MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC2

Total Repeats: 1298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020553	AAC	2	6	1	6	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020553	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020553	TCA	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020553	CGT	2	6	243	248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020553	GTC	2	6	257	262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020553	AAG	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020553	AGC	2	6	301	306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020553	AGT	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020553	GAC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020553	ACC	2	6	755	760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157237
11	NC_020553	AGG	2	6	837	842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157237
12	NC_020553	GTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157237
13	NC_020553	CGC	2	6	1054	1059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157237
14	NC_020553	GCA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157237
15	NC_020553	GGT	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157237
16	NC_020553	CGC	2	6	1475	1480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157238
17	NC_020553	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470157238
18	NC_020553	CGA	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157238
19	NC_020553	AAC	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157238
20	NC_020553	CTG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157238
21	NC_020553	GGT	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157238
22	NC_020553	ACC	3	9	1735	1743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157238
23	NC_020553	ACC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157238
24	NC_020553	ATC	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157238
25	NC_020553	CAT	2	6	1915	1920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157239
26	NC_020553	GTG	2	6	1924	1929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157239
27	NC_020553	CGC	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157239
28	NC_020553	GCC	3	9	2000	2008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157239
29	NC_020553	TGC	2	6	2046	2051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
30	NC_020553	TGA	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157239
31	NC_020553	CTG	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
32	NC_020553	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
33	NC_020553	TGC	2	6	2223	2228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
34	NC_020553	TCT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157239
35	NC_020553	TGC	3	9	2316	2324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
36	NC_020553	TGC	4	12	2328	2339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
37	NC_020553	CTG	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
38	NC_020553	TCG	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
39	NC_020553	TGA	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157239
40	NC_020553	GTC	3	9	2546	2554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
41	NC_020553	GCT	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157239
42	NC_020553	ACC	2	6	2687	2692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157239
43	NC_020553	GTG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157239
44	NC_020553	TGG	2	6	2805	2810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157239
45	NC_020553	GCG	2	6	2867	2872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157239
46	NC_020553	CAC	2	6	2911	2916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020553	TTG	2	6	2973	2978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157240
48	NC_020553	CAG	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157240
49	NC_020553	CAG	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157240
50	NC_020553	GCC	2	6	3069	3074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157240
51	NC_020553	GAG	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157240
52	NC_020553	TTC	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157240
53	NC_020553	GGA	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157240
54	NC_020553	CAG	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157240
55	NC_020553	CTC	2	6	3359	3364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470157240
56	NC_020553	CCA	2	6	3418	3423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157240
57	NC_020553	CGA	2	6	3444	3449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157240
58	NC_020553	TCC	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470157240
59	NC_020553	GTG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157240
60	NC_020553	CTG	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157240
61	NC_020553	GCT	2	6	3613	3618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157240
62	NC_020553	CAT	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157240
63	NC_020553	TTC	2	6	3830	3835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157240
64	NC_020553	ACA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157240
65	NC_020553	CAC	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157240
66	NC_020553	TGG	2	6	4039	4044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157240
67	NC_020553	GCT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157240
68	NC_020553	CTT	2	6	4124	4129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157240
69	NC_020553	ACA	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020553	TGG	2	6	4224	4229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020553	TCA	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020553	ACG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020553	TGG	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020553	TCG	2	6	4581	4586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020553	TGT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157241
76	NC_020553	GCC	2	6	4984	4989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157241
77	NC_020553	CGG	2	6	5036	5041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157241
78	NC_020553	CAC	2	6	5063	5068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157241
79	NC_020553	GCC	2	6	5071	5076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157241
80	NC_020553	ACC	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157241
81	NC_020553	GTG	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157241
82	NC_020553	TCA	2	6	5229	5234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020553	TCC	2	6	5237	5242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_020553	ATG	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020553	GAC	2	6	5316	5321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157242
86	NC_020553	ATT	2	6	5345	5350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470157242
87	NC_020553	CGC	2	6	5354	5359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157242
88	NC_020553	GCC	2	6	5409	5414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157242
89	NC_020553	GCT	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157242
90	NC_020553	TCA	2	6	5462	5467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157242
91	NC_020553	CAG	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157242
92	NC_020553	ACC	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157242
93	NC_020553	CTG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157242
94	NC_020553	TGC	2	6	5575	5580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157242
95	NC_020553	GTG	2	6	5652	5657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157243
96	NC_020553	GCC	2	6	5688	5693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157243
97	NC_020553	CAC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157243
98	NC_020553	CAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157243
99	NC_020553	CAC	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157243
100	NC_020553	GAT	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157243
101	NC_020553	CAG	2	6	5900	5905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157243
102	NC_020553	GGT	2	6	5981	5986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157243
