MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_020511	TAC	2	6	612054	612059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_020511	ATG	2	6	612071	612076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_020511	A	6	6	612106	612111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_020511	AC	3	6	612179	612184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13505	NC_020511	CCT	2	6	612231	612236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328720
13506	NC_020511	TCT	2	6	612304	612309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328720
13507	NC_020511	TTC	2	6	612333	612338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328720
13508	NC_020511	TGCCA	2	10	612365	612374	20 %	20 %	20 %	40 %	471328720
13509	NC_020511	GTA	2	6	612424	612429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328720
13510	NC_020511	CT	3	6	612430	612435	0 %	50 %	0 %	50 %	471328720
13511	NC_020511	GATT	2	8	612514	612521	25 %	50 %	25 %	0 %	471328720
13512	NC_020511	TCT	2	6	612541	612546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328720
13513	NC_020511	TC	3	6	612551	612556	0 %	50 %	0 %	50 %	471328720
13514	NC_020511	GGTT	2	8	612597	612604	0 %	50 %	50 %	0 %	471328720
13515	NC_020511	GGATGG	2	12	612609	612620	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	471328720
13516	NC_020511	AG	4	8	612662	612669	50 %	0 %	50 %	0 %	471328720
13517	NC_020511	TGG	2	6	612675	612680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328720
13518	NC_020511	ATA	2	6	612700	612705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328720
13519	NC_020511	GGCGC	2	10	612760	612769	0 %	0 %	60 %	40 %	471328720
13520	NC_020511	ATT	2	6	612786	612791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328720
13521	NC_020511	TAT	2	6	612794	612799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328720
13522	NC_020511	ATCG	2	8	612816	612823	25 %	25 %	25 %	25 %	471328720
13523	NC_020511	AGA	2	6	612878	612883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328720
13524	NC_020511	GAA	2	6	612900	612905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328720
13525	NC_020511	AG	3	6	612939	612944	50 %	0 %	50 %	0 %	471328720
13526	NC_020511	CT	3	6	612945	612950	0 %	50 %	0 %	50 %	471328720
13527	NC_020511	TTAC	2	8	612967	612974	25 %	50 %	0 %	25 %	471328720
13528	NC_020511	TAA	2	6	612983	612988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328720
13529	NC_020511	CCT	2	6	613012	613017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328720
13530	NC_020511	TTTA	2	8	613020	613027	25 %	75 %	0 %	0 %	471328720
13531	NC_020511	CT	3	6	613060	613065	0 %	50 %	0 %	50 %	471328720
13532	NC_020511	ATT	2	6	613084	613089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328720
13533	NC_020511	TTTG	2	8	613118	613125	0 %	75 %	25 %	0 %	471328720
13534	NC_020511	ATT	2	6	613136	613141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328720
13535	NC_020511	GGCT	2	8	613158	613165	0 %	25 %	50 %	25 %	471328720
13536	NC_020511	TCT	2	6	613210	613215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328720
13537	NC_020511	ATT	2	6	613223	613228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328720
13538	NC_020511	TGG	2	6	613272	613277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328720
13539	NC_020511	T	6	6	613307	613312	0 %	100 %	0 %	0 %	471328720
13540	NC_020511	ATG	2	6	613329	613334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328720
13541	NC_020511	ATTGG	2	10	613335	613344	20 %	40 %	40 %	0 %	471328720
13542	NC_020511	A	6	6	613365	613370	100 %	0 %	0 %	0 %	471328720
13543	NC_020511	AGC	2	6	613418	613423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328720
13544	NC_020511	TTG	2	6	613480	613485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328720
13545	NC_020511	TCAA	2	8	613645	613652	50 %	25 %	0 %	25 %	471328721
13546	NC_020511	TTG	2	6	613658	613663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328721
13547	NC_020511	CGCT	2	8	613691	613698	0 %	25 %	25 %	50 %	471328721
13548	NC_020511	TTTG	2	8	613716	613723	0 %	75 %	25 %	0 %	471328721
13549	NC_020511	ATC	2	6	613771	613776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328721
13550	NC_020511	A	9	9	613816	613824	100 %	0 %	0 %	0 %	471328721
13551	NC_020511	CTT	2	6	613858	613863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328721
13552	NC_020511	GAA	2	6	613873	613878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
13553	NC_020511	TTTG	2	8	613892	613899	0 %	75 %	25 %	0 %	471328721
