MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC2

Total Repeats: 1765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020553	CCA	2	6	70775	70780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157305
1502	NC_020553	GCA	2	6	70828	70833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1503	NC_020553	CAG	2	6	70964	70969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1504	NC_020553	GTG	2	6	71033	71038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157305
1505	NC_020553	TCG	2	6	71057	71062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1506	NC_020553	ACT	2	6	71185	71190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1507	NC_020553	ACG	2	6	71265	71270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1508	NC_020553	TG	3	6	71273	71278	0 %	50 %	50 %	0 %	470157305
1509	NC_020553	TC	3	6	71288	71293	0 %	50 %	0 %	50 %	470157305
1510	NC_020553	GCT	2	6	71375	71380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1511	NC_020553	GATA	2	8	71381	71388	50 %	25 %	25 %	0 %	470157305
1512	NC_020553	CAA	2	6	71420	71425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157305
1513	NC_020553	CTT	2	6	71541	71546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157305
1514	NC_020553	TCT	2	6	71587	71592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157305
1515	NC_020553	CAC	2	6	71595	71600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157305
1516	NC_020553	TGG	2	6	71642	71647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157305
1517	NC_020553	CAG	2	6	71684	71689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1518	NC_020553	CCA	2	6	71753	71758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157305
1519	NC_020553	TGG	2	6	71798	71803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157305
1520	NC_020553	GC	3	6	71811	71816	0 %	0 %	50 %	50 %	470157305
1521	NC_020553	TCG	2	6	71887	71892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1522	NC_020553	TTG	2	6	71907	71912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157305
1523	NC_020553	CGG	2	6	72052	72057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157305
1524	NC_020553	ATC	2	6	72117	72122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1525	NC_020553	CCA	2	6	72230	72235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157305
1526	NC_020553	ACA	2	6	72241	72246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157305
1527	NC_020553	TGC	2	6	72276	72281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1528	NC_020553	CAG	2	6	72287	72292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1529	NC_020553	TGG	2	6	72293	72298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157305
1530	NC_020553	TCA	2	6	72310	72315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1531	NC_020553	CAT	2	6	72362	72367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1532	NC_020553	CAG	2	6	72464	72469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1533	NC_020553	CAA	2	6	72518	72523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157305
1534	NC_020553	CTG	2	6	72551	72556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1535	NC_020553	AAT	2	6	72607	72612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470157305
1536	NC_020553	TCA	2	6	72706	72711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1537	NC_020553	TTC	2	6	72732	72737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157305
1538	NC_020553	CGT	2	6	72884	72889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1539	NC_020553	CGT	2	6	72985	72990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1540	NC_020553	CA	3	6	73029	73034	50 %	0 %	0 %	50 %	470157305
1541	NC_020553	ATC	2	6	73044	73049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1542	NC_020553	T	6	6	73109	73114	0 %	100 %	0 %	0 %	470157305
1543	NC_020553	TCT	2	6	73169	73174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157305
1544	NC_020553	CTG	2	6	73200	73205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1545	NC_020553	GAC	2	6	73298	73303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1546	NC_020553	GAA	2	6	73306	73311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470157305
1547	NC_020553	TCA	2	6	73327	73332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1548	NC_020553	TCCT	2	8	73365	73372	0 %	50 %	0 %	50 %	470157305
1549	NC_020553	TCA	2	6	73424	73429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157305
1550	NC_020553	TGC	2	6	73500	73505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1551	NC_020553	GCT	2	6	73534	73539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1552	NC_020553	TTG	2	6	73546	73551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157305
1553	NC_020553	GT	3	6	73567	73572	0 %	50 %	50 %	0 %	470157305
1554	NC_020553	GCA	2	6	73615	73620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1555	NC_020553	CTG	2	6	73628	73633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1556	NC_020553	TCG	2	6	73753	73758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157305
1557	NC_020553	GTT	2	6	73833	73838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157305
1558	NC_020553	T	7	7	73837	73843	0 %	100 %	0 %	0 %	470157305
1559	NC_020553	TG	3	6	73883	73888	0 %	50 %	50 %	0 %	470157305
1560	NC_020553	GTTT	2	8	73969	73976	0 %	75 %	25 %	0 %	470157305
1561	NC_020553	T	6	6	73995	74000	0 %	100 %	0 %	0 %	470157305
1562	NC_020553	TCT	2	6	74005	74010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157305
1563	NC_020553	GTAG	2	8	74031	74038	25 %	25 %	50 %	0 %	470157305
1564	NC_020553	ACA	2	6	74339	74344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_020553	TA	3	6	74356	74361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020553	TGG	2	6	74446	74451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020553	T	6	6	74452	74457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020553	GGC	2	6	74503	74508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_020553	TG	3	6	74546	74551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020553	ATG	2	6	74710	74715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157306
1571	NC_020553	CGA	2	6	74745	74750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157306
1572	NC_020553	TTC	2	6	74835	74840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157306
