MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_020053	CA	3	6	105774	105779	50 %	0 %	0 %	50 %	436736913
2003	NC_020053	TCCAC	2	10	105804	105813	20 %	20 %	0 %	60 %	436736913
2004	NC_020053	AGA	2	6	105825	105830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736913
2005	NC_020053	GAT	2	6	105844	105849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736913
2006	NC_020053	TCA	2	6	105878	105883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736913
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2008	NC_020053	TCATC	2	10	106008	106017	20 %	40 %	0 %	40 %	436736913
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2011	NC_020053	ATG	2	6	106262	106267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736913
2012	NC_020053	CTG	2	6	106378	106383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736913
2013	NC_020053	CTG	2	6	106509	106514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736913
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2015	NC_020053	GCC	2	6	106601	106606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736913
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2017	NC_020053	TGG	2	6	106725	106730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736913
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2021	NC_020053	GGA	2	6	106914	106919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736913
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2023	NC_020053	TGA	2	6	106953	106958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736913
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2034	NC_020053	CTG	2	6	107864	107869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_020053	TGC	2	6	107880	107885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2036	NC_020053	GAA	2	6	108045	108050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_020053	CATC	2	8	108060	108067	25 %	25 %	0 %	50 %	436736915
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2040	NC_020053	T	7	7	108250	108256	0 %	100 %	0 %	0 %	436736916
2041	NC_020053	CTG	2	6	108265	108270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736916
2042	NC_020053	AACGGT	2	12	108318	108329	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436736916
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2055	NC_020053	TGAA	2	8	109321	109328	50 %	25 %	25 %	0 %	436736916
2056	NC_020053	CAG	2	6	109444	109449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736916
2057	NC_020053	GCT	2	6	109507	109512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736916
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2083	NC_020053	CTTG	2	8	111068	111075	0 %	50 %	25 %	25 %	436736917
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2102	NC_020053	TC	3	6	112249	112254	0 %	50 %	0 %	50 %	436736917
2103	NC_020053	TGGC	2	8	112255	112262	0 %	25 %	50 %	25 %	436736917
2104	NC_020053	AATGC	2	10	112316	112325	40 %	20 %	20 %	20 %	436736917
2105	NC_020053	CTG	2	6	112371	112376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736917
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2112	NC_020053	TCTG	2	8	112744	112751	0 %	50 %	25 %	25 %	436736917
2113	NC_020053	CGAT	2	8	112757	112764	25 %	25 %	25 %	25 %	436736917
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2120	NC_020053	CAT	2	6	113121	113126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736917
2121	NC_020053	GAC	2	6	113130	113135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736917
2122	NC_020053	CTT	2	6	113156	113161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736917
2123	NC_020053	GAT	2	6	113184	113189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736917
2124	NC_020053	ACC	2	6	113190	113195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736917
2125	NC_020053	CGA	2	6	113198	113203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736917
2126	NC_020053	CGAT	2	8	113293	113300	25 %	25 %	25 %	25 %	436736917
2127	NC_020053	AGCC	2	8	113327	113334	25 %	0 %	25 %	50 %	436736917
2128	NC_020053	GATC	2	8	113339	113346	25 %	25 %	25 %	25 %	436736917
2129	NC_020053	GATTT	2	10	113460	113469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_020053	CAT	2	6	113481	113486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736918
2131	NC_020053	GCT	2	6	113490	113495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736918
2132	NC_020053	TAA	2	6	113818	113823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736918
2133	NC_020053	ATGA	2	8	113853	113860	50 %	25 %	25 %	0 %	436736918
2134	NC_020053	TCG	2	6	113920	113925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736918
2135	NC_020053	ATT	2	6	113938	113943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2136	NC_020053	GATTTT	2	12	114005	114016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	436736919
2137	NC_020053	ATA	2	6	114104	114109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736919
2138	NC_020053	CCA	2	6	114143	114148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736919
2139	NC_020053	ATC	2	6	114177	114182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736919
2140	NC_020053	TG	3	6	114223	114228	0 %	50 %	50 %	0 %	436736920
2141	NC_020053	CTG	2	6	114253	114258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736920
2142	NC_020053	CTCAT	2	10	114287	114296	20 %	40 %	0 %	40 %	436736920
2143	NC_020053	TAAT	2	8	114393	114400	50 %	50 %	0 %	0 %	436736920
2144	NC_020053	CTT	2	6	114489	114494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736920
2145	NC_020053	TAAA	3	12	114555	114566	75 %	25 %	0 %	0 %	436736920
2146	NC_020053	ATA	2	6	114583	114588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736920
2147	NC_020053	ATT	2	6	114704	114709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2148	NC_020053	CT	3	6	114710	114715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2149	NC_020053	AT	3	6	114794	114799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2150	NC_020053	GTA	2	6	114815	114820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_020053	A	8	8	114820	114827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2152	NC_020053	CGAT	2	8	114924	114931	25 %	25 %	25 %	25 %	436736921
2153	NC_020053	ACA	2	6	114990	114995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736921
2154	NC_020053	TCA	2	6	114996	115001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736921
2155	NC_020053	ACTG	2	8	115015	115022	25 %	25 %	25 %	25 %	436736921
2156	NC_020053	GT	3	6	115071	115076	0 %	50 %	50 %	0 %	436736921
2157	NC_020053	A	6	6	115400	115405	100 %	0 %	0 %	0 %	436736921
2158	NC_020053	AGC	2	6	115469	115474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736921
2159	NC_020053	CAGC	2	8	115501	115508	25 %	0 %	25 %	50 %	436736921
2160	NC_020053	ACT	2	6	115683	115688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736921
2161	NC_020053	GCCA	2	8	115761	115768	25 %	0 %	25 %	50 %	436736921
