MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 24704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020248	GTCC	2	8	236215	236222	0 %	25 %	25 %	50 %	449070872
5002	NC_020248	GTCT	2	8	236233	236240	0 %	50 %	25 %	25 %	449070872
5003	NC_020248	T	6	6	236240	236245	0 %	100 %	0 %	0 %	449070872
5004	NC_020248	GAA	2	6	236386	236391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070872
5005	NC_020248	ACA	2	6	236416	236421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070872
5006	NC_020248	CAA	2	6	236423	236428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070872
5007	NC_020248	ACT	2	6	236436	236441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070872
5008	NC_020248	TCT	2	6	236451	236456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070872
5009	NC_020248	TTA	2	6	236467	236472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070872
5010	NC_020248	GTA	2	6	236474	236479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070872
5011	NC_020248	TC	4	8	236486	236493	0 %	50 %	0 %	50 %	449070872
5012	NC_020248	ATC	2	6	236510	236515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070872
5013	NC_020248	TCT	2	6	236632	236637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070872
5014	NC_020248	TG	4	8	236650	236657	0 %	50 %	50 %	0 %	449070872
5015	NC_020248	TC	4	8	236742	236749	0 %	50 %	0 %	50 %	449070872
5016	NC_020248	CTT	2	6	236809	236814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070872
5017	NC_020248	ATG	2	6	236824	236829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070872
5018	NC_020248	TGT	2	6	236859	236864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070872
5019	NC_020248	TGG	2	6	236888	236893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070872
5020	NC_020248	AG	3	6	236955	236960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020248	AT	3	6	237025	237030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020248	CTA	2	6	237134	237139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_020248	CGA	2	6	237372	237377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070873
5024	NC_020248	TGC	2	6	237383	237388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070873
5025	NC_020248	T	6	6	237466	237471	0 %	100 %	0 %	0 %	449070873
5026	NC_020248	AAC	3	9	237541	237549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070873
5027	NC_020248	T	6	6	237556	237561	0 %	100 %	0 %	0 %	449070873
5028	NC_020248	GTT	2	6	237562	237567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070873
5029	NC_020248	TAA	2	6	237568	237573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070873
5030	NC_020248	TGC	2	6	237629	237634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070873
5031	NC_020248	CTT	2	6	237648	237653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070873
5032	NC_020248	ACT	2	6	237700	237705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070873
5033	NC_020248	CTTT	2	8	237725	237732	0 %	75 %	0 %	25 %	449070873
5034	NC_020248	TGC	2	6	237817	237822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070873
5035	NC_020248	CATC	2	8	237852	237859	25 %	25 %	0 %	50 %	449070873
5036	NC_020248	GCT	2	6	237869	237874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070873
5037	NC_020248	CTT	2	6	237930	237935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070873
5038	NC_020248	CGA	2	6	237986	237991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070873
5039	NC_020248	CATG	2	8	238110	238117	25 %	25 %	25 %	25 %	449070873
5040	NC_020248	CTTG	2	8	238128	238135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_020248	GAAT	2	8	238180	238187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_020248	GAA	3	9	238194	238202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_020248	T	6	6	238217	238222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020248	AAG	2	6	238226	238231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_020248	T	7	7	238241	238247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_020248	AAG	2	6	238280	238285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020248	ACC	2	6	238299	238304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_020248	AATT	2	8	238319	238326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_020248	GAT	2	6	238360	238365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_020248	TTTC	2	8	238419	238426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_020248	GTT	2	6	238447	238452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_020248	A	8	8	238488	238495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_020248	AGA	2	6	238530	238535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020248	GAG	2	6	238615	238620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070874
5055	NC_020248	T	6	6	238675	238680	0 %	100 %	0 %	0 %	449070874
5056	NC_020248	GTT	2	6	238731	238736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070874
5057	NC_020248	CT	3	6	238738	238743	0 %	50 %	0 %	50 %	449070874
5058	NC_020248	AGC	2	6	238791	238796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070874
5059	NC_020248	TTG	2	6	238799	238804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070874
5060	NC_020248	CTC	2	6	238888	238893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449070874
5061	NC_020248	CTTT	2	8	238934	238941	0 %	75 %	0 %	25 %	449070874
5062	NC_020248	T	6	6	238939	238944	0 %	100 %	0 %	0 %	449070874
5063	NC_020248	AGA	2	6	239091	239096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020248	GATT	2	8	239102	239109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020248	GCA	2	6	239135	239140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_020248	ACTA	2	8	239311	239318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_020248	TTG	2	6	239397	239402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020248	GGA	2	6	239445	239450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070875
5069	NC_020248	AGGC	2	8	239468	239475	25 %	0 %	50 %	25 %	449070875
5070	NC_020248	AAG	2	6	239546	239551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070875
5071	NC_020248	T	7	7	239574	239580	0 %	100 %	0 %	0 %	449070875
5072	NC_020248	ATTATA	2	12	239660	239671	50 %	50 %	0 %	0 %	449070875
5073	NC_020248	AAAT	2	8	239697	239704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020248	CTT	2	6	239732	239737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_020248	TAT	2	6	239759	239764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070876
5076	NC_020248	ATAA	2	8	239800	239807	75 %	25 %	0 %	0 %	449070876
5077	NC_020248	GA	3	6	239842	239847	50 %	0 %	50 %	0 %	449070876
5078	NC_020248	A	6	6	239877	239882	100 %	0 %	0 %	0 %	449070876
5079	NC_020248	GCA	2	6	239895	239900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070876
5080	NC_020248	GCA	2	6	239905	239910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070876
5081	NC_020248	CAA	2	6	239963	239968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070876
5082	NC_020248	GCTT	2	8	239978	239985	0 %	50 %	25 %	25 %	449070876
5083	NC_020248	TTC	2	6	240021	240026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070876
