MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 7019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020291	ATTAT	2	10	836	845	40 %	60 %	0 %	0 %	451816899
2	NC_020291	AAAAT	2	10	1028	1037	80 %	20 %	0 %	0 %	451816899
3	NC_020291	TTATT	2	10	3091	3100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020291	TAGAT	2	10	3363	3372	40 %	40 %	20 %	0 %	451816902
5	NC_020291	ATATT	2	10	3617	3626	40 %	60 %	0 %	0 %	451816902
6	NC_020291	AGATA	2	10	3723	3732	60 %	20 %	20 %	0 %	451816902
7	NC_020291	ATACA	2	10	4318	4327	60 %	20 %	0 %	20 %	451816903
8	NC_020291	CAATT	2	10	4746	4755	40 %	40 %	0 %	20 %	451816904
9	NC_020291	CAATT	2	10	6275	6284	40 %	40 %	0 %	20 %	451816904
10	NC_020291	TTAAT	2	10	9124	9133	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020291	TCGTG	2	10	10479	10488	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020291	TGTTC	2	10	11047	11056	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020291	ATTTA	2	10	11169	11178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020291	GGGAG	2	10	11805	11814	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020291	TAAGT	2	10	12334	12343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020291	AGGAT	2	10	12757	12766	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020291	ATTAT	2	10	14676	14685	40 %	60 %	0 %	0 %	451816906
18	NC_020291	TTAAA	2	10	14940	14949	60 %	40 %	0 %	0 %	451816906
19	NC_020291	TTAAT	2	10	15668	15677	40 %	60 %	0 %	0 %	451816907
20	NC_020291	AAAAT	2	10	18794	18803	80 %	20 %	0 %	0 %	451816911
21	NC_020291	TATAA	2	10	19048	19057	60 %	40 %	0 %	0 %	451816911
22	NC_020291	GATAG	2	10	21439	21448	40 %	20 %	40 %	0 %	451816911
23	NC_020291	TATAT	2	10	21624	21633	40 %	60 %	0 %	0 %	451816911
24	NC_020291	AAGAA	2	10	25391	25400	80 %	0 %	20 %	0 %	451816912
25	NC_020291	GATAT	2	10	25759	25768	40 %	40 %	20 %	0 %	451816912
26	NC_020291	TACTT	2	10	26040	26049	20 %	60 %	0 %	20 %	451816913
27	NC_020291	TTTAT	2	10	26833	26842	20 %	80 %	0 %	0 %	451816913
28	NC_020291	ATTTT	2	10	28142	28151	20 %	80 %	0 %	0 %	451816915
29	NC_020291	AATTT	2	10	28510	28519	40 %	60 %	0 %	0 %	451816915
30	NC_020291	AACAA	2	10	29701	29710	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020291	TAGAA	2	10	29755	29764	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020291	AAAAG	2	10	31112	31121	80 %	0 %	20 %	0 %	451816916
33	NC_020291	AAATG	2	10	31544	31553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020291	GAAAA	2	10	32586	32595	80 %	0 %	20 %	0 %	451816919
35	NC_020291	AACTT	2	10	33565	33574	40 %	40 %	0 %	20 %	451816921
36	NC_020291	TTCAA	2	10	33899	33908	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020291	TATAT	2	10	34052	34061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020291	ATTAT	2	10	34293	34302	40 %	60 %	0 %	0 %	451816922
39	NC_020291	TTTTG	2	10	35686	35695	0 %	80 %	20 %	0 %	451816923
40	NC_020291	AGTTC	2	10	36012	36021	20 %	40 %	20 %	20 %	451816923
41	NC_020291	AATAG	2	10	38219	38228	60 %	20 %	20 %	0 %	451816926
42	NC_020291	TAATA	2	10	41440	41449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020291	ATGGT	2	10	41898	41907	20 %	40 %	40 %	0 %	451816929
44	NC_020291	ATGTA	2	10	43774	43783	40 %	40 %	20 %	0 %	451816930
45	NC_020291	TAGAA	2	10	44263	44272	60 %	20 %	20 %	0 %	451816930
46	NC_020291	AAAAG	2	10	44812	44821	80 %	0 %	20 %	0 %	451816930
