MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020511	ATT	2	6	159804	159809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328316
3502	NC_020511	CAT	2	6	159956	159961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328316
3503	NC_020511	TCAA	2	8	160017	160024	50 %	25 %	0 %	25 %	471328316
3504	NC_020511	TGA	2	6	160214	160219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328316
3505	NC_020511	GAA	2	6	160242	160247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328316
3506	NC_020511	TC	3	6	160277	160282	0 %	50 %	0 %	50 %	471328316
3507	NC_020511	GT	3	6	160315	160320	0 %	50 %	50 %	0 %	471328316
3508	NC_020511	AAT	2	6	160359	160364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328316
3509	NC_020511	GGA	2	6	160371	160376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328316
3510	NC_020511	AGGAA	2	10	160400	160409	60 %	0 %	40 %	0 %	471328316
3511	NC_020511	TAG	2	6	160430	160435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328316
3512	NC_020511	AGG	2	6	160436	160441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328316
3513	NC_020511	CTG	2	6	160456	160461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328316
3514	NC_020511	AG	3	6	160487	160492	50 %	0 %	50 %	0 %	471328316
3515	NC_020511	TCT	2	6	160515	160520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328316
3516	NC_020511	AGG	2	6	160634	160639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328316
3517	NC_020511	GAA	2	6	160647	160652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328317
3518	NC_020511	AGA	2	6	160695	160700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328317
3519	NC_020511	ATAC	2	8	160819	160826	50 %	25 %	0 %	25 %	471328317
3520	NC_020511	AGG	2	6	160845	160850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328317
3521	NC_020511	AGG	2	6	160860	160865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328317
3522	NC_020511	CT	3	6	160958	160963	0 %	50 %	0 %	50 %	471328317
3523	NC_020511	GA	3	6	160968	160973	50 %	0 %	50 %	0 %	471328317
3524	NC_020511	ATT	2	6	160988	160993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328317
3525	NC_020511	ATA	2	6	161084	161089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328317
3526	NC_020511	AC	3	6	161108	161113	50 %	0 %	0 %	50 %	471328317
3527	NC_020511	A	8	8	161153	161160	100 %	0 %	0 %	0 %	471328317
3528	NC_020511	ATG	2	6	161234	161239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328317
3529	NC_020511	TCT	2	6	161249	161254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328317
3530	NC_020511	TTC	2	6	161463	161468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328317
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3532	NC_020511	ACA	2	6	161490	161495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328318
3533	NC_020511	ATA	3	9	161500	161508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328318
3534	NC_020511	TTTC	2	8	161518	161525	0 %	75 %	0 %	25 %	471328318
3535	NC_020511	AACAGC	2	12	161603	161614	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	471328318
3536	NC_020511	AGT	2	6	161646	161651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328318
3537	NC_020511	TGG	2	6	161732	161737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328318
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3539	NC_020511	AGA	2	6	161975	161980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328318
3540	NC_020511	TC	3	6	162059	162064	0 %	50 %	0 %	50 %	471328318
3541	NC_020511	A	6	6	162077	162082	100 %	0 %	0 %	0 %	471328318
3542	NC_020511	CTG	2	6	162145	162150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328318
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3544	NC_020511	ACA	2	6	162207	162212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328318
3545	NC_020511	GCA	2	6	162231	162236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328318
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3547	NC_020511	ATTG	2	8	162269	162276	25 %	50 %	25 %	0 %	471328318
3548	NC_020511	TCT	2	6	162300	162305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328318
3549	NC_020511	CT	4	8	162304	162311	0 %	50 %	0 %	50 %	471328318
3550	NC_020511	TGT	2	6	162332	162337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328318
3551	NC_020511	GCTT	2	8	162373	162380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_020511	CAAAA	2	10	162403	162412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3553	NC_020511	TGT	2	6	162425	162430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_020511	CAA	2	6	162505	162510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_020511	GAG	2	6	162524	162529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_020511	TGG	2	6	162747	162752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328319
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3558	NC_020511	GAA	2	6	162800	162805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328319
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3560	NC_020511	GAA	3	9	162857	162865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328319
3561	NC_020511	TTTC	2	8	162960	162967	0 %	75 %	0 %	25 %	471328319
3562	NC_020511	ATCT	2	8	162986	162993	25 %	50 %	0 %	25 %	471328319
3563	NC_020511	GA	3	6	163065	163070	50 %	0 %	50 %	0 %	471328319
3564	NC_020511	TTG	2	6	163091	163096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328319
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3574	NC_020511	TCGA	2	8	163502	163509	25 %	25 %	25 %	25 %	471328319
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3579	NC_020511	TGT	2	6	163924	163929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328319
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3585	NC_020511	AGCAA	2	10	164066	164075	60 %	0 %	20 %	20 %	471328319
3586	NC_020511	TAC	2	6	164092	164097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328319
3587	NC_020511	TGGC	2	8	164142	164149	0 %	25 %	50 %	25 %	471328319
3588	NC_020511	CCT	2	6	164231	164236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328319
3589	NC_020511	GT	3	6	164250	164255	0 %	50 %	50 %	0 %	471328319
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3593	NC_020511	GAT	2	6	164403	164408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328320
3594	NC_020511	TAT	2	6	164451	164456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328320
3595	NC_020511	TCAA	2	8	164461	164468	50 %	25 %	0 %	25 %	471328320
3596	NC_020511	CGA	2	6	164470	164475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328320
3597	NC_020511	ATG	2	6	164491	164496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328320
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3602	NC_020511	TTTC	2	8	164901	164908	0 %	75 %	0 %	25 %	471328320
3603	NC_020511	GGA	2	6	164988	164993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328320
3604	NC_020511	TCT	2	6	165009	165014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328320
3605	NC_020511	GCT	2	6	165021	165026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328320
3606	NC_020511	A	8	8	165070	165077	100 %	0 %	0 %	0 %	471328320
3607	NC_020511	GGT	2	6	165164	165169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328320
3608	NC_020511	GA	3	6	165181	165186	50 %	0 %	50 %	0 %	471328320
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3610	NC_020511	GGA	2	6	165341	165346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328320
3611	NC_020511	T	7	7	165406	165412	0 %	100 %	0 %	0 %	471328320
3612	NC_020511	A	8	8	165463	165470	100 %	0 %	0 %	0 %	471328320
3613	NC_020511	AGG	2	6	165506	165511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328320
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3615	NC_020511	AG	3	6	165560	165565	50 %	0 %	50 %	0 %	471328320
3616	NC_020511	TGT	2	6	165611	165616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328320
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3618	NC_020511	GA	3	6	165724	165729	50 %	0 %	50 %	0 %	471328320
3619	NC_020511	ATT	2	6	165743	165748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328320
3620	NC_020511	AT	3	6	165778	165783	50 %	50 %	0 %	0 %	471328320
3621	NC_020511	AGA	3	9	165794	165802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328320
3622	NC_020511	CTT	2	6	165982	165987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328320
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3989	NC_020511	AAAG	2	8	182957	182964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3993	NC_020511	GGA	2	6	183094	183099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_020511	TTGAG	2	10	183140	183149	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_020511	GAATG	2	10	183165	183174	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_020511	CT	3	6	183215	183220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3998	NC_020511	GA	4	8	183257	183264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_020511	AAC	2	6	183312	183317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_020511	TGA	2	6	183331	183336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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