MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020248	ACA	2	6	23034	23039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070656
502	NC_020248	AAG	2	6	23048	23053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070656
503	NC_020248	AAG	2	6	23075	23080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070656
504	NC_020248	AAC	2	6	23106	23111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070656
505	NC_020248	GGT	2	6	23158	23163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070656
506	NC_020248	AGC	2	6	23174	23179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070656
507	NC_020248	ATG	2	6	23264	23269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070656
508	NC_020248	AGC	2	6	23281	23286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070656
509	NC_020248	GCT	2	6	23287	23292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070656
510	NC_020248	CTG	2	6	23378	23383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070656
511	NC_020248	ATG	2	6	23579	23584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070656
512	NC_020248	TTA	2	6	23597	23602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070656
513	NC_020248	AAG	2	6	23654	23659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070656
514	NC_020248	GA	3	6	23668	23673	50 %	0 %	50 %	0 %	449070656
515	NC_020248	ACTT	2	8	23761	23768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_020248	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020248	TGA	3	9	23844	23852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020248	AAG	2	6	23889	23894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020248	CTA	2	6	23953	23958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070657
520	NC_020248	TTG	2	6	24014	24019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
521	NC_020248	CTG	2	6	24050	24055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070657
522	NC_020248	TGTC	2	8	24056	24063	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
523	NC_020248	AGT	2	6	24068	24073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070657
524	NC_020248	TTG	2	6	24080	24085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
525	NC_020248	TCC	2	6	24119	24124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070657
526	NC_020248	AGCT	2	8	24169	24176	25 %	25 %	25 %	25 %	449070657
527	NC_020248	T	7	7	24220	24226	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
528	NC_020248	TTG	2	6	24353	24358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
529	NC_020248	GAA	2	6	24363	24368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070657
530	NC_020248	GTT	2	6	24379	24384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
531	NC_020248	T	6	6	24388	24393	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
532	NC_020248	AT	3	6	24450	24455	50 %	50 %	0 %	0 %	449070657
533	NC_020248	TC	3	6	24511	24516	0 %	50 %	0 %	50 %	449070657
534	NC_020248	CTT	2	6	24517	24522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070657
535	NC_020248	AGG	2	6	24538	24543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070657
536	NC_020248	GTA	2	6	24551	24556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070657
537	NC_020248	GCA	2	6	24612	24617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070657
538	NC_020248	TTA	2	6	24621	24626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070657
539	NC_020248	AATT	2	8	24628	24635	50 %	50 %	0 %	0 %	449070657
540	NC_020248	ATAA	2	8	24695	24702	75 %	25 %	0 %	0 %	449070657
541	NC_020248	T	8	8	24797	24804	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
542	NC_020248	TGT	2	6	24819	24824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
543	NC_020248	GCT	2	6	24849	24854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070657
544	NC_020248	GCT	2	6	24879	24884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070657
545	NC_020248	CTA	2	6	24906	24911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070657
546	NC_020248	TCTG	2	8	24927	24934	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
547	NC_020248	TAGT	2	8	24984	24991	25 %	50 %	25 %	0 %	449070657
548	NC_020248	TTG	2	6	25016	25021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
549	NC_020248	TGT	2	6	25068	25073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
550	NC_020248	ATT	2	6	25109	25114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070657
551	NC_020248	T	6	6	25231	25236	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
552	NC_020248	TTGC	2	8	25252	25259	0 %	50 %	25 %	25 %	449070657
553	NC_020248	AGC	2	6	25372	25377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070657
554	NC_020248	TTG	2	6	25385	25390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
555	NC_020248	GAAC	2	8	25440	25447	50 %	0 %	25 %	25 %	449070657
556	NC_020248	GCA	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070657
557	NC_020248	GTT	2	6	25539	25544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
558	NC_020248	CTT	2	6	25585	25590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070657
559	NC_020248	AG	3	6	25607	25612	50 %	0 %	50 %	0 %	449070657
560	NC_020248	GAGT	2	8	25624	25631	25 %	25 %	50 %	0 %	449070657
561	NC_020248	TAA	2	6	25639	25644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070657
562	NC_020248	CTT	3	9	25645	25653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070657
563	NC_020248	CAC	2	6	25654	25659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070657
