MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020512	ATT	2	6	159804	159809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428276
3502	NC_020512	CAT	2	6	159956	159961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428276
3503	NC_020512	TCAA	2	8	160017	160024	50 %	25 %	0 %	25 %	478428276
3504	NC_020512	TGA	2	6	160214	160219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428276
3505	NC_020512	GAA	2	6	160242	160247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428276
3506	NC_020512	TC	3	6	160277	160282	0 %	50 %	0 %	50 %	478428276
3507	NC_020512	GT	3	6	160315	160320	0 %	50 %	50 %	0 %	478428276
3508	NC_020512	AAT	2	6	160359	160364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428276
3509	NC_020512	GGA	2	6	160371	160376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428276
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3511	NC_020512	TAG	2	6	160430	160435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428276
3512	NC_020512	AGG	2	6	160436	160441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428276
3513	NC_020512	CTG	2	6	160456	160461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428276
3514	NC_020512	AG	3	6	160487	160492	50 %	0 %	50 %	0 %	478428276
3515	NC_020512	TCT	2	6	160515	160520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428276
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3520	NC_020512	AGG	2	6	160845	160850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428277
3521	NC_020512	AGG	2	6	160860	160865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428277
3522	NC_020512	CT	3	6	160958	160963	0 %	50 %	0 %	50 %	478428277
3523	NC_020512	GA	3	6	160968	160973	50 %	0 %	50 %	0 %	478428277
3524	NC_020512	ATT	2	6	160988	160993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428277
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3533	NC_020512	ATA	3	9	161500	161508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428278
3534	NC_020512	TTTC	2	8	161518	161525	0 %	75 %	0 %	25 %	478428278
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3541	NC_020512	A	6	6	162077	162082	100 %	0 %	0 %	0 %	478428278
3542	NC_020512	CTG	2	6	162145	162150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428278
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3552	NC_020512	CAAAA	2	10	162403	162412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3553	NC_020512	TGT	2	6	162425	162430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_020512	CAA	2	6	162505	162510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3562	NC_020512	ATCT	2	8	162986	162993	25 %	50 %	0 %	25 %	478428279
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3594	NC_020512	TAT	2	6	164451	164456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428280
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3603	NC_020512	GGA	2	6	164988	164993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428280
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3606	NC_020512	A	8	8	165070	165077	100 %	0 %	0 %	0 %	478428280
3607	NC_020512	GGT	2	6	165164	165169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428280
3608	NC_020512	GA	3	6	165181	165186	50 %	0 %	50 %	0 %	478428280
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3989	NC_020512	AAAG	2	8	182957	182964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3994	NC_020512	TTGAG	2	10	183140	183149	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_020512	GAATG	2	10	183165	183174	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_020512	CT	3	6	183215	183220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3997	NC_020512	TGA	2	6	183229	183234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_020512	GA	4	8	183257	183264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_020512	AAC	2	6	183312	183317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_020512	TGA	2	6	183331	183336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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