MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020512	AGT	2	6	252495	252500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428354
5503	NC_020512	GCAG	2	8	252542	252549	25 %	0 %	50 %	25 %	478428354
5504	NC_020512	TCTT	2	8	252559	252566	0 %	75 %	0 %	25 %	478428354
5505	NC_020512	C	7	7	252571	252577	0 %	0 %	0 %	100 %	478428354
5506	NC_020512	AGA	2	6	252587	252592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428354
5507	NC_020512	ACA	2	6	252619	252624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428354
5508	NC_020512	TC	3	6	252661	252666	0 %	50 %	0 %	50 %	478428354
5509	NC_020512	TTG	2	6	252718	252723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428354
5510	NC_020512	TCT	2	6	252740	252745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428354
5511	NC_020512	CAA	2	6	252797	252802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428354
5512	NC_020512	AGA	3	9	252870	252878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428354
5513	NC_020512	GGC	2	6	252881	252886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478428354
5514	NC_020512	ACA	2	6	252911	252916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428354
5515	NC_020512	CAC	2	6	252918	252923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428354
5516	NC_020512	CAG	2	6	252924	252929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428354
5517	NC_020512	T	8	8	252993	253000	0 %	100 %	0 %	0 %	478428354
5518	NC_020512	TCC	2	6	253084	253089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_020512	GAAA	2	8	253105	253112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020512	T	7	7	253126	253132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020512	GCAG	2	8	253154	253161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_020512	AGAA	2	8	253187	253194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_020512	AG	3	6	253229	253234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_020512	TAT	2	6	253252	253257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_020512	ACA	2	6	253293	253298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_020512	A	6	6	253342	253347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_020512	TTG	2	6	253522	253527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428355
5528	NC_020512	TCT	2	6	253544	253549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428355
5529	NC_020512	TC	3	6	253591	253596	0 %	50 %	0 %	50 %	478428355
5530	NC_020512	T	7	7	253627	253633	0 %	100 %	0 %	0 %	478428355
5531	NC_020512	CCA	2	6	253640	253645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428355
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5533	NC_020512	AATA	2	8	253747	253754	75 %	25 %	0 %	0 %	478428355
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5538	NC_020512	CCCA	2	8	254010	254017	25 %	0 %	0 %	75 %	478428356
5539	NC_020512	CTT	2	6	254139	254144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428356
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5541	NC_020512	CTC	2	6	254229	254234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428356
5542	NC_020512	ACT	2	6	254237	254242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428356
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5545	NC_020512	GCAA	2	8	254300	254307	50 %	0 %	25 %	25 %	478428356
5546	NC_020512	AAC	2	6	254317	254322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428356
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5548	NC_020512	AAC	2	6	254401	254406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_020512	A	6	6	254415	254420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020512	TAA	2	6	254466	254471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020512	TTC	2	6	254484	254489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428357
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5554	NC_020512	CTT	2	6	254579	254584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428357
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5558	NC_020512	CATA	2	8	254705	254712	50 %	25 %	0 %	25 %	478428357
5559	NC_020512	TCC	2	6	254724	254729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428357
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5569	NC_020512	TA	3	6	255035	255040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5580	NC_020512	A	7	7	255535	255541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_020512	ATA	2	6	255548	255553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_020512	T	6	6	256079	256084	0 %	100 %	0 %	0 %	478428359
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5598	NC_020512	GAG	2	6	256517	256522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_020512	ATT	2	6	256529	256534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428360
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5612	NC_020512	AAG	2	6	256967	256972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428360
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5616	NC_020512	TAT	2	6	257221	257226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_020512	ATA	2	6	257230	257235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_020512	AAT	2	6	257254	257259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_020512	A	8	8	257334	257341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_020512	TC	3	6	257342	257347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_020512	TC	3	6	257428	257433	0 %	50 %	0 %	50 %	478428361
5622	NC_020512	A	6	6	257437	257442	100 %	0 %	0 %	0 %	478428361
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5625	NC_020512	T	7	7	257539	257545	0 %	100 %	0 %	0 %	478428361
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5628	NC_020512	T	6	6	257580	257585	0 %	100 %	0 %	0 %	478428361
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5747	NC_020512	A	6	6	262814	262819	100 %	0 %	0 %	0 %	478428365
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