MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 2870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020511	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	471328176
2	NC_020511	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	471328176
3	NC_020511	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	471328176
4	NC_020511	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	471328176
5	NC_020511	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	471328176
6	NC_020511	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020511	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	471328177
8	NC_020511	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	471328178
9	NC_020511	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	471328178
10	NC_020511	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	471328179
11	NC_020511	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	471328179
12	NC_020511	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	471328179
13	NC_020511	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	471328180
14	NC_020511	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	471328180
15	NC_020511	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	471328180
16	NC_020511	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	471328180
17	NC_020511	TGGA	2	8	5921	5928	25 %	25 %	50 %	0 %	471328181
18	NC_020511	CTTT	2	8	6298	6305	0 %	75 %	0 %	25 %	471328181
19	NC_020511	GGGA	2	8	6813	6820	25 %	0 %	75 %	0 %	471328181
20	NC_020511	GGAG	2	8	6904	6911	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020511	GGTG	2	8	7116	7123	0 %	25 %	75 %	0 %	471328182
22	NC_020511	AAAT	2	8	7182	7189	75 %	25 %	0 %	0 %	471328182
23	NC_020511	TATG	2	8	7553	7560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020511	ATTT	2	8	7694	7701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020511	ATTT	2	8	7785	7792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020511	AAGC	2	8	8420	8427	50 %	0 %	25 %	25 %	471328183
27	NC_020511	ATTG	2	8	8818	8825	25 %	50 %	25 %	0 %	471328184
28	NC_020511	AGCG	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	471328184
29	NC_020511	AAAG	2	8	9306	9313	75 %	0 %	25 %	0 %	471328184
30	NC_020511	CTTT	2	8	9646	9653	0 %	75 %	0 %	25 %	471328184
31	NC_020511	TATT	2	8	9909	9916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020511	TTCG	2	8	10020	10027	0 %	50 %	25 %	25 %	471328185
33	NC_020511	AATT	2	8	10125	10132	50 %	50 %	0 %	0 %	471328185
34	NC_020511	ATGG	2	8	10184	10191	25 %	25 %	50 %	0 %	471328185
35	NC_020511	CTTT	2	8	10809	10816	0 %	75 %	0 %	25 %	471328186
36	NC_020511	GCAA	2	8	11026	11033	50 %	0 %	25 %	25 %	471328186
37	NC_020511	AGCC	2	8	11256	11263	25 %	0 %	25 %	50 %	471328186
38	NC_020511	GAAA	2	8	11399	11406	75 %	0 %	25 %	0 %	471328186
39	NC_020511	AGAA	2	8	11803	11810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020511	AATG	2	8	12142	12149	50 %	25 %	25 %	0 %	471328187
41	NC_020511	GTTT	2	8	13174	13181	0 %	75 %	25 %	0 %	471328188
42	NC_020511	ATGC	2	8	13604	13611	25 %	25 %	25 %	25 %	471328188
43	NC_020511	AAGG	2	8	14039	14046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020511	TTGT	2	8	14640	14647	0 %	75 %	25 %	0 %	471328189
45	NC_020511	TTCT	2	8	14811	14818	0 %	75 %	0 %	25 %	471328189
46	NC_020511	ATTT	2	8	15017	15024	25 %	75 %	0 %	0 %	471328189
