MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020511	TGC	2	6	183367	183372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_020511	CCAG	2	8	183387	183394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_020511	TTG	2	6	183396	183401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020511	GAC	2	6	183405	183410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_020511	GAT	2	6	183435	183440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020511	GA	3	6	183461	183466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020511	GCG	2	6	183469	183474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_020511	ACT	2	6	183517	183522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_020511	TAG	2	6	183551	183556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020511	GCA	2	6	183606	183611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_020511	TCGC	2	8	183649	183656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_020511	AGA	2	6	183660	183665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020511	GCA	2	6	183669	183674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_020511	GAA	2	6	183697	183702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_020511	AGA	2	6	183736	183741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_020511	GA	3	6	183775	183780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_020511	GTT	2	6	183792	183797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_020511	GTT	2	6	183827	183832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_020511	CTT	2	6	183835	183840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_020511	GA	3	6	183878	183883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_020511	GTT	2	6	183889	183894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020511	GAG	2	6	183910	183915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020511	GAA	2	6	183930	183935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_020511	TTG	2	6	183941	183946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020511	AGG	2	6	183980	183985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020511	AGA	2	6	184076	184081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020511	TGA	2	6	184098	184103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020511	CAG	3	9	184171	184179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_020511	GTA	2	6	184214	184219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020511	GTTG	2	8	184254	184261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020511	GGA	3	9	184269	184277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020511	TC	3	6	184285	184290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_020511	ATT	2	6	184304	184309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020511	A	7	7	184334	184340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020511	T	8	8	184346	184353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020511	ATA	2	6	184396	184401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_020511	A	6	6	184401	184406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_020511	TAT	2	6	184477	184482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020511	GA	3	6	184517	184522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020511	AGA	2	6	184559	184564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328331
4041	NC_020511	TGT	2	6	184618	184623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328331
4042	NC_020511	TCT	3	9	184687	184695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328331
4043	NC_020511	TTTC	2	8	184760	184767	0 %	75 %	0 %	25 %	471328331
4044	NC_020511	CTG	2	6	184808	184813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328331
4045	NC_020511	GGA	2	6	184835	184840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328331
4046	NC_020511	TAG	2	6	184860	184865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328331
4047	NC_020511	AGT	2	6	184990	184995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328331
4048	NC_020511	ATCG	2	8	185017	185024	25 %	25 %	25 %	25 %	471328331
4049	NC_020511	TCA	2	6	185100	185105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328332
4050	NC_020511	GGA	2	6	185115	185120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328332
4051	NC_020511	AGAGA	2	10	185208	185217	60 %	0 %	40 %	0 %	471328332
4052	NC_020511	GCA	2	6	185304	185309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328332
4053	NC_020511	TTA	2	6	185601	185606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328332
4054	NC_020511	GAA	2	6	185670	185675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328332
4055	NC_020511	ATA	2	6	185730	185735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328332
4056	NC_020511	TCTA	2	8	185771	185778	25 %	50 %	0 %	25 %	471328332
4057	NC_020511	GTT	2	6	185839	185844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_020511	TGC	2	6	185972	185977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328333
4059	NC_020511	CA	3	6	185993	185998	50 %	0 %	0 %	50 %	471328333
4060	NC_020511	AGA	2	6	186108	186113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328333
4061	NC_020511	GTT	4	12	186237	186248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020511	T	6	6	186254	186259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020511	T	7	7	186262	186268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020511	T	6	6	186274	186279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020511	T	7	7	186324	186330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020511	A	7	7	186346	186352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020511	T	6	6	186369	186374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020511	T	7	7	186464	186470	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
4069	NC_020511	TCT	2	6	186488	186493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
4070	NC_020511	TG	3	6	186498	186503	0 %	50 %	50 %	0 %	471328334
4071	NC_020511	GTC	2	6	186589	186594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328334
4072	NC_020511	ATT	2	6	186659	186664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328334
4073	NC_020511	TCT	2	6	186678	186683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
4074	NC_020511	CTT	2	6	186694	186699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
4075	NC_020511	AAGC	2	8	186732	186739	50 %	0 %	25 %	25 %	471328334
4076	NC_020511	GAA	2	6	186762	186767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
4077	NC_020511	AAC	2	6	186839	186844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328334
4078	NC_020511	TA	3	6	186916	186921	50 %	50 %	0 %	0 %	471328334
4079	NC_020511	CTT	2	6	186937	186942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
4080	NC_020511	TAG	2	6	186943	186948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328334
4081	NC_020511	CAT	2	6	186987	186992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328334
4082	NC_020511	T	6	6	186994	186999	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
4083	NC_020511	GCTT	2	8	187013	187020	0 %	50 %	25 %	25 %	471328334
4084	NC_020511	CAC	2	6	187045	187050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328334
4085	NC_020511	GAA	2	6	187080	187085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
4086	NC_020511	AAG	2	6	187186	187191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
4087	NC_020511	TGT	2	6	187208	187213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328334
4088	NC_020511	ACGAT	2	10	187280	187289	40 %	20 %	20 %	20 %	471328334
4089	NC_020511	TTTA	2	8	187298	187305	25 %	75 %	0 %	0 %	471328334
4090	NC_020511	AAG	2	6	187309	187314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
