MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020512	T	6	6	70057	70062	0 %	100 %	0 %	0 %	478428196
1503	NC_020512	TCT	2	6	70173	70178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428196
1504	NC_020512	GGAGC	2	10	70296	70305	20 %	0 %	60 %	20 %	478428196
1505	NC_020512	TGC	2	6	70379	70384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428196
1506	NC_020512	A	7	7	70416	70422	100 %	0 %	0 %	0 %	478428196
1507	NC_020512	CT	3	6	70424	70429	0 %	50 %	0 %	50 %	478428196
1508	NC_020512	AGA	2	6	70433	70438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428196
1509	NC_020512	GCGAT	2	10	70486	70495	20 %	20 %	40 %	20 %	478428196
1510	NC_020512	GTT	2	6	70508	70513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428196
1511	NC_020512	GCT	2	6	70530	70535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428196
1512	NC_020512	GCA	3	9	70632	70640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428196
1513	NC_020512	AAAG	2	8	70665	70672	75 %	0 %	25 %	0 %	478428196
1514	NC_020512	GCA	2	6	70679	70684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428196
1515	NC_020512	ATT	2	6	70693	70698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428196
1516	NC_020512	TAT	2	6	70801	70806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428196
1517	NC_020512	CTT	2	6	70825	70830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428196
1518	NC_020512	GA	3	6	70834	70839	50 %	0 %	50 %	0 %	478428196
1519	NC_020512	CTCTT	2	10	70840	70849	0 %	60 %	0 %	40 %	478428196
1520	NC_020512	AGAA	2	8	70852	70859	75 %	0 %	25 %	0 %	478428196
1521	NC_020512	TGA	2	6	70880	70885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428196
1522	NC_020512	TTG	2	6	70969	70974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428196
1523	NC_020512	TCT	2	6	70992	70997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428196
1524	NC_020512	GA	3	6	71033	71038	50 %	0 %	50 %	0 %	478428196
1525	NC_020512	AGCT	2	8	71074	71081	25 %	25 %	25 %	25 %	478428196
1526	NC_020512	TGA	2	6	71120	71125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428196
1527	NC_020512	GCAT	2	8	71135	71142	25 %	25 %	25 %	25 %	478428196
1528	NC_020512	AGA	2	6	71153	71158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428196
1529	NC_020512	TCAA	2	8	71279	71286	50 %	25 %	0 %	25 %	478428196
1530	NC_020512	GT	3	6	71309	71314	0 %	50 %	50 %	0 %	478428196
1531	NC_020512	CT	3	6	71390	71395	0 %	50 %	0 %	50 %	478428196
1532	NC_020512	GA	3	6	71411	71416	50 %	0 %	50 %	0 %	478428196
1533	NC_020512	AGT	2	6	71453	71458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428196
1534	NC_020512	AGGGG	2	10	71486	71495	20 %	0 %	80 %	0 %	478428196
1535	NC_020512	AAGAA	2	10	71528	71537	80 %	0 %	20 %	0 %	478428196
1536	NC_020512	AGA	2	6	71600	71605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428196
1537	NC_020512	TGA	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428196
1538	NC_020512	TAT	2	6	71647	71652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428196
1539	NC_020512	T	6	6	71736	71741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020512	T	8	8	71757	71764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020512	CAT	2	6	71822	71827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428197
1542	NC_020512	CCTT	2	8	71851	71858	0 %	50 %	0 %	50 %	478428197
1543	NC_020512	GCTT	2	8	71881	71888	0 %	50 %	25 %	25 %	478428197
1544	NC_020512	A	6	6	71976	71981	100 %	0 %	0 %	0 %	478428197
1545	NC_020512	ATT	2	6	72026	72031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428197
1546	NC_020512	CAA	2	6	72173	72178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428197
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1548	NC_020512	TTCT	2	8	72219	72226	0 %	75 %	0 %	25 %	478428197
1549	NC_020512	ATG	2	6	72231	72236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428197
1550	NC_020512	GCTT	2	8	72265	72272	0 %	50 %	25 %	25 %	478428197
1551	NC_020512	AGA	2	6	72274	72279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428197
1552	NC_020512	GAGC	2	8	72293	72300	25 %	0 %	50 %	25 %	478428197
1553	NC_020512	TCA	2	6	72318	72323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428197
1554	NC_020512	A	7	7	72325	72331	100 %	0 %	0 %	0 %	478428197
1555	NC_020512	CTATTT	2	12	72336	72347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478428197
1556	NC_020512	TGA	2	6	72370	72375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428197
1557	NC_020512	ATG	2	6	72408	72413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428197
