MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 175553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020291	T	6	6	129185	129190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_020291	AATA	2	8	129197	129204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_020291	ATT	2	6	129217	129222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_020291	TAAT	2	8	129281	129288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020291	TAT	2	6	129299	129304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_020291	TTTGA	2	10	129309	129318	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_020291	AT	3	6	129327	129332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020291	T	6	6	129332	129337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_020291	ATA	2	6	129338	129343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_020291	TAA	2	6	129361	129366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020291	TA	3	6	129368	129373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_020291	TGT	2	6	129387	129392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020291	GGT	2	6	129463	129468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020291	ATA	2	6	129506	129511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_020291	TCG	2	6	129548	129553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_020291	TG	3	6	129685	129690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_020291	GGT	2	6	129735	129740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020291	ATA	2	6	129778	129783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020291	TCG	2	6	129820	129825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_020291	AAT	2	6	129881	129886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020291	TAT	2	6	129890	129895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020291	TA	3	6	129917	129922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020291	ATG	2	6	129924	129929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_020291	GGT	2	6	129987	129992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020291	T	7	7	130056	130062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020291	TTA	2	6	130064	130069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020291	AATA	2	8	130126	130133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020291	TTG	2	6	130149	130154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020291	T	6	6	130200	130205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020291	A	6	6	130215	130220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020291	TA	4	8	130225	130232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020291	ACT	2	6	130234	130239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_020291	AAT	2	6	130262	130267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020291	AAT	2	6	130367	130372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020291	AT	3	6	130438	130443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_020291	ATT	2	6	130474	130479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020291	TTA	2	6	130641	130646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817008
3538	NC_020291	AATC	2	8	130647	130654	50 %	25 %	0 %	25 %	451817008
3539	NC_020291	A	6	6	130719	130724	100 %	0 %	0 %	0 %	451817008
3540	NC_020291	GCA	3	9	130734	130742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451817008
3541	NC_020291	AATA	2	8	130769	130776	75 %	25 %	0 %	0 %	451817008
3542	NC_020291	TAA	2	6	130819	130824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
3543	NC_020291	AT	3	6	130827	130832	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3544	NC_020291	CAA	3	9	130846	130854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451817008
3545	NC_020291	AAAG	2	8	130858	130865	75 %	0 %	25 %	0 %	451817008
3546	NC_020291	TAT	2	6	130883	130888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817008
3547	NC_020291	T	7	7	130905	130911	0 %	100 %	0 %	0 %	451817008
3548	NC_020291	ATA	2	6	130962	130967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
3549	NC_020291	ATTA	2	8	130973	130980	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3550	NC_020291	AT	3	6	130989	130994	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3551	NC_020291	TAAT	2	8	131029	131036	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3552	NC_020291	TTAT	2	8	131042	131049	25 %	75 %	0 %	0 %	451817008
3553	NC_020291	AGTT	2	8	131062	131069	25 %	50 %	25 %	0 %	451817008
3554	NC_020291	TTA	2	6	131091	131096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817008
3555	NC_020291	ATT	2	6	131128	131133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817008
3556	NC_020291	AT	3	6	131143	131148	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3557	NC_020291	TA	3	6	131178	131183	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3558	NC_020291	GGA	2	6	131184	131189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451817008
3559	NC_020291	AAT	2	6	131225	131230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
3560	NC_020291	TAA	2	6	131246	131251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
3561	NC_020291	ATG	2	6	131253	131258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817008
3562	NC_020291	T	7	7	131270	131276	0 %	100 %	0 %	0 %	451817008
3563	NC_020291	GGA	2	6	131283	131288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451817008
3564	NC_020291	TAA	2	6	131344	131349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
3565	NC_020291	T	6	6	131420	131425	0 %	100 %	0 %	0 %	451817008
3566	NC_020291	TA	3	6	131447	131452	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3567	NC_020291	A	6	6	131486	131491	100 %	0 %	0 %	0 %	451817008
3568	NC_020291	TAATGA	2	12	131600	131611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451817008
3569	NC_020291	TAG	2	6	131644	131649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817008
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3572	NC_020291	TCA	2	6	131714	131719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451817008
3573	NC_020291	GAG	2	6	131757	131762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451817008
3574	NC_020291	A	8	8	131791	131798	100 %	0 %	0 %	0 %	451817008
3575	NC_020291	AAT	2	6	131844	131849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
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3577	NC_020291	GGGA	2	8	131889	131896	25 %	0 %	75 %	0 %	451817008
3578	NC_020291	AT	3	6	131911	131916	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3579	NC_020291	AT	3	6	131920	131925	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3580	NC_020291	TCT	2	6	131942	131947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451817008
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3582	NC_020291	TAA	2	6	132022	132027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
3583	NC_020291	T	6	6	132040	132045	0 %	100 %	0 %	0 %	451817008
3584	NC_020291	AATA	2	8	132080	132087	75 %	25 %	0 %	0 %	451817008
3585	NC_020291	ATT	2	6	132109	132114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817008
3586	NC_020291	A	7	7	132118	132124	100 %	0 %	0 %	0 %	451817008
3587	NC_020291	AAT	2	6	132144	132149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817008
3588	NC_020291	GAT	2	6	132174	132179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817008
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3591	NC_020291	AGA	2	6	132224	132229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817008
3592	NC_020291	ATAGTT	2	12	132298	132309	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451817008
3593	NC_020291	GTT	2	6	132318	132323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451817008
3594	NC_020291	AT	3	6	132332	132337	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3595	NC_020291	GAAG	2	8	132377	132384	50 %	0 %	50 %	0 %	451817008
3596	NC_020291	TAG	2	6	132406	132411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451817008
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3598	NC_020291	TA	3	6	132532	132537	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3599	NC_020291	AG	3	6	132586	132591	50 %	0 %	50 %	0 %	451817008
3600	NC_020291	TTA	2	6	132607	132612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451817008
3601	NC_020291	AAG	2	6	132667	132672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817008
3602	NC_020291	AT	3	6	132688	132693	50 %	50 %	0 %	0 %	451817008
3603	NC_020291	AAGT	2	8	132745	132752	50 %	25 %	25 %	0 %	451817008
3604	NC_020291	A	6	6	132805	132810	100 %	0 %	0 %	0 %	451817008
3605	NC_020291	GAA	2	6	132824	132829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817008
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3607	NC_020291	ATTT	2	8	132879	132886	25 %	75 %	0 %	0 %	451817008
3608	NC_020291	TAT	2	6	132927	132932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_020291	TAT	2	6	132958	132963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_020291	AGC	2	6	132973	132978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_020291	A	7	7	133009	133015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_020291	AAT	2	6	133023	133028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_020291	AT	3	6	133044	133049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_020291	AT	3	6	133057	133062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_020291	TAT	2	6	133070	133075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_020291	ATA	3	9	133076	133084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_020291	ATA	2	6	133129	133134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451817009
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3619	NC_020291	CT	4	8	133168	133175	0 %	50 %	0 %	50 %	451817009
3620	NC_020291	AGC	2	6	133244	133249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451817009
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3624	NC_020291	GAA	2	6	133431	133436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451817009
3625	NC_020291	CA	3	6	133474	133479	50 %	0 %	0 %	50 %	451817009
3626	NC_020291	TTTA	2	8	133505	133512	25 %	75 %	0 %	0 %	451817009
3627	NC_020291	GGA	2	6	133545	133550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451817009
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