MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Blochmannia chromaiodes str. 640 chromosome

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020075	CAAATG	2	12	967	978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509587
2	NC_020075	TTTTAT	2	12	3364	3375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	440509588
3	NC_020075	TATTAC	2	12	4510	4521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440509591
4	NC_020075	TAGAAA	2	12	4573	4584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509591
5	NC_020075	ATATTG	2	12	6300	6311	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509592
6	NC_020075	GGAATA	2	12	6386	6397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440509593
7	NC_020075	AAAGAA	2	12	7606	7617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	440509594
8	NC_020075	TGTTGG	2	12	7830	7841	0 %	50 %	50 %	0 %	440509594
9	NC_020075	TATGTA	2	12	9199	9210	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020075	AAAGAT	2	12	9272	9283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020075	ATTTAT	2	12	10852	10863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020075	ATGTGA	2	12	14059	14070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509598
13	NC_020075	TTAAAG	2	12	14097	14108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509598
14	NC_020075	ATTTAA	2	12	14583	14594	50 %	50 %	0 %	0 %	440509599
15	NC_020075	TGTTAT	2	12	18420	18431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509602
16	NC_020075	TAACAA	2	12	24078	24089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509606
17	NC_020075	TAAAAA	2	12	27162	27173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509608
18	NC_020075	ATTTTT	2	12	28470	28481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	440509609
19	NC_020075	GTTATT	2	12	28713	28724	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509609
20	NC_020075	AGAAAA	2	12	29731	29742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020075	AATATT	2	12	33565	33576	50 %	50 %	0 %	0 %	440509612
22	NC_020075	CAAAAT	2	12	34297	34308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509613
23	NC_020075	GATTCT	2	12	35071	35082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509614
24	NC_020075	GTGGTT	2	12	36052	36063	0 %	50 %	50 %	0 %	440509614
25	NC_020075	TGGACT	2	12	37894	37905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440509615
26	NC_020075	TTAAAT	2	12	40537	40548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020075	GTATCT	2	12	43636	43647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509619
28	NC_020075	TTCATT	2	12	45154	45165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509620
29	NC_020075	AGATAA	2	12	46439	46450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509621
30	NC_020075	TAAGCA	2	12	49179	49190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020075	AATTTT	2	12	49640	49651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020075	TGTTAT	2	12	51494	51505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440509626
33	NC_020075	CAAATA	2	12	56072	56083	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020075	ATTTTT	2	12	56213	56224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020075	TCAATT	2	12	58663	58674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020075	ATTTTA	2	12	59757	59768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509632
37	NC_020075	CATATC	2	12	60730	60741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509633
38	NC_020075	TATAGA	2	12	61688	61699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509634
39	NC_020075	TATTTT	2	12	62343	62354	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020075	CATAAA	2	12	65233	65244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440509637
41	NC_020075	ATTAGC	2	12	66805	66816	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509638
42	NC_020075	TTAATT	2	12	67677	67688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020075	ATATTT	2	12	71042	71053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509640
44	NC_020075	GTATGA	2	12	74668	74679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509645
45	NC_020075	GATAGT	2	12	76263	76274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509646
46	NC_020075	TTAATT	2	12	82751	82762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020075	TTAATT	2	12	83894	83905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020075	CAACCG	2	12	85893	85904	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	440509653
49	NC_020075	ATCTAA	2	12	88970	88981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440509655
50	NC_020075	TATTTT	2	12	93678	93689	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020075	AATTAA	2	12	96888	96899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509660
52	NC_020075	TAAAAA	2	12	99336	99347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509663
53	NC_020075	GTTAAT	2	12	99360	99371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509663
54	NC_020075	GTAATA	2	12	100465	100476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509664
55	NC_020075	TTTCAT	2	12	100957	100968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509664
56	NC_020075	AAATAT	2	12	103991	104002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020075	AAGCTA	2	12	105100	105111	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509669
58	NC_020075	TAAATA	2	12	106787	106798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020075	TAAAAA	2	12	108930	108941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509672
60	NC_020075	ACAAGG	2	12	110545	110556	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440509672
61	NC_020075	TTAAAT	2	12	111257	111268	50 %	50 %	0 %	0 %	440509672
62	NC_020075	CCAATA	2	12	112483	112494	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020075	AAGGAG	2	12	113323	113334	50 %	0 %	50 %	0 %	440509674
64	NC_020075	TAAGCA	2	12	114742	114753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509675
65	NC_020075	AGAAAT	2	12	115043	115054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509676
66	NC_020075	ATTTTT	2	12	117514	117525	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020075	GGGTTT	2	12	118651	118662	0 %	50 %	50 %	0 %	440509680
68	NC_020075	TGTCGG	2	12	118982	118993	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440509680
69	NC_020075	TGGTTT	2	12	120926	120937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440509681
70	NC_020075	TTAATA	2	12	121863	121874	50 %	50 %	0 %	0 %	440509682
71	NC_020075	AGTATA	2	12	124360	124371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509684
72	NC_020075	TGATAT	2	12	126594	126605	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509685
73	NC_020075	TGGTAT	2	12	128055	128066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509685
74	NC_020075	CAACAG	2	12	130677	130688	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	440509689
75	NC_020075	CTAATG	2	12	131436	131447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509689
76	NC_020075	ATTCAA	2	12	132998	133009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440509690
77	NC_020075	TTTATT	2	12	136111	136122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020075	TAATAT	2	12	137440	137451	50 %	50 %	0 %	0 %	440509692
79	NC_020075	ATTATC	2	12	138121	138132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440509692
80	NC_020075	ACCATT	2	12	138526	138537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509692
81	NC_020075	TTCAAA	2	12	144008	144019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440509696