5084	NC_020248	TAAAA	2	10	240077	240086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_020248	T	6	6	240122	240127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020248	TCA	2	6	240129	240134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070877
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5089	NC_020248	A	6	6	240388	240393	100 %	0 %	0 %	0 %	449070877
5090	NC_020248	TAG	2	6	240494	240499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070877
5091	NC_020248	T	6	6	240598	240603	0 %	100 %	0 %	0 %	449070877
5092	NC_020248	AAAT	2	8	240617	240624	75 %	25 %	0 %	0 %	449070877
5093	NC_020248	TCT	2	6	240667	240672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070877
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5095	NC_020248	CTT	2	6	240706	240711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449070877
5096	NC_020248	GTTT	2	8	240850	240857	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020248	TAG	2	6	240918	240923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_020248	A	7	7	241010	241016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020248	AG	3	6	241052	241057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_020248	TAT	2	6	241068	241073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_020248	TCAT	2	8	241080	241087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_020248	ATA	2	6	241095	241100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_020248	CGT	2	6	241116	241121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449070878
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5105	NC_020248	ATC	2	6	241200	241205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070878
5106	NC_020248	TAT	2	6	241237	241242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070878
5107	NC_020248	GAG	2	6	241252	241257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070878
5108	NC_020248	GAT	2	6	241276	241281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070878
5109	NC_020248	TTCAG	2	10	241306	241315	20 %	40 %	20 %	20 %	449070878
5110	NC_020248	TTG	2	6	241381	241386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070878
5111	NC_020248	CAT	2	6	241498	241503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070878
5112	NC_020248	ATT	2	6	241508	241513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070878
5113	NC_020248	GTTT	2	8	241619	241626	0 %	75 %	25 %	0 %	449070878
5114	NC_020248	AGG	2	6	241645	241650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449070878
5115	NC_020248	TG	3	6	241703	241708	0 %	50 %	50 %	0 %	449070878
5116	NC_020248	ATT	2	6	241743	241748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070878
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5118	NC_020248	AGA	2	6	241817	241822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070878
5119	NC_020248	TGA	2	6	241852	241857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070878
5120	NC_020248	TTG	2	6	241902	241907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070878
5121	NC_020248	CGG	2	6	241909	241914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449070878
5122	NC_020248	TTG	2	6	241920	241925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070878
5123	NC_020248	ATT	2	6	241955	241960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449070878
5124	NC_020248	ATG	2	6	242025	242030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070878
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5126	NC_020248	GCA	2	6	242087	242092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449070878
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5128	NC_020248	A	6	6	242132	242137	100 %	0 %	0 %	0 %	449070878
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5131	NC_020248	AT	3	6	242283	242288	50 %	50 %	0 %	0 %	449070878
5132	NC_020248	TGA	2	6	242407	242412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070878
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5135	NC_020248	TGA	2	6	242476	242481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070878
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5241	NC_020248	ATC	2	6	247556	247561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070884
5242	NC_020248	GTTT	2	8	247651	247658	0 %	75 %	25 %	0 %	449070885
5243	NC_020248	T	6	6	247668	247673	0 %	100 %	0 %	0 %	449070885
5244	NC_020248	AAT	2	6	247762	247767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070885
5245	NC_020248	TCA	2	6	247799	247804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070885
5246	NC_020248	AAG	2	6	247806	247811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_020248	ATA	2	6	247905	247910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449070886
5248	NC_020248	TAC	2	6	247994	247999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070886
5249	NC_020248	GAA	2	6	248007	248012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070886
5250	NC_020248	TTGAG	2	10	248053	248062	20 %	40 %	40 %	0 %	449070886
5251	NC_020248	GTT	2	6	248119	248124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449070886
5252	NC_020248	GAT	2	6	248169	248174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449070886
5253	NC_020248	GA	3	6	248223	248228	50 %	0 %	50 %	0 %	449070886
5254	NC_020248	TATT	2	8	248239	248246	25 %	75 %	0 %	0 %	449070886
5255	NC_020248	GAA	2	6	248295	248300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449070886
5256	NC_020248	ATC	2	6	248319	248324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449070886
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5259	NC_020248	TTCT	2	8	248441	248448	0 %	75 %	0 %	25 %	449070886
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5272	NC_020248	AG	3	6	249093	249098	50 %	0 %	50 %	0 %	449070886
5273	NC_020248	T	6	6	249181	249186	0 %	100 %	0 %	0 %	449070886
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5279	NC_020248	ACA	2	6	249705	249710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5280	NC_020248	TGG	2	6	249912	249917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449070887
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5283	NC_020248	AAT	2	6	250119	250124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_020248	T	6	6	250177	250182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_020248	GA	3	6	250238	250243	50 %	0 %	50 %	0 %	449070888
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5303	NC_020248	TA	3	6	251112	251117	50 %	50 %	0 %	0 %	449070888
5304	NC_020248	A	6	6	251195	251200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5305	NC_020248	GAG	2	6	251218	251223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5307	NC_020248	GTA	2	6	251327	251332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5310	NC_020248	T	8	8	251422	251429	0 %	100 %	0 %	0 %	449070889
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5369	NC_020248	TTGA	2	8	253848	253855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_020248	AAC	2	6	259794	259799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449070899
5500	NC_020248	A	6	6	259832	259837	100 %	0 %	0 %	0 %	449070899

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