MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium stercorarium subsp. stercorarium DSM 8532

Total Repeats: 58881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020134	CAG	2	6	167824	167829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_020134	TCA	2	6	167879	167884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_020134	GCA	2	6	167940	167945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_020134	TTA	2	6	167952	167957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_020134	CGG	2	6	167983	167988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_020134	GAT	2	6	168047	168052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_020134	GAT	2	6	168158	168163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_020134	GAAA	2	8	168177	168184	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_020134	GAAA	2	8	168236	168243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_020134	ATT	3	9	168257	168265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_020134	TTA	2	6	168291	168296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_020134	TCCT	2	8	168342	168349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_020134	AG	3	6	168425	168430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020134	TGT	2	6	168433	168438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_020134	GAA	2	6	168449	168454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_020134	GCAG	2	8	168525	168532	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3517	NC_020134	CTT	2	6	168537	168542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_020134	ATG	2	6	168591	168596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_020134	TA	3	6	168597	168602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_020134	GGA	2	6	168676	168681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020134	GAT	2	6	168906	168911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020134	AAG	2	6	168930	168935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_020134	GTT	2	6	168999	169004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_020134	A	6	6	169006	169011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_020134	GAA	2	6	169018	169023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_020134	T	6	6	169063	169068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_020134	CAGG	2	8	169102	169109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_020134	GA	3	6	169127	169132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020134	GAA	2	6	169267	169272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020134	CTT	2	6	169273	169278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_020134	TGAA	2	8	169280	169287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020134	CAA	2	6	169301	169306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_020134	AT	4	8	169318	169325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020134	AG	4	8	169361	169368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020134	TA	3	6	169391	169396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_020134	T	7	7	169494	169500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020134	T	7	7	169516	169522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_020134	AGA	2	6	169617	169622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803646
3539	NC_020134	TGT	2	6	169654	169659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803646
3540	NC_020134	TCA	2	6	169674	169679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803646
3541	NC_020134	ATG	2	6	169849	169854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803646
3542	NC_020134	GCG	2	6	169951	169956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803646
3543	NC_020134	A	6	6	169996	170001	100 %	0 %	0 %	0 %	442803646
3544	NC_020134	T	6	6	170003	170008	0 %	100 %	0 %	0 %	442803646
3545	NC_020134	AAT	2	6	170012	170017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803646
3546	NC_020134	GAC	2	6	170127	170132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803646
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3548	NC_020134	A	7	7	170194	170200	100 %	0 %	0 %	0 %	442803646
3549	NC_020134	AGA	2	6	170279	170284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803646
3550	NC_020134	AGA	2	6	170303	170308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803646
3551	NC_020134	CAG	2	6	170325	170330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803646
3552	NC_020134	AGA	2	6	170426	170431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803646
3553	NC_020134	GGA	2	6	170510	170515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803646
3554	NC_020134	GAAG	2	8	170531	170538	50 %	0 %	50 %	0 %	442803646
3555	NC_020134	AT	3	6	170679	170684	50 %	50 %	0 %	0 %	442803646
3556	NC_020134	ACG	2	6	170695	170700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803646
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3559	NC_020134	TAA	2	6	170830	170835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803646
3560	NC_020134	ATG	2	6	170884	170889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803646
3561	NC_020134	GAG	2	6	170911	170916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803646
3562	NC_020134	ATT	2	6	170923	170928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803646
3563	NC_020134	GGA	2	6	170936	170941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803646
3564	NC_020134	GCT	2	6	170966	170971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803646
3565	NC_020134	CAG	2	6	171009	171014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803646
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3568	NC_020134	TAT	2	6	171150	171155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803646
3569	NC_020134	CAAT	2	8	171160	171167	50 %	25 %	0 %	25 %	442803646
3570	NC_020134	CAGG	2	8	171185	171192	25 %	0 %	50 %	25 %	442803646
3571	NC_020134	AT	3	6	171194	171199	50 %	50 %	0 %	0 %	442803646
3572	NC_020134	GAT	2	6	171243	171248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803646
