MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020511	CTA	2	6	114557	114562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328272
2502	NC_020511	TC	3	6	114584	114589	0 %	50 %	0 %	50 %	471328272
2503	NC_020511	CTC	2	6	114635	114640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_020511	A	7	7	114654	114660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_020511	A	8	8	114663	114670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020511	GCTCT	2	10	114697	114706	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2507	NC_020511	ATT	2	6	114731	114736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_020511	AGA	2	6	114759	114764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328273
2509	NC_020511	TTC	3	9	114765	114773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328273
2510	NC_020511	AG	3	6	114885	114890	50 %	0 %	50 %	0 %	471328273
2511	NC_020511	TAC	2	6	114999	115004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328273
2512	NC_020511	T	7	7	115088	115094	0 %	100 %	0 %	0 %	471328273
2513	NC_020511	CTTT	2	8	115096	115103	0 %	75 %	0 %	25 %	471328273
2514	NC_020511	ACAG	2	8	115108	115115	50 %	0 %	25 %	25 %	471328273
2515	NC_020511	T	6	6	115140	115145	0 %	100 %	0 %	0 %	471328273
2516	NC_020511	T	6	6	115170	115175	0 %	100 %	0 %	0 %	471328273
2517	NC_020511	CTG	2	6	115265	115270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328273
2518	NC_020511	TTC	2	6	115296	115301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328273
2519	NC_020511	TGTTT	2	10	115321	115330	0 %	80 %	20 %	0 %	471328273
2520	NC_020511	GA	4	8	115341	115348	50 %	0 %	50 %	0 %	471328273
2521	NC_020511	AGAA	2	8	115371	115378	75 %	0 %	25 %	0 %	471328273
2522	NC_020511	ACT	2	6	115381	115386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328273
2523	NC_020511	TCA	2	6	115393	115398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328273
2524	NC_020511	TTG	2	6	115402	115407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328273
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2527	NC_020511	GGA	2	6	115546	115551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328273
2528	NC_020511	TCT	2	6	115556	115561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328273
2529	NC_020511	TTTG	2	8	115589	115596	0 %	75 %	25 %	0 %	471328273
2530	NC_020511	GAT	2	6	115638	115643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328273
2531	NC_020511	CATGT	2	10	115699	115708	20 %	40 %	20 %	20 %	471328273
2532	NC_020511	TCT	2	6	115860	115865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328273
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2537	NC_020511	GGAA	2	8	115978	115985	50 %	0 %	50 %	0 %	471328273
2538	NC_020511	ACC	2	6	116013	116018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328273
2539	NC_020511	TTG	2	6	116099	116104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328273
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2541	NC_020511	ACTTCG	2	12	116161	116172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	471328273
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2545	NC_020511	TCT	2	6	116386	116391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328273
2546	NC_020511	AAGC	2	8	116395	116402	50 %	0 %	25 %	25 %	471328273
2547	NC_020511	TATCG	2	10	116403	116412	20 %	40 %	20 %	20 %	471328273
2548	NC_020511	T	6	6	116419	116424	0 %	100 %	0 %	0 %	471328273
2549	NC_020511	ATG	2	6	116460	116465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_020511	AGT	2	6	116494	116499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020511	A	6	6	116515	116520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020511	TAA	2	6	116546	116551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020511	A	7	7	116568	116574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020511	TTTTAG	2	12	116596	116607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020511	TG	3	6	116612	116617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020511	GGTT	2	8	116727	116734	0 %	50 %	50 %	0 %	471328274
2557	NC_020511	T	7	7	116743	116749	0 %	100 %	0 %	0 %	471328274
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2559	NC_020511	TTTCT	2	10	116919	116928	0 %	80 %	0 %	20 %	471328274
2560	NC_020511	ACA	2	6	116956	116961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328274
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2563	NC_020511	TATC	2	8	117176	117183	25 %	50 %	0 %	25 %	471328274
2564	NC_020511	TTTG	2	8	117273	117280	0 %	75 %	25 %	0 %	471328274
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2568	NC_020511	A	6	6	117413	117418	100 %	0 %	0 %	0 %	471328274
2569	NC_020511	GTTC	2	8	117469	117476	0 %	50 %	25 %	25 %	471328274
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2597	NC_020511	TAA	2	6	118650	118655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020511	AT	3	6	118737	118742	50 %	50 %	0 %	0 %	471328277
2599	NC_020511	T	6	6	118747	118752	0 %	100 %	0 %	0 %	471328277
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2602	NC_020511	G	6	6	118883	118888	0 %	0 %	100 %	0 %	471328277
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2607	NC_020511	A	8	8	119109	119116	100 %	0 %	0 %	0 %	471328277
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2609	NC_020511	AAAGA	2	10	119165	119174	80 %	0 %	20 %	0 %	471328277
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2613	NC_020511	TTA	2	6	119229	119234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328278
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2621	NC_020511	GA	4	8	119724	119731	50 %	0 %	50 %	0 %	471328278
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2626	NC_020511	TAT	2	6	119918	119923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328278
2627	NC_020511	GAT	2	6	119934	119939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328278
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2630	NC_020511	AG	3	6	120159	120164	50 %	0 %	50 %	0 %	471328279
2631	NC_020511	GCTA	2	8	120181	120188	25 %	25 %	25 %	25 %	471328279
2632	NC_020511	GA	3	6	120192	120197	50 %	0 %	50 %	0 %	471328279
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2639	NC_020511	CGGC	2	8	120362	120369	0 %	0 %	50 %	50 %	471328279
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2651	NC_020511	GA	3	6	121021	121026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_020511	TAT	2	6	121045	121050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_020511	ATA	2	6	121066	121071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2665	NC_020511	GTA	2	6	121597	121602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2685	NC_020511	AGA	2	6	122739	122744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2686	NC_020511	TGA	2	6	122751	122756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2693	NC_020511	GCTTC	2	10	123160	123169	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2695	NC_020511	TA	3	6	123261	123266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2745	NC_020511	T	6	6	125406	125411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2746	NC_020511	GCA	2	6	125421	125426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2747	NC_020511	T	7	7	125431	125437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2748	NC_020511	TGAA	2	8	125468	125475	50 %	25 %	25 %	0 %	471328282
2749	NC_020511	TAA	2	6	125763	125768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328282
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