2162	NC_020053	ACTG	2	8	116060	116067	25 %	25 %	25 %	25 %	436736921
2163	NC_020053	CGCC	2	8	116075	116082	0 %	0 %	25 %	75 %	436736921
2164	NC_020053	GGAA	2	8	116174	116181	50 %	0 %	50 %	0 %	436736921
2165	NC_020053	GTC	2	6	116220	116225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736921
2166	NC_020053	C	7	7	116235	116241	0 %	0 %	0 %	100 %	436736921
2167	NC_020053	TCCA	2	8	116273	116280	25 %	25 %	0 %	50 %	436736921
2168	NC_020053	CCAC	2	8	116286	116293	25 %	0 %	0 %	75 %	436736921
2169	NC_020053	CCG	2	6	116337	116342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736921
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2171	NC_020053	TCGC	2	8	116479	116486	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2172	NC_020053	TTG	2	6	116493	116498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2173	NC_020053	ATC	2	6	116538	116543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2174	NC_020053	TCT	2	6	116595	116600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736922
2175	NC_020053	TAATG	2	10	116611	116620	40 %	40 %	20 %	0 %	436736922
2176	NC_020053	CGAT	2	8	116668	116675	25 %	25 %	25 %	25 %	436736922
2177	NC_020053	CAC	2	6	116738	116743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736922
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2180	NC_020053	ATG	2	6	116801	116806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736922
2181	NC_020053	GCT	2	6	117015	117020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736922
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2183	NC_020053	GCA	2	6	117135	117140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736922
2184	NC_020053	GCT	2	6	117166	117171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736922
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2186	NC_020053	GTTA	2	8	117218	117225	25 %	50 %	25 %	0 %	436736922
2187	NC_020053	GCTT	2	8	117272	117279	0 %	50 %	25 %	25 %	436736922
2188	NC_020053	GCC	2	6	117340	117345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736922
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2190	NC_020053	CGAT	2	8	117379	117386	25 %	25 %	25 %	25 %	436736922
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2195	NC_020053	GAA	2	6	117479	117484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736922
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2197	NC_020053	GTC	2	6	117578	117583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736922
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2199	NC_020053	TCA	2	6	117667	117672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736922
2200	NC_020053	TCA	2	6	117703	117708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736922
2201	NC_020053	TCA	2	6	117909	117914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736922
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2214	NC_020053	GCA	2	6	118421	118426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736922
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2223	NC_020053	CAT	2	6	118989	118994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2224	NC_020053	CT	3	6	119052	119057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2225	NC_020053	CATC	2	8	119076	119083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2226	NC_020053	ATG	2	6	119119	119124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2227	NC_020053	TAA	2	6	119144	119149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2228	NC_020053	TTGC	2	8	119185	119192	0 %	50 %	25 %	25 %	436736923
2229	NC_020053	TTC	2	6	119210	119215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736923
2230	NC_020053	ATAA	2	8	119258	119265	75 %	25 %	0 %	0 %	436736923
2231	NC_020053	GAT	2	6	119309	119314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736923
2232	NC_020053	GCC	2	6	119325	119330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736923
2233	NC_020053	GC	3	6	119388	119393	0 %	0 %	50 %	50 %	436736923
2234	NC_020053	CAT	2	6	119401	119406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736923
2235	NC_020053	T	7	7	119424	119430	0 %	100 %	0 %	0 %	436736923
2236	NC_020053	CGAT	2	8	119436	119443	25 %	25 %	25 %	25 %	436736923
2237	NC_020053	TTC	2	6	119468	119473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736923
2238	NC_020053	TGAT	2	8	119538	119545	25 %	50 %	25 %	0 %	436736923
2239	NC_020053	CTC	2	6	119546	119551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736923
2240	NC_020053	GCT	2	6	119557	119562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736923
2241	NC_020053	GGC	2	6	119589	119594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736923
2242	NC_020053	TGGA	2	8	119618	119625	25 %	25 %	50 %	0 %	436736923
2243	NC_020053	TAA	2	6	119649	119654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736923
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2245	NC_020053	AAT	2	6	119840	119845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736923
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2362	NC_020053	GAA	2	6	125409	125414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736927
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2364	NC_020053	AGT	2	6	125531	125536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736927
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2367	NC_020053	A	6	6	125599	125604	100 %	0 %	0 %	0 %	436736927
2368	NC_020053	GAAT	2	8	125651	125658	50 %	25 %	25 %	0 %	436736927
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2371	NC_020053	A	6	6	125705	125710	100 %	0 %	0 %	0 %	436736927
2372	NC_020053	AG	3	6	125724	125729	50 %	0 %	50 %	0 %	436736927
2373	NC_020053	AGA	2	6	125762	125767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736927
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2376	NC_020053	A	6	6	125824	125829	100 %	0 %	0 %	0 %	436736927
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2490	NC_020053	TCGA	2	8	131699	131706	25 %	25 %	25 %	25 %	436736934
2491	NC_020053	CAG	2	6	131828	131833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736934
2492	NC_020053	TTG	2	6	131867	131872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736934
2493	NC_020053	TCG	2	6	131877	131882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736934
2494	NC_020053	AGC	2	6	131913	131918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736934
2495	NC_020053	CGA	2	6	131953	131958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736934
2496	NC_020053	TCA	2	6	131959	131964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736934
2497	NC_020053	CAGCTT	2	12	131977	131988	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436736934
2498	NC_020053	A	6	6	132045	132050	100 %	0 %	0 %	0 %	436736934
2499	NC_020053	CCG	2	6	132057	132062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736934
2500	NC_020053	ATCG	2	8	132079	132086	25 %	25 %	25 %	25 %	436736934

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