MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020053	CT	3	6	157793	157798	0 %	50 %	0 %	50 %	436736960
3002	NC_020053	ACA	2	6	157812	157817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736960
3003	NC_020053	GGAAC	2	10	157847	157856	40 %	0 %	40 %	20 %	436736960
3004	NC_020053	C	6	6	157892	157897	0 %	0 %	0 %	100 %	436736960
3005	NC_020053	AG	3	6	157925	157930	50 %	0 %	50 %	0 %	436736960
3006	NC_020053	TG	3	6	157938	157943	0 %	50 %	50 %	0 %	436736960
3007	NC_020053	TATT	2	8	157959	157966	25 %	75 %	0 %	0 %	436736960
3008	NC_020053	GAG	2	6	158019	158024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736960
3009	NC_020053	CGG	2	6	158032	158037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736960
3010	NC_020053	ATC	2	6	158054	158059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736960
3011	NC_020053	CGA	2	6	158076	158081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736960
3012	NC_020053	GCA	2	6	158180	158185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736960
3013	NC_020053	ATCG	2	8	158199	158206	25 %	25 %	25 %	25 %	436736960
3014	NC_020053	TAA	2	6	158219	158224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736960
3015	NC_020053	CAT	2	6	158293	158298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_020053	CCA	2	6	158330	158335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_020053	TCTA	2	8	158354	158361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3018	NC_020053	CTAA	2	8	158383	158390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_020053	ATCG	2	8	158412	158419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_020053	ACA	2	6	158442	158447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_020053	TGGTA	2	10	158479	158488	20 %	40 %	40 %	0 %	436736961
3022	NC_020053	CCCG	2	8	158599	158606	0 %	0 %	25 %	75 %	436736961
3023	NC_020053	GCA	2	6	158614	158619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736961
3024	NC_020053	CGG	2	6	158624	158629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736961
3025	NC_020053	ATC	2	6	158633	158638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736961
3026	NC_020053	GGCTG	2	10	158831	158840	0 %	20 %	60 %	20 %	436736961
3027	NC_020053	TG	3	6	158839	158844	0 %	50 %	50 %	0 %	436736961
3028	NC_020053	GAA	2	6	158917	158922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736961
3029	NC_020053	ATT	2	6	158947	158952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736961
3030	NC_020053	GCC	2	6	159019	159024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736961
3031	NC_020053	GCC	2	6	159031	159036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736961
3032	NC_020053	ATC	2	6	159052	159057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736961
3033	NC_020053	GGC	2	6	159178	159183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736961
3034	NC_020053	CGA	2	6	159222	159227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736961
3035	NC_020053	GCT	2	6	159231	159236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736961
3036	NC_020053	TGG	2	6	159261	159266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736961
3037	NC_020053	ATT	2	6	159280	159285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736961
3038	NC_020053	TCGA	2	8	159375	159382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_020053	TTCA	2	8	159430	159437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_020053	ACA	2	6	159447	159452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_020053	ACTCA	2	10	159463	159472	40 %	20 %	0 %	40 %	436736962
3042	NC_020053	GAA	2	6	159526	159531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736962
3043	NC_020053	GAT	2	6	159538	159543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736962
3044	NC_020053	ATT	2	6	159624	159629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736962
3045	NC_020053	CGAT	2	8	159821	159828	25 %	25 %	25 %	25 %	436736962
3046	NC_020053	AGCATT	2	12	159855	159866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	436736962
3047	NC_020053	TG	3	6	159893	159898	0 %	50 %	50 %	0 %	436736962
3048	NC_020053	AGCA	2	8	159917	159924	50 %	0 %	25 %	25 %	436736962
3049	NC_020053	CAG	2	6	159941	159946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736962
3050	NC_020053	CTG	2	6	159961	159966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736962
3051	NC_020053	CGA	2	6	159999	160004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736962
3052	NC_020053	ATC	2	6	160169	160174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736962
3053	NC_020053	ACA	2	6	160233	160238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736962
3054	NC_020053	CA	3	6	160333	160338	50 %	0 %	0 %	50 %	436736962
3055	NC_020053	TGC	2	6	160442	160447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736962
3056	NC_020053	GGA	2	6	160470	160475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736962
3057	NC_020053	ATCT	2	8	160497	160504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3058	NC_020053	TTC	2	6	160505	160510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_020053	ATCAA	2	10	160526	160535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3060	NC_020053	AAT	2	6	160546	160551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736963
3061	NC_020053	GATC	3	12	160617	160628	25 %	25 %	25 %	25 %	436736963
3062	NC_020053	GAA	2	6	160649	160654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736963
3063	NC_020053	GCA	2	6	160670	160675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736963
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3072	NC_020053	CTGT	2	8	161079	161086	0 %	50 %	25 %	25 %	436736963
3073	NC_020053	GATC	2	8	161141	161148	25 %	25 %	25 %	25 %	436736963
3074	NC_020053	CGAT	2	8	161158	161165	25 %	25 %	25 %	25 %	436736963
3075	NC_020053	TCT	2	6	161303	161308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_020053	GCA	2	6	161406	161411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_020053	GAT	2	6	161428	161433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_020053	TAG	2	6	161622	161627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736964
