MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020511	AGA	2	6	634164	634169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328736
14002	NC_020511	GATA	2	8	634248	634255	50 %	25 %	25 %	0 %	471328736
14003	NC_020511	TCT	2	6	634328	634333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_020511	AT	3	6	634352	634357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020511	A	11	11	634360	634370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_020511	T	6	6	634394	634399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_020511	A	6	6	634461	634466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_020511	CCTG	2	8	634552	634559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_020511	GTC	2	6	634632	634637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328737
14010	NC_020511	TAA	2	6	634640	634645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328737
14011	NC_020511	A	6	6	634644	634649	100 %	0 %	0 %	0 %	471328737
14012	NC_020511	TC	3	6	634652	634657	0 %	50 %	0 %	50 %	471328737
14013	NC_020511	AAG	2	6	634711	634716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328737
14014	NC_020511	GAA	2	6	634746	634751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328737
14015	NC_020511	AGGA	2	8	634792	634799	50 %	0 %	50 %	0 %	471328737
14016	NC_020511	TTA	2	6	634831	634836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328737
14017	NC_020511	CCTC	2	8	634870	634877	0 %	25 %	0 %	75 %	471328737
14018	NC_020511	ATC	2	6	634908	634913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328737
14019	NC_020511	AAC	2	6	635035	635040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328737
14020	NC_020511	A	7	7	635054	635060	100 %	0 %	0 %	0 %	471328737
14021	NC_020511	CT	3	6	635088	635093	0 %	50 %	0 %	50 %	471328737
14022	NC_020511	A	6	6	635214	635219	100 %	0 %	0 %	0 %	471328737
14023	NC_020511	ACA	2	6	635235	635240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328737
14024	NC_020511	AAGA	2	8	635256	635263	75 %	0 %	25 %	0 %	471328737
14025	NC_020511	TCT	2	6	635302	635307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328738
14026	NC_020511	GCA	2	6	635355	635360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328738
14027	NC_020511	CTT	2	6	635371	635376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328738
14028	NC_020511	CTC	2	6	635395	635400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328738
14029	NC_020511	A	6	6	635425	635430	100 %	0 %	0 %	0 %	471328738
14030	NC_020511	CCT	2	6	635490	635495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328738
14031	NC_020511	AAG	2	6	635497	635502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328738
14032	NC_020511	TCC	2	6	635508	635513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328738
14033	NC_020511	CCT	2	6	635605	635610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328738
14034	NC_020511	ATT	2	6	635622	635627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328738
14035	NC_020511	ACA	2	6	635660	635665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328738
14036	NC_020511	CCT	2	6	635670	635675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328738
14037	NC_020511	A	6	6	635757	635762	100 %	0 %	0 %	0 %	471328738
14038	NC_020511	TCGAG	2	10	635767	635776	20 %	20 %	40 %	20 %	471328738
14039	NC_020511	T	6	6	635794	635799	0 %	100 %	0 %	0 %	471328738
14040	NC_020511	TTG	2	6	635824	635829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328738
14041	NC_020511	TTA	2	6	635866	635871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328738
14042	NC_020511	CAA	2	6	635943	635948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328738
14043	NC_020511	ATC	2	6	635970	635975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328738
14044	NC_020511	TCA	2	6	635986	635991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328738
14045	NC_020511	CTTT	2	8	636040	636047	0 %	75 %	0 %	25 %	471328738
14046	NC_020511	ATG	3	9	636090	636098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328738
14047	NC_020511	TC	4	8	636115	636122	0 %	50 %	0 %	50 %	471328738
14048	NC_020511	CTA	2	6	636168	636173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328738
14049	NC_020511	TGA	2	6	636181	636186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328738
14050	NC_020511	CAA	2	6	636225	636230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328739
14051	NC_020511	TTTG	2	8	636244	636251	0 %	75 %	25 %	0 %	471328739
14052	NC_020511	TTA	2	6	636272	636277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328739
14053	NC_020511	CTC	2	6	636294	636299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328739
14054	NC_020511	TAT	2	6	636301	636306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328739
14055	NC_020511	TGG	2	6	636330	636335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328739
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14057	NC_020511	GGCT	2	8	636428	636435	0 %	25 %	50 %	25 %	471328739
14058	NC_020511	TGC	2	6	636457	636462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328739
14059	NC_020511	GGCTC	2	10	636531	636540	0 %	20 %	40 %	40 %	471328740
14060	NC_020511	TA	3	6	636554	636559	50 %	50 %	0 %	0 %	471328740
14061	NC_020511	AGCC	2	8	636567	636574	25 %	0 %	25 %	50 %	471328740
14062	NC_020511	TCTT	2	8	636591	636598	0 %	75 %	0 %	25 %	471328740
14063	NC_020511	ATC	2	6	636632	636637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328740
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14065	NC_020511	TGC	2	6	636705	636710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328740
14066	NC_020511	CTT	2	6	636773	636778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328740
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14068	NC_020511	CT	3	6	636901	636906	0 %	50 %	0 %	50 %	471328740
14069	NC_020511	ATT	2	6	636948	636953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328740
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14071	NC_020511	ATC	2	6	637025	637030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328740
14072	NC_020511	ATG	2	6	637058	637063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328740
14073	NC_020511	CAG	2	6	637143	637148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328740
14074	NC_020511	ATC	2	6	637184	637189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328740
14075	NC_020511	CTC	2	6	637200	637205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328740
14076	NC_020511	CTAC	2	8	637219	637226	25 %	25 %	0 %	50 %	471328740
14077	NC_020511	TGG	2	6	637274	637279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328740
14078	NC_020511	ATT	2	6	637299	637304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328740
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14080	NC_020511	TCC	2	6	637354	637359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328740
