MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020511	TGAT	2	8	70009	70016	25 %	50 %	25 %	0 %	471328236
1502	NC_020511	T	6	6	70057	70062	0 %	100 %	0 %	0 %	471328236
1503	NC_020511	TCT	2	6	70173	70178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328236
1504	NC_020511	GGAGC	2	10	70296	70305	20 %	0 %	60 %	20 %	471328236
1505	NC_020511	TGC	2	6	70379	70384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328236
1506	NC_020511	A	7	7	70416	70422	100 %	0 %	0 %	0 %	471328236
1507	NC_020511	CT	3	6	70424	70429	0 %	50 %	0 %	50 %	471328236
1508	NC_020511	AGA	2	6	70433	70438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328236
1509	NC_020511	GCGAT	2	10	70486	70495	20 %	20 %	40 %	20 %	471328236
1510	NC_020511	GTT	2	6	70508	70513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328236
1511	NC_020511	GCT	2	6	70530	70535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328236
1512	NC_020511	GCA	3	9	70632	70640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328236
1513	NC_020511	AAAG	2	8	70665	70672	75 %	0 %	25 %	0 %	471328236
1514	NC_020511	GCA	2	6	70679	70684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328236
1515	NC_020511	ATT	2	6	70693	70698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328236
1516	NC_020511	TAT	2	6	70801	70806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328236
1517	NC_020511	CTT	2	6	70825	70830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328236
1518	NC_020511	GA	3	6	70834	70839	50 %	0 %	50 %	0 %	471328236
1519	NC_020511	CTCTT	2	10	70840	70849	0 %	60 %	0 %	40 %	471328236
1520	NC_020511	AGAA	2	8	70852	70859	75 %	0 %	25 %	0 %	471328236
1521	NC_020511	TGA	2	6	70880	70885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328236
1522	NC_020511	TTG	2	6	70969	70974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328236
1523	NC_020511	TCT	2	6	70992	70997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328236
1524	NC_020511	GA	3	6	71033	71038	50 %	0 %	50 %	0 %	471328236
1525	NC_020511	AGCT	2	8	71074	71081	25 %	25 %	25 %	25 %	471328236
1526	NC_020511	TGA	2	6	71120	71125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328236
1527	NC_020511	GCAT	2	8	71135	71142	25 %	25 %	25 %	25 %	471328236
1528	NC_020511	AGA	2	6	71153	71158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328236
1529	NC_020511	TCAA	2	8	71279	71286	50 %	25 %	0 %	25 %	471328236
1530	NC_020511	GT	3	6	71309	71314	0 %	50 %	50 %	0 %	471328236
1531	NC_020511	CT	3	6	71390	71395	0 %	50 %	0 %	50 %	471328236
1532	NC_020511	GA	3	6	71411	71416	50 %	0 %	50 %	0 %	471328236
1533	NC_020511	AGT	2	6	71453	71458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328236
1534	NC_020511	AGGGG	2	10	71486	71495	20 %	0 %	80 %	0 %	471328236
1535	NC_020511	AAGAA	2	10	71528	71537	80 %	0 %	20 %	0 %	471328236
1536	NC_020511	AGA	2	6	71600	71605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328236
1537	NC_020511	TGA	2	6	71636	71641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328236
1538	NC_020511	TAT	2	6	71647	71652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328236
1539	NC_020511	T	6	6	71736	71741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020511	T	8	8	71757	71764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020511	CAT	2	6	71822	71827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328237
1542	NC_020511	CCTT	2	8	71851	71858	0 %	50 %	0 %	50 %	471328237
1543	NC_020511	GCTT	2	8	71881	71888	0 %	50 %	25 %	25 %	471328237
1544	NC_020511	A	6	6	71976	71981	100 %	0 %	0 %	0 %	471328237
1545	NC_020511	ATT	2	6	72026	72031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328237
1546	NC_020511	CAA	2	6	72173	72178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328237
1547	NC_020511	TCC	2	6	72197	72202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328237
1548	NC_020511	TTCT	2	8	72219	72226	0 %	75 %	0 %	25 %	471328237
1549	NC_020511	ATG	2	6	72231	72236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328237
1550	NC_020511	GCTT	2	8	72265	72272	0 %	50 %	25 %	25 %	471328237
1551	NC_020511	AGA	2	6	72274	72279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328237
1552	NC_020511	GAGC	2	8	72293	72300	25 %	0 %	50 %	25 %	471328237
1553	NC_020511	TCA	2	6	72318	72323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328237
1554	NC_020511	A	7	7	72325	72331	100 %	0 %	0 %	0 %	471328237
1555	NC_020511	CTATTT	2	12	72336	72347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	471328237
1556	NC_020511	TGA	2	6	72370	72375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328237
1557	NC_020511	ATG	2	6	72408	72413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328237
1558	NC_020511	AGA	2	6	72538	72543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020511	CGT	2	6	72586	72591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_020511	T	7	7	72591	72597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020511	CTTGC	2	10	72617	72626	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_020511	GATA	2	8	72641	72648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020511	TTC	2	6	72732	72737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328238
