGT	3	9	448	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465461
6	NC_020887	ATT	3	9	507	515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465461
7	NC_020887	CGG	2	6	643	648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465461
8	NC_020887	TTA	2	6	759	764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465461
9	NC_020887	GAT	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465461
10	NC_020887	GAA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
11	NC_020887	CTT	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465461
12	NC_020887	GAA	2	6	872	877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
13	NC_020887	ATT	2	6	923	928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465461
14	NC_020887	GGA	2	6	964	969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465461
15	NC_020887	TGA	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465461
16	NC_020887	GTT	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465461
17	NC_020887	AGC	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465461
18	NC_020887	ATA	2	6	1268	1273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465461
19	NC_020887	GGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465461
20	NC_020887	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
21	NC_020887	GAA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465461
22	NC_020887	CAA	2	6	1592	1597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020887	GAT	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020887	CAA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020887	TTA	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020887	AAT	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020887	TAA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465462
28	NC_020887	TAC	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465462
29	NC_020887	TAC	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465462
30	NC_020887	CAT	2	6	2048	2053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465462
31	NC_020887	TGT	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465462
32	NC_020887	GAA	2	6	2184	2189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465462
33	NC_020887	CAG	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465462
34	NC_020887	ATG	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465462
35	NC_020887	GTT	2	6	2376	2381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465462
36	NC_020887	TGA	2	6	2444	2449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465462
37	NC_020887	AAT	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465462
38	NC_020887	GAA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465462
39	NC_020887	ATT	2	6	2667	2672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465462
40	NC_020887	ATA	2	6	3007	3012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465463
41	NC_020887	ATA	2	6	3166	3171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465463
42	NC_020887	ATT	2	6	3172	3177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465463
43	NC_020887	ATG	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465463
44	NC_020887	GTT	2	6	3270	3275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465463
45	NC_020887	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465463
46	NC_020887	TAT	2	6	3427	3432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465463
47	NC_020887	AAG	2	6	3512	3517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465463
48	NC_020887	GAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465463
49	NC_020887	CAG	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465463
50	NC_020887	GGA	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465463
51	NC_020887	TGA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465463
52	NC_020887	ATT	2	6	3895	3900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465463
53	NC_020887	TAA	2	6	3910	3915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465463
54	NC_020887	GAT	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465463
55	NC_020887	ATT	3	9	4023	4031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020887	AAT	2	6	4115	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
57	NC_020887	GGA	2	6	4175	4180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465464
58	NC_020887	TAA	2	6	4231	4236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
59	NC_020887	TAA	2	6	4253	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
60	NC_020887	CAA	2	6	4279	4284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465464
61	NC_020887	TAA	2	6	4317	4322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465464
62	NC_020887	GGA	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020887	ATG	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465465
64	NC_020887	TCA	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
65	NC_020887	TGA	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465465
66	NC_020887	ATT	2	6	4545	4550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465465
67	NC_020887	GTT	2	6	4638	4643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465465
68	NC_020887	TGC	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465465
69	NC_020887	TAC	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
70	NC_020887	ACG	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465465
71	NC_020887	CAT	2	6	5081	5086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
72	NC_020887	GGC	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465465
73	NC_020887	GGC	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465465
74	NC_020887	TTG	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465465
75	NC_020887	GGA	2	6	5447	5452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472465465
76	NC_020887	AAT	2	6	5471	5476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
77	NC_020887	ATT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465465
78	NC_020887	CGG	2	6	5648	5653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472465465
79	NC_020887	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465465
80	NC_020887	TTC	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465465
81	NC_020887	ATA	2	6	5772	5777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
82	NC_020887	TAA	2	6	5842	5847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
83	NC_020887	TCA	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465465
84	NC_020887	GCT	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472465465
85	NC_020887	CCT	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472465465
86	NC_020887	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465465
87	NC_020887	ACA	2	6	6120	6125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465465
88	NC_020887	AAT	2	6	6165	6170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
89	NC_020887	TAA	2	6	6260	6265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465465
90	NC_020887	GAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472465465
91	NC_020887	GTT	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020887	GCT	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020887	TCG	2	6	6434	6439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020887	ATT	2	6	6440	6445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020887	GAG	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020887	TAT	2	6	6871	6876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465466
97	NC_020887	GCA	2	6	6914	6919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472465466
98	NC_020887	ATC	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020887	ACA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020887	CTT	2	6	7080	7085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020887	ACT	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020887	TTC	2	6	7255	7260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465467
103	NC_020887	TTG	2	6	7306	7311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465467
104	NC_020887	TTC	2	6	7327	7332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465467
105	NC_020887	TAA	2	6	7374	7379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472465467
106	NC_020887	CTA	2	6	7475	7480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465467
107	NC_020887	CTT	2	6	7716	7721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465467
108	NC_020887	TAG	2	6	7875	7880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465467
109	NC_020887	CAA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472465467
110	NC_020887	GTA	2	6	7944	7949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472465467
111	NC_020887	TCT	2	6	7955	7960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465467
112	NC_020887	TTG	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472465467
113	NC_020887	TTA	2	6	8147	8152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465467
114	NC_020887	CTT	2	6	8175	8180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472465467
115	NC_020887	CCT	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020887	ATT	2	6	8337	8342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020887	ATT	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020887	ATT	2	6	8412	8417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020887	ATT	2	6	8433	8438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020887	AAT	2	6	8484	8489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020887	ACA	2	6	8644	8649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020887	ATA	2	6	8705	8710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020887	ATA	2	6	8773	8778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020887	CAT	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020887	TAA	2	6	8934	8939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020887	GTA	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020887	ATT	3	9	8971	8979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020887	ATT	2	6	9015	9020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020887	AAT	2	6	9027	9032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020887	ATT	2	6	9065	9070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020887	TTA	2	6	9091	9096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020887	ATA	2	6	9102	9107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020887	GGT	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020887	TAC	2	6	9374	9379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472465468
135	NC_020887	TTA	2	6	9430	9435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472465468
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