MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 3593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020292	GAA	2	6	60875	60880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1502	NC_020292	TAA	2	6	60882	60887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1503	NC_020292	ACC	2	6	60926	60931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451822654
1504	NC_020292	ACTTGG	2	12	60950	60961	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451822654
1505	NC_020292	GAT	2	6	60962	60967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1506	NC_020292	TCT	2	6	61057	61062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822654
1507	NC_020292	AAT	2	6	61100	61105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1508	NC_020292	TTA	2	6	61159	61164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822654
1509	NC_020292	A	6	6	61231	61236	100 %	0 %	0 %	0 %	451822654
1510	NC_020292	TGT	2	6	61237	61242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822654
1511	NC_020292	ATG	2	6	61278	61283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1512	NC_020292	T	7	7	61285	61291	0 %	100 %	0 %	0 %	451822654
1513	NC_020292	GAA	2	6	61316	61321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1514	NC_020292	TA	3	6	61353	61358	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1515	NC_020292	AT	3	6	61408	61413	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1516	NC_020292	AAG	2	6	61466	61471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1517	NC_020292	A	6	6	61484	61489	100 %	0 %	0 %	0 %	451822654
1518	NC_020292	AT	3	6	61504	61509	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1519	NC_020292	ATA	2	6	61622	61627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1520	NC_020292	A	7	7	61681	61687	100 %	0 %	0 %	0 %	451822654
1521	NC_020292	GA	4	8	61718	61725	50 %	0 %	50 %	0 %	451822654
1522	NC_020292	TGA	2	6	61741	61746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1523	NC_020292	GAT	3	9	61787	61795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1524	NC_020292	ATA	2	6	61911	61916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1525	NC_020292	ATA	2	6	61935	61940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1526	NC_020292	CTA	2	6	61983	61988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822654
1527	NC_020292	TA	5	10	62012	62021	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1528	NC_020292	ATG	2	6	62064	62069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1529	NC_020292	AGG	2	6	62079	62084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822654
1530	NC_020292	AAG	2	6	62190	62195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1531	NC_020292	TA	3	6	62245	62250	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1532	NC_020292	CAG	2	6	62289	62294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822654
1533	NC_020292	CTC	2	6	62307	62312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451822654
1534	NC_020292	TAAA	2	8	62331	62338	75 %	25 %	0 %	0 %	451822654
1535	NC_020292	ATTT	2	8	62364	62371	25 %	75 %	0 %	0 %	451822654
1536	NC_020292	ATC	2	6	62457	62462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822654
1537	NC_020292	GAA	2	6	62465	62470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1538	NC_020292	AGT	2	6	62485	62490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1539	NC_020292	TGA	2	6	62509	62514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1540	NC_020292	TA	3	6	62550	62555	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1541	NC_020292	AT	3	6	62579	62584	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1542	NC_020292	AGA	2	6	62620	62625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1543	NC_020292	ATA	2	6	62640	62645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1544	NC_020292	AGT	2	6	62674	62679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1545	NC_020292	ATAA	2	8	62723	62730	75 %	25 %	0 %	0 %	451822654
1546	NC_020292	A	6	6	62804	62809	100 %	0 %	0 %	0 %	451822654
1547	NC_020292	ATG	2	6	62820	62825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1548	NC_020292	AT	3	6	62837	62842	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1549	NC_020292	TTCA	2	8	62856	62863	25 %	50 %	0 %	25 %	451822654
1550	NC_020292	G	7	7	62871	62877	0 %	0 %	100 %	0 %	451822654
1551	NC_020292	AAT	2	6	62930	62935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1552	NC_020292	ATG	2	6	63021	63026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1553	NC_020292	AAC	2	6	63036	63041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822654
1554	NC_020292	AT	3	6	63073	63078	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1555	NC_020292	ATA	2	6	63108	63113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1556	NC_020292	ATT	2	6	63123	63128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822654
1557	NC_020292	T	6	6	63143	63148	0 %	100 %	0 %	0 %	451822654
1558	NC_020292	TAT	2	6	63161	63166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822654
1559	NC_020292	GAT	2	6	63202	63207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1560	NC_020292	GAA	2	6	63269	63274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1561	NC_020292	ATTT	2	8	63288	63295	25 %	75 %	0 %	0 %	451822654
1562	NC_020292	ATTT	2	8	63305	63312	25 %	75 %	0 %	0 %	451822654
1563	NC_020292	CTT	2	6	63313	63318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822654
