MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020511	AGT	2	6	252495	252500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328393
5503	NC_020511	GCAG	2	8	252542	252549	25 %	0 %	50 %	25 %	471328393
5504	NC_020511	TCTT	2	8	252559	252566	0 %	75 %	0 %	25 %	471328393
5505	NC_020511	C	7	7	252571	252577	0 %	0 %	0 %	100 %	471328393
5506	NC_020511	AGA	2	6	252587	252592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328393
5507	NC_020511	ACA	2	6	252619	252624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328393
5508	NC_020511	TC	3	6	252661	252666	0 %	50 %	0 %	50 %	471328393
5509	NC_020511	TTG	2	6	252718	252723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328393
5510	NC_020511	TCT	2	6	252740	252745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328393
5511	NC_020511	CAA	2	6	252797	252802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328393
5512	NC_020511	AGA	3	9	252870	252878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328393
5513	NC_020511	GGC	2	6	252881	252886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471328393
5514	NC_020511	ACA	2	6	252911	252916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328393
5515	NC_020511	CAC	2	6	252918	252923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328393
5516	NC_020511	CAG	2	6	252924	252929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328393
5517	NC_020511	T	8	8	252993	253000	0 %	100 %	0 %	0 %	471328393
5518	NC_020511	TCC	2	6	253084	253089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_020511	GAAA	2	8	253105	253112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020511	T	7	7	253126	253132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020511	GCAG	2	8	253154	253161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_020511	AGAA	2	8	253187	253194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_020511	AG	3	6	253229	253234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_020511	TAT	2	6	253252	253257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_020511	ACA	2	6	253293	253298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_020511	A	6	6	253342	253347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_020511	TTG	2	6	253522	253527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328394
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5529	NC_020511	TC	3	6	253591	253596	0 %	50 %	0 %	50 %	471328394
5530	NC_020511	T	7	7	253627	253633	0 %	100 %	0 %	0 %	471328394
5531	NC_020511	CCA	2	6	253640	253645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328394
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5533	NC_020511	AATA	2	8	253747	253754	75 %	25 %	0 %	0 %	471328394
5534	NC_020511	GCT	2	6	253757	253762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328394
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5538	NC_020511	CCCA	2	8	254010	254017	25 %	0 %	0 %	75 %	471328395
5539	NC_020511	CTT	2	6	254139	254144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328395
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5541	NC_020511	CTC	2	6	254229	254234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328395
5542	NC_020511	ACT	2	6	254237	254242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328395
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5545	NC_020511	GCAA	2	8	254300	254307	50 %	0 %	25 %	25 %	471328395
5546	NC_020511	AAC	2	6	254317	254322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328395
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5549	NC_020511	A	6	6	254415	254420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020511	TAA	2	6	254466	254471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020511	TTC	2	6	254484	254489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328396
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5553	NC_020511	AGCA	2	8	254562	254569	50 %	0 %	25 %	25 %	471328396
5554	NC_020511	CTT	2	6	254579	254584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328396
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5559	NC_020511	TCC	2	6	254724	254729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328396
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5569	NC_020511	TA	3	6	255035	255040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5571	NC_020511	A	7	7	255094	255100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5579	NC_020511	A	6	6	255504	255509	100 %	0 %	0 %	0 %	471328397
5580	NC_020511	A	7	7	255535	255541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_020511	ATA	2	6	255548	255553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_020511	T	6	6	256079	256084	0 %	100 %	0 %	0 %	471328398
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5598	NC_020511	GAG	2	6	256517	256522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_020511	ATT	2	6	256529	256534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328399
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5612	NC_020511	AAG	2	6	256967	256972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328399
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5616	NC_020511	TAT	2	6	257221	257226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_020511	ATA	2	6	257230	257235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_020511	AAT	2	6	257254	257259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_020511	A	8	8	257334	257341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_020511	TC	3	6	257342	257347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5621	NC_020511	TC	3	6	257428	257433	0 %	50 %	0 %	50 %	471328400
5622	NC_020511	A	6	6	257437	257442	100 %	0 %	0 %	0 %	471328400
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5625	NC_020511	T	7	7	257539	257545	0 %	100 %	0 %	0 %	471328400
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5628	NC_020511	T	6	6	257580	257585	0 %	100 %	0 %	0 %	471328400
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5747	NC_020511	A	6	6	262814	262819	100 %	0 %	0 %	0 %	471328404
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5999	NC_020511	T	7	7	274822	274828	0 %	100 %	0 %	0 %	471328415
6000	NC_020511	CTG	3	9	274855	274863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328415

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