MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020512	CTA	2	6	114557	114562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428232
2502	NC_020512	TC	3	6	114584	114589	0 %	50 %	0 %	50 %	478428232
2503	NC_020512	CTC	2	6	114635	114640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_020512	A	7	7	114654	114660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020512	A	8	8	114663	114670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020512	GCTCT	2	10	114697	114706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2507	NC_020512	ATT	2	6	114731	114736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020512	AGA	2	6	114759	114764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428233
2509	NC_020512	TTC	3	9	114765	114773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428233
2510	NC_020512	AG	3	6	114885	114890	50 %	0 %	50 %	0 %	478428233
2511	NC_020512	TAC	2	6	114999	115004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428233
2512	NC_020512	T	7	7	115088	115094	0 %	100 %	0 %	0 %	478428233
2513	NC_020512	CTTT	2	8	115096	115103	0 %	75 %	0 %	25 %	478428233
2514	NC_020512	ACAG	2	8	115108	115115	50 %	0 %	25 %	25 %	478428233
2515	NC_020512	T	6	6	115140	115145	0 %	100 %	0 %	0 %	478428233
2516	NC_020512	T	6	6	115170	115175	0 %	100 %	0 %	0 %	478428233
2517	NC_020512	CTG	2	6	115265	115270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428233
2518	NC_020512	TTC	2	6	115296	115301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428233
2519	NC_020512	TGTTT	2	10	115321	115330	0 %	80 %	20 %	0 %	478428233
2520	NC_020512	GA	4	8	115341	115348	50 %	0 %	50 %	0 %	478428233
2521	NC_020512	AGAA	2	8	115371	115378	75 %	0 %	25 %	0 %	478428233
2522	NC_020512	ACT	2	6	115381	115386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428233
2523	NC_020512	TCA	2	6	115393	115398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428233
2524	NC_020512	TTG	2	6	115402	115407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428233
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2527	NC_020512	GGA	2	6	115546	115551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428233
2528	NC_020512	TCT	2	6	115556	115561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428233
2529	NC_020512	TTTG	2	8	115589	115596	0 %	75 %	25 %	0 %	478428233
2530	NC_020512	GAT	2	6	115638	115643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428233
2531	NC_020512	CATGT	2	10	115699	115708	20 %	40 %	20 %	20 %	478428233
2532	NC_020512	TCT	2	6	115860	115865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428233
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2537	NC_020512	GGAA	2	8	115978	115985	50 %	0 %	50 %	0 %	478428233
2538	NC_020512	ACC	2	6	116013	116018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428233
2539	NC_020512	TTG	2	6	116099	116104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428233
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2541	NC_020512	ACTTCG	2	12	116161	116172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478428233
2542	NC_020512	ACA	3	9	116251	116259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428233
2543	NC_020512	CAA	2	6	116276	116281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428233
2544	NC_020512	TTC	3	9	116325	116333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428233
2545	NC_020512	TCT	2	6	116386	116391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428233
2546	NC_020512	AAGC	2	8	116395	116402	50 %	0 %	25 %	25 %	478428233
2547	NC_020512	TATCG	2	10	116403	116412	20 %	40 %	20 %	20 %	478428233
2548	NC_020512	T	6	6	116419	116424	0 %	100 %	0 %	0 %	478428233
2549	NC_020512	ATG	2	6	116460	116465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020512	AGT	2	6	116494	116499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020512	A	6	6	116515	116520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020512	TAA	2	6	116546	116551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020512	A	7	7	116568	116574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020512	TTTTAG	2	12	116596	116607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020512	TG	3	6	116612	116617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020512	GGTT	2	8	116727	116734	0 %	50 %	50 %	0 %	478428234
2557	NC_020512	T	7	7	116743	116749	0 %	100 %	0 %	0 %	478428234
2558	NC_020512	GCT	2	6	116869	116874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428234
2559	NC_020512	TTTCT	2	10	116919	116928	0 %	80 %	0 %	20 %	478428234
2560	NC_020512	ACA	2	6	116956	116961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428234
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2562	NC_020512	TAT	2	6	117144	117149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428234
2563	NC_020512	TATC	2	8	117176	117183	25 %	50 %	0 %	25 %	478428234
2564	NC_020512	TTTG	2	8	117273	117280	0 %	75 %	25 %	0 %	478428234
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2567	NC_020512	GA	3	6	117360	117365	50 %	0 %	50 %	0 %	478428234
2568	NC_020512	A	6	6	117413	117418	100 %	0 %	0 %	0 %	478428234
2569	NC_020512	GTTC	2	8	117469	117476	0 %	50 %	25 %	25 %	478428234
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2572	NC_020512	GCT	2	6	117523	117528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428234
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2595	NC_020512	ATC	2	6	118579	118584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428236
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2597	NC_020512	TAA	2	6	118650	118655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020512	AT	3	6	118737	118742	50 %	50 %	0 %	0 %	478428237
2599	NC_020512	T	6	6	118747	118752	0 %	100 %	0 %	0 %	478428237
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2601	NC_020512	CTTT	2	8	118790	118797	0 %	75 %	0 %	25 %	478428237
2602	NC_020512	G	6	6	118883	118888	0 %	0 %	100 %	0 %	478428237
2603	NC_020512	T	6	6	118906	118911	0 %	100 %	0 %	0 %	478428237
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2607	NC_020512	A	8	8	119109	119116	100 %	0 %	0 %	0 %	478428237
2608	NC_020512	CTC	2	6	119124	119129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428237
2609	NC_020512	AAAGA	2	10	119165	119174	80 %	0 %	20 %	0 %	478428237
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2612	NC_020512	CTT	2	6	119207	119212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2621	NC_020512	GA	4	8	119724	119731	50 %	0 %	50 %	0 %	478428238
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2626	NC_020512	TAT	2	6	119918	119923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428238
2627	NC_020512	GAT	2	6	119934	119939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428238
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2630	NC_020512	AG	3	6	120159	120164	50 %	0 %	50 %	0 %	478428239
2631	NC_020512	GCTA	2	8	120181	120188	25 %	25 %	25 %	25 %	478428239
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2639	NC_020512	CGGC	2	8	120362	120369	0 %	0 %	50 %	50 %	478428239
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2651	NC_020512	GA	3	6	121021	121026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_020512	TAT	2	6	121045	121050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_020512	ATA	2	6	121066	121071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2686	NC_020512	TGA	2	6	122751	122756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2743	NC_020512	T	6	6	125329	125334	0 %	100 %	0 %	0 %	478428241
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2745	NC_020512	T	6	6	125406	125411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2746	NC_020512	GCA	2	6	125421	125426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2747	NC_020512	T	7	7	125431	125437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2748	NC_020512	TGAA	2	8	125468	125475	50 %	25 %	25 %	0 %	478428242
2749	NC_020512	TAA	2	6	125763	125768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428242
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