MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. gxpsy

Total Repeats: 29728

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020549	GTA	2	6	9	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020549	ATAG	2	8	32	39	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020549	AACG	2	8	69	76	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020549	GA	3	6	98	103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020549	TTA	2	6	108	113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020549	AAT	2	6	146	151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020549	CGA	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020549	AAG	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020549	AG	3	6	192	197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020549	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020549	TCT	2	6	264	269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020549	AAAAT	2	10	277	286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020549	T	7	7	322	328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020549	GAAAA	2	10	346	355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020549	GAA	2	6	399	404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020549	CTT	2	6	415	420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020549	AT	3	6	447	452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020549	GGA	2	6	543	548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020549	TGC	2	6	578	583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020549	TTC	2	6	596	601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020549	ATT	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020549	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020549	T	6	6	723	728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020549	TCA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020549	CAAG	2	8	1010	1017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020549	GCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020549	GCTCCT	2	12	1029	1040	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020549	CTA	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020549	CCG	2	6	1117	1122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020549	ATC	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020549	A	6	6	1143	1148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020549	TC	3	6	1175	1180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020549	TCT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020549	CAA	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020549	AAT	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020549	TTCC	2	8	1339	1346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020549	CAG	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020549	ACC	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020549	GCT	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020549	ATC	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020549	GA	3	6	1512	1517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020549	TGA	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020549	TAAA	2	8	1600	1607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020549	CTT	2	6	1615	1620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020549	T	6	6	1641	1646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020549	T	6	6	1654	1659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020549	AT	3	6	1693	1698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020549	AAT	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020549	AGA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020549	AT	3	6	1785	1790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020549	A	6	6	1810	1815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020549	TA	3	6	1819	1824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020549	A	6	6	1906	1911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020549	CGA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204501
55	NC_020549	TAAA	2	8	2039	2046	75 %	25 %	0 %	0 %	470204501
56	NC_020549	AAAAT	2	10	2149	2158	80 %	20 %	0 %	0 %	470204501
57	NC_020549	AC	3	6	2173	2178	50 %	0 %	0 %	50 %	470204501
58	NC_020549	ATT	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
59	NC_020549	A	6	6	2217	2222	100 %	0 %	0 %	0 %	470204501
60	NC_020549	A	6	6	2226	2231	100 %	0 %	0 %	0 %	470204501
61	NC_020549	T	7	7	2251	2257	0 %	100 %	0 %	0 %	470204501
62	NC_020549	ATA	2	6	2258	2263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204501
63	NC_020549	AAG	2	6	2293	2298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
64	NC_020549	AGT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204501
65	NC_020549	CAA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204501
66	NC_020549	T	6	6	2537	2542	0 %	100 %	0 %	0 %	470204501
67	NC_020549	TGA	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204501
68	NC_020549	TCC	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204501
69	NC_020549	CAG	2	6	2594	2599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204501
70	NC_020549	GAA	2	6	2662	2667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
71	NC_020549	CAC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204501
72	NC_020549	TCATT	2	10	2738	2747	20 %	60 %	0 %	20 %	470204501
73	NC_020549	ACTA	2	8	2754	2761	50 %	25 %	0 %	25 %	470204501
74	NC_020549	TAT	2	6	2781	2786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
75	NC_020549	TTCA	2	8	2849	2856	25 %	50 %	0 %	25 %	470204501
76	NC_020549	AAG	2	6	2936	2941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204501
77	NC_020549	CT	3	6	2967	2972	0 %	50 %	0 %	50 %	470204501
78	NC_020549	A	6	6	2977	2982	100 %	0 %	0 %	0 %	470204501
79	NC_020549	CAAT	2	8	3001	3008	50 %	25 %	0 %	25 %	470204501
80	NC_020549	TTA	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204501
81	NC_020549	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	470204501
82	NC_020549	ATA	2	6	3108	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
83	NC_020549	AAG	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
84	NC_020549	ATA	2	6	3168	3173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
85	NC_020549	AAAAC	2	10	3343	3352	80 %	0 %	0 %	20 %	470204502
86	NC_020549	ATT	2	6	3397	3402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204502
87	NC_020549	CAG	2	6	3462	3467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204502
88	NC_020549	CTAAT	2	10	3528	3537	40 %	40 %	0 %	20 %	470204502
89	NC_020549	AGG	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470204502
90	NC_020549	AGC	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204502
91	NC_020549	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
92	NC_020549	TA	3	6	3708	3713	50 %	50 %	0 %	0 %	470204502
93	NC_020549	AC	3	6	3719	3724	50 %	0 %	0 %	50 %	470204502
94	NC_020549	TAA	2	6	3730	3735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204502
95	NC_020549	A	6	6	3773	3778	100 %	0 %	0 %	0 %	470204502