103	NC_020553	CGA	2	6	6004	6009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157243
104	NC_020553	GGT	2	6	6098	6103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157243
105	NC_020553	CAG	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157243
106	NC_020553	GTC	2	6	6236	6241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157243
107	NC_020553	GTC	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020553	CAT	2	6	6289	6294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020553	CGG	3	9	6309	6317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157244
110	NC_020553	AAG	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470157244
111	NC_020553	GCG	2	6	6467	6472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157244
112	NC_020553	GGC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157244
113	NC_020553	TGT	2	6	6528	6533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157244
114	NC_020553	CGG	2	6	6537	6542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157244
115	NC_020553	CTG	2	6	6601	6606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157244
116	NC_020553	GGC	2	6	6607	6612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157244
117	NC_020553	TCC	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470157244
118	NC_020553	GCC	2	6	6731	6736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157244
119	NC_020553	CCA	2	6	6768	6773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157244
120	NC_020553	TGT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157244
121	NC_020553	ACC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157244
122	NC_020553	CGA	2	6	6900	6905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157244
123	NC_020553	GAC	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157244
124	NC_020553	GGT	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157244
125	NC_020553	TGG	2	6	6996	7001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157244
126	NC_020553	TGG	2	6	7031	7036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020553	CGA	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020553	TCC	2	6	7094	7099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_020553	AAC	2	6	7139	7144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157245
130	NC_020553	ACC	2	6	7162	7167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157245
131	NC_020553	TCA	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157245
132	NC_020553	TAC	2	6	7472	7477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020553	CGG	2	6	7491	7496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020553	TCT	2	6	7713	7718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157246
135	NC_020553	CGG	2	6	7722	7727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157246
136	NC_020553	GCC	2	6	7852	7857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157246
137	NC_020553	ACG	2	6	7883	7888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157246
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139	NC_020553	CGT	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157246
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143	NC_020553	TCT	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020553	CGT	2	6	8394	8399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020553	TCG	2	6	8631	8636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_020553	GAG	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020553	CGG	2	6	8709	8714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_020553	GGT	2	6	8724	8729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157247
149	NC_020553	GGT	3	9	8834	8842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157247
150	NC_020553	AGG	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157247
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154	NC_020553	CGA	2	6	9049	9054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157247
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260	NC_020553	GGA	2	6	14563	14568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157251
261	NC_020553	CTC	2	6	14641	14646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470157251
262	NC_020553	ATC	2	6	14693	14698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157251
263	NC_020553	CGC	2	6	14721	14726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157251
264	NC_020553	TCG	2	6	14778	14783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157251
265	NC_020553	GGA	2	6	14902	14907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157251
266	NC_020553	CAT	2	6	15016	15021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157251
267	NC_020553	CGC	2	6	15068	15073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157251
268	NC_020553	GAG	2	6	15086	15091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157251
269	NC_020553	GCA	2	6	15121	15126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157251
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271	NC_020553	CCG	2	6	15319	15324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157251
272	NC_020553	CAC	2	6	15354	15359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_020553	TAA	2	6	15421	15426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020553	CGG	2	6	15543	15548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157252
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279	NC_020553	TTC	2	6	15716	15721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157252
280	NC_020553	TCC	2	6	15740	15745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470157252
281	NC_020553	TCG	2	6	15783	15788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157252
282	NC_020553	TGC	2	6	15834	15839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157252
283	NC_020553	GGA	2	6	15979	15984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157252
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287	NC_020553	CCG	2	6	16275	16280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157252
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289	NC_020553	CCG	2	6	16338	16343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157252
290	NC_020553	CTG	2	6	16367	16372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157252
291	NC_020553	TCG	2	6	16434	16439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157252
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293	NC_020553	CAC	2	6	16605	16610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157252
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298	NC_020553	CGA	2	6	16800	16805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157252
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333	NC_020553	GCC	2	6	19035	19040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157254
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339	NC_020553	CGG	2	6	19288	19293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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342	NC_020553	GCC	2	6	19372	19377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157255
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375	NC_020553	TTC	2	6	21523	21528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
376	NC_020553	CTT	2	6	21584	21589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
377	NC_020553	CGG	2	6	21751	21756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157258
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379	NC_020553	CTT	2	6	21843	21848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
380	NC_020553	TGG	2	6	21851	21856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
381	NC_020553	GCG	3	9	21876	21884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_020553	TAA	2	6	21896	21901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_020553	GCA	2	6	22120	22125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157259
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385	NC_020553	AGT	2	6	22248	22253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157259
386	NC_020553	TTC	2	6	22302	22307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157259
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498	NC_020553	ATT	2	6	29548	29553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470157268
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