MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020512	GTC	2	6	206718	206723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428313
4502	NC_020512	ATG	2	6	206727	206732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428313
4503	NC_020512	CTG	2	6	206815	206820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428313
4504	NC_020512	CTT	2	6	206875	206880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428313
4505	NC_020512	AGA	2	6	206894	206899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428313
4506	NC_020512	TTG	2	6	206950	206955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428313
4507	NC_020512	GATG	2	8	206971	206978	25 %	25 %	50 %	0 %	478428313
4508	NC_020512	ATTC	2	8	207044	207051	25 %	50 %	0 %	25 %	478428313
4509	NC_020512	GCT	2	6	207054	207059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428313
4510	NC_020512	CAA	3	9	207103	207111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428314
4511	NC_020512	T	6	6	207114	207119	0 %	100 %	0 %	0 %	478428314
4512	NC_020512	A	6	6	207136	207141	100 %	0 %	0 %	0 %	478428314
4513	NC_020512	CT	3	6	207213	207218	0 %	50 %	0 %	50 %	478428314
4514	NC_020512	TAT	2	6	207246	207251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428314
4515	NC_020512	AGT	2	6	207273	207278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428314
4516	NC_020512	TTC	2	6	207468	207473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428314
4517	NC_020512	GA	4	8	207563	207570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_020512	T	7	7	207593	207599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_020512	CT	4	8	207611	207618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_020512	A	6	6	207620	207625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_020512	GAA	2	6	207654	207659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428315
4522	NC_020512	TCC	2	6	207692	207697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428315
4523	NC_020512	AGGA	2	8	207775	207782	50 %	0 %	50 %	0 %	478428315
4524	NC_020512	TTTG	2	8	207798	207805	0 %	75 %	25 %	0 %	478428315
4525	NC_020512	GAA	2	6	207849	207854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428315
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4529	NC_020512	CAA	2	6	208005	208010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428315
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4531	NC_020512	ACC	2	6	208049	208054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428315
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4533	NC_020512	ATC	2	6	208071	208076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428315
4534	NC_020512	CAA	2	6	208191	208196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428315
4535	NC_020512	TGA	2	6	208214	208219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428315
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4537	NC_020512	CT	3	6	208297	208302	0 %	50 %	0 %	50 %	478428315
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4543	NC_020512	A	6	6	208501	208506	100 %	0 %	0 %	0 %	478428315
4544	NC_020512	TTC	2	6	208525	208530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428315
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4555	NC_020512	TGA	2	6	209129	209134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428315
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4558	NC_020512	TTA	2	6	209209	209214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428316
4559	NC_020512	ATG	2	6	209221	209226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428316
4560	NC_020512	AAG	2	6	209254	209259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478428316
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4603	NC_020512	CT	3	6	211356	211361	0 %	50 %	0 %	50 %	478428318
4604	NC_020512	CTT	2	6	211382	211387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428318
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4608	NC_020512	TTC	2	6	211513	211518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428319
4609	NC_020512	CAA	2	6	211560	211565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428319
4610	NC_020512	TG	3	6	211604	211609	0 %	50 %	50 %	0 %	478428319
4611	NC_020512	GAAC	2	8	211745	211752	50 %	0 %	25 %	25 %	478428319
4612	NC_020512	CA	4	8	211818	211825	50 %	0 %	0 %	50 %	478428319
4613	NC_020512	T	6	6	211883	211888	0 %	100 %	0 %	0 %	478428319
4614	NC_020512	CTC	2	6	211905	211910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478428319
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4617	NC_020512	CAT	2	6	212034	212039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428319
4618	NC_020512	T	6	6	212062	212067	0 %	100 %	0 %	0 %	478428319
4619	NC_020512	ACA	2	6	212105	212110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478428319
4620	NC_020512	CTT	2	6	212113	212118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428319
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4623	NC_020512	TAA	2	6	212211	212216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428319
4624	NC_020512	AGTA	2	8	212300	212307	50 %	25 %	25 %	0 %	478428319
4625	NC_020512	TTC	2	6	212354	212359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428319
4626	NC_020512	ATC	2	6	212434	212439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428319
4627	NC_020512	TGA	2	6	212451	212456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428319
4628	NC_020512	ATA	2	6	212474	212479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428319
4629	NC_020512	TCT	2	6	212480	212485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428319
4630	NC_020512	ACG	2	6	212524	212529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428319
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4632	NC_020512	TAAC	2	8	212583	212590	50 %	25 %	0 %	25 %	478428319
4633	NC_020512	TCT	2	6	212591	212596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428319
4634	NC_020512	ATA	2	6	212614	212619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428319
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4639	NC_020512	TTC	3	9	212880	212888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428319
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4645	NC_020512	AAT	2	6	213307	213312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428319
