MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020053	AGA	2	6	80556	80561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020053	AAT	2	6	80566	80571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736888
1503	NC_020053	A	7	7	80573	80579	100 %	0 %	0 %	0 %	436736888
1504	NC_020053	AAC	2	6	80590	80595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736888
1505	NC_020053	TAAT	2	8	80613	80620	50 %	50 %	0 %	0 %	436736888
1506	NC_020053	TCC	2	6	80716	80721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736888
1507	NC_020053	GAC	2	6	80726	80731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736888
1508	NC_020053	ATTGAA	2	12	80739	80750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	436736888
1509	NC_020053	TGTC	2	8	80755	80762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_020053	AGTG	2	8	80764	80771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020053	TCT	2	6	80775	80780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_020053	CT	3	6	80805	80810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_020053	ATCG	2	8	80813	80820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_020053	G	6	6	80921	80926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020053	TATT	2	8	80929	80936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020053	TA	3	6	80938	80943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020053	GGT	2	6	80951	80956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020053	TGAA	2	8	80986	80993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020053	TAGA	2	8	81000	81007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020053	TTA	2	6	81014	81019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020053	GAT	2	6	81025	81030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020053	ATTA	2	8	81115	81122	50 %	50 %	0 %	0 %	436736889
1523	NC_020053	GAT	2	6	81202	81207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736889
1524	NC_020053	ACGA	2	8	81405	81412	50 %	0 %	25 %	25 %	436736889
1525	NC_020053	TGC	2	6	81414	81419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736889
1526	NC_020053	TCGA	2	8	81712	81719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_020053	GTT	2	6	81728	81733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020053	AAT	2	6	81747	81752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020053	ATT	2	6	81779	81784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020053	TGT	2	6	81787	81792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020053	CAT	2	6	81824	81829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_020053	TA	3	6	81837	81842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020053	TAG	2	6	81879	81884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020053	TTCAT	2	10	81894	81903	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1535	NC_020053	AT	3	6	81933	81938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020053	AG	3	6	81939	81944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020053	AG	3	6	81948	81953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020053	A	7	7	81966	81972	100 %	0 %	0 %	0 %	436736890
1539	NC_020053	CAG	2	6	82009	82014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736890
1540	NC_020053	GAC	2	6	82047	82052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736890
1541	NC_020053	GCT	2	6	82268	82273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736890
1542	NC_020053	GATT	2	8	82316	82323	25 %	50 %	25 %	0 %	436736890
1543	NC_020053	TGC	2	6	82345	82350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736890
1544	NC_020053	GTCT	2	8	82358	82365	0 %	50 %	25 %	25 %	436736890
1545	NC_020053	CTAT	2	8	82473	82480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_020053	AT	3	6	82479	82484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020053	AT	3	6	82488	82493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020053	ATT	2	6	82596	82601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736891
1549	NC_020053	TAT	2	6	82621	82626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736891
1550	NC_020053	A	6	6	82652	82657	100 %	0 %	0 %	0 %	436736891
1551	NC_020053	CTA	2	6	82681	82686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736891
1552	NC_020053	AAC	2	6	82715	82720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736891
1553	NC_020053	AGT	2	6	82755	82760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736891
1554	NC_020053	TGG	2	6	82778	82783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736891
1555	NC_020053	AGT	2	6	82787	82792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736891
1556	NC_020053	GTTC	2	8	82817	82824	0 %	50 %	25 %	25 %	436736891
1557	NC_020053	ATG	2	6	82960	82965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736891
1558	NC_020053	GCA	2	6	82983	82988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736891
1559	NC_020053	TTCG	2	8	83073	83080	0 %	50 %	25 %	25 %	436736891
1560	NC_020053	GAG	2	6	83100	83105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020053	TCC	3	9	83121	83129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_020053	TAC	2	6	83165	83170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736892
1563	NC_020053	ACCACA	2	12	83205	83216	50 %	0 %	0 %	50 %	436736892
1564	NC_020053	CAG	2	6	83219	83224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736892
1565	NC_020053	AGC	2	6	83229	83234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736892
1566	NC_020053	CAG	2	6	83237	83242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736892
1567	NC_020053	CAG	2	6	83261	83266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736892
1568	NC_020053	TAT	2	6	83307	83312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020053	C	6	6	83322	83327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1570	NC_020053	CAAG	2	8	83358	83365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_020053	TAC	2	6	83450	83455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736893