96	NC_020549	AAG	2	6	3789	3794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204502
97	NC_020549	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
98	NC_020549	TAC	2	6	3892	3897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
99	NC_020549	T	7	7	3931	3937	0 %	100 %	0 %	0 %	470204503
100	NC_020549	T	7	7	3940	3946	0 %	100 %	0 %	0 %	470204503
101	NC_020549	TA	3	6	3948	3953	50 %	50 %	0 %	0 %	470204503
102	NC_020549	GCA	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470204503
103	NC_020549	ATG	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
104	NC_020549	TCA	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
105	NC_020549	TTC	2	6	4041	4046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204503
106	NC_020549	TCAC	2	8	4113	4120	25 %	25 %	0 %	50 %	470204503
107	NC_020549	CAA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
108	NC_020549	ACAT	2	8	4204	4211	50 %	25 %	0 %	25 %	470204503
109	NC_020549	A	9	9	4235	4243	100 %	0 %	0 %	0 %	470204503
110	NC_020549	GAAA	2	8	4264	4271	75 %	0 %	25 %	0 %	470204503
111	NC_020549	ATT	2	6	4310	4315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204503
112	NC_020549	A	8	8	4341	4348	100 %	0 %	0 %	0 %	470204503
113	NC_020549	A	6	6	4373	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	470204503
114	NC_020549	TAC	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
115	NC_020549	ATA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
116	NC_020549	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
117	NC_020549	ACA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
118	NC_020549	CTC	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470204503
119	NC_020549	TAA	2	6	4626	4631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
120	NC_020549	ATC	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
121	NC_020549	AAC	2	6	4683	4688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
122	NC_020549	AAG	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470204503
123	NC_020549	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	470204503
124	NC_020549	ATC	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204503
125	NC_020549	T	6	6	4773	4778	0 %	100 %	0 %	0 %	470204503
126	NC_020549	AGT	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
127	NC_020549	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	470204503
128	NC_020549	CAATA	2	10	4872	4881	60 %	20 %	0 %	20 %	470204503
129	NC_020549	AACAT	2	10	4885	4894	60 %	20 %	0 %	20 %	470204503
130	NC_020549	TTC	2	6	4908	4913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470204503
131	NC_020549	TAA	2	6	4944	4949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
132	NC_020549	AAC	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204503
133	NC_020549	A	6	6	5027	5032	100 %	0 %	0 %	0 %	470204503
134	NC_020549	AAT	2	6	5059	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
135	NC_020549	TGA	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470204503
136	NC_020549	AAT	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204503
137	NC_020549	AT	3	6	5215	5220	50 %	50 %	0 %	0 %	470204503
138	NC_020549	CAA	2	6	5237	5242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020549	ATGG	2	8	5244	5251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020549	A	8	8	5287	5294	100 %	0 %	0 %	0 %	470204504
141	NC_020549	TAT	3	9	5318	5326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204504
142	NC_020549	TCA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204504
143	NC_020549	T	6	6	5346	5351	0 %	100 %	0 %	0 %	470204504
144	NC_020549	ATA	2	6	5354	5359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204504
145	NC_020549	AT	3	6	5369	5374	50 %	50 %	0 %	0 %	470204504
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170	NC_020549	A	7	7	6065	6071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_020549	A	7	7	6115	6121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_020549	AT	3	6	6165	6170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020549	CAT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_020549	TAC	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_020549	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_020549	TAC	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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259	NC_020549	CGG	2	6	9812	9817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470204505
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273	NC_020549	AAT	2	6	10375	10380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204505
274	NC_020549	AAAC	2	8	10456	10463	75 %	0 %	0 %	25 %	470204505
275	NC_020549	T	6	6	10508	10513	0 %	100 %	0 %	0 %	470204505
276	NC_020549	CTGA	2	8	10565	10572	25 %	25 %	25 %	25 %	470204505
277	NC_020549	ATC	2	6	10585	10590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204505
278	NC_020549	A	6	6	10603	10608	100 %	0 %	0 %	0 %	470204505
279	NC_020549	TTG	2	6	10621	10626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204505
280	NC_020549	TC	3	6	10636	10641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NC_020549	A	6	6	10665	10670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020549	A	6	6	10672	10677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020549	TTCT	2	8	10678	10685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_020549	TTA	2	6	10689	10694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204506
285	NC_020549	TTA	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470204506
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288	NC_020549	CAA	2	6	10853	10858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204506
289	NC_020549	CAT	2	6	10889	10894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470204506
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292	NC_020549	TGT	2	6	11011	11016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470204506
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374	NC_020549	A	6	6	14802	14807	100 %	0 %	0 %	0 %	470204506
375	NC_020549	T	7	7	14903	14909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_020549	CCA	2	6	15770	15775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470204508
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399	NC_020549	CTTA	2	8	15868	15875	25 %	50 %	0 %	25 %	470204508
400	NC_020549	GAA	3	9	15991	15999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
401	NC_020549	A	6	6	16024	16029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_020549	CA	3	6	16058	16063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
403	NC_020549	A	6	6	16063	16068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_020549	ACA	2	6	16191	16196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470204509
405	NC_020549	T	7	7	16228	16234	0 %	100 %	0 %	0 %	470204509
406	NC_020549	GAAA	2	8	16241	16248	75 %	0 %	25 %	0 %	470204509
407	NC_020549	AAT	2	6	16268	16273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470204509
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