1564	NC_020292	TAA	2	6	63349	63354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1565	NC_020292	AGA	2	6	63361	63366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822654
1566	NC_020292	AT	3	6	63386	63391	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1567	NC_020292	CAT	2	6	63458	63463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822654
1568	NC_020292	GGC	2	6	63506	63511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451822654
1569	NC_020292	AAT	2	6	63514	63519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1570	NC_020292	ATT	3	9	63567	63575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822654
1571	NC_020292	AGTTAT	2	12	63619	63630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451822654
1572	NC_020292	GGA	2	6	63662	63667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822654
1573	NC_020292	AT	3	6	63668	63673	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1574	NC_020292	GAT	2	6	63680	63685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1575	NC_020292	TGT	2	6	63748	63753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822654
1576	NC_020292	GAT	2	6	63755	63760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1577	NC_020292	GTA	2	6	63800	63805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822654
1578	NC_020292	AT	3	6	63826	63831	50 %	50 %	0 %	0 %	451822654
1579	NC_020292	ATTAAA	2	12	63849	63860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822654
1580	NC_020292	AT	3	6	63936	63941	50 %	50 %	0 %	0 %	451822655
1581	NC_020292	ATC	2	6	63944	63949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822655
1582	NC_020292	TA	4	8	63969	63976	50 %	50 %	0 %	0 %	451822655
1583	NC_020292	A	6	6	64091	64096	100 %	0 %	0 %	0 %	451822655
1584	NC_020292	ATC	2	6	64129	64134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822655
1585	NC_020292	TTTTAA	2	12	64160	64171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822655
1586	NC_020292	TTA	2	6	64187	64192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822655
1587	NC_020292	CAA	2	6	64219	64224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822655
1588	NC_020292	GAT	2	6	64227	64232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822655
1589	NC_020292	AT	3	6	64236	64241	50 %	50 %	0 %	0 %	451822655
1590	NC_020292	ACA	2	6	64277	64282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822655
1591	NC_020292	GAT	2	6	64287	64292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822655
1592	NC_020292	TTA	2	6	64329	64334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822655
1593	NC_020292	TAT	2	6	64348	64353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822655
1594	NC_020292	TGATTT	2	12	64379	64390	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451822655
1595	NC_020292	ATG	2	6	64441	64446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822655
1596	NC_020292	GA	3	6	64476	64481	50 %	0 %	50 %	0 %	451822655
1597	NC_020292	AT	3	6	64491	64496	50 %	50 %	0 %	0 %	451822655
1598	NC_020292	AATA	2	8	64514	64521	75 %	25 %	0 %	0 %	451822655
1599	NC_020292	A	6	6	64562	64567	100 %	0 %	0 %	0 %	451822655
1600	NC_020292	TATT	2	8	64568	64575	25 %	75 %	0 %	0 %	451822655
1601	NC_020292	ATT	2	6	64687	64692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822655
1602	NC_020292	TGA	2	6	64715	64720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822655
1603	NC_020292	AAAAG	2	10	64763	64772	80 %	0 %	20 %	0 %	451822655
1604	NC_020292	AGT	2	6	64779	64784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822655
1605	NC_020292	ATA	2	6	64785	64790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822655
1606	NC_020292	A	6	6	64902	64907	100 %	0 %	0 %	0 %	451822655
1607	NC_020292	TGA	2	6	64934	64939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822655
1608	NC_020292	TGA	2	6	64982	64987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822655
1609	NC_020292	AGA	2	6	65051	65056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822655
1610	NC_020292	AGG	2	6	65123	65128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451822655
1611	NC_020292	TAT	2	6	65133	65138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822655
1612	NC_020292	GAA	2	6	65169	65174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822655
1613	NC_020292	AATA	2	8	65268	65275	75 %	25 %	0 %	0 %	451822655
1614	NC_020292	TGA	2	6	65357	65362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822656
1615	NC_020292	TTA	2	6	65390	65395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822656
1616	NC_020292	TAACT	2	10	65411	65420	40 %	40 %	0 %	20 %	451822656
1617	NC_020292	GAA	2	6	65442	65447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822656
1618	NC_020292	AT	4	8	65451	65458	50 %	50 %	0 %	0 %	451822656
1619	NC_020292	TA	3	6	65481	65486	50 %	50 %	0 %	0 %	451822656
1620	NC_020292	A	7	7	65491	65497	100 %	0 %	0 %	0 %	451822656
1621	NC_020292	AT	4	8	65542	65549	50 %	50 %	0 %	0 %	451822656
1622	NC_020292	AAT	2	6	65583	65588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822656
1623	NC_020292	AAAT	2	8	65593	65600	75 %	25 %	0 %	0 %	451822656
1624	NC_020292	ATT	2	6	65605	65610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822656
1625	NC_020292	AGCA	2	8	65624	65631	50 %	0 %	25 %	25 %	451822656
1626	NC_020292	GAT	2	6	65633	65638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822656
1627	NC_020292	AGC	2	6	65718	65723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822656
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