47	NC_020511	TTTC	2	8	15679	15686	0 %	75 %	0 %	25 %	471328190
48	NC_020511	AAAT	2	8	16161	16168	75 %	25 %	0 %	0 %	471328190
49	NC_020511	CAAA	2	8	16673	16680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020511	GTAA	2	8	17003	17010	50 %	25 %	25 %	0 %	471328191
51	NC_020511	CTAA	2	8	17196	17203	50 %	25 %	0 %	25 %	471328191
52	NC_020511	AGAA	2	8	17459	17466	75 %	0 %	25 %	0 %	471328191
53	NC_020511	ATTT	2	8	17605	17612	25 %	75 %	0 %	0 %	471328191
54	NC_020511	TGCG	2	8	19127	19134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020511	GAAG	2	8	20111	20118	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
56	NC_020511	TTTG	2	8	20137	20144	0 %	75 %	25 %	0 %	471328193
57	NC_020511	TGTA	2	8	20829	20836	25 %	50 %	25 %	0 %	471328194
58	NC_020511	GCCA	2	8	21621	21628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020511	CGCT	2	8	21869	21876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020511	TTAA	2	8	21890	21897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020511	GTTA	2	8	21927	21934	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020511	GATC	2	8	21982	21989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020511	TGGG	2	8	22247	22254	0 %	25 %	75 %	0 %	471328195
64	NC_020511	CATT	2	8	23304	23311	25 %	50 %	0 %	25 %	471328195
65	NC_020511	GCTT	2	8	23647	23654	0 %	50 %	25 %	25 %	471328195
66	NC_020511	GGTT	2	8	23695	23702	0 %	50 %	50 %	0 %	471328195
67	NC_020511	TTCT	2	8	24065	24072	0 %	75 %	0 %	25 %	471328195
68	NC_020511	TAAC	2	8	24167	24174	50 %	25 %	0 %	25 %	471328195
69	NC_020511	CATT	2	8	24290	24297	25 %	50 %	0 %	25 %	471328195
70	NC_020511	GGTA	2	8	24660	24667	25 %	25 %	50 %	0 %	471328195
71	NC_020511	TTGA	2	8	25655	25662	25 %	50 %	25 %	0 %	471328196
72	NC_020511	TTCG	2	8	25800	25807	0 %	50 %	25 %	25 %	471328196
73	NC_020511	TAGG	2	8	25879	25886	25 %	25 %	50 %	0 %	471328196
74	NC_020511	TTCC	2	8	26003	26010	0 %	50 %	0 %	50 %	471328196
75	NC_020511	TAGG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	50 %	0 %	471328196
76	NC_020511	TTTC	2	8	26552	26559	0 %	75 %	0 %	25 %	471328196
77	NC_020511	GCTT	2	8	26889	26896	0 %	50 %	25 %	25 %	471328196
78	NC_020511	GGAA	2	8	27472	27479	50 %	0 %	50 %	0 %	471328197
79	NC_020511	TTAA	2	8	27545	27552	50 %	50 %	0 %	0 %	471328197
80	NC_020511	AAAG	2	8	27595	27602	75 %	0 %	25 %	0 %	471328197
81	NC_020511	GGGC	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	471328197
82	NC_020511	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	471328198
83	NC_020511	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	471328198
84	NC_020511	ATTG	2	8	28539	28546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020511	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	471328200
86	NC_020511	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	471328200
87	NC_020511	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	471328200
88	NC_020511	TGGC	2	8	30365	30372	0 %	25 %	50 %	25 %	471328200
89	NC_020511	AAAG	2	8	30925	30932	75 %	0 %	25 %	0 %	471328201
90	NC_020511	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	471328201
91	NC_020511	GATG	2	8	31138	31145	25 %	25 %	50 %	0 %	471328201
92	NC_020511	GATA	2	8	32247	32254	50 %	25 %	25 %	0 %	471328203
93	NC_020511	TGAT	2	8	34742	34749	25 %	50 %	25 %	0 %	471328206
94	NC_020511	AAGA	3	12	34870	34881	75 %	0 %	25 %	0 %	471328206