47	NC_020291	ATTCA	2	10	45398	45407	40 %	40 %	0 %	20 %	451816930
48	NC_020291	GTAAG	2	10	45477	45486	40 %	20 %	40 %	0 %	451816930
49	NC_020291	ATTAA	2	10	46256	46265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020291	GAACT	2	10	46331	46340	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020291	TTAAA	2	10	46512	46521	60 %	40 %	0 %	0 %	451816931
52	NC_020291	ATTAA	2	10	46903	46912	60 %	40 %	0 %	0 %	451816932
53	NC_020291	AGTGG	2	10	49378	49387	20 %	20 %	60 %	0 %	451816934
54	NC_020291	AAAGT	2	10	50139	50148	60 %	20 %	20 %	0 %	451816935
55	NC_020291	TAGAA	2	10	51402	51411	60 %	20 %	20 %	0 %	451816937
56	NC_020291	AATAT	2	10	52730	52739	60 %	40 %	0 %	0 %	451816937
57	NC_020291	AATAG	2	10	53845	53854	60 %	20 %	20 %	0 %	451816937
58	NC_020291	ATTAA	2	10	54194	54203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020291	TAAAT	2	10	54243	54252	60 %	40 %	0 %	0 %	451816938
60	NC_020291	AATTG	2	10	55185	55194	40 %	40 %	20 %	0 %	451816938
61	NC_020291	TAAAA	3	15	55501	55515	80 %	20 %	0 %	0 %	451816939
62	NC_020291	TTTTA	2	10	56585	56594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020291	TAATA	2	10	58181	58190	60 %	40 %	0 %	0 %	451816941
64	NC_020291	AAAAT	2	10	58380	58389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020291	TTTAA	2	10	58925	58934	40 %	60 %	0 %	0 %	451816942
66	NC_020291	AGTAT	2	10	59417	59426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020291	AATTA	2	10	60430	60439	60 %	40 %	0 %	0 %	451816943
68	NC_020291	ATATA	2	10	60615	60624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020291	TCATT	2	10	60938	60947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020291	AGATA	2	10	64442	64451	60 %	20 %	20 %	0 %	451816945
71	NC_020291	TATAA	2	10	65187	65196	60 %	40 %	0 %	0 %	451816946
72	NC_020291	CTCTT	2	10	67103	67112	0 %	60 %	0 %	40 %	451816947
73	NC_020291	AAATT	2	10	67421	67430	60 %	40 %	0 %	0 %	451816947
74	NC_020291	GTCTT	2	10	67774	67783	0 %	60 %	20 %	20 %	451816948
75	NC_020291	TGGTG	2	10	68538	68547	0 %	40 %	60 %	0 %	451816950
76	NC_020291	GATTG	2	10	69222	69231	20 %	40 %	40 %	0 %	451816951
77	NC_020291	ATGGA	2	10	69842	69851	40 %	20 %	40 %	0 %	451816952
78	NC_020291	GCATA	2	10	70604	70613	40 %	20 %	20 %	20 %	451816952
79	NC_020291	AAAAC	2	10	71361	71370	80 %	0 %	0 %	20 %	451816953
80	NC_020291	TTATA	2	10	71541	71550	40 %	60 %	0 %	0 %	451816953
81	NC_020291	ATATT	2	10	73377	73386	40 %	60 %	0 %	0 %	451816954
82	NC_020291	ATATT	2	10	75687	75696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020291	GATTA	2	10	76044	76053	40 %	40 %	20 %	0 %	451816955
84	NC_020291	ATTAA	2	10	77071	77080	60 %	40 %	0 %	0 %	451816956
85	NC_020291	AAATA	2	10	77540	77549	80 %	20 %	0 %	0 %	451816956
86	NC_020291	ATATA	2	10	79461	79470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020291	AGAAA	2	10	80464	80473	80 %	0 %	20 %	0 %	451816959
88	NC_020291	ATTTA	2	10	80881	80890	40 %	60 %	0 %	0 %	451816959
89	NC_020291	TTAGT	2	10	83461	83470	20 %	60 %	20 %	0 %	451816962
90	NC_020291	AATTA	2	10	84624	84633	60 %	40 %	0 %	0 %	451816964
91	NC_020291	TGAAA	2	10	85086	85095	60 %	20 %	20 %	0 %	451816965
92	NC_020291	TGAAT	2	10	85430	85439	40 %	40 %	20 %	0 %	451816965
93	NC_020291	GGAAT	2	10	85868	85877	40 %	20 %	40 %	0 %	451816966
94	NC_020291	AAGAA	2	10	87060	87069	80 %	0 %	20 %	0 %	451816967
