MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020053	CAA	2	6	55141	55146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736871
1002	NC_020053	GTT	2	6	55204	55209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736871
1003	NC_020053	G	6	6	55229	55234	0 %	0 %	100 %	0 %	436736871
1004	NC_020053	TTA	2	6	55248	55253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736871
1005	NC_020053	TTGA	2	8	55267	55274	25 %	50 %	25 %	0 %	436736871
1006	NC_020053	AGA	3	9	55391	55399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736872
1007	NC_020053	CTC	2	6	55499	55504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736872
1008	NC_020053	AGGT	2	8	55513	55520	25 %	25 %	50 %	0 %	436736872
1009	NC_020053	T	7	7	55526	55532	0 %	100 %	0 %	0 %	436736872
1010	NC_020053	AAG	2	6	55562	55567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736872
1011	NC_020053	GCA	2	6	55587	55592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736872
1012	NC_020053	GATA	2	8	55638	55645	50 %	25 %	25 %	0 %	436736872
1013	NC_020053	CTC	2	6	55651	55656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736872
1014	NC_020053	TTC	2	6	55769	55774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736872
1015	NC_020053	ATCA	2	8	55811	55818	50 %	25 %	0 %	25 %	436736872
1016	NC_020053	TCA	2	6	55890	55895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736872
1017	NC_020053	ATTC	2	8	55898	55905	25 %	50 %	0 %	25 %	436736872
1018	NC_020053	AGC	2	6	55947	55952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736872
1019	NC_020053	ATA	2	6	56071	56076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736872
1020	NC_020053	TCC	2	6	56097	56102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736872
1021	NC_020053	TTC	2	6	56123	56128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736872
1022	NC_020053	AAG	2	6	56129	56134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736872
1023	NC_020053	AAT	2	6	56299	56304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736872
1024	NC_020053	TCA	2	6	56331	56336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736872
1025	NC_020053	GCA	2	6	56337	56342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736872
1026	NC_020053	AATAGA	2	12	56367	56378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	436736872
1027	NC_020053	ATT	2	6	56436	56441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736872
1028	NC_020053	TTG	2	6	56454	56459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736872
1029	NC_020053	GGA	2	6	56467	56472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736872
1030	NC_020053	GT	3	6	56515	56520	0 %	50 %	50 %	0 %	436736872
1031	NC_020053	T	7	7	56520	56526	0 %	100 %	0 %	0 %	436736872
1032	NC_020053	AT	3	6	56539	56544	50 %	50 %	0 %	0 %	436736872
1033	NC_020053	CTT	2	6	56572	56577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736872
1034	NC_020053	T	7	7	56608	56614	0 %	100 %	0 %	0 %	436736872
1035	NC_020053	ATC	2	6	56615	56620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736872
1036	NC_020053	TTA	2	6	56635	56640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736872
1037	NC_020053	TC	3	6	56644	56649	0 %	50 %	0 %	50 %	436736872
1038	NC_020053	TAA	2	6	56657	56662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736872
1039	NC_020053	CAT	2	6	56726	56731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736872
1040	NC_020053	CCA	2	6	56735	56740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436736872
1041	NC_020053	TAA	2	6	56774	56779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736872
1042	NC_020053	TCA	2	6	56784	56789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736872
1043	NC_020053	AGT	2	6	56829	56834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736872
1044	NC_020053	CAT	3	9	56845	56853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736872
1045	NC_020053	TA	3	6	56888	56893	50 %	50 %	0 %	0 %	436736872
1046	NC_020053	CTTG	2	8	56896	56903	0 %	50 %	25 %	25 %	436736872
1047	NC_020053	AGA	2	6	56957	56962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736872
1048	NC_020053	GCA	2	6	57004	57009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736872
1049	NC_020053	CAA	2	6	57031	57036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736872
1050	NC_020053	AATC	2	8	57067	57074	50 %	25 %	0 %	25 %	436736872
1051	NC_020053	AT	3	6	57096	57101	50 %	50 %	0 %	0 %	436736872
1052	NC_020053	CTAA	2	8	57170	57177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_020053	TCAC	2	8	57187	57194	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_020053	ACT	2	6	57222	57227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_020053	TGCGAT	2	12	57239	57250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1056	NC_020053	TAA	2	6	57312	57317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736873
1057	NC_020053	TAAG	2	8	57349	57356	50 %	25 %	25 %	0 %	436736873
1058	NC_020053	A	7	7	57378	57384	100 %	0 %	0 %	0 %	436736873
1059	NC_020053	TAAT	2	8	57389	57396	50 %	50 %	0 %	0 %	436736873
1060	NC_020053	TGG	2	6	57585	57590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736873
1061	NC_020053	TCG	2	6	57607	57612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736873
1062	NC_020053	TCT	2	6	57640	57645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736873
1063	NC_020053	CTA	2	6	57662	57667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736873
1064	NC_020053	TCT	2	6	57694	57699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736873
1065	NC_020053	CTCAAT	2	12	57724	57735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736873
1066	NC_020053	AAT	2	6	57743	57748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736873
1067	NC_020053	AAC	2	6	57796	57801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736873
1068	NC_020053	CAT	2	6	57807	57812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736873
1069	NC_020053	CTT	2	6	57827	57832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736873
1070	NC_020053	CTA	2	6	57844	57849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736873
1071	NC_020053	TTAA	2	8	57853	57860	50 %	50 %	0 %	0 %	436736873