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4648	NC_020512	TTG	2	6	213435	213440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478428319
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4653	NC_020512	GAT	2	6	213952	213957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428319
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4656	NC_020512	ATT	2	6	214002	214007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428320
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4659	NC_020512	TTC	2	6	214217	214222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
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4662	NC_020512	TCT	2	6	214288	214293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
4663	NC_020512	TGGA	2	8	214320	214327	25 %	25 %	50 %	0 %	478428320
4664	NC_020512	TTC	2	6	214374	214379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
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4666	NC_020512	TTC	2	6	214422	214427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428320
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4671	NC_020512	AACG	2	8	214614	214621	50 %	0 %	25 %	25 %	478428320
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4675	NC_020512	GA	3	6	214723	214728	50 %	0 %	50 %	0 %	478428320
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4682	NC_020512	GCT	2	6	214948	214953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428320
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4685	NC_020512	AGCG	2	8	215159	215166	25 %	0 %	50 %	25 %	478428320
4686	NC_020512	CT	3	6	215196	215201	0 %	50 %	0 %	50 %	478428320
4687	NC_020512	CT	3	6	215204	215209	0 %	50 %	0 %	50 %	478428320
4688	NC_020512	AGC	2	6	215211	215216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428320
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4694	NC_020512	TAGA	2	8	215456	215463	50 %	25 %	25 %	0 %	478428320
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4700	NC_020512	CTGGAT	2	12	215861	215872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	478428320
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4702	NC_020512	ACC	2	6	216100	216105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428320
4703	NC_020512	CTTG	2	8	216128	216135	0 %	50 %	25 %	25 %	478428320
4704	NC_020512	GAAATA	2	12	216184	216195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	478428320
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4708	NC_020512	TTTCT	2	10	216384	216393	0 %	80 %	0 %	20 %	478428320
4709	NC_020512	TAA	2	6	216413	216418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428321
4710	NC_020512	CTG	2	6	216451	216456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428321
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4714	NC_020512	TTG	2	6	216811	216816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4727	NC_020512	CCA	2	6	217426	217431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478428322
4728	NC_020512	TAC	2	6	217478	217483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428322
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4730	NC_020512	CTC	2	6	217566	217571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4731	NC_020512	T	8	8	217580	217587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4732	NC_020512	CTA	2	6	217619	217624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4734	NC_020512	ATG	2	6	217721	217726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428323
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4736	NC_020512	GC	3	6	217794	217799	0 %	0 %	50 %	50 %	478428323
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4739	NC_020512	CTG	2	6	218023	218028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478428323
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4741	NC_020512	TCT	2	6	218121	218126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478428323
4742	NC_020512	C	6	6	218165	218170	0 %	0 %	0 %	100 %	478428323
4743	NC_020512	ATGA	2	8	218171	218178	50 %	25 %	25 %	0 %	478428323
4744	NC_020512	T	6	6	218205	218210	0 %	100 %	0 %	0 %	478428323
4745	NC_020512	GCA	2	6	218293	218298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428323
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4747	NC_020512	GAAA	2	8	218364	218371	75 %	0 %	25 %	0 %	478428323
4748	NC_020512	TCA	2	6	218412	218417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478428323
4749	NC_020512	ATG	2	6	218427	218432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428323
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4751	NC_020512	T	6	6	218444	218449	0 %	100 %	0 %	0 %	478428323
4752	NC_020512	TAA	2	6	218524	218529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478428323
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4754	NC_020512	AGC	2	6	218570	218575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478428323
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4757	NC_020512	A	7	7	218815	218821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_020512	TAA	2	6	218822	218827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_020512	AG	4	8	218847	218854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4760	NC_020512	A	6	6	218872	218877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_020512	CA	3	6	218906	218911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4834	NC_020512	A	7	7	221939	221945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4835	NC_020512	TAA	2	6	221993	221998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4849	NC_020512	CTTG	2	8	222402	222409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4850	NC_020512	T	6	6	222457	222462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4870	NC_020512	CA	3	6	223427	223432	50 %	0 %	0 %	50 %	478428327
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4874	NC_020512	CA	3	6	223553	223558	50 %	0 %	0 %	50 %	478428328
4875	NC_020512	GAT	2	6	223577	223582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478428328
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4881	NC_020512	T	6	6	223755	223760	0 %	100 %	0 %	0 %	478428328
4882	NC_020512	TTA	2	6	223776	223781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478428328
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