4091	NC_020511	AGA	2	6	187394	187399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328334
4092	NC_020511	CTT	2	6	187431	187436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
4093	NC_020511	A	6	6	187449	187454	100 %	0 %	0 %	0 %	471328334
4094	NC_020511	AGG	2	6	187477	187482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328334
4095	NC_020511	GCTT	2	8	187505	187512	0 %	50 %	25 %	25 %	471328334
4096	NC_020511	T	7	7	187511	187517	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
4097	NC_020511	A	6	6	187552	187557	100 %	0 %	0 %	0 %	471328334
4098	NC_020511	GCT	2	6	187641	187646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328334
4099	NC_020511	TTC	2	6	187820	187825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328334
4100	NC_020511	GCTT	2	8	187946	187953	0 %	50 %	25 %	25 %	471328334
4101	NC_020511	TAG	2	6	187984	187989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328334
4102	NC_020511	GAT	2	6	188022	188027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328334
4103	NC_020511	T	7	7	188027	188033	0 %	100 %	0 %	0 %	471328334
4104	NC_020511	TTA	2	6	188057	188062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328334
4105	NC_020511	ATC	2	6	188064	188069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_020511	CGATA	2	10	188092	188101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4107	NC_020511	T	6	6	188105	188110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020511	TCC	2	6	188125	188130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328335
4109	NC_020511	ACA	3	9	188131	188139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328335
4110	NC_020511	AGT	2	6	188149	188154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328335
4111	NC_020511	AAAC	2	8	188174	188181	75 %	0 %	0 %	25 %	471328335
4112	NC_020511	TGC	2	6	188240	188245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328335
4113	NC_020511	AGT	2	6	188308	188313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328335
4114	NC_020511	AGT	2	6	188331	188336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328335
4115	NC_020511	TTG	2	6	188339	188344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328335
4116	NC_020511	TAT	2	6	188419	188424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020511	T	6	6	188438	188443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020511	GCA	2	6	188491	188496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_020511	CTT	2	6	188506	188511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_020511	GGAC	2	8	188533	188540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_020511	AAG	2	6	188643	188648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020511	TTG	2	6	188665	188670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020511	CAT	2	6	188675	188680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_020511	T	7	7	188714	188720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020511	TAA	2	6	188793	188798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020511	TTG	2	6	188821	188826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020511	CTC	2	6	188896	188901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328336
4128	NC_020511	CAC	2	6	188942	188947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328336
4129	NC_020511	TAC	2	6	189023	189028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328336
4130	NC_020511	CAT	2	6	189039	189044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328336
4131	NC_020511	GGT	2	6	189086	189091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328336
4132	NC_020511	CCT	2	6	189147	189152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328336
4133	NC_020511	CCT	2	6	189162	189167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328336
4134	NC_020511	CTC	2	6	189255	189260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328336
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4136	NC_020511	CGTA	2	8	189302	189309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4137	NC_020511	G	10	10	189321	189330	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_020511	TCC	2	6	189356	189361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4139	NC_020511	CAG	2	6	189364	189369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4141	NC_020511	AGA	2	6	189398	189403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_020511	GAA	2	6	189404	189409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_020511	GGA	2	6	189410	189415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_020511	CTT	2	6	189418	189423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4145	NC_020511	AGA	2	6	189479	189484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_020511	TAAA	2	8	189532	189539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_020511	CAA	2	6	189612	189617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4148	NC_020511	AGA	2	6	189640	189645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_020511	CAT	2	6	189655	189660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4150	NC_020511	GAA	2	6	189705	189710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_020511	GAC	2	6	189719	189724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4152	NC_020511	ATC	2	6	189792	189797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4155	NC_020511	GAA	2	6	189938	189943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_020511	AAAG	2	8	190043	190050	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4157	NC_020511	GAC	2	6	190058	190063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4158	NC_020511	TGA	2	6	190133	190138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_020511	TTG	2	6	190180	190185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4160	NC_020511	TGCT	2	8	190209	190216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4161	NC_020511	AGAA	2	8	190264	190271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_020511	GAG	2	6	190287	190292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_020511	AGA	2	6	190330	190335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_020511	AAC	2	6	190351	190356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4165	NC_020511	GGATC	2	10	190371	190380	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4167	NC_020511	CAGAT	2	10	190486	190495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4168	NC_020511	GTAT	2	8	190498	190505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4169	NC_020511	GGA	2	6	190511	190516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4170	NC_020511	ATG	2	6	190545	190550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4171	NC_020511	ACA	2	6	190677	190682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4172	NC_020511	AGA	2	6	190730	190735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4173	NC_020511	ATC	2	6	190906	190911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4178	NC_020511	TCG	2	6	191122	191127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4245	NC_020511	ACTC	2	8	194536	194543	25 %	25 %	0 %	50 %	471328339
4246	NC_020511	GATTA	2	10	194555	194564	40 %	40 %	20 %	0 %	471328339
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4251	NC_020511	GGC	2	6	194917	194922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328340
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4253	NC_020511	AAG	2	6	195090	195095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328340
4254	NC_020511	TA	3	6	195108	195113	50 %	50 %	0 %	0 %	471328340
4255	NC_020511	CTA	2	6	195115	195120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328340
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