MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020512	TG	3	6	136817	136822	0 %	50 %	50 %	0 %	478428251
3002	NC_020512	TAG	2	6	136854	136859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428251
3003	NC_020512	ACA	2	6	136862	136867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428251
3004	NC_020512	CTT	2	6	136876	136881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428251
3005	NC_020512	TGTTT	2	10	136894	136903	0 %	80 %	20 %	0 %	478428251
3006	NC_020512	GCT	2	6	136907	136912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428251
3007	NC_020512	GGAT	2	8	136922	136929	25 %	25 %	50 %	0 %	478428251
3008	NC_020512	CTG	2	6	137043	137048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428252
3009	NC_020512	CAAT	2	8	137071	137078	50 %	25 %	0 %	25 %	478428252
3010	NC_020512	AAGC	2	8	137125	137132	50 %	0 %	25 %	25 %	478428252
3011	NC_020512	TTTG	2	8	137151	137158	0 %	75 %	25 %	0 %	478428252
3012	NC_020512	GCG	2	6	137194	137199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428252
3013	NC_020512	CTG	3	9	137216	137224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428252
3014	NC_020512	TTC	2	6	137225	137230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428252
3015	NC_020512	CTG	2	6	137236	137241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428252
3016	NC_020512	AAC	2	6	137247	137252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428252
3017	NC_020512	TTTG	2	8	137266	137273	0 %	75 %	25 %	0 %	478428252
3018	NC_020512	CAG	2	6	137303	137308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428252
3019	NC_020512	GAA	2	6	137338	137343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428252
3020	NC_020512	GCT	2	6	137353	137358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428252
3021	NC_020512	CAG	2	6	137371	137376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428252
3022	NC_020512	AGG	2	6	137382	137387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428252
3023	NC_020512	GAG	2	6	137398	137403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428252
3024	NC_020512	CAC	2	6	137411	137416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428252
3025	NC_020512	GAT	2	6	137494	137499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428252
3026	NC_020512	ATAA	2	8	137500	137507	75 %	25 %	0 %	0 %	478428252
3027	NC_020512	ACA	2	6	137510	137515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428252
3028	NC_020512	AGG	2	6	137571	137576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_020512	CCT	2	6	137581	137586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_020512	T	11	11	137588	137598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_020512	TTGCA	2	10	137686	137695	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3032	NC_020512	GAG	2	6	137750	137755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428253
3033	NC_020512	TC	3	6	137760	137765	0 %	50 %	0 %	50 %	478428253
3034	NC_020512	CT	3	6	137789	137794	0 %	50 %	0 %	50 %	478428253
3035	NC_020512	TTC	2	6	137887	137892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428253
3036	NC_020512	CTT	2	6	137937	137942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428253
3037	NC_020512	CT	3	6	137971	137976	0 %	50 %	0 %	50 %	478428253
3038	NC_020512	A	6	6	138021	138026	100 %	0 %	0 %	0 %	478428253
3039	NC_020512	TCT	2	6	138038	138043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428253
3040	NC_020512	CAG	2	6	138132	138137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428253
3041	NC_020512	AG	3	6	138136	138141	50 %	0 %	50 %	0 %	478428253
3042	NC_020512	GAA	2	6	138177	138182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428253
3043	NC_020512	TTCT	2	8	138184	138191	0 %	75 %	0 %	25 %	478428253
3044	NC_020512	AATT	2	8	138210	138217	50 %	50 %	0 %	0 %	478428253
3045	NC_020512	AAG	2	6	138322	138327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428253
3046	NC_020512	CAA	2	6	138360	138365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428253
3047	NC_020512	GCT	2	6	138422	138427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428253
3048	NC_020512	AAG	2	6	138450	138455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428253
3049	NC_020512	TTG	2	6	138640	138645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428254
3050	NC_020512	ATGT	2	8	138790	138797	25 %	50 %	25 %	0 %	478428254
3051	NC_020512	AGG	2	6	138807	138812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428254
3052	NC_020512	AAT	2	6	138840	138845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428254
3053	NC_020512	CTT	2	6	138863	138868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_020512	GA	3	6	138937	138942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_020512	A	6	6	138953	138958	100 %	0 %	0 %	0 %	478428255
3056	NC_020512	TAT	2	6	138982	138987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428255
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3058	NC_020512	ATGG	2	8	139067	139074	25 %	25 %	50 %	0 %	478428255
3059	NC_020512	GTT	2	6	139109	139114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428255
3060	NC_020512	TC	3	6	139302	139307	0 %	50 %	0 %	50 %	478428255
3061	NC_020512	AGAA	2	8	139417	139424	75 %	0 %	25 %	0 %	478428255
3062	NC_020512	GAAG	2	8	139463	139470	50 %	0 %	50 %	0 %	478428255
3063	NC_020512	TTGA	2	8	139475	139482	25 %	50 %	25 %	0 %	478428255
3064	NC_020512	GGT	2	6	139490	139495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428255
3065	NC_020512	CCT	2	6	139554	139559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428255