3082	NC_020053	GGT	2	6	161634	161639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_020053	GTC	2	6	161644	161649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3085	NC_020053	ACTT	2	8	161844	161851	25 %	50 %	0 %	25 %	436736965
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3087	NC_020053	CCAG	2	8	161972	161979	25 %	0 %	25 %	50 %	436736965
3088	NC_020053	TGC	2	6	162016	162021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736965
3089	NC_020053	GAC	2	6	162246	162251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736965
3090	NC_020053	CT	3	6	162262	162267	0 %	50 %	0 %	50 %	436736965
3091	NC_020053	CTGC	2	8	162332	162339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3092	NC_020053	AT	3	6	162399	162404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_020053	AGT	2	6	162421	162426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_020053	AAC	2	6	162453	162458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_020053	TCTG	2	8	162557	162564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3096	NC_020053	ATC	2	6	162568	162573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_020053	AAGTTT	2	12	162579	162590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_020053	ACA	2	6	162598	162603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736966
3099	NC_020053	GTAA	2	8	162693	162700	50 %	25 %	25 %	0 %	436736966
3100	NC_020053	TGG	2	6	162705	162710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736966
3101	NC_020053	GTG	2	6	162723	162728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736966
3102	NC_020053	TTTG	2	8	162881	162888	0 %	75 %	25 %	0 %	436736966
3103	NC_020053	AGT	2	6	162950	162955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_020053	TACTT	2	10	162970	162979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3105	NC_020053	ACC	2	6	162985	162990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_020053	GCGA	2	8	163073	163080	25 %	0 %	50 %	25 %	436736967
3107	NC_020053	GCA	2	6	163114	163119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736967
3108	NC_020053	TCCA	2	8	163130	163137	25 %	25 %	0 %	50 %	436736967
3109	NC_020053	GGATT	2	10	163194	163203	20 %	40 %	40 %	0 %	436736967
3110	NC_020053	CCA	2	6	163219	163224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736967
3111	NC_020053	AGC	2	6	163250	163255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736967
3112	NC_020053	TGA	2	6	163266	163271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736967
3113	NC_020053	GTTG	2	8	163272	163279	0 %	50 %	50 %	0 %	436736967
3114	NC_020053	CGAT	2	8	163296	163303	25 %	25 %	25 %	25 %	436736967
3115	NC_020053	ACGTTT	2	12	163387	163398	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436736967
3116	NC_020053	GAA	2	6	163431	163436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736967
3117	NC_020053	GAC	2	6	163588	163593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736967
3118	NC_020053	GCCA	2	8	163658	163665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_020053	TAG	2	6	163674	163679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_020053	AGA	2	6	163700	163705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736968
3121	NC_020053	TC	3	6	163730	163735	0 %	50 %	0 %	50 %	436736968
3122	NC_020053	ACA	2	6	163829	163834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736968
3123	NC_020053	TCGA	2	8	163864	163871	25 %	25 %	25 %	25 %	436736968
3124	NC_020053	GGT	2	6	163956	163961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736968
3125	NC_020053	TTG	2	6	163963	163968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736968
3126	NC_020053	GAG	2	6	164070	164075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736968
3127	NC_020053	GAG	2	6	164091	164096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736968
3128	NC_020053	A	6	6	164115	164120	100 %	0 %	0 %	0 %	436736968
3129	NC_020053	GGT	2	6	164211	164216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_020053	GCA	2	6	164295	164300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736969
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3142	NC_020053	AAG	2	6	165116	165121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_020053	CTT	2	6	166455	166460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3183	NC_020053	TAGCC	2	10	167953	167962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3237	NC_020053	ATC	2	6	171220	171225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736976
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3240	NC_020053	CGAT	2	8	171571	171578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3241	NC_020053	GCA	2	6	171598	171603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3242	NC_020053	CTG	2	6	171607	171612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_020053	ATCG	2	8	171717	171724	25 %	25 %	25 %	25 %	436736977
3244	NC_020053	TCGA	2	8	171750	171757	25 %	25 %	25 %	25 %	436736977
3245	NC_020053	AGGA	2	8	171759	171766	50 %	0 %	50 %	0 %	436736977
3246	NC_020053	TCGA	2	8	171768	171775	25 %	25 %	25 %	25 %	436736977
3247	NC_020053	GCT	2	6	171788	171793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736977
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3490	NC_020053	A	6	6	186345	186350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_020053	GATC	2	8	186360	186367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3494	NC_020053	CGC	2	6	186475	186480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736995
3495	NC_020053	CAC	2	6	186531	186536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736995
3496	NC_020053	T	6	6	186541	186546	0 %	100 %	0 %	0 %	436736995
3497	NC_020053	CAC	2	6	186723	186728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736995
3498	NC_020053	TGGT	2	8	186732	186739	0 %	50 %	50 %	0 %	436736995
3499	NC_020053	ACGA	2	8	186748	186755	50 %	0 %	25 %	25 %	436736995
3500	NC_020053	TGC	2	6	186775	186780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736995

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