MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020248	AAG	2	6	118678	118683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070756
2502	NC_020248	T	6	6	118690	118695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_020248	A	6	6	118730	118735	100 %	0 %	0 %	0 %	449070757
2504	NC_020248	GTT	2	6	118775	118780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070757
2505	NC_020248	CAA	2	6	118798	118803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070757
2506	NC_020248	GTC	2	6	118888	118893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070757
2507	NC_020248	TGC	2	6	118900	118905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070757
2508	NC_020248	GT	3	6	118967	118972	0 %	50 %	50 %	0 %	449070757
2509	NC_020248	GTT	2	6	119033	119038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070757
2510	NC_020248	GAG	2	6	119116	119121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_020248	TTTAC	2	10	119148	119157	20 %	60 %	0 %	20 %	449070758
2512	NC_020248	AGTC	2	8	119177	119184	25 %	25 %	25 %	25 %	449070758
2513	NC_020248	ATG	2	6	119188	119193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070758
2514	NC_020248	ATT	2	6	119326	119331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070758
2515	NC_020248	AGA	2	6	119385	119390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070758
2516	NC_020248	ATC	2	6	119401	119406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070758
2517	NC_020248	TTA	2	6	119425	119430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070758
2518	NC_020248	ATT	2	6	119475	119480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070758
2519	NC_020248	TGG	2	6	119523	119528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070758
2520	NC_020248	AAG	2	6	119561	119566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070758
2521	NC_020248	TAC	2	6	119664	119669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070758
2522	NC_020248	CGT	2	6	119736	119741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070758
2523	NC_020248	AGA	2	6	119760	119765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070758
2524	NC_020248	AAG	2	6	119840	119845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070758
2525	NC_020248	A	6	6	119894	119899	100 %	0 %	0 %	0 %	449070758
2526	NC_020248	GAA	2	6	119907	119912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070758
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2529	NC_020248	AGTT	2	8	119972	119979	25 %	50 %	25 %	0 %	449070758
2530	NC_020248	TTA	2	6	120062	120067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070758
2531	NC_020248	A	6	6	120206	120211	100 %	0 %	0 %	0 %	449070758
2532	NC_020248	AGAA	2	8	120279	120286	75 %	0 %	25 %	0 %	449070759
2533	NC_020248	CCA	2	6	120353	120358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070759
2534	NC_020248	AGAA	2	8	120359	120366	75 %	0 %	25 %	0 %	449070759
2535	NC_020248	ACT	2	6	120372	120377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070759
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2537	NC_020248	GAT	2	6	120416	120421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070759
2538	NC_020248	AAG	2	6	120505	120510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070759
2539	NC_020248	GGT	2	6	120525	120530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070759
2540	NC_020248	TGG	2	6	120611	120616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070759
2541	NC_020248	TAT	2	6	120671	120676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070759
2542	NC_020248	T	7	7	120700	120706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_020248	ACT	2	6	120716	120721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_020248	TTC	2	6	120801	120806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070760
2545	NC_020248	CAG	2	6	120893	120898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070760
2546	NC_020248	TTG	2	6	120923	120928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070760
2547	NC_020248	A	6	6	121033	121038	100 %	0 %	0 %	0 %	449070760
2548	NC_020248	TAC	2	6	121185	121190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070760
2549	NC_020248	AGA	2	6	121239	121244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070760
2550	NC_020248	ACC	2	6	121255	121260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070760
2551	NC_020248	CGC	2	6	121266	121271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449070760
2552	NC_020248	CA	3	6	121278	121283	50 %	0 %	0 %	50 %	449070760
2553	NC_020248	A	7	7	121305	121311	100 %	0 %	0 %	0 %	449070760
2554	NC_020248	GAA	2	6	121495	121500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070760
2555	NC_020248	GTT	2	6	121510	121515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070760
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2558	NC_020248	TCT	2	6	121576	121581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070760
2559	NC_020248	TTC	2	6	121602	121607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070760
2560	NC_020248	TTA	2	6	121708	121713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070760
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2562	NC_020248	AGC	2	6	121832	121837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070761
2563	NC_020248	TGT	2	6	121854	121859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070761
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2565	NC_020248	CTG	2	6	121937	121942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070761
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2567	NC_020248	AGC	2	6	122055	122060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070761
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2570	NC_020248	CTG	2	6	122126	122131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070761
2571	NC_020248	CTC	2	6	122138	122143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070761
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2574	NC_020248	TAA	2	6	122223	122228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070761
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2581	NC_020248	AGA	2	6	122324	122329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070761
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2584	NC_020248	AATT	2	8	122357	122364	50 %	50 %	0 %	0 %	449070761
2585	NC_020248	ATT	2	6	122491	122496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070761
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2589	NC_020248	TCT	2	6	122600	122605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_020248	AGT	2	6	122629	122634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020248	T	6	6	122665	122670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_020248	ATTT	2	8	122714	122721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_020248	AAT	2	6	122726	122731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_020248	ATT	2	6	122746	122751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_020248	TGG	2	6	122759	122764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_020248	CTTTT	2	10	122836	122845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2597	NC_020248	AAAG	2	8	122889	122896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020248	T	6	6	122905	122910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_020248	T	6	6	122923	122928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_020248	T	6	6	122976	122981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_020248	TTTCTT	2	12	122994	123005	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2602	NC_020248	TAAT	2	8	123058	123065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_020248	GCG	2	6	123084	123089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_020248	TTC	3	9	123147	123155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_020248	AT	3	6	123169	123174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_020248	AAC	2	6	123278	123283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070762
2607	NC_020248	AGCA	2	8	123308	123315	50 %	0 %	25 %	25 %	449070762
2608	NC_020248	TCCT	2	8	123317	123324	0 %	50 %	0 %	50 %	449070762
2609	NC_020248	AGAA	2	8	123374	123381	75 %	0 %	25 %	0 %	449070762
2610	NC_020248	GAGAT	2	10	123392	123401	40 %	20 %	40 %	0 %	449070762
2611	NC_020248	ACA	2	6	123447	123452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070762
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2614	NC_020248	CAA	2	6	123535	123540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070762
2615	NC_020248	AAG	2	6	123701	123706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070762
2616	NC_020248	TAC	2	6	123736	123741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070762
2617	NC_020248	AGA	3	9	123806	123814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070762
2618	NC_020248	TTG	2	6	123839	123844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070762
2619	NC_020248	TA	4	8	124015	124022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_020248	TTG	2	6	124153	124158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070763
2621	NC_020248	AGC	2	6	124159	124164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070763
2622	NC_020248	AGC	2	6	124237	124242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070763
2623	NC_020248	GAG	2	6	124354	124359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070763
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2999	NC_020248	TTG	2	6	142938	142943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070780
3000	NC_020248	GTA	2	6	142962	142967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070780

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