MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p

Total Repeats: 3593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020292	GAA	2	6	20304	20309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
502	NC_020292	AT	3	6	20324	20329	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
503	NC_020292	AAAT	2	8	20381	20388	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
504	NC_020292	TAAA	2	8	20440	20447	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
505	NC_020292	A	6	6	20445	20450	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
506	NC_020292	TTA	2	6	20464	20469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
507	NC_020292	GATG	2	8	20495	20502	25 %	25 %	50 %	0 %	451822631
508	NC_020292	AAG	2	6	20526	20531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
509	NC_020292	TAT	2	6	20535	20540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
510	NC_020292	ATT	2	6	20551	20556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
511	NC_020292	AT	3	6	20578	20583	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
512	NC_020292	TAT	2	6	20596	20601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
513	NC_020292	ATA	3	9	20668	20676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
514	NC_020292	GAAT	2	8	20710	20717	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
515	NC_020292	TAA	2	6	20732	20737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
516	NC_020292	TA	3	6	20778	20783	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
517	NC_020292	AT	3	6	20789	20794	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
518	NC_020292	TTA	2	6	20827	20832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
519	NC_020292	CTG	2	6	20887	20892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822631
520	NC_020292	ATTA	2	8	20922	20929	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
521	NC_020292	AGT	2	6	20946	20951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
522	NC_020292	ATA	2	6	20959	20964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
523	NC_020292	TA	4	8	20971	20978	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
524	NC_020292	ATA	2	6	21010	21015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
525	NC_020292	AATA	2	8	21027	21034	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
526	NC_020292	ATT	2	6	21055	21060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
527	NC_020292	TATT	3	12	21083	21094	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
528	NC_020292	TTTA	2	8	21137	21144	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
529	NC_020292	ATT	2	6	21179	21184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
530	NC_020292	ATC	2	6	21199	21204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822631
531	NC_020292	TA	3	6	21222	21227	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
532	NC_020292	TAAT	2	8	21289	21296	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
533	NC_020292	GAAA	2	8	21342	21349	75 %	0 %	25 %	0 %	451822631
534	NC_020292	TA	3	6	21382	21387	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
535	NC_020292	TAT	2	6	21552	21557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
536	NC_020292	GAA	2	6	21591	21596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
537	NC_020292	TCA	2	6	21682	21687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822631
538	NC_020292	ATAA	2	8	21705	21712	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
539	NC_020292	TGA	2	6	21737	21742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
540	NC_020292	A	6	6	21756	21761	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
541	NC_020292	ATG	2	6	21880	21885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
542	NC_020292	GGAT	2	8	21905	21912	25 %	25 %	50 %	0 %	451822631
543	NC_020292	ATGA	2	8	21924	21931	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
544	NC_020292	TTA	2	6	21932	21937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
545	NC_020292	A	6	6	21948	21953	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
546	NC_020292	ATGA	2	8	21972	21979	50 %	25 %	25 %	0 %	451822631
547	NC_020292	GGAT	2	8	22001	22008	25 %	25 %	50 %	0 %	451822631
548	NC_020292	TCA	2	6	22014	22019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822631
549	NC_020292	ATG	2	6	22024	22029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
550	NC_020292	ATTT	2	8	22064	22071	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
551	NC_020292	AAAT	2	8	22079	22086	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
552	NC_020292	TA	3	6	22125	22130	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
553	NC_020292	TAAA	2	8	22138	22145	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
554	NC_020292	ATTT	2	8	22158	22165	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
555	NC_020292	AT	3	6	22182	22187	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
556	NC_020292	TGA	2	6	22211	22216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
557	NC_020292	AAT	2	6	22220	22225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
558	NC_020292	AATAC	2	10	22316	22325	60 %	20 %	0 %	20 %	451822631
559	NC_020292	AAG	2	6	22348	22353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
560	NC_020292	GAT	2	6	22427	22432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
561	NC_020292	TATT	2	8	22462	22469	25 %	75 %	0 %	0 %	451822631
562	NC_020292	AATT	2	8	22505	22512	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
563	NC_020292	ATAA	2	8	22578	22585	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
564	NC_020292	ATT	2	6	22660	22665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
565	NC_020292	TAA	2	6	22676	22681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
566	NC_020292	AGA	3	9	22700	22708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
567	NC_020292	TAAA	2	8	22912	22919	75 %	25 %	0 %	0 %	451822631
568	NC_020292	ATT	2	6	22975	22980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
569	NC_020292	A	7	7	23010	23016	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
570	NC_020292	AT	3	6	23124	23129	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
571	NC_020292	TGA	2	6	23177	23182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
572	NC_020292	AAT	2	6	23186	23191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
573	NC_020292	GAA	2	6	23226	23231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
574	NC_020292	CAT	2	6	23247	23252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822631
575	NC_020292	TAT	2	6	23292	23297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