1573	NC_020553	TCG	2	6	74859	74864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157306
1574	NC_020553	GAT	2	6	74887	74892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157306
1575	NC_020553	AAG	2	6	74939	74944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470157306
1576	NC_020553	TCC	3	9	75003	75011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_020553	GAT	2	6	75108	75113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157307
1578	NC_020553	CTGGAT	2	12	75119	75130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470157307
1579	NC_020553	ATT	2	6	75268	75273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470157307
1580	NC_020553	TG	4	8	75286	75293	0 %	50 %	50 %	0 %	470157307
1581	NC_020553	CGA	2	6	75299	75304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157307
1582	NC_020553	ACA	2	6	75326	75331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_020553	GTC	2	6	75361	75366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_020553	GATG	2	8	75441	75448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020553	GAT	2	6	75495	75500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020553	ACAA	2	8	75542	75549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_020553	ACCC	2	8	75551	75558	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1588	NC_020553	TGGG	2	8	75565	75572	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020553	TTTG	2	8	75574	75581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020553	T	6	6	75592	75597	0 %	100 %	0 %	0 %	470157308
1591	NC_020553	CCA	2	6	75669	75674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157308
1592	NC_020553	GCC	2	6	75747	75752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157308
1593	NC_020553	TGCT	2	8	75790	75797	0 %	50 %	25 %	25 %	470157308
1594	NC_020553	GCC	2	6	75847	75852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157308
1595	NC_020553	CTG	2	6	75873	75878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157308
1596	NC_020553	TCA	2	6	75920	75925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157308
1597	NC_020553	TGC	2	6	75932	75937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157308
1598	NC_020553	ATG	2	6	75941	75946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157308
1599	NC_020553	AAG	2	6	75963	75968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470157308
1600	NC_020553	CCA	2	6	75999	76004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157308
1601	NC_020553	TCCA	2	8	76031	76038	25 %	25 %	0 %	50 %	470157308
1602	NC_020553	GC	3	6	76044	76049	0 %	0 %	50 %	50 %	470157308
1603	NC_020553	TGC	2	6	76126	76131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157308
1604	NC_020553	TGG	2	6	76149	76154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157308
1605	NC_020553	TCA	2	6	76199	76204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157309
1606	NC_020553	GCG	2	6	76303	76308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470157309
1607	NC_020553	GGT	2	6	76336	76341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157309
1608	NC_020553	TAA	2	6	76356	76361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470157309
1609	NC_020553	AGC	3	9	76519	76527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157309
1610	NC_020553	CTG	2	6	76605	76610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157309
1611	NC_020553	TTG	2	6	76640	76645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470157309
1612	NC_020553	CAG	2	6	76689	76694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157310
1613	NC_020553	TCG	2	6	76777	76782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157310
1614	NC_020553	T	6	6	76826	76831	0 %	100 %	0 %	0 %	470157310
1615	NC_020553	AAC	2	6	76911	76916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157310
1616	NC_020553	CTC	2	6	76932	76937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470157310
1617	NC_020553	ATT	2	6	76951	76956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470157310
1618	NC_020553	TTGG	2	8	77066	77073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020553	TCG	2	6	77125	77130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157311
1620	NC_020553	TCA	2	6	77152	77157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157311
1621	NC_020553	TTGC	2	8	77158	77165	0 %	50 %	25 %	25 %	470157311
1622	NC_020553	CAC	2	6	77172	77177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157311
1623	NC_020553	CCA	2	6	77183	77188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157311
1624	NC_020553	CTT	2	6	77261	77266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470157311
1625	NC_020553	TCCA	2	8	77269	77276	25 %	25 %	0 %	50 %	470157311
1626	NC_020553	CTTGG	2	10	77303	77312	0 %	40 %	40 %	20 %	470157311
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1640	NC_020553	ACCT	2	8	78412	78419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1654	NC_020553	TCC	2	6	79200	79205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1752	NC_020553	CACC	2	8	84535	84542	25 %	0 %	0 %	75 %	470157318
1753	NC_020553	CAT	3	9	84562	84570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157318
1754	NC_020553	CGT	2	6	84571	84576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157318
1755	NC_020553	CAT	2	6	84577	84582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157318
1756	NC_020553	GCC	2	6	84603	84608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157318
1757	NC_020553	CCAGGG	2	12	84616	84627	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470157318
1758	NC_020553	CAG	2	6	84655	84660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157318
1759	NC_020553	CCAG	2	8	84732	84739	25 %	0 %	25 %	50 %	470157318
1760	NC_020553	GCCCC	2	10	84763	84772	0 %	0 %	20 %	80 %	470157318
1761	NC_020553	A	6	6	84779	84784	100 %	0 %	0 %	0 %	470157318
1762	NC_020553	GAT	2	6	84797	84802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157318
1763	NC_020553	GTC	2	6	84803	84808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157318
1764	NC_020553	TGG	2	6	84814	84819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157318
1765	NC_020553	AC	3	6	84881	84886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.