82	NC_020075	ATGGTT	2	12	148825	148836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509700
83	NC_020075	ATTGGC	2	12	149184	149195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440509700
84	NC_020075	GTAACA	2	12	150417	150428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020075	TTTAGA	2	12	153145	153156	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509704
86	NC_020075	GTGAAT	2	12	154494	154505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509704
87	NC_020075	GTAGAT	2	12	155132	155143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509704
88	NC_020075	ATTTAA	2	12	155299	155310	50 %	50 %	0 %	0 %	440509704
89	NC_020075	TATTTC	2	12	156951	156962	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509706
90	NC_020075	TATTAA	2	12	158653	158664	50 %	50 %	0 %	0 %	440509707
91	NC_020075	CTGTTC	2	12	158914	158925	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440509708
92	NC_020075	TAATAT	2	12	162403	162414	50 %	50 %	0 %	0 %	440509710
93	NC_020075	ATAAAA	2	12	163902	163913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020075	AGTATC	2	12	164671	164682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509711
95	NC_020075	ATATTT	2	12	166887	166898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440509713
96	NC_020075	GGGATA	2	12	167999	168010	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	440509714
97	NC_020075	AAAGCA	2	12	168740	168751	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440509714
98	NC_020075	ATTAGC	2	12	171726	171737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509717
99	NC_020075	GGAAAA	2	12	175091	175102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440509719
100	NC_020075	AAATAA	2	12	175111	175122	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	440509719
101	NC_020075	AATTGG	2	12	177768	177779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440509722
102	NC_020075	TTTGCA	2	12	180520	180531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509724
103	NC_020075	CACTGA	2	12	181746	181757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440509725
104	NC_020075	ATTTAT	2	12	186497	186508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020075	TGCTCA	2	12	188571	188582	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440509729
106	NC_020075	TCTTTA	2	12	190064	190075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	440509730
107	NC_020075	TTTAGA	2	12	191904	191915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509732
108	NC_020075	CTAATA	2	12	192985	192996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020075	TATAAA	2	12	193659	193670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020075	TTTTTA	2	12	195247	195258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	440509733
111	NC_020075	CATATG	2	12	197419	197430	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509735
112	NC_020075	TTAAAT	2	12	200966	200977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020075	TTGGCA	6	36	201114	201149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020075	CTGATT	2	12	209402	209413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509740
115	NC_020075	GCAGAA	2	12	211758	211769	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	440509741
116	NC_020075	TGAATT	2	12	216903	216914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509745
117	NC_020075	TATTTC	2	12	219566	219577	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020075	TGATTT	2	12	221949	221960	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020075	TTAAAT	2	12	225828	225839	50 %	50 %	0 %	0 %	440509753
120	NC_020075	ATGCTC	2	12	226943	226954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020075	TACTGT	2	12	227778	227789	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440509755
122	NC_020075	AAACAA	2	12	228462	228473	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	440509756
123	NC_020075	ATTAAA	2	12	228862	228873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509757
124	NC_020075	AATGAA	2	12	230802	230813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509759
125	NC_020075	ATTTGA	2	12	232478	232489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440509760
126	NC_020075	AGAATT	2	12	232603	232614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509760
127	NC_020075	ATAGAT	2	12	233000	233011	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020075	TAAATA	2	12	239219	239230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509765
129	NC_020075	AGGAAG	2	12	239451	239462	50 %	0 %	50 %	0 %	440509765
130	NC_020075	ATTAAA	2	12	239614	239625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440509765
131	NC_020075	GGTATT	2	12	239719	239730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	440509765
132	NC_020075	TAATTA	2	12	241244	241255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020075	TAAAGG	2	12	243521	243532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440509769
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136	NC_020075	ATTCCA	2	12	252323	252334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509788
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143	NC_020075	AAAATA	2	12	260504	260515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020075	CATATA	2	12	266182	266193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_020075	CCTAAT	2	12	271282	271293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440509808
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152	NC_020075	TAAATT	2	12	287837	287848	50 %	50 %	0 %	0 %	440509821
153	NC_020075	GCAGTA	2	12	288245	288256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440509822
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157	NC_020075	ACTGGA	2	12	291888	291899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440509825
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159	NC_020075	TAATAG	2	12	295536	295547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440509828
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162	NC_020075	ACTGTA	2	12	302792	302803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509834
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168	NC_020075	TATAAT	2	12	310923	310934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020075	TATCTA	3	18	312780	312797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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171	NC_020075	AAATAG	2	12	313232	313243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440509842
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200	NC_020075	AATTAT	2	12	369492	369503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_020075	AAATGC	2	12	418947	418958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509917
231	NC_020075	AATTAA	2	12	419689	419700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_020075	AGATCA	2	12	420022	420033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440509918
233	NC_020075	ACATAT	2	12	420402	420413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
234	NC_020075	AGCACG	2	12	420971	420982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440509919
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239	NC_020075	ACTGGA	2	12	436394	436405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440509931
240	NC_020075	AATCTG	2	12	438532	438543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440509933
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242	NC_020075	TAATTA	2	12	442829	442840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.