576	NC_020292	A	7	7	23303	23309	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
577	NC_020292	TAT	2	6	23385	23390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
578	NC_020292	GAA	3	9	23409	23417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
579	NC_020292	TGA	2	6	23453	23458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822631
580	NC_020292	AGA	2	6	23486	23491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
581	NC_020292	A	6	6	23525	23530	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
582	NC_020292	AGA	2	6	23578	23583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
583	NC_020292	T	6	6	23615	23620	0 %	100 %	0 %	0 %	451822631
584	NC_020292	TCCAGA	3	18	23636	23653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451822631
585	NC_020292	CA	3	6	23701	23706	50 %	0 %	0 %	50 %	451822631
586	NC_020292	TTA	2	6	23728	23733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
587	NC_020292	TAA	2	6	23740	23745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
588	NC_020292	AT	3	6	23841	23846	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
589	NC_020292	GA	3	6	23924	23929	50 %	0 %	50 %	0 %	451822631
590	NC_020292	AT	3	6	23942	23947	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
591	NC_020292	AGC	2	6	24025	24030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822631
592	NC_020292	AAG	2	6	24037	24042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
593	NC_020292	ATGC	2	8	24050	24057	25 %	25 %	25 %	25 %	451822631
594	NC_020292	AAT	2	6	24093	24098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
595	NC_020292	AT	4	8	24104	24111	50 %	50 %	0 %	0 %	451822631
596	NC_020292	TAT	2	6	24144	24149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
597	NC_020292	ATA	2	6	24177	24182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
598	NC_020292	ATA	2	6	24190	24195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
599	NC_020292	ATTAT	2	10	24211	24220	40 %	60 %	0 %	0 %	451822631
600	NC_020292	A	7	7	24239	24245	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
601	NC_020292	ATA	3	9	24265	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
602	NC_020292	CAG	2	6	24329	24334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822631
603	NC_020292	AAT	2	6	24341	24346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
604	NC_020292	GAA	2	6	24405	24410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822631
605	NC_020292	ATA	2	6	24487	24492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822631
606	NC_020292	ATT	2	6	24560	24565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822631
607	NC_020292	A	6	6	24714	24719	100 %	0 %	0 %	0 %	451822631
608	NC_020292	GAAA	2	8	24731	24738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020292	AAG	2	6	24784	24789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822632
610	NC_020292	ACA	2	6	24802	24807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822632
611	NC_020292	GACTG	2	10	24814	24823	20 %	20 %	40 %	20 %	451822632
612	NC_020292	GCT	2	6	24826	24831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451822632
613	NC_020292	A	7	7	24928	24934	100 %	0 %	0 %	0 %	451822632
614	NC_020292	AGC	2	6	24981	24986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451822632
615	NC_020292	AAC	2	6	25001	25006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451822632
616	NC_020292	AGT	2	6	25047	25052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822632
617	NC_020292	GAA	3	9	25081	25089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822632
618	NC_020292	TCT	3	9	25111	25119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451822633
619	NC_020292	TAT	2	6	25124	25129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822633
620	NC_020292	AGA	2	6	25134	25139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822633
621	NC_020292	TC	3	6	25152	25157	0 %	50 %	0 %	50 %	451822633
622	NC_020292	TAG	2	6	25188	25193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822633
623	NC_020292	GTT	2	6	25195	25200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451822633
624	NC_020292	TTA	2	6	25222	25227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822633
625	NC_020292	ACT	2	6	25248	25253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822633
626	NC_020292	TA	3	6	25254	25259	50 %	50 %	0 %	0 %	451822633
627	NC_020292	GAT	2	6	25387	25392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822633
628	NC_020292	ATA	2	6	25417	25422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822633
629	NC_020292	ATG	2	6	25427	25432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822633
630	NC_020292	TAT	2	6	25480	25485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822633
631	NC_020292	GAATA	2	10	25509	25518	60 %	20 %	20 %	0 %	451822633
632	NC_020292	CTA	2	6	25521	25526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822633
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640	NC_020292	ATT	2	6	25733	25738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822633
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739	NC_020292	TGG	2	6	30139	30144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451822635
740	NC_020292	TAAAT	2	10	30247	30256	60 %	40 %	0 %	0 %	451822635
741	NC_020292	AAG	2	6	30321	30326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
742	NC_020292	G	6	6	30339	30344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
743	NC_020292	TTA	2	6	30373	30378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822636
744	NC_020292	A	7	7	30383	30389	100 %	0 %	0 %	0 %	451822636
745	NC_020292	TCA	2	6	30443	30448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451822636
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747	NC_020292	AGA	2	6	30607	30612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451822636
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750	NC_020292	ATT	2	6	30723	30728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822636
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752	NC_020292	ATTTA	2	10	30792	30801	40 %	60 %	0 %	0 %	451822636
753	NC_020292	TAG	2	6	30819	30824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451822636
754	NC_020292	AAAT	2	8	30828	30835	75 %	25 %	0 %	0 %	451822636
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756	NC_020292	AT	3	6	30962	30967	50 %	50 %	0 %	0 %	451822636
757	NC_020292	ATA	2	6	31037	31042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451822636
758	NC_020292	TAT	2	6	31058	31063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451822636
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