13554	NC_020511	CTCTC	2	10	613900	613909	0 %	40 %	0 %	60 %	471328721
13555	NC_020511	ATAG	2	8	613945	613952	50 %	25 %	25 %	0 %	471328721
13556	NC_020511	GAA	2	6	614038	614043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
13557	NC_020511	AAG	2	6	614084	614089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
13558	NC_020511	AGA	2	6	614124	614129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
13559	NC_020511	GAA	2	6	614146	614151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
13560	NC_020511	AAAAC	2	10	614160	614169	80 %	0 %	0 %	20 %	471328721
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13562	NC_020511	GCTC	2	8	614289	614296	0 %	25 %	25 %	50 %	471328721
13563	NC_020511	AG	3	6	614323	614328	50 %	0 %	50 %	0 %	471328721
13564	NC_020511	TAG	2	6	614388	614393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328721
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13566	NC_020511	GCA	2	6	614437	614442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328721
13567	NC_020511	CTATC	2	10	614517	614526	20 %	40 %	0 %	40 %	471328721
13568	NC_020511	A	8	8	614546	614553	100 %	0 %	0 %	0 %	471328721
13569	NC_020511	AGA	2	6	614565	614570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
13570	NC_020511	CTT	2	6	614595	614600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328721
13571	NC_020511	AGA	2	6	614601	614606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
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13573	NC_020511	TAT	3	9	614727	614735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328721
13574	NC_020511	ATT	2	6	614776	614781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328721
13575	NC_020511	TTC	2	6	614896	614901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328721
13576	NC_020511	TCA	2	6	614909	614914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328721
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13579	NC_020511	TTA	2	6	614978	614983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328721
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13581	NC_020511	TGTA	2	8	615185	615192	25 %	50 %	25 %	0 %	471328721
13582	NC_020511	A	6	6	615229	615234	100 %	0 %	0 %	0 %	471328721
13583	NC_020511	TGC	2	6	615267	615272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328721
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13586	NC_020511	A	7	7	615454	615460	100 %	0 %	0 %	0 %	471328721
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13588	NC_020511	TTC	2	6	615518	615523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328721
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13590	NC_020511	CAT	2	6	615662	615667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328721
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13593	NC_020511	TAA	2	6	615969	615974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328721
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13599	NC_020511	AG	4	8	616251	616258	50 %	0 %	50 %	0 %	471328721
13600	NC_020511	A	7	7	616259	616265	100 %	0 %	0 %	0 %	471328721
13601	NC_020511	A	6	6	616312	616317	100 %	0 %	0 %	0 %	471328721
13602	NC_020511	TGG	2	6	616343	616348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328721
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13607	NC_020511	TC	3	6	616511	616516	0 %	50 %	0 %	50 %	471328721
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13612	NC_020511	A	6	6	616738	616743	100 %	0 %	0 %	0 %	471328721
13613	NC_020511	GAA	2	6	616831	616836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328721
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13621	NC_020511	TTAT	2	8	617107	617114	25 %	75 %	0 %	0 %	471328721
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13993	NC_020511	CTAC	2	8	633801	633808	25 %	25 %	0 %	50 %	471328736
13994	NC_020511	TCC	2	6	633834	633839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328736
13995	NC_020511	AGA	2	6	633849	633854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328736
13996	NC_020511	ATGCT	2	10	633881	633890	20 %	40 %	20 %	20 %	471328736
13997	NC_020511	ACGGA	2	10	634015	634024	40 %	0 %	40 %	20 %	471328736
13998	NC_020511	ATT	2	6	634034	634039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328736
13999	NC_020511	GGA	2	6	634092	634097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328736
14000	NC_020511	CTT	2	6	634140	634145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328736

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