MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 2377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020511	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	471328176
2	NC_020511	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	471328176
3	NC_020511	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	471328176
4	NC_020511	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020511	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	471328179
6	NC_020511	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	471328179
7	NC_020511	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	471328180
8	NC_020511	TC	3	6	5862	5867	0 %	50 %	0 %	50 %	471328181
9	NC_020511	GA	3	6	5873	5878	50 %	0 %	50 %	0 %	471328181
10	NC_020511	AT	3	6	5977	5982	50 %	50 %	0 %	0 %	471328181
11	NC_020511	TG	3	6	6130	6135	0 %	50 %	50 %	0 %	471328181
12	NC_020511	AG	3	6	6538	6543	50 %	0 %	50 %	0 %	471328181
13	NC_020511	AG	3	6	7012	7017	50 %	0 %	50 %	0 %	471328182
14	NC_020511	GA	3	6	7596	7601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020511	AC	3	6	8247	8252	50 %	0 %	0 %	50 %	471328183
16	NC_020511	AG	3	6	8990	8995	50 %	0 %	50 %	0 %	471328184
17	NC_020511	CT	4	8	9109	9116	0 %	50 %	0 %	50 %	471328184
18	NC_020511	GT	3	6	9191	9196	0 %	50 %	50 %	0 %	471328184
19	NC_020511	AG	3	6	9951	9956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020511	GA	3	6	10467	10472	50 %	0 %	50 %	0 %	471328186
21	NC_020511	AG	3	6	10684	10689	50 %	0 %	50 %	0 %	471328186
22	NC_020511	TA	3	6	11849	11854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020511	AG	3	6	11910	11915	50 %	0 %	50 %	0 %	471328187
24	NC_020511	TA	3	6	12470	12475	50 %	50 %	0 %	0 %	471328187
25	NC_020511	TG	3	6	13373	13378	0 %	50 %	50 %	0 %	471328188
26	NC_020511	AG	3	6	13522	13527	50 %	0 %	50 %	0 %	471328188
27	NC_020511	TC	3	6	13656	13661	0 %	50 %	0 %	50 %	471328188
28	NC_020511	AG	4	8	13678	13685	50 %	0 %	50 %	0 %	471328188
29	NC_020511	TA	3	6	13940	13945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020511	TA	4	8	14164	14171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020511	AC	3	6	15007	15012	50 %	0 %	0 %	50 %	471328189
32	NC_020511	AG	3	6	16346	16351	50 %	0 %	50 %	0 %	471328190
33	NC_020511	TC	3	6	16386	16391	0 %	50 %	0 %	50 %	471328190
34	NC_020511	GA	3	6	16915	16920	50 %	0 %	50 %	0 %	471328191
35	NC_020511	AG	3	6	16986	16991	50 %	0 %	50 %	0 %	471328191
36	NC_020511	GA	3	6	17770	17775	50 %	0 %	50 %	0 %	471328191
37	NC_020511	AG	3	6	18116	18121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020511	GA	3	6	18129	18134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020511	GA	3	6	18373	18378	50 %	0 %	50 %	0 %	471328192
40	NC_020511	TC	3	6	18823	18828	0 %	50 %	0 %	50 %	471328192
41	NC_020511	CT	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020511	TC	3	6	19251	19256	0 %	50 %	0 %	50 %	471328193
43	NC_020511	GA	3	6	19266	19271	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
44	NC_020511	GA	3	6	19365	19370	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
45	NC_020511	AG	3	6	19831	19836	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
46	NC_020511	AG	4	8	20117	20124	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
47	NC_020511	GT	3	6	20380	20385	0 %	50 %	50 %	0 %	471328193
48	NC_020511	TG	3	6	20721	20726	0 %	50 %	50 %	0 %	471328194
49	NC_020511	AG	3	6	21117	21122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020511	GA	3	6	21275	21280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020511	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020511	CT	3	6	21861	21866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020511	CT	4	8	22518	22525	0 %	50 %	0 %	50 %	471328195
54	NC_020511	AT	3	6	22788	22793	50 %	50 %	0 %	0 %	471328195
55	NC_020511	AT	3	6	23112	23117	50 %	50 %	0 %	0 %	471328195
56	NC_020511	GA	3	6	24431	24436	50 %	0 %	50 %	0 %	471328195
57	NC_020511	GA	3	6	24523	24528	50 %	0 %	50 %	0 %	471328195
58	NC_020511	AG	3	6	24904	24909	50 %	0 %	50 %	0 %	471328195
59	NC_020511	GA	3	6	26321	26326	50 %	0 %	50 %	0 %	471328196
60	NC_020511	GT	3	6	26341	26346	0 %	50 %	50 %	0 %	471328196
61	NC_020511	GA	3	6	26989	26994	50 %	0 %	50 %	0 %	471328196
62	NC_020511	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020511	CT	3	6	27120	27125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020511	AT	3	6	27406	27411	50 %	50 %	0 %	0 %	471328197
65	NC_020511	GA	3	6	27620	27625	50 %	0 %	50 %	0 %	471328197
66	NC_020511	TC	3	6	28488	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020511	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020511	TG	3	6	28994	28999	0 %	50 %	50 %	0 %	471328199
69	NC_020511	TC	3	6	29047	29052	0 %	50 %	0 %	50 %	471328199
70	NC_020511	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	471328199
71	NC_020511	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	471328199
72	NC_020511	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	471328200
