MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020511	GCA	2	6	274885	274890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328415
6002	NC_020511	GAAA	2	8	274902	274909	75 %	0 %	25 %	0 %	471328415
6003	NC_020511	TG	3	6	274946	274951	0 %	50 %	50 %	0 %	471328415
6004	NC_020511	TGG	2	6	274983	274988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328415
6005	NC_020511	GCA	2	6	275011	275016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328415
6006	NC_020511	TCT	2	6	275041	275046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328415
6007	NC_020511	TCCCT	2	10	275125	275134	0 %	40 %	0 %	60 %	471328415
6008	NC_020511	ATT	2	6	275143	275148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328415
6009	NC_020511	ATGG	2	8	275156	275163	25 %	25 %	50 %	0 %	471328415
6010	NC_020511	TCTT	2	8	275235	275242	0 %	75 %	0 %	25 %	471328415
6011	NC_020511	ATTT	2	8	275264	275271	25 %	75 %	0 %	0 %	471328415
6012	NC_020511	CAC	2	6	275302	275307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328415
6013	NC_020511	CAA	2	6	275311	275316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328415
6014	NC_020511	TAT	2	6	275328	275333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328415
6015	NC_020511	TCT	2	6	275415	275420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328415
6016	NC_020511	ATCCT	2	10	275429	275438	20 %	40 %	0 %	40 %	471328415
6017	NC_020511	GAT	2	6	275482	275487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328415
6018	NC_020511	AGA	2	6	275577	275582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328415
6019	NC_020511	TGA	2	6	275641	275646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328416
6020	NC_020511	AGGAG	2	10	275680	275689	40 %	0 %	60 %	0 %	471328416
6021	NC_020511	GCT	2	6	275780	275785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328416
6022	NC_020511	TGGAAT	2	12	275791	275802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328416
6023	NC_020511	AGC	2	6	275806	275811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328416
6024	NC_020511	ATT	2	6	275831	275836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328416
6025	NC_020511	TC	3	6	275856	275861	0 %	50 %	0 %	50 %	471328416
6026	NC_020511	TGC	2	6	275866	275871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328416
6027	NC_020511	GCA	2	6	275891	275896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328416
6028	NC_020511	TAT	2	6	275903	275908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328416
6029	NC_020511	GCT	2	6	275960	275965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328416
6030	NC_020511	CTT	2	6	276068	276073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328416
6031	NC_020511	AAC	2	6	276092	276097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328416
6032	NC_020511	AGA	2	6	276154	276159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328416
6033	NC_020511	AAG	2	6	276195	276200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328416
6034	NC_020511	GCT	2	6	276254	276259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328416
6035	NC_020511	AAC	2	6	276270	276275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328416
6036	NC_020511	CT	3	6	276284	276289	0 %	50 %	0 %	50 %	471328416
6037	NC_020511	ACGA	2	8	276307	276314	50 %	0 %	25 %	25 %	471328416
6038	NC_020511	CTC	2	6	276338	276343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328416
6039	NC_020511	A	7	7	276353	276359	100 %	0 %	0 %	0 %	471328416
6040	NC_020511	TTGTC	2	10	276367	276376	0 %	60 %	20 %	20 %	471328416
6041	NC_020511	GAA	2	6	276380	276385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328416
6042	NC_020511	ATT	2	6	276390	276395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328416
6043	NC_020511	ACG	2	6	276422	276427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328416
6044	NC_020511	ATC	2	6	276456	276461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328416
6045	NC_020511	CTC	2	6	276462	276467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328416
6046	NC_020511	ATA	2	6	276501	276506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328416
6047	NC_020511	A	6	6	276561	276566	100 %	0 %	0 %	0 %	471328416
6048	NC_020511	A	6	6	276651	276656	100 %	0 %	0 %	0 %	471328417
6049	NC_020511	TGGT	2	8	276740	276747	0 %	50 %	50 %	0 %	471328417
6050	NC_020511	AAG	2	6	276766	276771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328417
6051	NC_020511	GAA	2	6	276858	276863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328417
6052	NC_020511	TGT	2	6	276866	276871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328417
6053	NC_020511	ATG	2	6	276951	276956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328417
6054	NC_020511	TCCG	2	8	276961	276968	0 %	25 %	25 %	50 %	471328417