564	NC_020248	TTA	2	6	25674	25679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070657
565	NC_020248	TTA	2	6	25749	25754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070657
566	NC_020248	TCAT	2	8	25788	25795	25 %	50 %	0 %	25 %	449070657
567	NC_020248	CCA	2	6	25812	25817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070657
568	NC_020248	A	6	6	25862	25867	100 %	0 %	0 %	0 %	449070657
569	NC_020248	TCT	2	6	25914	25919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070657
570	NC_020248	T	6	6	25991	25996	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
571	NC_020248	TCTT	2	8	26013	26020	0 %	75 %	0 %	25 %	449070657
572	NC_020248	T	7	7	26049	26055	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
573	NC_020248	GTTT	2	8	26077	26084	0 %	75 %	25 %	0 %	449070657
574	NC_020248	T	6	6	26082	26087	0 %	100 %	0 %	0 %	449070657
575	NC_020248	TAA	2	6	26099	26104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070657
576	NC_020248	TGT	2	6	26207	26212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
577	NC_020248	AGG	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070657
578	NC_020248	GTT	2	6	26312	26317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070657
579	NC_020248	AAC	2	6	26325	26330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070657
580	NC_020248	TAAA	2	8	26470	26477	75 %	25 %	0 %	0 %	449070657
581	NC_020248	TA	3	6	26510	26515	50 %	50 %	0 %	0 %	449070657
582	NC_020248	AGA	2	6	26519	26524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070657
583	NC_020248	ATT	2	6	26532	26537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020248	T	7	7	26575	26581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020248	TTAA	2	8	26594	26601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020248	TTC	2	6	26611	26616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_020248	TATT	2	8	26651	26658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020248	ATTA	2	8	26663	26670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020248	TTA	2	6	26694	26699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
590	NC_020248	A	6	6	26769	26774	100 %	0 %	0 %	0 %	449070658
591	NC_020248	CCA	2	6	26813	26818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449070658
592	NC_020248	TTA	2	6	26820	26825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
593	NC_020248	TGA	2	6	26906	26911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070658
594	NC_020248	CTG	2	6	27052	27057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070658
595	NC_020248	ACA	2	6	27110	27115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
596	NC_020248	TTA	2	6	27129	27134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070658
597	NC_020248	A	6	6	27144	27149	100 %	0 %	0 %	0 %	449070658
598	NC_020248	AAG	2	6	27271	27276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
599	NC_020248	AGC	2	6	27287	27292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
600	NC_020248	TGGT	2	8	27325	27332	0 %	50 %	50 %	0 %	449070658
601	NC_020248	TA	3	6	27370	27375	50 %	50 %	0 %	0 %	449070658
602	NC_020248	AAG	2	6	27384	27389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
603	NC_020248	TCT	2	6	27411	27416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070658
604	NC_020248	GGT	2	6	27426	27431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070658
605	NC_020248	TC	3	6	27455	27460	0 %	50 %	0 %	50 %	449070658
606	NC_020248	AGA	3	9	27560	27568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
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608	NC_020248	AC	3	6	27623	27628	50 %	0 %	0 %	50 %	449070658
609	NC_020248	AATC	2	8	27719	27726	50 %	25 %	0 %	25 %	449070658
610	NC_020248	GCT	2	6	27765	27770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070658
611	NC_020248	GTT	2	6	27789	27794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070658
612	NC_020248	TCA	2	6	27818	27823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070658
613	NC_020248	CAG	2	6	27914	27919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
614	NC_020248	CGC	2	6	27920	27925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449070658
615	NC_020248	AATT	2	8	27956	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	449070658
616	NC_020248	CAA	3	9	27990	27998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
617	NC_020248	TAA	2	6	28004	28009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070658
618	NC_020248	TA	3	6	28047	28052	50 %	50 %	0 %	0 %	449070658
619	NC_020248	TTG	2	6	28072	28077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070658
620	NC_020248	CTA	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070658
621	NC_020248	ACA	2	6	28101	28106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
622	NC_020248	AGC	2	6	28142	28147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
623	NC_020248	GAAA	2	8	28148	28155	75 %	0 %	25 %	0 %	449070658
624	NC_020248	AGA	2	6	28259	28264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070658
625	NC_020248	CAA	2	6	28284	28289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070658
626	NC_020248	T	6	6	28613	28618	0 %	100 %	0 %	0 %	449070658
627	NC_020248	GCT	2	6	28707	28712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070658
628	NC_020248	CAG	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070658
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630	NC_020248	GA	3	6	28759	28764	50 %	0 %	50 %	0 %	449070658
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