MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1004	NC_020511	AAAG	2	8	46964	46971	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
1005	NC_020511	ATT	3	9	47001	47009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328218
1006	NC_020511	TG	3	6	47019	47024	0 %	50 %	50 %	0 %	471328218
1007	NC_020511	AG	3	6	47072	47077	50 %	0 %	50 %	0 %	471328218
1008	NC_020511	AAGA	2	8	47079	47086	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
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1013	NC_020511	AGA	2	6	47505	47510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328218
1014	NC_020511	AGA	2	6	47564	47569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328218
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1020	NC_020511	AGGA	2	8	47997	48004	50 %	0 %	50 %	0 %	471328218
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1053	NC_020511	TAT	2	6	49398	49403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_020511	AAT	2	6	50320	50325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1120	NC_020511	AGT	3	9	52082	52090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020511	GCA	2	6	52138	52143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1123	NC_020511	GTA	2	6	52170	52175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1125	NC_020511	A	6	6	52206	52211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020511	AAG	2	6	52236	52241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020511	A	7	7	52266	52272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020511	AGC	2	6	52277	52282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_020511	N	216	216	52304	52519	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_020511	A	7	7	52590	52596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_020511	A	7	7	52640	52646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020511	A	6	6	52680	52685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_020511	CAA	2	6	52800	52805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1142	NC_020511	AAT	2	6	52948	52953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_020511	AGTTGT	2	12	58370	58381	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	471328227
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1264	NC_020511	CAT	2	6	58542	58547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328227
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1266	NC_020511	TGT	2	6	58702	58707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328227
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1270	NC_020511	AGGT	2	8	58814	58821	25 %	25 %	50 %	0 %	471328227
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1283	NC_020511	TCT	3	9	59327	59335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328227
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1293	NC_020511	T	6	6	59751	59756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1342	NC_020511	AAAAAT	2	12	61595	61606	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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