6055	NC_020511	ACC	2	6	276971	276976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328417
6056	NC_020511	CTC	2	6	276985	276990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328417
6057	NC_020511	A	7	7	277037	277043	100 %	0 %	0 %	0 %	471328417
6058	NC_020511	CT	3	6	277068	277073	0 %	50 %	0 %	50 %	471328417
6059	NC_020511	GGA	2	6	277095	277100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328417
6060	NC_020511	AAAG	2	8	277109	277116	75 %	0 %	25 %	0 %	471328417
6061	NC_020511	CTC	2	6	277129	277134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328417
6062	NC_020511	TA	3	6	277191	277196	50 %	50 %	0 %	0 %	471328417
6063	NC_020511	GAA	2	6	277197	277202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328417
6064	NC_020511	GCT	2	6	277245	277250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328417
6065	NC_020511	C	6	6	277297	277302	0 %	0 %	0 %	100 %	471328417
6066	NC_020511	ATT	2	6	277310	277315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328417
6067	NC_020511	CT	3	6	277344	277349	0 %	50 %	0 %	50 %	471328417
6068	NC_020511	ATTGT	2	10	277357	277366	20 %	60 %	20 %	0 %	471328417
6069	NC_020511	AATT	2	8	277403	277410	50 %	50 %	0 %	0 %	471328417
6070	NC_020511	ATT	2	6	277437	277442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328417
6071	NC_020511	A	6	6	277523	277528	100 %	0 %	0 %	0 %	471328417
6072	NC_020511	CAG	2	6	277578	277583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328417
6073	NC_020511	AGA	3	9	277592	277600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328417
6074	NC_020511	AGG	2	6	277607	277612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328417
6075	NC_020511	TTCT	2	8	277613	277620	0 %	75 %	0 %	25 %	471328417
6076	NC_020511	TCC	2	6	277673	277678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328417
6077	NC_020511	GCT	2	6	277683	277688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328417
6078	NC_020511	AAC	2	6	277714	277719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328417
6079	NC_020511	AGCT	2	8	277738	277745	25 %	25 %	25 %	25 %	471328417
6080	NC_020511	TGAT	2	8	277789	277796	25 %	50 %	25 %	0 %	471328417
6081	NC_020511	CTC	2	6	277836	277841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328417
6082	NC_020511	AAG	2	6	277871	277876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328417
6083	NC_020511	CTT	2	6	277888	277893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_020511	TCT	2	6	277894	277899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328418
6085	NC_020511	AAG	2	6	277900	277905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328418
6086	NC_020511	C	6	6	277976	277981	0 %	0 %	0 %	100 %	471328418
6087	NC_020511	CTT	2	6	277997	278002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328418
6088	NC_020511	TA	3	6	278054	278059	50 %	50 %	0 %	0 %	471328418
6089	NC_020511	TCT	2	6	278139	278144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328418
6090	NC_020511	GA	3	6	278146	278151	50 %	0 %	50 %	0 %	471328418
6091	NC_020511	TTG	2	6	278188	278193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328418
6092	NC_020511	AGA	2	6	278256	278261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328418
6093	NC_020511	CCAT	2	8	278316	278323	25 %	25 %	0 %	50 %	471328418
6094	NC_020511	ATT	2	6	278501	278506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328418
6095	NC_020511	AAC	2	6	278507	278512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328418
6096	NC_020511	GCT	2	6	278514	278519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328418
6097	NC_020511	ATT	2	6	278522	278527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328418
6098	NC_020511	CATAG	2	10	278552	278561	40 %	20 %	20 %	20 %	471328418
6099	NC_020511	TC	3	6	278605	278610	0 %	50 %	0 %	50 %	471328418
6100	NC_020511	AAAT	2	8	278637	278644	75 %	25 %	0 %	0 %	471328418
6101	NC_020511	GCT	2	6	278754	278759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328418
6102	NC_020511	AACTT	2	10	278893	278902	40 %	40 %	0 %	20 %	471328418
6103	NC_020511	CCAA	2	8	278917	278924	50 %	0 %	0 %	50 %	471328418
6104	NC_020511	CAA	2	6	278977	278982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328418
6105	NC_020511	CAA	2	6	279052	279057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328418
6106	NC_020511	CTTC	2	8	279090	279097	0 %	50 %	0 %	50 %	471328418
6107	NC_020511	ATA	2	6	279102	279107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328418
6108	NC_020511	ATAA	2	8	279182	279189	75 %	25 %	0 %	0 %	471328418
6109	NC_020511	GAA	2	6	279205	279210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328418
6110	NC_020511	AAAT	2	8	279218	279225	75 %	25 %	0 %	0 %	471328418
6111	NC_020511	TC	3	6	279236	279241	0 %	50 %	0 %	50 %	471328418
6112	NC_020511	GAA	2	6	279253	279258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328418