3573	NC_020134	A	6	6	171360	171365	100 %	0 %	0 %	0 %	442803646
3574	NC_020134	CG	3	6	171390	171395	0 %	0 %	50 %	50 %	442803646
3575	NC_020134	GTG	2	6	171426	171431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803646
3576	NC_020134	ACG	2	6	171442	171447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803646
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3579	NC_020134	TGTA	2	8	171730	171737	25 %	50 %	25 %	0 %	442803646
3580	NC_020134	CAT	2	6	171829	171834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803646
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3582	NC_020134	T	6	6	171964	171969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_020134	TCC	2	6	172002	172007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803647
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3585	NC_020134	ACA	2	6	172123	172128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803647
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3589	NC_020134	CAA	2	6	172426	172431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803647
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3592	NC_020134	CCA	2	6	172718	172723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803647
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3594	NC_020134	GCAA	2	8	172824	172831	50 %	0 %	25 %	25 %	442803647
3595	NC_020134	TTC	2	6	172859	172864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803647
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3597	NC_020134	CCA	2	6	172909	172914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442803647
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3599	NC_020134	TTC	2	6	172997	173002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803647
3600	NC_020134	TTA	2	6	173182	173187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803647
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3602	NC_020134	TCG	2	6	173343	173348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803647
3603	NC_020134	GGC	2	6	173398	173403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803647
3604	NC_020134	TC	3	6	173412	173417	0 %	50 %	0 %	50 %	442803647
3605	NC_020134	CGG	2	6	173470	173475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803647
3606	NC_020134	ATG	2	6	173514	173519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803647
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3609	NC_020134	TGAT	2	8	173685	173692	25 %	50 %	25 %	0 %	442803647
3610	NC_020134	CCAG	2	8	173722	173729	25 %	0 %	25 %	50 %	442803647
3611	NC_020134	GCA	2	6	173771	173776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803647
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3613	NC_020134	GTT	2	6	173895	173900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803647
3614	NC_020134	TGT	2	6	174013	174018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803647
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3616	NC_020134	T	6	6	174135	174140	0 %	100 %	0 %	0 %	442803647
3617	NC_020134	TTC	2	6	174205	174210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803647
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3621	NC_020134	AT	3	6	174429	174434	50 %	50 %	0 %	0 %	442803647
3622	NC_020134	AT	4	8	174489	174496	50 %	50 %	0 %	0 %	442803647
3623	NC_020134	GGT	2	6	174560	174565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803647
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3625	NC_020134	TAT	2	6	174725	174730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_020134	AAAG	2	8	174835	174842	75 %	0 %	25 %	0 %	442803648
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3753	NC_020134	TTC	2	6	181465	181470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803656
3754	NC_020134	GGA	2	6	181529	181534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442803656
3755	NC_020134	GAT	2	6	181815	181820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803656
3756	NC_020134	ATC	2	6	181833	181838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803656
3757	NC_020134	CG	3	6	181891	181896	0 %	0 %	50 %	50 %	442803656
3758	NC_020134	CTT	2	6	181908	181913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803656
3759	NC_020134	CCAG	2	8	181918	181925	25 %	0 %	25 %	50 %	442803656
3760	NC_020134	CGA	2	6	181964	181969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803656
3761	NC_020134	CAT	2	6	182057	182062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803656
3762	NC_020134	CAGG	2	8	182115	182122	25 %	0 %	50 %	25 %	442803656
3763	NC_020134	ATT	2	6	182153	182158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803657
3764	NC_020134	TTG	2	6	182178	182183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803657
3765	NC_020134	TGA	2	6	182196	182201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803657
3766	NC_020134	AGTA	2	8	182218	182225	50 %	25 %	25 %	0 %	442803657
3767	NC_020134	GAAA	2	8	182228	182235	75 %	0 %	25 %	0 %	442803657
3768	NC_020134	AC	3	6	182241	182246	50 %	0 %	0 %	50 %	442803657
3769	NC_020134	TTC	2	6	182382	182387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803657
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3771	NC_020134	A	6	6	182707	182712	100 %	0 %	0 %	0 %	442803657
3772	NC_020134	CG	3	6	182731	182736	0 %	0 %	50 %	50 %	442803657
3773	NC_020134	GGC	2	6	182872	182877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803657
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3775	NC_020134	A	6	6	182986	182991	100 %	0 %	0 %	0 %	442803657
3776	NC_020134	GC	3	6	183020	183025	0 %	0 %	50 %	50 %	442803657
3777	NC_020134	AAG	2	6	183037	183042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803657
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3779	NC_020134	AAG	2	6	183148	183153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442803657
3780	NC_020134	A	6	6	183224	183229	100 %	0 %	0 %	0 %	442803658
3781	NC_020134	GTGC	2	8	183253	183260	0 %	25 %	50 %	25 %	442803658