1572	NC_020053	TAC	2	6	83469	83474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736893
1573	NC_020053	TCA	2	6	83541	83546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736893
1574	NC_020053	ATCG	2	8	83645	83652	25 %	25 %	25 %	25 %	436736893
1575	NC_020053	GCT	2	6	83686	83691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736893
1576	NC_020053	CAAA	2	8	83698	83705	75 %	0 %	0 %	25 %	436736893
1577	NC_020053	GAA	2	6	83783	83788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736893
1578	NC_020053	AATT	2	8	83816	83823	50 %	50 %	0 %	0 %	436736893
1579	NC_020053	TTAT	2	8	83927	83934	25 %	75 %	0 %	0 %	436736894
1580	NC_020053	AAGATG	2	12	83960	83971	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	436736894
1581	NC_020053	ACA	2	6	84000	84005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736894
1582	NC_020053	ACC	2	6	84006	84011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736894
1583	NC_020053	GCC	2	6	84034	84039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736894
1584	NC_020053	GTT	2	6	84043	84048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736894
1585	NC_020053	GATC	2	8	84075	84082	25 %	25 %	25 %	25 %	436736894
1586	NC_020053	GTT	2	6	84139	84144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020053	AAT	2	6	84195	84200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020053	TAA	2	6	84240	84245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020053	GT	3	6	84323	84328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020053	ATA	2	6	84364	84369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020053	AAT	2	6	84379	84384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020053	ATTT	2	8	84401	84408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020053	ATT	2	6	84416	84421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020053	T	6	6	84463	84468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020053	TGA	2	6	84480	84485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736895
1596	NC_020053	CTA	2	6	84486	84491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736895
1597	NC_020053	GCCT	2	8	84530	84537	0 %	25 %	25 %	50 %	436736895
1598	NC_020053	CAC	2	6	84565	84570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736895
1599	NC_020053	GAT	2	6	84598	84603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736895
1600	NC_020053	GCT	2	6	84605	84610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736895
1601	NC_020053	TGC	2	6	84730	84735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736895
1602	NC_020053	GTC	2	6	84765	84770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736895
1603	NC_020053	GTC	2	6	84786	84791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736895
1604	NC_020053	TAA	2	6	84833	84838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020053	A	6	6	85021	85026	100 %	0 %	0 %	0 %	436736896
1606	NC_020053	TAA	2	6	85040	85045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736896
1607	NC_020053	TCG	2	6	85060	85065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736896
1608	NC_020053	CCA	2	6	85122	85127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_020053	AGC	2	6	85167	85172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_020053	GGC	2	6	85178	85183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436736897
1611	NC_020053	CAA	2	6	85213	85218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736897
1612	NC_020053	TAC	2	6	85223	85228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736897
1613	NC_020053	GACCAC	2	12	85229	85240	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	436736897
1614	NC_020053	CAA	2	6	85282	85287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736897
1615	NC_020053	ATG	2	6	85374	85379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736897
1616	NC_020053	CAAG	2	8	85391	85398	50 %	0 %	25 %	25 %	436736897
1617	NC_020053	AAC	2	6	85450	85455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736897
1618	NC_020053	TCGA	2	8	85460	85467	25 %	25 %	25 %	25 %	436736897
1619	NC_020053	GTG	2	6	85555	85560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736897
1620	NC_020053	ATG	2	6	85563	85568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736897
1621	NC_020053	GCA	2	6	85679	85684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736897
1622	NC_020053	GAC	2	6	85736	85741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736897
1623	NC_020053	ATT	2	6	85776	85781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736897
1624	NC_020053	CT	3	6	85888	85893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_020053	AG	3	6	85902	85907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020053	TCA	2	6	85941	85946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_020053	CAAG	2	8	86098	86105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1628	NC_020053	GGCT	2	8	86158	86165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_020053	TGAT	2	8	86213	86220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020053	ATCG	2	8	86271	86278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1632	NC_020053	T	6	6	86353	86358	0 %	100 %	0 %	0 %	436736898
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1885	NC_020053	ACC	2	6	99264	99269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736908
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1997	NC_020053	TTCGT	2	10	105437	105446	0 %	60 %	20 %	20 %	436736913
1998	NC_020053	ATCG	3	12	105467	105478	25 %	25 %	25 %	25 %	436736913
1999	NC_020053	CAT	2	6	105555	105560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736913
2000	NC_020053	TGC	2	6	105662	105667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736913

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