MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT)

Total Repeats: 175553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020291	ATA	2	6	54101	54106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816937
1502	NC_020291	TTA	2	6	54126	54131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816937
1503	NC_020291	GTT	2	6	54143	54148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020291	AAT	2	6	54149	54154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020291	ATTAA	2	10	54194	54203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020291	TAT	3	9	54204	54212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020291	TAAAT	2	10	54243	54252	60 %	40 %	0 %	0 %	451816938
1508	NC_020291	GTA	2	6	54268	54273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816938
1509	NC_020291	TTA	2	6	54329	54334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816938
1510	NC_020291	TTAT	2	8	54364	54371	25 %	75 %	0 %	0 %	451816938
1511	NC_020291	AT	5	10	54424	54433	50 %	50 %	0 %	0 %	451816938
1512	NC_020291	TGC	2	6	54434	54439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816938
1513	NC_020291	AGA	2	6	54454	54459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816938
1514	NC_020291	T	8	8	54467	54474	0 %	100 %	0 %	0 %	451816938
1515	NC_020291	AAG	2	6	54483	54488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816938
1516	NC_020291	ATT	2	6	54526	54531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816938
1517	NC_020291	CTTC	2	8	54532	54539	0 %	50 %	0 %	50 %	451816938
1518	NC_020291	TCA	2	6	54577	54582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816938
1519	NC_020291	ACT	2	6	54583	54588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816938
1520	NC_020291	GTAA	2	8	54665	54672	50 %	25 %	25 %	0 %	451816938
1521	NC_020291	AT	3	6	54679	54684	50 %	50 %	0 %	0 %	451816938
1522	NC_020291	TAT	2	6	54728	54733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816938
1523	NC_020291	ATT	2	6	54753	54758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816938
1524	NC_020291	T	9	9	54757	54765	0 %	100 %	0 %	0 %	451816938
1525	NC_020291	AAT	2	6	54783	54788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816938
1526	NC_020291	TAT	2	6	54824	54829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816938
1527	NC_020291	AC	3	6	54965	54970	50 %	0 %	0 %	50 %	451816938
1528	NC_020291	A	7	7	54989	54995	100 %	0 %	0 %	0 %	451816938
1529	NC_020291	CTC	2	6	55032	55037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816938
1530	NC_020291	AAG	2	6	55048	55053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816938
1531	NC_020291	TCA	2	6	55099	55104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816938
1532	NC_020291	CATT	2	8	55144	55151	25 %	50 %	0 %	25 %	451816938
1533	NC_020291	ATT	2	6	55164	55169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816938
1534	NC_020291	AATTG	2	10	55185	55194	40 %	40 %	20 %	0 %	451816938
1535	NC_020291	AT	3	6	55198	55203	50 %	50 %	0 %	0 %	451816938
1536	NC_020291	AGC	2	6	55232	55237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_020291	AGC	2	6	55255	55260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_020291	TGC	2	6	55263	55268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_020291	TTAT	2	8	55321	55328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020291	TA	4	8	55375	55382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020291	AATT	2	8	55408	55415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020291	TA	3	6	55457	55462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020291	TTTA	2	8	55474	55481	25 %	75 %	0 %	0 %	451816939
1544	NC_020291	TAAAA	3	15	55501	55515	80 %	20 %	0 %	0 %	451816939
1545	NC_020291	AAATAT	2	12	55523	55534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1546	NC_020291	TTAA	2	8	55569	55576	50 %	50 %	0 %	0 %	451816939
1547	NC_020291	CTATAA	2	12	55615	55626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451816939
1548	NC_020291	T	6	6	55634	55639	0 %	100 %	0 %	0 %	451816939
1549	NC_020291	ATA	2	6	55722	55727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1550	NC_020291	AAT	2	6	55731	55736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1551	NC_020291	TA	5	10	55795	55804	50 %	50 %	0 %	0 %	451816939
1552	NC_020291	TAA	2	6	55820	55825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1553	NC_020291	AAT	2	6	55868	55873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1554	NC_020291	T	7	7	55897	55903	0 %	100 %	0 %	0 %	451816939
1555	NC_020291	TAT	2	6	55948	55953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816939
1556	NC_020291	ATA	2	6	55963	55968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1557	NC_020291	T	6	6	55991	55996	0 %	100 %	0 %	0 %	451816939
1558	NC_020291	ATA	2	6	56070	56075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1559	NC_020291	TAA	2	6	56135	56140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816939
1560	NC_020291	A	7	7	56139	56145	100 %	0 %	0 %	0 %	451816939
1561	NC_020291	TAAT	2	8	56164	56171	50 %	50 %	0 %	0 %	451816939
1562	NC_020291	ATTA	2	8	56204	56211	50 %	50 %	0 %	0 %	451816939