6113	NC_020511	TAA	2	6	279335	279340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328418
6114	NC_020511	CAT	2	6	279344	279349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328418
6115	NC_020511	ACG	2	6	279440	279445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328418
6116	NC_020511	ATT	2	6	279665	279670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328418
6117	NC_020511	GGAACA	2	12	279678	279689	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	471328418
6118	NC_020511	ATGCT	2	10	279756	279765	20 %	40 %	20 %	20 %	471328418
6119	NC_020511	TCT	2	6	279877	279882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328418
6120	NC_020511	CAT	2	6	280000	280005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328418
6121	NC_020511	CTT	2	6	280054	280059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328418
6122	NC_020511	AGA	2	6	280071	280076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328418
6123	NC_020511	GTA	2	6	280133	280138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328418
6124	NC_020511	ATA	2	6	280160	280165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328418
6125	NC_020511	ACC	2	6	280183	280188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328418
6126	NC_020511	CCAT	2	8	280195	280202	25 %	25 %	0 %	50 %	471328418
6127	NC_020511	GAG	2	6	280255	280260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471328418
6128	NC_020511	GCTT	2	8	280296	280303	0 %	50 %	25 %	25 %	471328418
6129	NC_020511	GTTT	2	8	280363	280370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_020511	ATATTA	2	12	280386	280397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_020511	AAAG	2	8	280398	280405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_020511	A	6	6	280453	280458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_020511	T	6	6	280477	280482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_020511	AGG	2	6	280488	280493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_020511	GCA	2	6	280572	280577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328419
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6137	NC_020511	TCT	2	6	280600	280605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328419
6138	NC_020511	GCA	2	6	280630	280635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328419
6139	NC_020511	TTA	2	6	280745	280750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328419
6140	NC_020511	AGC	2	6	280761	280766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328419
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6143	NC_020511	AGG	2	6	280871	280876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6144	NC_020511	TGCC	2	8	280886	280893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6145	NC_020511	TCT	2	6	280906	280911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328420
6146	NC_020511	TGA	2	6	280935	280940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328420
6147	NC_020511	CT	3	6	280983	280988	0 %	50 %	0 %	50 %	471328420
6148	NC_020511	ATC	2	6	280989	280994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328420
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6151	NC_020511	GA	3	6	281051	281056	50 %	0 %	50 %	0 %	471328420
6152	NC_020511	AAAG	2	8	281083	281090	75 %	0 %	25 %	0 %	471328420
6153	NC_020511	ATA	2	6	281181	281186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328420
6154	NC_020511	CAT	2	6	281249	281254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328420
6155	NC_020511	TAA	2	6	281256	281261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328420
6156	NC_020511	GTT	2	6	281329	281334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328420
6157	NC_020511	GAT	2	6	281362	281367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328420
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6159	NC_020511	A	6	6	281437	281442	100 %	0 %	0 %	0 %	471328420
6160	NC_020511	TAAT	2	8	281504	281511	50 %	50 %	0 %	0 %	471328420
6161	NC_020511	TTC	2	6	281514	281519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328420
6162	NC_020511	AGA	2	6	281550	281555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328420
6163	NC_020511	GAA	2	6	281601	281606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328420
6164	NC_020511	CTT	2	6	281609	281614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328420
6165	NC_020511	TCC	2	6	281784	281789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328420
6166	NC_020511	CAG	2	6	281792	281797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328420
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6168	NC_020511	CACGCG	2	12	282051	282062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	471328420
6169	NC_020511	ATT	3	9	282075	282083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328420
