MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020248	AG	4	8	165996	166003	50 %	0 %	50 %	0 %	449070805
3502	NC_020248	GAT	2	6	166035	166040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3503	NC_020248	GAA	3	9	166053	166061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3504	NC_020248	CAA	2	6	166062	166067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070805
3505	NC_020248	ATG	2	6	166084	166089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3506	NC_020248	AAC	2	6	166109	166114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070805
3507	NC_020248	TGT	2	6	166193	166198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070805
3508	NC_020248	CGAG	2	8	166202	166209	25 %	0 %	50 %	25 %	449070805
3509	NC_020248	GAA	2	6	166221	166226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3510	NC_020248	GAT	2	6	166289	166294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3511	NC_020248	GTG	2	6	166345	166350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070805
3512	NC_020248	GAG	2	6	166365	166370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070805
3513	NC_020248	AAATG	2	10	166400	166409	60 %	20 %	20 %	0 %	449070805
3514	NC_020248	CTT	2	6	166560	166565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3515	NC_020248	AAGAGA	2	12	166600	166611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3516	NC_020248	GAA	2	6	166674	166679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3517	NC_020248	AAT	2	6	166701	166706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070805
3518	NC_020248	TCT	2	6	166718	166723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3519	NC_020248	AGC	2	6	166813	166818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070805
3520	NC_020248	G	6	6	166898	166903	0 %	0 %	100 %	0 %	449070805
3521	NC_020248	TGA	2	6	166970	166975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070805
3522	NC_020248	AAC	2	6	166996	167001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070805
3523	NC_020248	TTGC	2	8	167003	167010	0 %	50 %	25 %	25 %	449070805
3524	NC_020248	TTC	2	6	167019	167024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
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3526	NC_020248	TC	3	6	167263	167268	0 %	50 %	0 %	50 %	449070805
3527	NC_020248	GGA	2	6	167295	167300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070805
3528	NC_020248	GAA	2	6	167322	167327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3529	NC_020248	TTC	2	6	167334	167339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3530	NC_020248	AGC	2	6	167417	167422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070805
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3532	NC_020248	AAG	2	6	167510	167515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070805
3533	NC_020248	TCT	2	6	167580	167585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070805
3534	NC_020248	CAAC	2	8	167619	167626	50 %	0 %	0 %	50 %	449070805
3535	NC_020248	TGT	2	6	167790	167795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070806
3536	NC_020248	A	6	6	167797	167802	100 %	0 %	0 %	0 %	449070806
3537	NC_020248	GT	3	6	167872	167877	0 %	50 %	50 %	0 %	449070806
3538	NC_020248	GCA	2	6	167911	167916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070806
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3540	NC_020248	TAC	2	6	167934	167939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070806
3541	NC_020248	ATTC	2	8	167943	167950	25 %	50 %	0 %	25 %	449070806
3542	NC_020248	ATA	2	6	168023	168028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070806
3543	NC_020248	GAA	2	6	168040	168045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070806
3544	NC_020248	A	8	8	168044	168051	100 %	0 %	0 %	0 %	449070806
3545	NC_020248	TGA	2	6	168166	168171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070806
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3547	NC_020248	TTC	2	6	168186	168191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070806
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3550	NC_020248	T	6	6	168406	168411	0 %	100 %	0 %	0 %	449070806
3551	NC_020248	GAAG	2	8	168439	168446	50 %	0 %	50 %	0 %	449070806
3552	NC_020248	AAAG	2	8	168477	168484	75 %	0 %	25 %	0 %	449070806
3553	NC_020248	A	6	6	168493	168498	100 %	0 %	0 %	0 %	449070806
3554	NC_020248	TG	3	6	168652	168657	0 %	50 %	50 %	0 %	449070806
3555	NC_020248	GAA	2	6	168691	168696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_020248	GTT	2	6	168711	168716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070807
3557	NC_020248	T	7	7	168736	168742	0 %	100 %	0 %	0 %	449070807
3558	NC_020248	TGA	2	6	168783	168788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070807
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3560	NC_020248	T	7	7	168900	168906	0 %	100 %	0 %	0 %	449070807
3561	NC_020248	CTG	2	6	168907	168912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070807
3562	NC_020248	T	12	12	168991	169002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_020248	A	8	8	169065	169072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_020248	TTA	2	6	169085	169090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_020248	A	6	6	169099	169104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_020248	TTTTC	2	10	169215	169224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3567	NC_020248	TAA	2	6	169225	169230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3570	NC_020248	AGT	2	6	169318	169323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_020248	GTA	2	6	169383	169388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_020248	T	9	9	169418	169426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_020248	AG	3	6	169502	169507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_020248	A	6	6	169542	169547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_020248	ACA	2	6	169562	169567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_020248	GAT	2	6	169622	169627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3578	NC_020248	AG	3	6	169684	169689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_020248	CTGTT	2	10	169694	169703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3580	NC_020248	AATGA	2	10	169729	169738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_020248	TTG	2	6	169757	169762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_020248	TGT	2	6	169833	169838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070808
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3585	NC_020248	GTT	2	6	169973	169978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_020248	TAGT	2	8	170038	170045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_020248	TAC	2	6	170148	170153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070809
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3594	NC_020248	AGT	2	6	170417	170422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070809
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3598	NC_020248	TAT	2	6	170712	170717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070809
3599	NC_020248	TCT	2	6	170721	170726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070809
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3604	NC_020248	GAT	2	6	170957	170962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070810
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3606	NC_020248	AAG	2	6	171046	171051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070810
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3608	NC_020248	GAT	2	6	171109	171114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070810
3609	NC_020248	ATA	2	6	171122	171127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070810
3610	NC_020248	AAC	2	6	171233	171238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070810
3611	NC_020248	T	8	8	171280	171287	0 %	100 %	0 %	0 %	449070810
3612	NC_020248	AGA	2	6	171377	171382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070810
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3614	NC_020248	GA	3	6	171444	171449	50 %	0 %	50 %	0 %	449070810
3615	NC_020248	TCT	2	6	171545	171550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070811
3616	NC_020248	ATC	2	6	171628	171633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070811
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3620	NC_020248	GATA	2	8	171843	171850	50 %	25 %	25 %	0 %	449070811
3621	NC_020248	TTG	2	6	171895	171900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070811
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3627	NC_020248	AGA	2	6	172258	172263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070812
3628	NC_020248	GA	4	8	172426	172433	50 %	0 %	50 %	0 %	449070812
3629	NC_020248	CAGG	2	8	172441	172448	25 %	0 %	50 %	25 %	449070812
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3635	NC_020248	AG	3	6	173173	173178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3652	NC_020248	GGC	2	6	173662	173667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3653	NC_020248	AGT	2	6	173728	173733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3654	NC_020248	AGA	2	6	173842	173847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3655	NC_020248	AGA	2	6	173860	173865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3656	NC_020248	CGCAT	2	10	173906	173915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3668	NC_020248	A	6	6	174671	174676	100 %	0 %	0 %	0 %	449070815
3669	NC_020248	ATG	2	6	174776	174781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070815
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4000	NC_020248	TAGT	2	8	190033	190040	25 %	50 %	25 %	0 %	449070828

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