MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	AGACC	2	10	306	315	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020261	CATCG	2	10	612	621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020261	TTCCC	2	10	1695	1704	0 %	40 %	0 %	60 %	449306369
4	NC_020261	AGTTA	2	10	1826	1835	40 %	40 %	20 %	0 %	449306369
5	NC_020261	GGTCA	2	10	5494	5503	20 %	20 %	40 %	20 %	449306373
6	NC_020261	TAAAT	2	10	5695	5704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020261	AATGA	2	10	5724	5733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020261	CGTAT	2	10	6836	6845	20 %	40 %	20 %	20 %	449306375
9	NC_020261	ACGCA	2	10	7652	7661	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_020261	GACAG	2	10	9678	9687	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020261	TCTGG	2	10	9782	9791	0 %	40 %	40 %	20 %	449306377
12	NC_020261	GCAGA	2	10	9889	9898	40 %	0 %	40 %	20 %	449306377
13	NC_020261	ATTCG	2	10	10197	10206	20 %	40 %	20 %	20 %	449306378
14	NC_020261	TCAGC	2	10	10419	10428	20 %	20 %	20 %	40 %	449306378
15	NC_020261	CGTTA	2	10	15292	15301	20 %	40 %	20 %	20 %	449306381
16	NC_020261	GAAAA	2	10	18120	18129	80 %	0 %	20 %	0 %	449306384
17	NC_020261	TTATC	2	10	19336	19345	20 %	60 %	0 %	20 %	449306384
18	NC_020261	AATTT	2	10	20707	20716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020261	CATGC	2	10	20825	20834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020261	TGATA	2	10	21142	21151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020261	ACCCA	2	10	21664	21673	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_020261	GGAAA	2	10	24470	24479	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020261	GCAGT	2	10	27426	27435	20 %	20 %	40 %	20 %	449306390
24	NC_020261	CCGGA	2	10	27543	27552	20 %	0 %	40 %	40 %	449306390
25	NC_020261	GCAGC	2	10	28652	28661	20 %	0 %	40 %	40 %	449306391
26	NC_020261	GCCAG	2	10	29362	29371	20 %	0 %	40 %	40 %	449306391
27	NC_020261	TTTGT	2	10	29739	29748	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020261	AAAAG	2	10	30814	30823	80 %	0 %	20 %	0 %	449306394
29	NC_020261	CGAAA	2	10	32904	32913	60 %	0 %	20 %	20 %	449306397
30	NC_020261	TGATC	2	10	33572	33581	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020261	CAAAC	2	10	33726	33735	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020261	TTCTT	2	10	34520	34529	0 %	80 %	0 %	20 %	449306399
33	NC_020261	CACGA	2	10	35232	35241	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020261	TGGTG	2	10	36713	36722	0 %	40 %	60 %	0 %	449306401
35	NC_020261	ATTGC	2	10	39567	39576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020261	AGAAA	2	10	40328	40337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020261	AAGAA	2	10	45624	45633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020261	ACCGG	2	10	47617	47626	20 %	0 %	40 %	40 %	449306415
39	NC_020261	ATGAG	2	10	48476	48485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020261	TGTCA	2	10	49858	49867	20 %	40 %	20 %	20 %	449306417
41	NC_020261	CACGA	2	10	50680	50689	40 %	0 %	20 %	40 %	449306419

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.