14081	NC_020511	A	8	8	637376	637383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020511	T	6	6	637394	637399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_020511	GGAG	2	8	637400	637407	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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14085	NC_020511	TTG	2	6	637434	637439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_020511	TGC	2	6	637478	637483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328741
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14088	NC_020511	CAA	2	6	637677	637682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328741
14089	NC_020511	CAC	2	6	637737	637742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328741
14090	NC_020511	C	6	6	637783	637788	0 %	0 %	0 %	100 %	471328741
14091	NC_020511	TG	3	6	637801	637806	0 %	50 %	50 %	0 %	471328741
14092	NC_020511	GAG	2	6	637862	637867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328741
14093	NC_020511	CT	3	6	637868	637873	0 %	50 %	0 %	50 %	471328741
14094	NC_020511	T	7	7	637907	637913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_020511	ATTAA	2	10	637920	637929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_020511	A	6	6	637974	637979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_020511	TCT	2	6	637996	638001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328742
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14099	NC_020511	CTT	2	6	638092	638097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328742
14100	NC_020511	AAAG	2	8	638105	638112	75 %	0 %	25 %	0 %	471328742
14101	NC_020511	GCA	2	6	638195	638200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328742
14102	NC_020511	CTG	2	6	638230	638235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328742
14103	NC_020511	CG	3	6	638237	638242	0 %	0 %	50 %	50 %	471328742
14104	NC_020511	GAA	2	6	638310	638315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328742
14105	NC_020511	CAAC	2	8	638428	638435	50 %	0 %	0 %	50 %	471328742
14106	NC_020511	GGA	2	6	638451	638456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328742
14107	NC_020511	AAT	2	6	638500	638505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328742
14108	NC_020511	AGCA	2	8	638518	638525	50 %	0 %	25 %	25 %	471328742
14109	NC_020511	GAA	2	6	638618	638623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328742
14110	NC_020511	ATT	2	6	638680	638685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328742
14111	NC_020511	GGC	2	6	638687	638692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328742
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14113	NC_020511	GCTCT	2	10	638772	638781	0 %	40 %	20 %	40 %	471328742
14114	NC_020511	TCGTT	2	10	638800	638809	0 %	60 %	20 %	20 %	471328742
14115	NC_020511	TTG	2	6	638842	638847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328742
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14117	NC_020511	GCA	2	6	638912	638917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328742
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14119	NC_020511	AAAAT	2	10	638963	638972	80 %	20 %	0 %	0 %	471328742
14120	NC_020511	TGG	2	6	639018	639023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328743
14121	NC_020511	CCTT	2	8	639035	639042	0 %	50 %	0 %	50 %	471328743
14122	NC_020511	TCCAT	2	10	639101	639110	20 %	40 %	0 %	40 %	471328743
14123	NC_020511	AGAA	2	8	639111	639118	75 %	0 %	25 %	0 %	471328743
14124	NC_020511	CCT	2	6	639152	639157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328743
14125	NC_020511	CT	3	6	639156	639161	0 %	50 %	0 %	50 %	471328743
14126	NC_020511	CTA	2	6	639170	639175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328743
14127	NC_020511	GAAA	2	8	639264	639271	75 %	0 %	25 %	0 %	471328743
14128	NC_020511	A	6	6	639269	639274	100 %	0 %	0 %	0 %	471328743
14129	NC_020511	CTCTTT	2	12	639372	639383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328743
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14149	NC_020511	AAG	2	6	640002	640007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328745
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14153	NC_020511	CAC	2	6	640051	640056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328745
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14160	NC_020511	TTC	2	6	640297	640302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14161	NC_020511	CCT	2	6	640311	640316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14162	NC_020511	GAA	2	6	640350	640355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328746
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14164	NC_020511	ACC	2	6	640484	640489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328746
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14189	NC_020511	CCT	2	6	641501	641506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14190	NC_020511	CGGAA	2	10	641717	641726	40 %	0 %	40 %	20 %	471328747
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14235	NC_020511	T	7	7	643872	643878	0 %	100 %	0 %	0 %	471328748
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14244	NC_020511	AGA	2	6	644332	644337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328748
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14246	NC_020511	TCT	2	6	644360	644365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328748
14247	NC_020511	GCT	2	6	644372	644377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328748
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14367	NC_020511	TAA	2	6	649789	649794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328752
14368	NC_020511	A	6	6	649793	649798	100 %	0 %	0 %	0 %	471328752
14369	NC_020511	TGC	2	6	649822	649827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328752
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14475	NC_020511	TTG	2	6	654778	654783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14477	NC_020511	A	7	7	654831	654837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14478	NC_020511	A	6	6	654847	654852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_020511	TA	3	6	654870	654875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14481	NC_020511	T	6	6	655014	655019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14482	NC_020511	AAG	2	6	655057	655062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328757
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14490	NC_020511	GCT	2	6	655452	655457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328757
14491	NC_020511	GAA	2	6	655512	655517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328757
14492	NC_020511	CCTT	2	8	655574	655581	0 %	50 %	0 %	50 %	471328757
14493	NC_020511	TCT	2	6	655620	655625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328757
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