MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 22964

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020511	GTC	2	6	206718	206723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328352
4502	NC_020511	ATG	2	6	206727	206732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328352
4503	NC_020511	CTG	2	6	206815	206820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328352
4504	NC_020511	CTT	2	6	206875	206880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328352
4505	NC_020511	AGA	2	6	206894	206899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328352
4506	NC_020511	TTG	2	6	206950	206955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328352
4507	NC_020511	GATG	2	8	206971	206978	25 %	25 %	50 %	0 %	471328352
4508	NC_020511	ATTC	2	8	207044	207051	25 %	50 %	0 %	25 %	471328352
4509	NC_020511	GCT	2	6	207054	207059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328352
4510	NC_020511	CAA	3	9	207103	207111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328353
4511	NC_020511	T	6	6	207114	207119	0 %	100 %	0 %	0 %	471328353
4512	NC_020511	A	6	6	207136	207141	100 %	0 %	0 %	0 %	471328353
4513	NC_020511	CT	3	6	207213	207218	0 %	50 %	0 %	50 %	471328353
4514	NC_020511	TAT	2	6	207246	207251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328353
4515	NC_020511	AGT	2	6	207273	207278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328353
4516	NC_020511	TTC	2	6	207468	207473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328353
4517	NC_020511	GA	4	8	207563	207570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_020511	T	7	7	207593	207599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_020511	CT	4	8	207611	207618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4520	NC_020511	A	6	6	207620	207625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_020511	GAA	2	6	207654	207659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328354
4522	NC_020511	TCC	2	6	207692	207697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328354
4523	NC_020511	AGGA	2	8	207775	207782	50 %	0 %	50 %	0 %	471328354
4524	NC_020511	TTTG	2	8	207798	207805	0 %	75 %	25 %	0 %	471328354
4525	NC_020511	GAA	2	6	207849	207854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328354
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4527	NC_020511	ACC	2	6	207937	207942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328354
4528	NC_020511	CTCTG	2	10	207971	207980	0 %	40 %	20 %	40 %	471328354
4529	NC_020511	CAA	2	6	208005	208010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328354
4530	NC_020511	T	6	6	208033	208038	0 %	100 %	0 %	0 %	471328354
4531	NC_020511	ACC	2	6	208049	208054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328354
4532	NC_020511	ATT	2	6	208057	208062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328354
4533	NC_020511	ATC	2	6	208071	208076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328354
4534	NC_020511	CAA	2	6	208191	208196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328354
4535	NC_020511	TGA	2	6	208214	208219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328354
4536	NC_020511	ATT	2	6	208243	208248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328354
4537	NC_020511	CT	3	6	208297	208302	0 %	50 %	0 %	50 %	471328354
4538	NC_020511	TTC	2	6	208386	208391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328354
4539	NC_020511	GCT	2	6	208439	208444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328354
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4541	NC_020511	GAA	2	6	208485	208490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328354
4542	NC_020511	A	7	7	208493	208499	100 %	0 %	0 %	0 %	471328354
4543	NC_020511	A	6	6	208501	208506	100 %	0 %	0 %	0 %	471328354
4544	NC_020511	TTC	2	6	208525	208530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328354
4545	NC_020511	GAA	2	6	208539	208544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328354
4546	NC_020511	GAA	2	6	208611	208616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328354
4547	NC_020511	TTC	2	6	208631	208636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328354
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4554	NC_020511	AAG	2	6	209122	209127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328354
4555	NC_020511	TGA	2	6	209129	209134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328354
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4558	NC_020511	TTA	2	6	209209	209214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471328355
4559	NC_020511	ATG	2	6	209221	209226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328355
4560	NC_020511	AAG	2	6	209254	209259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471328355
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4591	NC_020511	CT	3	6	210802	210807	0 %	50 %	0 %	50 %	471328356
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4594	NC_020511	TGG	2	6	210979	210984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471328357
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4603	NC_020511	CT	3	6	211356	211361	0 %	50 %	0 %	50 %	471328357
4604	NC_020511	CTT	2	6	211382	211387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328357
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4606	NC_020511	CTA	2	6	211448	211453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328357
4607	NC_020511	TGC	2	6	211501	211506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328358
4608	NC_020511	TTC	2	6	211513	211518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328358
4609	NC_020511	CAA	2	6	211560	211565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328358
4610	NC_020511	TG	3	6	211604	211609	0 %	50 %	50 %	0 %	471328358
4611	NC_020511	GAAC	2	8	211745	211752	50 %	0 %	25 %	25 %	471328358
4612	NC_020511	CA	4	8	211818	211825	50 %	0 %	0 %	50 %	471328358
4613	NC_020511	T	6	6	211883	211888	0 %	100 %	0 %	0 %	471328358
4614	NC_020511	CTC	2	6	211905	211910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471328358