1563	NC_020291	TAT	2	6	56231	56236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816939
1564	NC_020291	A	6	6	56255	56260	100 %	0 %	0 %	0 %	451816939
1565	NC_020291	TTA	2	6	56371	56376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816939
1566	NC_020291	A	6	6	56409	56414	100 %	0 %	0 %	0 %	451816939
1567	NC_020291	CAA	2	6	56476	56481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816939
1568	NC_020291	TAA	2	6	56565	56570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020291	TA	3	6	56571	56576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020291	TTTTA	2	10	56585	56594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020291	T	6	6	56625	56630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020291	GGA	2	6	56660	56665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020291	AAT	2	6	56672	56677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816940
1574	NC_020291	ATT	2	6	56709	56714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816940
1575	NC_020291	T	6	6	56713	56718	0 %	100 %	0 %	0 %	451816940
1576	NC_020291	AGT	2	6	56798	56803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816940
1577	NC_020291	T	6	6	56814	56819	0 %	100 %	0 %	0 %	451816940
1578	NC_020291	ATG	2	6	56897	56902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816940
1579	NC_020291	GAA	2	6	56914	56919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816940
1580	NC_020291	GAG	2	6	56972	56977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816940
1581	NC_020291	A	7	7	56983	56989	100 %	0 %	0 %	0 %	451816940
1582	NC_020291	TGT	2	6	57016	57021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816940
1583	NC_020291	GAT	3	9	57056	57064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816940
1584	NC_020291	TTA	2	6	57074	57079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816940
1585	NC_020291	AAAT	2	8	57084	57091	75 %	25 %	0 %	0 %	451816940
1586	NC_020291	TGA	2	6	57136	57141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816940
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1588	NC_020291	A	7	7	57210	57216	100 %	0 %	0 %	0 %	451816940
1589	NC_020291	GTA	2	6	57224	57229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816940
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1591	NC_020291	TAA	2	6	57417	57422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816940
1592	NC_020291	A	6	6	57518	57523	100 %	0 %	0 %	0 %	451816940
1593	NC_020291	GAA	2	6	57557	57562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816940
1594	NC_020291	TAT	2	6	57606	57611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020291	GTT	2	6	57693	57698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816941
1596	NC_020291	GTA	2	6	57699	57704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816941
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1598	NC_020291	AGA	2	6	57785	57790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816941
1599	NC_020291	GAG	2	6	57838	57843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816941
1600	NC_020291	A	6	6	57914	57919	100 %	0 %	0 %	0 %	451816941
1601	NC_020291	ACA	3	9	57936	57944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816941
1602	NC_020291	GAA	2	6	57982	57987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816941
1603	NC_020291	A	6	6	58026	58031	100 %	0 %	0 %	0 %	451816941
1604	NC_020291	TTA	2	6	58057	58062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816941
1605	NC_020291	GAT	2	6	58095	58100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816941
1606	NC_020291	TA	3	6	58116	58121	50 %	50 %	0 %	0 %	451816941
1607	NC_020291	TAATA	2	10	58181	58190	60 %	40 %	0 %	0 %	451816941
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1609	NC_020291	ATT	2	6	58237	58242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816941
1610	NC_020291	A	7	7	58290	58296	100 %	0 %	0 %	0 %	451816941
1611	NC_020291	TAT	2	6	58298	58303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816941
1612	NC_020291	ATA	2	6	58327	58332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816941
1613	NC_020291	TAAT	2	8	58369	58376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020291	AAAAT	2	10	58380	58389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020291	TAAA	2	8	58396	58403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020291	A	6	6	58401	58406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020291	GAAT	2	8	58457	58464	50 %	25 %	25 %	0 %	451816942
1618	NC_020291	AAT	2	6	58472	58477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816942
1619	NC_020291	ATA	2	6	58482	58487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816942
1620	NC_020291	T	7	7	58494	58500	0 %	100 %	0 %	0 %	451816942
1621	NC_020291	TAA	2	6	58523	58528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816942
1622	NC_020291	T	6	6	58552	58557	0 %	100 %	0 %	0 %	451816942
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1628	NC_020291	T	6	6	58813	58818	0 %	100 %	0 %	0 %	451816942
1629	NC_020291	TTTAA	2	10	58925	58934	40 %	60 %	0 %	0 %	451816942
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