73	NC_020511	AG	3	6	30632	30637	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
74	NC_020511	TC	3	6	30741	30746	0 %	50 %	0 %	50 %	471328201
75	NC_020511	GA	3	6	31362	31367	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
76	NC_020511	GA	3	6	31830	31835	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
77	NC_020511	TC	3	6	32256	32261	0 %	50 %	0 %	50 %	471328203
78	NC_020511	CT	3	6	32736	32741	0 %	50 %	0 %	50 %	471328203
79	NC_020511	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	471328203
80	NC_020511	TC	3	6	34365	34370	0 %	50 %	0 %	50 %	471328205
81	NC_020511	AG	3	6	34378	34383	50 %	0 %	50 %	0 %	471328205
82	NC_020511	AG	3	6	34516	34521	50 %	0 %	50 %	0 %	471328206
83	NC_020511	AG	3	6	35209	35214	50 %	0 %	50 %	0 %	471328207
84	NC_020511	GA	4	8	35232	35239	50 %	0 %	50 %	0 %	471328207
85	NC_020511	TG	3	6	36057	36062	0 %	50 %	50 %	0 %	471328208
86	NC_020511	GA	3	6	36985	36990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020511	AT	3	6	37087	37092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020511	GA	3	6	37135	37140	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
89	NC_020511	CT	3	6	37619	37624	0 %	50 %	0 %	50 %	471328209
90	NC_020511	AG	3	6	38130	38135	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
91	NC_020511	AG	3	6	38676	38681	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
92	NC_020511	AG	3	6	39203	39208	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
93	NC_020511	CT	3	6	39354	39359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020511	GA	3	6	39987	39992	50 %	0 %	50 %	0 %	471328210
95	NC_020511	AG	3	6	40124	40129	50 %	0 %	50 %	0 %	471328210
96	NC_020511	AG	3	6	40224	40229	50 %	0 %	50 %	0 %	471328210
97	NC_020511	CT	3	6	40725	40730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020511	AG	3	6	41201	41206	50 %	0 %	50 %	0 %	471328211
99	NC_020511	GC	3	6	41250	41255	0 %	0 %	50 %	50 %	471328211
100	NC_020511	GA	3	6	41415	41420	50 %	0 %	50 %	0 %	471328211
101	NC_020511	TC	3	6	41424	41429	0 %	50 %	0 %	50 %	471328211
102	NC_020511	GC	3	6	41489	41494	0 %	0 %	50 %	50 %	471328211
103	NC_020511	GA	3	6	41629	41634	50 %	0 %	50 %	0 %	471328211
104	NC_020511	GT	3	6	42067	42072	0 %	50 %	50 %	0 %	471328212
105	NC_020511	GA	3	6	42605	42610	50 %	0 %	50 %	0 %	471328212
106	NC_020511	GA	4	8	42615	42622	50 %	0 %	50 %	0 %	471328212
107	NC_020511	AG	3	6	42851	42856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020511	CT	3	6	42917	42922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020511	GA	5	10	43192	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020511	AG	3	6	43316	43321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020511	TG	3	6	43679	43684	0 %	50 %	50 %	0 %	471328213
112	NC_020511	AC	3	6	44074	44079	50 %	0 %	0 %	50 %	471328214
113	NC_020511	TC	3	6	44243	44248	0 %	50 %	0 %	50 %	471328214
114	NC_020511	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020511	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	471328215
116	NC_020511	TC	3	6	45473	45478	0 %	50 %	0 %	50 %	471328216
117	NC_020511	GA	3	6	45956	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	471328217
118	NC_020511	TG	3	6	46174	46179	0 %	50 %	50 %	0 %	471328217
119	NC_020511	AG	3	6	46185	46190	50 %	0 %	50 %	0 %	471328217
120	NC_020511	AG	4	8	46627	46634	50 %	0 %	50 %	0 %	471328218
121	NC_020511	CT	3	6	46818	46823	0 %	50 %	0 %	50 %	471328218
122	NC_020511	TG	3	6	47019	47024	0 %	50 %	50 %	0 %	471328218
123	NC_020511	AG	3	6	47072	47077	50 %	0 %	50 %	0 %	471328218
124	NC_020511	AG	3	6	48644	48649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020511	AG	3	6	50002	50007	50 %	0 %	50 %	0 %	471328220
126	NC_020511	CA	3	6	50668	50673	50 %	0 %	0 %	50 %	471328221
127	NC_020511	TG	4	8	51997	52004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020511	TC	3	6	53618	53623	0 %	50 %	0 %	50 %	471328223
129	NC_020511	CA	3	6	53669	53674	50 %	0 %	0 %	50 %	471328223
130	NC_020511	GA	3	6	54090	54095	50 %	0 %	50 %	0 %	471328224
131	NC_020511	CT	3	6	54407	54412	0 %	50 %	0 %	50 %	471328224
132	NC_020511	CT	3	6	55070	55075	0 %	50 %	0 %	50 %	471328225
133	NC_020511	AT	3	6	56278	56283	50 %	50 %	0 %	0 %	471328225
134	NC_020511	GA	3	6	56315	56320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020511	AG	3	6	56914	56919	50 %	0 %	50 %	0 %	471328226
136	NC_020511	CT	3	6	57213	57218	0 %	50 %	0 %	50 %	471328226
137	NC_020511	GT	3	6	57263	57268	0 %	50 %	50 %	0 %	471328226
138	NC_020511	TG	3	6	57901	57906	0 %	50 %	50 %	0 %	471328226
139	NC_020511	CT	3	6	58785	58790	0 %	50 %	0 %	50 %	471328227
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142	NC_020511	TC	3	6	61232	61237	0 %	50 %	0 %	50 %	471328229
143	NC_020511	GA	3	6	61460	61465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020511	CA	3	6	61858	61863	50 %	0 %	0 %	50 %	471328230
145	NC_020511	AT	3	6	62108	62113	50 %	50 %	0 %	0 %	471328230
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