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4617	NC_020511	CAT	2	6	212034	212039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328358
4618	NC_020511	T	6	6	212062	212067	0 %	100 %	0 %	0 %	471328358
4619	NC_020511	ACA	2	6	212105	212110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471328358
4620	NC_020511	CTT	2	6	212113	212118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328358
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4622	NC_020511	TTCC	2	8	212196	212203	0 %	50 %	0 %	50 %	471328358
4623	NC_020511	TAA	2	6	212211	212216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328358
4624	NC_020511	AGTA	2	8	212300	212307	50 %	25 %	25 %	0 %	471328358
4625	NC_020511	TTC	2	6	212354	212359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328358
4626	NC_020511	ATC	2	6	212434	212439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328358
4627	NC_020511	TGA	2	6	212451	212456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328358
4628	NC_020511	ATA	2	6	212474	212479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328358
4629	NC_020511	TCT	2	6	212480	212485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328358
4630	NC_020511	ACG	2	6	212524	212529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328358
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4632	NC_020511	TAAC	2	8	212583	212590	50 %	25 %	0 %	25 %	471328358
4633	NC_020511	TCT	2	6	212591	212596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328358
4634	NC_020511	ATA	2	6	212614	212619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328358
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4639	NC_020511	TTC	3	9	212880	212888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328358
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4645	NC_020511	AAT	2	6	213307	213312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328358
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4648	NC_020511	TTG	2	6	213435	213440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471328358
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4653	NC_020511	GAT	2	6	213952	213957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328358
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4662	NC_020511	TCT	2	6	214288	214293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328359
4663	NC_020511	TGGA	2	8	214320	214327	25 %	25 %	50 %	0 %	471328359
4664	NC_020511	TTC	2	6	214374	214379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328359
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4666	NC_020511	TTC	2	6	214422	214427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328359
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4675	NC_020511	GA	3	6	214723	214728	50 %	0 %	50 %	0 %	471328359
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4686	NC_020511	CT	3	6	215196	215201	0 %	50 %	0 %	50 %	471328359
4687	NC_020511	CT	3	6	215204	215209	0 %	50 %	0 %	50 %	471328359
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4703	NC_020511	CTTG	2	8	216128	216135	0 %	50 %	25 %	25 %	471328359
4704	NC_020511	GAAATA	2	12	216184	216195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	471328359
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4710	NC_020511	CTG	2	6	216451	216456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328360
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4714	NC_020511	TTG	2	6	216811	216816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4727	NC_020511	CCA	2	6	217426	217431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328361
4728	NC_020511	TAC	2	6	217478	217483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328361
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4730	NC_020511	CTC	2	6	217566	217571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4731	NC_020511	T	8	8	217580	217587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4732	NC_020511	CTA	2	6	217619	217624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4734	NC_020511	ATG	2	6	217721	217726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328362
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4736	NC_020511	GC	3	6	217794	217799	0 %	0 %	50 %	50 %	471328362
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4739	NC_020511	CTG	2	6	218023	218028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471328362
4740	NC_020511	CAC	2	6	218051	218056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471328362
4741	NC_020511	TCT	2	6	218121	218126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471328362
4742	NC_020511	C	6	6	218165	218170	0 %	0 %	0 %	100 %	471328362
4743	NC_020511	ATGA	2	8	218171	218178	50 %	25 %	25 %	0 %	471328362
4744	NC_020511	T	6	6	218205	218210	0 %	100 %	0 %	0 %	471328362
4745	NC_020511	GCA	2	6	218293	218298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328362
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4747	NC_020511	GAAA	2	8	218364	218371	75 %	0 %	25 %	0 %	471328362
4748	NC_020511	TCA	2	6	218412	218417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471328362
4749	NC_020511	ATG	2	6	218427	218432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328362
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4751	NC_020511	T	6	6	218444	218449	0 %	100 %	0 %	0 %	471328362
4752	NC_020511	TAA	2	6	218524	218529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471328362
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4754	NC_020511	AGC	2	6	218570	218575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471328362
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4760	NC_020511	A	6	6	218872	218877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_020511	CA	3	6	218906	218911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4835	NC_020511	TAA	2	6	221993	221998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4875	NC_020511	GAT	2	6	223577	223582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471328367
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4881	NC_020511	T	6	6	223755	223760	0 %	100 %	0 %	0 %	471328367
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