3066	NC_020512	T	7	7	139561	139567	0 %	100 %	0 %	0 %	478428255
3067	NC_020512	GAAA	2	8	139588	139595	75 %	0 %	25 %	0 %	478428255
3068	NC_020512	GAA	2	6	139616	139621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428255
3069	NC_020512	AGT	2	6	139685	139690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428256
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3071	NC_020512	GA	3	6	139773	139778	50 %	0 %	50 %	0 %	478428256
3072	NC_020512	AAG	2	6	139804	139809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428256
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3074	NC_020512	AGG	2	6	140060	140065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428256
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3078	NC_020512	GAGTTA	2	12	140277	140288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428257
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3080	NC_020512	AG	3	6	140408	140413	50 %	0 %	50 %	0 %	478428257
3081	NC_020512	GAA	2	6	140420	140425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428257
3082	NC_020512	TTA	2	6	140515	140520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428257
3083	NC_020512	GTT	2	6	140550	140555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428257
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3085	NC_020512	TCCAG	2	10	140642	140651	20 %	20 %	20 %	40 %	478428257
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3088	NC_020512	ATT	2	6	140736	140741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428258
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3091	NC_020512	GCA	2	6	140853	140858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428258
3092	NC_020512	CCTA	2	8	140863	140870	25 %	25 %	0 %	50 %	478428258
3093	NC_020512	GCT	2	6	140889	140894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428258
3094	NC_020512	TCA	2	6	141154	141159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428258
3095	NC_020512	TAA	2	6	141263	141268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428258
3096	NC_020512	GTACA	2	10	141373	141382	40 %	20 %	20 %	20 %	478428258
3097	NC_020512	AGA	2	6	141404	141409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428258
3098	NC_020512	GAA	2	6	141588	141593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428258
3099	NC_020512	TAA	2	6	141722	141727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428258
3100	NC_020512	TAGAT	2	10	141746	141755	40 %	40 %	20 %	0 %	478428258
3101	NC_020512	TAT	2	6	141756	141761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428258
3102	NC_020512	CTCC	2	8	141762	141769	0 %	25 %	0 %	75 %	478428258
3103	NC_020512	CTG	2	6	141778	141783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428258
3104	NC_020512	CCT	2	6	141822	141827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428258
3105	NC_020512	TAT	2	6	141828	141833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428258
3106	NC_020512	TGG	2	6	141923	141928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428258
3107	NC_020512	TCA	2	6	141950	141955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428258
3108	NC_020512	TCT	2	6	141980	141985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428258
3109	NC_020512	ATTA	2	8	141999	142006	50 %	50 %	0 %	0 %	478428258
3110	NC_020512	T	8	8	142068	142075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_020512	T	6	6	142113	142118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_020512	AAG	2	6	142122	142127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_020512	AAAAG	2	10	142158	142167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_020512	T	6	6	142182	142187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_020512	GCT	2	6	142218	142223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_020512	A	6	6	142234	142239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_020512	ATC	2	6	142242	142247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_020512	A	6	6	142291	142296	100 %	0 %	0 %	0 %	478428259
3119	NC_020512	CTC	2	6	142441	142446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428259
3120	NC_020512	AAAAC	2	10	142638	142647	80 %	0 %	0 %	20 %	478428259
3121	NC_020512	AGA	2	6	142792	142797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428260
3122	NC_020512	GGA	2	6	142966	142971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428260
3123	NC_020512	AGAA	2	8	143030	143037	75 %	0 %	25 %	0 %	478428260
3124	NC_020512	CTT	2	6	143067	143072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428260
3125	NC_020512	AAGA	2	8	143089	143096	75 %	0 %	25 %	0 %	478428260
3126	NC_020512	A	6	6	143101	143106	100 %	0 %	0 %	0 %	478428260
3127	NC_020512	AT	3	6	143169	143174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_020512	CTT	2	6	143196	143201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_020512	AAG	2	6	143206	143211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428261
3130	NC_020512	AAAG	2	8	143286	143293	75 %	0 %	25 %	0 %	478428261
3131	NC_020512	T	6	6	143330	143335	0 %	100 %	0 %	0 %	478428261
3132	NC_020512	GCA	2	6	143338	143343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428261
3133	NC_020512	TGAA	2	8	143344	143351	50 %	25 %	25 %	0 %	478428261
3134	NC_020512	TCA	2	6	143369	143374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428261
3135	NC_020512	TGCT	2	8	143396	143403	0 %	50 %	25 %	25 %	478428261
3136	NC_020512	TCC	2	6	143421	143426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428261
3137	NC_020512	TTC	2	6	143498	143503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428261
