MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020248	AGCG	2	8	190073	190080	25 %	0 %	50 %	25 %	449070828
4002	NC_020248	GAA	2	6	190170	190175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070828
4003	NC_020248	TC	3	6	190180	190185	0 %	50 %	0 %	50 %	449070828
4004	NC_020248	CAG	2	6	190200	190205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070828
4005	NC_020248	GCCTTG	2	12	190231	190242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070828
4006	NC_020248	TTA	2	6	190268	190273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070828
4007	NC_020248	CGG	2	6	190280	190285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449070828
4008	NC_020248	TCT	2	6	190316	190321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070828
4009	NC_020248	CAC	2	6	190354	190359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070828
4010	NC_020248	AAG	2	6	190494	190499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070828
4011	NC_020248	CTT	2	6	190551	190556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070828
4012	NC_020248	TTAT	2	8	190635	190642	25 %	75 %	0 %	0 %	449070828
4013	NC_020248	TTC	3	9	190650	190658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070828
4014	NC_020248	ATG	2	6	190698	190703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070828
4015	NC_020248	GAT	2	6	190757	190762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070828
4016	NC_020248	GT	3	6	190787	190792	0 %	50 %	50 %	0 %	449070828
4017	NC_020248	GGT	2	6	190842	190847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070828
4018	NC_020248	GCA	2	6	190903	190908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070828
4019	NC_020248	TTC	2	6	190973	190978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070828
4020	NC_020248	GATAA	2	10	190980	190989	60 %	20 %	20 %	0 %	449070828
4021	NC_020248	ATTT	2	8	190992	190999	25 %	75 %	0 %	0 %	449070828
4022	NC_020248	CTAT	2	8	191067	191074	25 %	50 %	0 %	25 %	449070828
4023	NC_020248	TGA	2	6	191077	191082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070828
4024	NC_020248	TCT	2	6	191112	191117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070828
4025	NC_020248	TAA	2	6	191171	191176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070828
4026	NC_020248	ACA	2	6	191183	191188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070828
4027	NC_020248	TTA	2	6	191214	191219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070828
4028	NC_020248	TCT	2	6	191294	191299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070828
4029	NC_020248	CTT	3	9	191330	191338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070828
4030	NC_020248	A	6	6	191341	191346	100 %	0 %	0 %	0 %	449070828
4031	NC_020248	ATA	2	6	191403	191408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020248	TCA	2	6	191412	191417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_020248	ATT	2	6	191452	191457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070829
4034	NC_020248	TTAA	2	8	191474	191481	50 %	50 %	0 %	0 %	449070829
4035	NC_020248	A	6	6	191493	191498	100 %	0 %	0 %	0 %	449070829
4036	NC_020248	GAA	2	6	191505	191510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070829
4037	NC_020248	CAA	2	6	191526	191531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070829
4038	NC_020248	ATT	3	9	191551	191559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070829
4039	NC_020248	TGG	2	6	191563	191568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070829
4040	NC_020248	TCA	2	6	191592	191597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070829
4041	NC_020248	ATC	2	6	191626	191631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070829
4042	NC_020248	CTT	2	6	191651	191656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_020248	GAAA	2	8	191678	191685	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_020248	ACA	2	6	191686	191691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_020248	TTG	2	6	191706	191711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_020248	AGAT	2	8	191749	191756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_020248	ACG	2	6	191772	191777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_020248	TTC	2	6	191804	191809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070830
4049	NC_020248	AT	3	6	191829	191834	50 %	50 %	0 %	0 %	449070830
4050	NC_020248	TCT	2	6	191859	191864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070830
4051	NC_020248	TGC	2	6	191894	191899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070830
4052	NC_020248	GTG	2	6	192040	192045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070830
4053	NC_020248	CTT	2	6	192099	192104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070830
4054	NC_020248	T	6	6	192146	192151	0 %	100 %	0 %	0 %	449070830
4055	NC_020248	GAAG	2	8	192203	192210	50 %	0 %	50 %	0 %	449070830
4056	NC_020248	AAG	2	6	192259	192264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070830
4057	NC_020248	ATC	2	6	192307	192312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070830
4058	NC_020248	GTG	2	6	192427	192432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070830
4059	NC_020248	TTA	2	6	192486	192491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070830
4060	NC_020248	GA	3	6	192538	192543	50 %	0 %	50 %	0 %	449070830
4061	NC_020248	T	6	6	192616	192621	0 %	100 %	0 %	0 %	449070830