95	NC_020511	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	471328207
96	NC_020511	GTTC	2	8	35123	35130	0 %	50 %	25 %	25 %	471328207
97	NC_020511	GGCA	2	8	35502	35509	25 %	0 %	50 %	25 %	471328208
98	NC_020511	TCGA	2	8	35759	35766	25 %	25 %	25 %	25 %	471328208
99	NC_020511	TGCT	2	8	35912	35919	0 %	50 %	25 %	25 %	471328208
100	NC_020511	TTGG	2	8	36144	36151	0 %	50 %	50 %	0 %	471328208
101	NC_020511	AGAT	2	8	36864	36871	50 %	25 %	25 %	0 %	471328208
102	NC_020511	CTTT	2	8	37237	37244	0 %	75 %	0 %	25 %	471328209
103	NC_020511	ATGA	2	8	37727	37734	50 %	25 %	25 %	0 %	471328209
104	NC_020511	TAGG	2	8	37886	37893	25 %	25 %	50 %	0 %	471328209
105	NC_020511	CAAT	2	8	38070	38077	50 %	25 %	0 %	25 %	471328209
106	NC_020511	AATG	2	8	38857	38864	50 %	25 %	25 %	0 %	471328209
107	NC_020511	AGAA	2	8	39694	39701	75 %	0 %	25 %	0 %	471328210
108	NC_020511	AAGA	2	8	39746	39753	75 %	0 %	25 %	0 %	471328210
109	NC_020511	ATCC	2	8	39754	39761	25 %	25 %	0 %	50 %	471328210
110	NC_020511	TAAT	2	8	39965	39972	50 %	50 %	0 %	0 %	471328210
111	NC_020511	GTGC	2	8	42054	42061	0 %	25 %	50 %	25 %	471328212
112	NC_020511	AGAA	2	8	42473	42480	75 %	0 %	25 %	0 %	471328212
113	NC_020511	GGAT	2	8	42625	42632	25 %	25 %	50 %	0 %	471328212
114	NC_020511	AAAC	2	8	43833	43840	75 %	0 %	0 %	25 %	471328214
115	NC_020511	CAAT	2	8	44037	44044	50 %	25 %	0 %	25 %	471328214
116	NC_020511	TGTT	2	8	44417	44424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020511	AATA	2	8	44656	44663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020511	ATTT	2	8	44794	44801	25 %	75 %	0 %	0 %	471328216
119	NC_020511	GCTC	2	8	45102	45109	0 %	25 %	25 %	50 %	471328216
120	NC_020511	TTCT	2	8	45244	45251	0 %	75 %	0 %	25 %	471328216
121	NC_020511	TTGA	2	8	45844	45851	25 %	50 %	25 %	0 %	471328217
122	NC_020511	TGTT	2	8	46016	46023	0 %	75 %	25 %	0 %	471328217
123	NC_020511	CTAT	2	8	46046	46053	25 %	50 %	0 %	25 %	471328217
124	NC_020511	TGTT	2	8	46075	46082	0 %	75 %	25 %	0 %	471328217
125	NC_020511	CTAT	2	8	46371	46378	25 %	50 %	0 %	25 %	471328217
126	NC_020511	AAGA	2	8	46867	46874	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
127	NC_020511	AAGA	2	8	46924	46931	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
128	NC_020511	AAAG	2	8	46964	46971	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
129	NC_020511	AAGA	2	8	47079	47086	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
130	NC_020511	ACTT	2	8	47340	47347	25 %	50 %	0 %	25 %	471328218
131	NC_020511	ATGG	2	8	47966	47973	25 %	25 %	50 %	0 %	471328218
132	NC_020511	AGGA	2	8	47997	48004	50 %	0 %	50 %	0 %	471328218
133	NC_020511	GAAC	2	8	48544	48551	50 %	0 %	25 %	25 %	471328218
134	NC_020511	AAGT	2	8	48579	48586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020511	AACA	2	8	48788	48795	75 %	0 %	0 %	25 %	471328219
136	NC_020511	CTTT	2	8	48984	48991	0 %	75 %	0 %	25 %	471328219
137	NC_020511	CTTT	2	8	49875	49882	0 %	75 %	0 %	25 %	471328220
138	NC_020511	GTAG	2	8	49893	49900	25 %	25 %	50 %	0 %	471328220
139	NC_020511	GAAG	2	8	51321	51328	50 %	0 %	50 %	0 %	471328221
140	NC_020511	TTCA	2	8	51743	51750	25 %	50 %	0 %	25 %	471328221
141	NC_020511	TCTA	2	8	51960	51967	25 %	50 %	0 %	25 %	471328221
142	NC_020511	TATT	2	8	52894	52901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020511	GGAA	2	8	53125	53132	50 %	0 %	50 %	0 %	471328223
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