3138	NC_020512	AGT	2	6	143518	143523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428261
3139	NC_020512	TATC	2	8	143600	143607	25 %	50 %	0 %	25 %	478428261
3140	NC_020512	GAAA	2	8	143619	143626	75 %	0 %	25 %	0 %	478428261
3141	NC_020512	AG	3	6	143638	143643	50 %	0 %	50 %	0 %	478428261
3142	NC_020512	GAA	2	6	143647	143652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428261
3143	NC_020512	A	6	6	143656	143661	100 %	0 %	0 %	0 %	478428261
3144	NC_020512	TGGAAT	2	12	143705	143716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428261
3145	NC_020512	TAA	2	6	143718	143723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428261
3146	NC_020512	TGCTA	2	10	143724	143733	20 %	40 %	20 %	20 %	478428261
3147	NC_020512	GGAGC	2	10	143771	143780	20 %	0 %	60 %	20 %	478428261
3148	NC_020512	A	6	6	143812	143817	100 %	0 %	0 %	0 %	478428261
3149	NC_020512	CTT	2	6	143819	143824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428261
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3152	NC_020512	AG	3	6	143884	143889	50 %	0 %	50 %	0 %	478428261
3153	NC_020512	AGA	2	6	143913	143918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428261
3154	NC_020512	ATGGTT	2	12	143949	143960	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478428261
3155	NC_020512	TTG	2	6	144108	144113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_020512	TCA	2	6	144156	144161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428262
3157	NC_020512	TCTT	2	8	144185	144192	0 %	75 %	0 %	25 %	478428262
3158	NC_020512	TTG	2	6	144239	144244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428262
3159	NC_020512	TGA	2	6	144268	144273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428262
3160	NC_020512	TAA	2	6	144291	144296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428262
3161	NC_020512	TCTA	2	8	144335	144342	25 %	50 %	0 %	25 %	478428262
3162	NC_020512	GAA	2	6	144402	144407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428262
3163	NC_020512	TTG	2	6	144413	144418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428262
3164	NC_020512	CTT	2	6	144478	144483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428262
3165	NC_020512	GAAA	2	8	144614	144621	75 %	0 %	25 %	0 %	478428262
3166	NC_020512	GTC	2	6	144622	144627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428262
3167	NC_020512	TAA	2	6	144629	144634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428262
3168	NC_020512	AGG	2	6	144792	144797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428262
3169	NC_020512	ATA	3	9	144855	144863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428262
3170	NC_020512	GATC	2	8	144876	144883	25 %	25 %	25 %	25 %	478428262
3171	NC_020512	ATC	2	6	144887	144892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3172	NC_020512	TAA	2	6	144894	144899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_020512	T	8	8	144958	144965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3174	NC_020512	T	6	6	144987	144992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3175	NC_020512	T	7	7	145020	145026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3176	NC_020512	TACA	2	8	145052	145059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3177	NC_020512	CTT	2	6	145123	145128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428263
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3179	NC_020512	CTGGG	2	10	145186	145195	0 %	20 %	60 %	20 %	478428263
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3181	NC_020512	CTT	2	6	145322	145327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428263
3182	NC_020512	TGG	2	6	145352	145357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428263
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3184	NC_020512	CTTA	2	8	145391	145398	25 %	50 %	0 %	25 %	478428263
3185	NC_020512	TGCG	2	8	145409	145416	0 %	25 %	50 %	25 %	478428263
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3230	NC_020512	AAG	2	6	147714	147719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428265
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3232	NC_020512	AAG	2	6	147878	147883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428265
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3239	NC_020512	AG	3	6	148245	148250	50 %	0 %	50 %	0 %	478428265
3240	NC_020512	AGA	2	6	148384	148389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428265
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3242	NC_020512	GAA	2	6	148627	148632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428265
3243	NC_020512	TG	3	6	148646	148651	0 %	50 %	50 %	0 %	478428265
3244	NC_020512	AG	3	6	148706	148711	50 %	0 %	50 %	0 %	478428265
3245	NC_020512	AGGA	2	8	148726	148733	50 %	0 %	50 %	0 %	478428265
3246	NC_020512	CTC	2	6	148738	148743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428265
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3248	NC_020512	GAT	2	6	148780	148785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428265
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3250	NC_020512	CTT	2	6	148948	148953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428265
3251	NC_020512	GA	3	6	148978	148983	50 %	0 %	50 %	0 %	478428265
3252	NC_020512	AG	3	6	148988	148993	50 %	0 %	50 %	0 %	478428265
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3373	NC_020512	CTTT	2	8	153979	153986	0 %	75 %	0 %	25 %	478428269
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3375	NC_020512	GCG	2	6	154050	154055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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