4062	NC_020248	TTG	2	6	192726	192731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070830
4063	NC_020248	TGA	2	6	192755	192760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070830
4064	NC_020248	A	6	6	192799	192804	100 %	0 %	0 %	0 %	449070830
4065	NC_020248	ATG	2	6	192823	192828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070830
4066	NC_020248	A	6	6	192832	192837	100 %	0 %	0 %	0 %	449070830
4067	NC_020248	A	6	6	192842	192847	100 %	0 %	0 %	0 %	449070830
4068	NC_020248	AGC	2	6	192869	192874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070830
4069	NC_020248	TAT	2	6	192917	192922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070830
4070	NC_020248	TAA	2	6	192947	192952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070830
4071	NC_020248	ATT	2	6	192963	192968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070830
4072	NC_020248	AGGG	2	8	192976	192983	25 %	0 %	75 %	0 %	449070830
4073	NC_020248	GGA	2	6	193068	193073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070830
4074	NC_020248	GCA	2	6	193083	193088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070830
4075	NC_020248	TTCA	2	8	193134	193141	25 %	50 %	0 %	25 %	449070830
4076	NC_020248	A	6	6	193160	193165	100 %	0 %	0 %	0 %	449070830
4077	NC_020248	CCCTT	2	10	193183	193192	0 %	40 %	0 %	60 %	449070830
4078	NC_020248	TGA	2	6	193211	193216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070830
4079	NC_020248	CT	3	6	193233	193238	0 %	50 %	0 %	50 %	449070830
4080	NC_020248	TTA	2	6	193323	193328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070830
4081	NC_020248	ATC	2	6	193336	193341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070830
4082	NC_020248	GAAA	2	8	193365	193372	75 %	0 %	25 %	0 %	449070830
4083	NC_020248	CAC	2	6	193456	193461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070830
4084	NC_020248	GGA	2	6	193482	193487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070830
4085	NC_020248	TCAT	2	8	193489	193496	25 %	50 %	0 %	25 %	449070830
4086	NC_020248	TTC	2	6	193519	193524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070830
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4088	NC_020248	T	6	6	193609	193614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_020248	CT	3	6	193674	193679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_020248	GTTT	2	8	193682	193689	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_020248	TTA	2	6	193752	193757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_020248	GTT	2	6	193834	193839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_020248	TTTTA	2	10	193884	193893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_020248	TTC	2	6	193900	193905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_020248	T	7	7	193968	193974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020248	TTC	2	6	194090	194095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070831
4097	NC_020248	AGTTA	2	10	194174	194183	40 %	40 %	20 %	0 %	449070831
4098	NC_020248	TTATT	2	10	194194	194203	20 %	80 %	0 %	0 %	449070831
4099	NC_020248	CTG	2	6	194260	194265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070831
4100	NC_020248	TTA	2	6	194307	194312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070831
4101	NC_020248	AGG	2	6	194314	194319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070831
4102	NC_020248	ATG	2	6	194350	194355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
4103	NC_020248	ATG	2	6	194392	194397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
4104	NC_020248	ATTT	2	8	194398	194405	25 %	75 %	0 %	0 %	449070831
4105	NC_020248	TGA	3	9	194510	194518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
4106	NC_020248	ACAATC	2	12	194540	194551	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	449070831
4107	NC_020248	TAG	2	6	194588	194593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070831
4108	NC_020248	CAAAGG	2	12	194671	194682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449070831
4109	NC_020248	ATT	2	6	194685	194690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070831
4110	NC_020248	GA	3	6	194756	194761	50 %	0 %	50 %	0 %	449070831
4111	NC_020248	TGT	2	6	194777	194782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070831
4112	NC_020248	TCA	2	6	194808	194813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070831
4113	NC_020248	GTT	2	6	194858	194863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070831
4114	NC_020248	ATT	2	6	194915	194920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070831
4115	NC_020248	AC	3	6	194922	194927	50 %	0 %	0 %	50 %	449070831
4116	NC_020248	AAT	2	6	194975	194980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070831
4117	NC_020248	TTC	2	6	195018	195023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_020248	TCT	2	6	195052	195057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_020248	CAT	2	6	195059	195064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_020248	ACA	2	6	195091	195096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_020248	TTG	2	6	195099	195104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020248	ACA	2	6	195150	195155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_020248	TGT	2	6	195240	195245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_020248	AGT	2	6	195294	195299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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