1558	NC_020512	AGA	2	6	72538	72543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020512	CGT	2	6	72586	72591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_020512	T	7	7	72591	72597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020512	CTTGC	2	10	72617	72626	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_020512	GATA	2	8	72641	72648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020512	TTC	2	6	72732	72737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428198
1564	NC_020512	CTT	2	6	72800	72805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428198
1565	NC_020512	ATTGG	2	10	72818	72827	20 %	40 %	40 %	0 %	478428198
1566	NC_020512	T	6	6	72834	72839	0 %	100 %	0 %	0 %	478428198
1567	NC_020512	AGC	2	6	72849	72854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428198
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1569	NC_020512	ATA	2	6	72962	72967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428198
1570	NC_020512	GCT	2	6	72982	72987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428198
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1572	NC_020512	AAT	2	6	73021	73026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428198
1573	NC_020512	TGG	2	6	73052	73057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478428198
1574	NC_020512	T	6	6	73059	73064	0 %	100 %	0 %	0 %	478428198
1575	NC_020512	AGC	2	6	73121	73126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428198
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1580	NC_020512	GATT	2	8	73269	73276	25 %	50 %	25 %	0 %	478428198
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1582	NC_020512	CTGG	2	8	73377	73384	0 %	25 %	50 %	25 %	478428198
1583	NC_020512	CTC	2	6	73397	73402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428198
1584	NC_020512	ACTCTT	2	12	73465	73476	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	478428198
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1586	NC_020512	TGA	2	6	73503	73508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428198
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1588	NC_020512	T	6	6	73618	73623	0 %	100 %	0 %	0 %	478428198
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1593	NC_020512	TGT	2	6	73877	73882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428198
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1595	NC_020512	A	7	7	73896	73902	100 %	0 %	0 %	0 %	478428198
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1598	NC_020512	TTTCTG	2	12	74015	74026	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	478428199
1599	NC_020512	AGA	2	6	74052	74057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428199
1600	NC_020512	GA	3	6	74075	74080	50 %	0 %	50 %	0 %	478428199
1601	NC_020512	TAC	2	6	74100	74105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428199
1602	NC_020512	GATCAT	2	12	74145	74156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478428199
1603	NC_020512	TGA	2	6	74178	74183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428199
1604	NC_020512	G	6	6	74236	74241	0 %	0 %	100 %	0 %	478428199
1605	NC_020512	TAT	2	6	74248	74253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428199
1606	NC_020512	A	6	6	74284	74289	100 %	0 %	0 %	0 %	478428199
1607	NC_020512	TGGGA	2	10	74307	74316	20 %	20 %	60 %	0 %	478428199
1608	NC_020512	GCT	2	6	74416	74421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428199
1609	NC_020512	TGGA	2	8	74426	74433	25 %	25 %	50 %	0 %	478428199
1610	NC_020512	AGG	2	6	74460	74465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428199
1611	NC_020512	TC	3	6	74562	74567	0 %	50 %	0 %	50 %	478428199
1612	NC_020512	T	6	6	74590	74595	0 %	100 %	0 %	0 %	478428199
1613	NC_020512	AGC	3	9	74634	74642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428199
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1615	NC_020512	ATT	2	6	74773	74778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428199
1616	NC_020512	AAG	2	6	74813	74818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428199
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1618	NC_020512	TGC	2	6	74954	74959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428199
1619	NC_020512	TC	3	6	74969	74974	0 %	50 %	0 %	50 %	478428199
1620	NC_020512	TCA	2	6	75063	75068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428199
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1622	NC_020512	TCT	2	6	75205	75210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428199
1623	NC_020512	ATG	2	6	75224	75229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428199
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1625	NC_020512	ACT	2	6	75394	75399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_020512	T	6	6	75405	75410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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