95	NC_020291	TAAAT	2	10	87945	87954	60 %	40 %	0 %	0 %	451816967
96	NC_020291	ACCAT	2	10	88125	88134	40 %	20 %	0 %	40 %	451816967
97	NC_020291	AAGAA	2	10	88677	88686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020291	AATGA	2	10	88942	88951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020291	GAAGA	2	10	91112	91121	60 %	0 %	40 %	0 %	451816969
100	NC_020291	ATTTT	2	10	92775	92784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020291	GAAAA	2	10	93555	93564	80 %	0 %	20 %	0 %	451816970
102	NC_020291	ATGGA	2	10	94879	94888	40 %	20 %	40 %	0 %	451816972
103	NC_020291	ATAAA	2	10	96935	96944	80 %	20 %	0 %	0 %	451816974
104	NC_020291	ATTAA	2	10	98036	98045	60 %	40 %	0 %	0 %	451816976
105	NC_020291	AATTA	2	10	99252	99261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020291	GGAAA	2	10	101433	101442	60 %	0 %	40 %	0 %	451816979
107	NC_020291	TTGAT	2	10	102178	102187	20 %	60 %	20 %	0 %	451816981
108	NC_020291	GGAAG	2	10	102518	102527	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020291	TATGG	2	10	102591	102600	20 %	40 %	40 %	0 %	451816982
110	NC_020291	ATTAC	2	10	104659	104668	40 %	40 %	0 %	20 %	451816984
111	NC_020291	TAAAA	2	10	104965	104974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020291	TTTTA	2	10	104999	105008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020291	ATGAT	2	10	106487	106496	40 %	40 %	20 %	0 %	451816986
114	NC_020291	TCTTT	2	10	108208	108217	0 %	80 %	0 %	20 %	451816987
115	NC_020291	TATTG	2	10	110122	110131	20 %	60 %	20 %	0 %	451816989
116	NC_020291	AATGA	2	10	110791	110800	60 %	20 %	20 %	0 %	451816989
117	NC_020291	AATAT	2	10	111433	111442	60 %	40 %	0 %	0 %	451816990
118	NC_020291	AATGA	2	10	113233	113242	60 %	20 %	20 %	0 %	451816992
119	NC_020291	ATGAT	2	10	114828	114837	40 %	40 %	20 %	0 %	451816993
120	NC_020291	GGATA	2	10	114943	114952	40 %	20 %	40 %	0 %	451816993
121	NC_020291	AAAAG	2	10	116960	116969	80 %	0 %	20 %	0 %	451816995
122	NC_020291	GAAGT	2	10	117757	117766	40 %	20 %	40 %	0 %	451816996
123	NC_020291	GATTT	2	10	118193	118202	20 %	60 %	20 %	0 %	451816997
124	NC_020291	AATTA	2	10	119890	119899	60 %	40 %	0 %	0 %	451816997
125	NC_020291	AAAGT	2	10	120561	120570	60 %	20 %	20 %	0 %	451816997
126	NC_020291	AGCCA	2	10	121244	121253	40 %	0 %	20 %	40 %	451816997
127	NC_020291	TAAAA	2	10	121411	121420	80 %	20 %	0 %	0 %	451816997
128	NC_020291	AGTAA	2	10	121506	121515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020291	AAACT	2	10	123454	123463	60 %	20 %	0 %	20 %	451816999
130	NC_020291	TAATT	2	10	123516	123525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020291	GCCAA	2	10	123922	123931	40 %	0 %	20 %	40 %	451817000
132	NC_020291	GAATA	2	10	124139	124148	60 %	20 %	20 %	0 %	451817000
133	NC_020291	TATAT	2	10	125071	125080	40 %	60 %	0 %	0 %	451817000
134	NC_020291	ATTTA	2	10	125451	125460	40 %	60 %	0 %	0 %	451817001
135	NC_020291	AAGTT	2	10	125660	125669	40 %	40 %	20 %	0 %	451817001
136	NC_020291	GATTT	2	10	126299	126308	20 %	60 %	20 %	0 %	451817001
137	NC_020291	ACTTA	2	10	127484	127493	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020291	TTTTC	2	10	128041	128050	0 %	80 %	0 %	20 %	451817005
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140	NC_020291	AAATA	2	10	133685	133694	80 %	20 %	0 %	0 %	451817009
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