1564	NC_020511	CTT	2	6	72800	72805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328238
1565	NC_020511	ATTGG	2	10	72818	72827	20 %	40 %	40 %	0 %	471328238
1566	NC_020511	T	6	6	72834	72839	0 %	100 %	0 %	0 %	471328238
1567	NC_020511	AGC	2	6	72849	72854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328238
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1569	NC_020511	ATA	2	6	72962	72967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328238
1570	NC_020511	GCT	2	6	72982	72987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328238
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1572	NC_020511	AAT	2	6	73021	73026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328238
1573	NC_020511	TGG	2	6	73052	73057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328238
1574	NC_020511	T	6	6	73059	73064	0 %	100 %	0 %	0 %	471328238
1575	NC_020511	AGC	2	6	73121	73126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328238
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1577	NC_020511	TGC	2	6	73175	73180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328238
1578	NC_020511	TGT	2	6	73218	73223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328238
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1580	NC_020511	GATT	2	8	73269	73276	25 %	50 %	25 %	0 %	471328238
1581	NC_020511	GAA	2	6	73344	73349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328238
1582	NC_020511	CTGG	2	8	73377	73384	0 %	25 %	50 %	25 %	471328238
1583	NC_020511	CTC	2	6	73397	73402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328238
1584	NC_020511	ACTCTT	2	12	73465	73476	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	471328238
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1586	NC_020511	TGA	2	6	73503	73508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328238
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1588	NC_020511	T	6	6	73618	73623	0 %	100 %	0 %	0 %	471328238
1589	NC_020511	TAG	2	6	73658	73663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328238
1590	NC_020511	TAG	2	6	73667	73672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328238
1591	NC_020511	AGA	2	6	73774	73779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328238
1592	NC_020511	ATCA	2	8	73804	73811	50 %	25 %	0 %	25 %	471328238
1593	NC_020511	TGT	2	6	73877	73882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328238
1594	NC_020511	GAAAA	2	10	73890	73899	80 %	0 %	20 %	0 %	471328238
1595	NC_020511	A	7	7	73896	73902	100 %	0 %	0 %	0 %	471328238
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1598	NC_020511	TTTCTG	2	12	74015	74026	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	471328239
1599	NC_020511	AGA	2	6	74052	74057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328239
1600	NC_020511	GA	3	6	74075	74080	50 %	0 %	50 %	0 %	471328239
1601	NC_020511	TAC	2	6	74100	74105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328239
1602	NC_020511	GATCAT	2	12	74145	74156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	471328239
1603	NC_020511	TGA	2	6	74178	74183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328239
1604	NC_020511	G	6	6	74236	74241	0 %	0 %	100 %	0 %	471328239
1605	NC_020511	TAT	2	6	74248	74253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328239
1606	NC_020511	A	6	6	74284	74289	100 %	0 %	0 %	0 %	471328239
1607	NC_020511	TGGGA	2	10	74307	74316	20 %	20 %	60 %	0 %	471328239
1608	NC_020511	GCT	2	6	74416	74421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328239
1609	NC_020511	TGGA	2	8	74426	74433	25 %	25 %	50 %	0 %	471328239
1610	NC_020511	AGG	2	6	74460	74465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328239
1611	NC_020511	TC	3	6	74562	74567	0 %	50 %	0 %	50 %	471328239
1612	NC_020511	T	6	6	74590	74595	0 %	100 %	0 %	0 %	471328239
1613	NC_020511	AGC	3	9	74634	74642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328239
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1615	NC_020511	ATT	2	6	74773	74778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328239
1616	NC_020511	AAG	2	6	74813	74818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328239
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1618	NC_020511	TGC	2	6	74954	74959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328239
1619	NC_020511	TC	3	6	74969	74974	0 %	50 %	0 %	50 %	471328239
1620	NC_020511	TCA	2	6	75063	75068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328239
1621	NC_020511	ATT	2	6	75113	75118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328239
1622	NC_020511	TCT	2	6	75205	75210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328239
1623	NC_020511	ATG	2	6	75224	75229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328239
1624	NC_020511	AAG	2	6	75379	75384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020511	ACT	2	6	75394	75399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_020511	T	6	6	75405	75410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_020511	CAA	2	6	75456	75461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328240
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