1072	NC_020053	TTC	2	6	57882	57887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736873
1073	NC_020053	ATA	2	6	57920	57925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736873
1074	NC_020053	TTGC	2	8	57928	57935	0 %	50 %	25 %	25 %	436736873
1075	NC_020053	TCT	2	6	58010	58015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_020053	AGC	2	6	58077	58082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736874
1077	NC_020053	ACA	2	6	58091	58096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736874
1078	NC_020053	T	6	6	58152	58157	0 %	100 %	0 %	0 %	436736874
1079	NC_020053	GA	3	6	58257	58262	50 %	0 %	50 %	0 %	436736874
1080	NC_020053	GAC	2	6	58322	58327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736874
1081	NC_020053	TCC	2	6	58377	58382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436736874
1082	NC_020053	ATC	2	6	58392	58397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736874
1083	NC_020053	ATT	2	6	58404	58409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736874
1084	NC_020053	TAA	2	6	58421	58426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736874
1085	NC_020053	T	7	7	58434	58440	0 %	100 %	0 %	0 %	436736874
1086	NC_020053	GAA	2	6	58452	58457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736874
1087	NC_020053	A	8	8	58509	58516	100 %	0 %	0 %	0 %	436736874
1088	NC_020053	T	6	6	58550	58555	0 %	100 %	0 %	0 %	436736874
1089	NC_020053	ACAG	2	8	58637	58644	50 %	0 %	25 %	25 %	436736874
1090	NC_020053	CT	3	6	58746	58751	0 %	50 %	0 %	50 %	436736874
1091	NC_020053	TTGA	2	8	58770	58777	25 %	50 %	25 %	0 %	436736874
1092	NC_020053	TTTG	2	8	58787	58794	0 %	75 %	25 %	0 %	436736874
1093	NC_020053	AGG	2	6	58824	58829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020053	ACT	2	6	58845	58850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_020053	AAT	2	6	58876	58881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020053	TCT	2	6	58888	58893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436736875
1097	NC_020053	CTTG	2	8	58922	58929	0 %	50 %	25 %	25 %	436736875
1098	NC_020053	CTG	2	6	59076	59081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_020053	TTC	2	6	59089	59094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_020053	CAT	2	6	59128	59133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020053	TG	3	6	59144	59149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020053	ATA	2	6	59204	59209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020053	ACCC	2	8	59215	59222	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1104	NC_020053	T	6	6	59433	59438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020053	AGG	2	6	59493	59498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736876
1106	NC_020053	T	8	8	59662	59669	0 %	100 %	0 %	0 %	436736876
1107	NC_020053	CGA	2	6	59712	59717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736876
1108	NC_020053	ACA	2	6	59722	59727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436736876
1109	NC_020053	TGC	2	6	59752	59757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736876
1110	NC_020053	GCT	2	6	59767	59772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736876
1111	NC_020053	AGA	2	6	59833	59838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736876
1112	NC_020053	AAG	2	6	59847	59852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436736876
1113	NC_020053	CT	3	6	59896	59901	0 %	50 %	0 %	50 %	436736876
1114	NC_020053	TACCC	2	10	59934	59943	20 %	20 %	0 %	60 %	436736876
1115	NC_020053	GAG	2	6	59978	59983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436736876
1116	NC_020053	TTG	2	6	59997	60002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436736876
1117	NC_020053	ATG	2	6	60015	60020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436736876
1118	NC_020053	TCACT	2	10	60039	60048	20 %	40 %	0 %	40 %	436736876
1119	NC_020053	TCA	2	6	60073	60078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436736876
1120	NC_020053	GCC	2	6	60094	60099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436736876
1121	NC_020053	TGC	2	6	60162	60167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736876
1122	NC_020053	A	6	6	60169	60174	100 %	0 %	0 %	0 %	436736876
1123	NC_020053	CGA	2	6	60245	60250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436736876
1124	NC_020053	TAT	2	6	60298	60303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436736876
1125	NC_020053	TAA	2	6	60340	60345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436736876
1126	NC_020053	TGG	2	6	60352	60357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436736876
1127	NC_020053	AAGGAT	2	12	60359	60370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	436736876
1128	NC_020053	TGC	2	6	60469	60474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436736876
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1132	NC_020053	AGATGC	2	12	60567	60578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1133	NC_020053	TGG	2	6	60644	60649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_020053	TGT	2	6	60714	60719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_020053	GTT	2	6	61062	61067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_020053	TTG	2	6	61164	61169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_020053	T	6	6	61216	61221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_020053	TCA	2	6	61277	61282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1145	NC_020053	TCGC	2	8	61381	61388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1151	NC_020053	CGC	2	6	61591	61596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1153	NC_020053	AAG	2	6	61652	61657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1155	NC_020053	CTTC	2	8	61704	61711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1160	NC_020053	TCA	2	6	61994	61999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1162	NC_020053	AT	3	6	62240	62245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_020053	TAC	2	6	62325	62330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1171	NC_020053	GGA	2	6	62646	62651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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