MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy

Total Repeats: 17626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020549	GTA	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020549	TTA	2	6	108	113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020549	AAT	2	6	146	151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020549	CGA	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020549	AAG	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020549	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020549	TCT	2	6	264	269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020549	GAA	2	6	399	404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020549	CTT	2	6	415	420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020549	GGA	2	6	543	548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020549	TGC	2	6	578	583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020549	TTC	2	6	596	601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020549	ATT	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020549	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020549	TCA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020549	GCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020549	CTA	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020549	CCG	2	6	1117	1122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_020549	ATC	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020549	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020549	CAA	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020549	AAT	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020549	CAG	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020549	ACC	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_020549	GCT	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020549	ATC	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020549	TGA	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020549	CTT	2	6	1615	1620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020549	AAT	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020549	AGA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020549	CGA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204501
32	NC_020549	ATT	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
33	NC_020549	ATA	2	6	2258	2263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204501
34	NC_020549	AAG	2	6	2293	2298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
35	NC_020549	AGT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204501
36	NC_020549	CAA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204501
37	NC_020549	TGA	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204501
38	NC_020549	TCC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204501
39	NC_020549	CAG	2	6	2594	2599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204501
40	NC_020549	GAA	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
41	NC_020549	CAC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204501
42	NC_020549	TAT	2	6	2781	2786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
43	NC_020549	AAG	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
44	NC_020549	TTA	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
45	NC_020549	ATA	2	6	3108	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
46	NC_020549	AAG	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
47	NC_020549	ATA	2	6	3168	3173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
48	NC_020549	ATT	2	6	3397	3402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204502
49	NC_020549	CAG	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204502
50	NC_020549	AGG	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470204502
51	NC_020549	AGC	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204502
52	NC_020549	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
53	NC_020549	TAA	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
54	NC_020549	AAG	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
55	NC_020549	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
56	NC_020549	TAC	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
57	NC_020549	GCA	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204503
58	NC_020549	ATG	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
59	NC_020549	TCA	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
60	NC_020549	TTC	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204503
61	NC_020549	CAA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
62	NC_020549	ATT	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204503
63	NC_020549	TAC	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
64	NC_020549	ATA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
65	NC_020549	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
66	NC_020549	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
67	NC_020549	CTC	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204503
68	NC_020549	TAA	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
69	NC_020549	ATC	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
70	NC_020549	AAC	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
71	NC_020549	AAG	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204503
72	NC_020549	ATC	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
73	NC_020549	AGT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
74	NC_020549	TTC	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204503
75	NC_020549	TAA	2	6	4944	4949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
76	NC_020549	AAC	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
77	NC_020549	AAT	2	6	5059	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
78	NC_020549	TGA	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
79	NC_020549	AAT	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
80	NC_020549	CAA	2	6	5237	5242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020549	TAT	3	9	5318	5326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204504
82	NC_020549	TCA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204504
83	NC_020549	ATA	2	6	5354	5359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
84	NC_020549	ATG	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204504
85	NC_020549	ATC	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204504
86	NC_020549	ATT	2	6	5476	5481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204504
87	NC_020549	AAT	2	6	5581	5586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
88	NC_020549	TGT	2	6	5601	5606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204504
89	NC_020549	AAT	2	6	5640	5645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
90	NC_020549	CAT	2	6	5691	5696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204504
91	NC_020549	AAT	2	6	5712	5717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
92	NC_020549	ATA	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
93	NC_020549	TAG	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204504
94	NC_020549	GAA	2	6	5764	5769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204504
95	NC_020549	ATA	2	6	5783	5788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
96	NC_020549	TAA	2	6	6020	6025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020549	ATT	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020549	TCA	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020549	AAT	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020549	CAT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020549	TAC	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020549	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020549	TAA	2	6	6246	6251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020549	TAC	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020549	TGA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020549	TCA	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020549	ATA	2	6	6355	6360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020549	ATC	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
109	NC_020549	CGT	2	6	6536	6541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204505
110	NC_020549	CAG	2	6	6567	6572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
111	NC_020549	TAC	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
112	NC_020549	GCT	2	6	6638	6643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470204505
113	NC_020549	GTT	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204505
114	NC_020549	AAG	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
115	NC_020549	TTG	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204505
116	NC_020549	AAC	3	9	6874	6882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
117	NC_020549	CTT	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204505
118	NC_020549	TAA	2	6	6942	6947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
119	NC_020549	CAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
120	NC_020549	GAC	2	6	7200	7205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
121	NC_020549	AAG	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
122	NC_020549	ACA	2	6	7385	7390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
123	NC_020549	AAC	2	6	7405	7410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
124	NC_020549	ACC	2	6	7615	7620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
125	NC_020549	ATC	2	6	7621	7626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
126	NC_020549	AAT	2	6	7631	7636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
127	NC_020549	ATG	2	6	7649	7654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204505
128	NC_020549	AGC	2	6	7879	7884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204505
129	NC_020549	CTA	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
130	NC_020549	TAA	2	6	8091	8096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
131	NC_020549	ATC	2	6	8098	8103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
132	NC_020549	CTA	2	6	8160	8165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
133	NC_020549	TCA	2	6	8274	8279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
134	NC_020549	ACC	2	6	8302	8307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
135	NC_020549	GAA	2	6	8320	8325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
136	NC_020549	ACC	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
137	NC_020549	AAT	2	6	8374	8379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
138	NC_020549	CCA	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204505
139	NC_020549	CAT	2	6	8464	8469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
140	NC_020549	CAT	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
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155	NC_020549	ACA	2	6	9362	9367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
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158	NC_020549	CTT	2	6	9427	9432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204505
159	NC_020549	CAA	2	6	9555	9560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
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169	NC_020549	CAA	2	6	9951	9956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204505
170	NC_020549	TAT	2	6	9970	9975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204505
171	NC_020549	AGA	3	9	9994	10002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204505
172	NC_020549	TAA	2	6	10057	10062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
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212	NC_020549	TCT	2	6	12985	12990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
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227	NC_020549	AAT	2	6	13542	13547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204506
228	NC_020549	TCT	2	6	13549	13554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204506
229	NC_020549	CAT	2	6	13571	13576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
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248	NC_020549	CAA	2	6	15321	15326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204507
249	NC_020549	AAC	2	6	15436	15441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204508
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251	NC_020549	AAG	2	6	15537	15542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204508
252	NC_020549	CCA	2	6	15590	15595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204508
253	NC_020549	ATT	2	6	15610	15615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204508
254	NC_020549	CCA	2	6	15770	15775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204508
255	NC_020549	CAA	3	9	15837	15845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204508
256	NC_020549	AGA	3	9	15853	15861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204508
257	NC_020549	GAA	3	9	15991	15999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020549	ACA	2	6	16191	16196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204509
259	NC_020549	AAT	2	6	16268	16273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204509
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261	NC_020549	CAG	2	6	16324	16329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204509
262	NC_020549	TGT	2	6	16340	16345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204509
263	NC_020549	ATA	2	6	16371	16376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204509
264	NC_020549	CAT	2	6	16418	16423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204509
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286	NC_020549	ACA	2	6	17939	17944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204512
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288	NC_020549	ACA	2	6	17953	17958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204512
289	NC_020549	TCT	2	6	17999	18004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204512
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291	NC_020549	CCG	2	6	18213	18218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_020549	TTA	2	6	18276	18281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_020549	ATG	2	6	19722	19727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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