6170	NC_020511	TTTCTT	2	12	282230	282241	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	471328420
6171	NC_020511	A	6	6	282316	282321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6172	NC_020511	TAC	2	6	282325	282330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6173	NC_020511	TCT	2	6	282354	282359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328421
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6176	NC_020511	TTG	2	6	282418	282423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328421
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6179	NC_020511	CAT	2	6	282508	282513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328421
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6182	NC_020511	CAG	2	6	282570	282575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328421
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6185	NC_020511	TATC	2	8	282693	282700	25 %	50 %	0 %	25 %	471328421
6186	NC_020511	AGCT	2	8	282714	282721	25 %	25 %	25 %	25 %	471328421
6187	NC_020511	CTG	2	6	282880	282885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328421
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6199	NC_020511	AGT	2	6	283582	283587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328421
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6203	NC_020511	TAT	2	6	283677	283682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328421
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6211	NC_020511	TCT	2	6	284126	284131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328421
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6213	NC_020511	ATG	2	6	284187	284192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328421
6214	NC_020511	CTA	2	6	284283	284288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328421
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6219	NC_020511	TAC	2	6	284542	284547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328421
6220	NC_020511	GCT	2	6	284592	284597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328421
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6223	NC_020511	CGTT	2	8	284692	284699	0 %	50 %	25 %	25 %	471328421
6224	NC_020511	ATTC	2	8	284701	284708	25 %	50 %	0 %	25 %	471328421
6225	NC_020511	GGGA	2	8	284734	284741	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6226	NC_020511	CAAA	2	8	284779	284786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6227	NC_020511	C	6	6	284941	284946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6228	NC_020511	AT	4	8	285000	285007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6229	NC_020511	CAT	2	6	285020	285025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328422
6230	NC_020511	T	9	9	285025	285033	0 %	100 %	0 %	0 %	471328422
6231	NC_020511	TTC	2	6	285109	285114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328422
6232	NC_020511	GT	3	6	285133	285138	0 %	50 %	50 %	0 %	471328422
6233	NC_020511	CTG	2	6	285189	285194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328422
6234	NC_020511	CCA	2	6	285314	285319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328422
6235	NC_020511	A	6	6	285324	285329	100 %	0 %	0 %	0 %	471328422
6236	NC_020511	CAC	2	6	285505	285510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328422
6237	NC_020511	CCT	2	6	285539	285544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328422
6238	NC_020511	CTCC	2	8	285587	285594	0 %	25 %	0 %	75 %	471328422
6239	NC_020511	AAGC	2	8	285609	285616	50 %	0 %	25 %	25 %	471328422
6240	NC_020511	ATG	2	6	285626	285631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328422
6241	NC_020511	T	6	6	285682	285687	0 %	100 %	0 %	0 %	471328422
6242	NC_020511	CTC	2	6	285688	285693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328422
6243	NC_020511	GAT	2	6	285737	285742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328422
6244	NC_020511	A	7	7	285743	285749	100 %	0 %	0 %	0 %	471328422
6245	NC_020511	AG	3	6	285810	285815	50 %	0 %	50 %	0 %	471328422
6246	NC_020511	CT	3	6	285852	285857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6247	NC_020511	AGA	2	6	285863	285868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6495	NC_020511	TACT	2	8	296586	296593	25 %	50 %	0 %	25 %	471328434
6496	NC_020511	CTTT	2	8	296710	296717	0 %	75 %	0 %	25 %	471328434
6497	NC_020511	AAAATA	2	12	296736	296747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	471328434
6498	NC_020511	AAAC	2	8	296757	296764	75 %	0 %	0 %	25 %	471328434
6499	NC_020511	ACT	2	6	296799	296804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328434
6500	NC_020511	ACT	2	6	296897	296902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328434

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