MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 3593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020292	AAT	2	6	133323	133328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822716
3502	NC_020292	TAT	2	6	133368	133373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
3503	NC_020292	GAT	2	6	133380	133385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822716
3504	NC_020292	TGGA	2	8	133400	133407	25 %	25 %	50 %	0 %	451822716
3505	NC_020292	A	6	6	133409	133414	100 %	0 %	0 %	0 %	451822716
3506	NC_020292	TAT	2	6	133428	133433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
3507	NC_020292	GTT	2	6	133477	133482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822716
3508	NC_020292	AGA	2	6	133505	133510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822716
3509	NC_020292	CAA	2	6	133516	133521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822716
3510	NC_020292	TGA	2	6	133547	133552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822716
3511	NC_020292	TAA	3	9	133559	133567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822716
3512	NC_020292	TAA	2	6	133595	133600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822716
3513	NC_020292	ATT	2	6	133735	133740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
3514	NC_020292	A	6	6	133860	133865	100 %	0 %	0 %	0 %	451822716
3515	NC_020292	TAT	2	6	133911	133916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822716
3516	NC_020292	GTA	2	6	133923	133928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822716
3517	NC_020292	TTC	2	6	133967	133972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822716
3518	NC_020292	AAT	2	6	133980	133985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020292	A	6	6	133986	133991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020292	AAT	2	6	134018	134023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822717
3521	NC_020292	CAA	2	6	134036	134041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822717
3522	NC_020292	TGA	2	6	134106	134111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822717
3523	NC_020292	TG	3	6	134159	134164	0 %	50 %	50 %	0 %	451822717
3524	NC_020292	CATTTT	2	12	134171	134182	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451822717
3525	NC_020292	T	6	6	134179	134184	0 %	100 %	0 %	0 %	451822717
3526	NC_020292	TTTTG	2	10	134208	134217	0 %	80 %	20 %	0 %	451822717
3527	NC_020292	TC	3	6	134241	134246	0 %	50 %	0 %	50 %	451822717
3528	NC_020292	GTT	2	6	134247	134252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822717
3529	NC_020292	TAT	3	9	134351	134359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822717
3530	NC_020292	TAT	2	6	134367	134372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822717
3531	NC_020292	TCT	2	6	134380	134385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822717
3532	NC_020292	TTTCA	2	10	134433	134442	20 %	60 %	0 %	20 %	451822717
3533	NC_020292	AT	4	8	134491	134498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020292	TAAAA	2	10	134569	134578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020292	A	7	7	134575	134581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_020292	TA	3	6	134587	134592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020292	TAAA	2	8	134621	134628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_020292	AGG	2	6	134637	134642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_020292	ATGA	2	8	134650	134657	50 %	25 %	25 %	0 %	451822718
3540	NC_020292	CT	3	6	134754	134759	0 %	50 %	0 %	50 %	451822718
3541	NC_020292	GAA	2	6	134836	134841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822718
3542	NC_020292	A	6	6	134868	134873	100 %	0 %	0 %	0 %	451822718
3543	NC_020292	ATT	2	6	134900	134905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_020292	ATT	2	6	134928	134933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_020292	CTATA	2	10	134942	134951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_020292	GTA	2	6	134952	134957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_020292	T	7	7	134958	134964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_020292	AG	3	6	135009	135014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_020292	TC	3	6	135037	135042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_020292	AGC	2	6	135061	135066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822719
3551	NC_020292	CAT	2	6	135069	135074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822719
3552	NC_020292	TTTC	2	8	135086	135093	0 %	75 %	0 %	25 %	451822719
3553	NC_020292	CAC	2	6	135105	135110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451822719
3554	NC_020292	AT	3	6	135144	135149	50 %	50 %	0 %	0 %	451822719
3555	NC_020292	ATT	2	6	135158	135163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822719
3556	NC_020292	TTG	2	6	135231	135236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822719
3557	NC_020292	CCT	2	6	135239	135244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451822719
3558	NC_020292	ATA	2	6	135278	135283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822719
3559	NC_020292	CCT	2	6	135290	135295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_020292	T	6	6	135299	135304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_020292	GGAT	2	8	135414	135421	25 %	25 %	50 %	0 %	451822720
3562	NC_020292	CAT	2	6	135425	135430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822720
3563	NC_020292	T	6	6	135430	135435	0 %	100 %	0 %	0 %	451822720
3564	NC_020292	CTTT	2	8	135518	135525	0 %	75 %	0 %	25 %	451822720
3565	NC_020292	CTTTC	2	10	135555	135564	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3566	NC_020292	TTAA	2	8	135568	135575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_020292	AT	3	6	135598	135603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_020292	T	6	6	135618	135623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_020292	TAA	2	6	135636	135641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_020292	GATTG	2	10	135651	135660	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_020292	T	7	7	135663	135669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_020292	TAAT	2	8	135684	135691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_020292	AT	3	6	135699	135704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_020292	AAG	2	6	135705	135710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_020292	A	6	6	135711	135716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_020292	ATTT	2	8	135735	135742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_020292	AT	4	8	135745	135752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_020292	TAA	2	6	135761	135766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_020292	ATT	2	6	135804	135809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_020292	ATA	2	6	135810	135815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_020292	TATAA	2	10	135819	135828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_020292	TAAAT	2	10	135851	135860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020292	AAT	3	9	135877	135885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_020292	TA	3	6	135893	135898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_020292	ATT	3	9	135899	135907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_020292	TA	3	6	135923	135928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_020292	TAA	3	9	135935	135943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_020292	AAT	2	6	136016	136021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_020292	ATA	2	6	136027	136032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_020292	AT	3	6	136062	136067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_020292	ACA	2	6	136084	136089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_020292	TA	3	6	136130	136135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_020292	A	6	6	136181	136186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.