3782	NC_020134	GGT	2	6	183325	183330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442803658
3783	NC_020134	GCT	2	6	183343	183348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803658
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3785	NC_020134	TATT	2	8	183450	183457	25 %	75 %	0 %	0 %	442803658
3786	NC_020134	TTGCGG	2	12	183498	183509	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	442803658
3787	NC_020134	ACG	2	6	183512	183517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803658
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3789	NC_020134	TAT	2	6	183619	183624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803658
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3793	NC_020134	AAT	2	6	183898	183903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442803658
3794	NC_020134	ATG	2	6	183965	183970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803658
3795	NC_020134	CCGC	2	8	183977	183984	0 %	0 %	25 %	75 %	442803658
3796	NC_020134	CAG	2	6	184132	184137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442803658
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3799	NC_020134	TA	3	6	184319	184324	50 %	50 %	0 %	0 %	442803658
3800	NC_020134	GA	3	6	184420	184425	50 %	0 %	50 %	0 %	442803658
3801	NC_020134	ACA	2	6	184431	184436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803658
3802	NC_020134	A	6	6	184503	184508	100 %	0 %	0 %	0 %	442803658
3803	NC_020134	T	6	6	184538	184543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3804	NC_020134	ACC	2	6	184561	184566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3805	NC_020134	CTG	2	6	184588	184593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803659
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3807	NC_020134	GGAT	2	8	184766	184773	25 %	25 %	50 %	0 %	442803659
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3810	NC_020134	GTC	2	6	184832	184837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803659
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3816	NC_020134	TA	3	6	185020	185025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3817	NC_020134	A	6	6	185034	185039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3818	NC_020134	TAT	2	6	185053	185058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3819	NC_020134	GTAAA	2	10	185059	185068	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3820	NC_020134	A	6	6	185066	185071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3821	NC_020134	CTT	2	6	185098	185103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3822	NC_020134	TTTTA	2	10	185126	185135	20 %	80 %	0 %	0 %	442803660
3823	NC_020134	TTC	2	6	185194	185199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803660
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3832	NC_020134	TTG	2	6	185759	185764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442803660
3833	NC_020134	CTG	2	6	185804	185809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
3834	NC_020134	TAT	2	6	185859	185864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803660
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3838	NC_020134	CGT	2	6	186036	186041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
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3841	NC_020134	GTCAAG	2	12	186133	186144	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	442803660
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3844	NC_020134	TCG	2	6	186278	186283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
3845	NC_020134	TGC	2	6	186408	186413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
3846	NC_020134	GCT	2	6	186535	186540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
3847	NC_020134	ATAC	2	8	186543	186550	50 %	25 %	0 %	25 %	442803660
3848	NC_020134	GCG	2	6	186722	186727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442803660
3849	NC_020134	TGC	2	6	186786	186791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
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3852	NC_020134	TAG	2	6	187040	187045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803660
3853	NC_020134	CGT	2	6	187056	187061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
3854	NC_020134	CCG	2	6	187079	187084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	442803660
3855	NC_020134	GTA	2	6	187381	187386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442803660
3856	NC_020134	TTCCTT	2	12	187426	187437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803660
3857	NC_020134	ACA	2	6	187580	187585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442803660
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3859	NC_020134	T	6	6	187626	187631	0 %	100 %	0 %	0 %	442803660
3860	NC_020134	TG	3	6	187736	187741	0 %	50 %	50 %	0 %	442803660
3861	NC_020134	CAT	2	6	187830	187835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803660
3862	NC_020134	TGTT	2	8	187995	188002	0 %	75 %	25 %	0 %	442803660
3863	NC_020134	TGC	2	6	188010	188015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
3864	NC_020134	TTC	2	6	188053	188058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442803660
3865	NC_020134	TCA	2	6	188114	188119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803660
3866	NC_020134	AATTT	2	10	188204	188213	40 %	60 %	0 %	0 %	442803660
3867	NC_020134	T	6	6	188323	188328	0 %	100 %	0 %	0 %	442803660
3868	NC_020134	TGTC	2	8	188376	188383	0 %	50 %	25 %	25 %	442803660
3869	NC_020134	ATT	2	6	188417	188422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442803660
3870	NC_020134	GTC	2	6	188524	188529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442803660
3871	NC_020134	TTGC	2	8	188621	188628	0 %	50 %	25 %	25 %	442803660
3872	NC_020134	TCC	2	6	188635	188640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442803660
3873	NC_020134	ATC	2	6	188675	188680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442803660
3874	NC_020134	T	7	7	188690	188696	0 %	100 %	0 %	0 %	442803660
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