MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020512	CTG	2	6	23123	23128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428155
503	NC_020512	TCG	2	6	23142	23147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428155
504	NC_020512	GAA	2	6	23151	23156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428155
505	NC_020512	TTG	2	6	23205	23210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428155
506	NC_020512	CATT	2	8	23304	23311	25 %	50 %	0 %	25 %	478428155
507	NC_020512	AGA	2	6	23483	23488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428155
508	NC_020512	TGA	2	6	23514	23519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428155
509	NC_020512	GAA	2	6	23552	23557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428155
510	NC_020512	TTG	2	6	23574	23579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428155
511	NC_020512	AGA	2	6	23634	23639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428155
512	NC_020512	GCTT	2	8	23647	23654	0 %	50 %	25 %	25 %	478428155
513	NC_020512	GGTT	2	8	23695	23702	0 %	50 %	50 %	0 %	478428155
514	NC_020512	TGC	2	6	23721	23726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428155
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521	NC_020512	GCA	2	6	24235	24240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428155
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538	NC_020512	TTA	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020512	T	9	9	25189	25197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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543	NC_020512	GGA	3	9	25512	25520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428156
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614	NC_020512	ATTG	2	8	28539	28546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020512	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_020512	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478428159
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631	NC_020512	TGA	2	6	29257	29262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428159
632	NC_020512	TTC	2	6	29290	29295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428159
633	NC_020512	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	478428159
634	NC_020512	AAG	2	6	29469	29474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428159
635	NC_020512	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	478428159
636	NC_020512	GAA	2	6	29672	29677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428159
637	NC_020512	TGT	2	6	29704	29709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428160
638	NC_020512	TCT	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428160
639	NC_020512	ACA	2	6	30000	30005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428160
640	NC_020512	ATG	2	6	30010	30015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428160
641	NC_020512	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	478428160
642	NC_020512	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	478428160
643	NC_020512	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	478428160
644	NC_020512	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	478428160
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646	NC_020512	ATC	2	6	30316	30321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428160
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648	NC_020512	T	8	8	30471	30478	0 %	100 %	0 %	0 %	478428160
649	NC_020512	ATG	2	6	30496	30501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428160
650	NC_020512	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	478428160
651	NC_020512	AG	3	6	30632	30637	50 %	0 %	50 %	0 %	478428161
652	NC_020512	GTT	2	6	30713	30718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428161
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654	NC_020512	TC	3	6	30741	30746	0 %	50 %	0 %	50 %	478428161
655	NC_020512	TCT	2	6	30788	30793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428161
656	NC_020512	ACT	2	6	30878	30883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428161
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659	NC_020512	CCT	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428161
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661	NC_020512	T	6	6	31012	31017	0 %	100 %	0 %	0 %	478428161
662	NC_020512	AAGGA	2	10	31021	31030	60 %	0 %	40 %	0 %	478428161
663	NC_020512	GGC	2	6	31048	31053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428161
664	NC_020512	GAT	2	6	31127	31132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428161
665	NC_020512	GATG	2	8	31138	31145	25 %	25 %	50 %	0 %	478428161
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668	NC_020512	TAA	2	6	31333	31338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428161
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675	NC_020512	ATT	2	6	31670	31675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428161
676	NC_020512	ATG	2	6	31793	31798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428161
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678	NC_020512	T	6	6	31811	31816	0 %	100 %	0 %	0 %	478428161
679	NC_020512	GA	3	6	31830	31835	50 %	0 %	50 %	0 %	478428161
680	NC_020512	A	7	7	31853	31859	100 %	0 %	0 %	0 %	478428161
681	NC_020512	ACA	2	6	31899	31904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428162
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684	NC_020512	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	478428162
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686	NC_020512	A	6	6	32165	32170	100 %	0 %	0 %	0 %	478428162
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693	NC_020512	CTT	2	6	32506	32511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428163
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701	NC_020512	AAG	2	6	33022	33027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428163
702	NC_020512	ATT	2	6	33072	33077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428163
703	NC_020512	T	6	6	33177	33182	0 %	100 %	0 %	0 %	478428163
704	NC_020512	GGA	2	6	33202	33207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428163
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745	NC_020512	GA	4	8	35232	35239	50 %	0 %	50 %	0 %	478428167
746	NC_020512	AGA	2	6	35267	35272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428167
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755	NC_020512	GAG	2	6	35771	35776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478428168
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758	NC_020512	TGCT	2	8	35912	35919	0 %	50 %	25 %	25 %	478428168
759	NC_020512	TG	3	6	36057	36062	0 %	50 %	50 %	0 %	478428168
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761	NC_020512	GAA	2	6	36135	36140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428168
762	NC_020512	TTGG	2	8	36144	36151	0 %	50 %	50 %	0 %	478428168
763	NC_020512	ATA	2	6	36188	36193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428168
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771	NC_020512	TCCTA	2	10	36781	36790	20 %	40 %	0 %	40 %	478428168
772	NC_020512	AGAT	2	8	36864	36871	50 %	25 %	25 %	0 %	478428168
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776	NC_020512	T	9	9	37019	37027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_020512	CTT	2	6	37079	37084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
778	NC_020512	AT	3	6	37087	37092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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785	NC_020512	GAA	2	6	37336	37341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428169
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890	NC_020512	GA	4	8	42615	42622	50 %	0 %	50 %	0 %	478428172
891	NC_020512	GGAT	2	8	42625	42632	25 %	25 %	50 %	0 %	478428172
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