MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

< Previous12...6789101112131415161718Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_020053	AAT	2	6	314949	314954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_020053	TCT	2	6	315017	315022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_020053	GGT	2	6	315243	315248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_020053	CTG	2	6	315273	315278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_020053	TCGC	2	8	315336	315343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_020053	CTCGA	2	10	315401	315410	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6007	NC_020053	CAG	2	6	315441	315446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_020053	GCA	2	6	315461	315466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_020053	TCT	2	6	315487	315492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_020053	CTG	2	6	315543	315548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_020053	CTT	2	6	315569	315574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_020053	CAC	2	6	315606	315611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_020053	TCG	2	6	315623	315628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_020053	TCG	3	9	315688	315696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_020053	CTG	2	6	315711	315716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_020053	GTT	2	6	315798	315803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_020053	TGAC	2	8	315817	315824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_020053	AAC	2	6	315841	315846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_020053	GCA	2	6	315869	315874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_020053	TTC	2	6	316005	316010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_020053	AGC	2	6	316054	316059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_020053	GCC	2	6	316270	316275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_020053	T	6	6	316448	316453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_020053	CAA	2	6	316476	316481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_020053	CCG	2	6	316565	316570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_020053	CG	3	6	316619	316624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_020053	CAT	2	6	316628	316633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_020053	CAT	2	6	316669	316674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737134
6029	NC_020053	A	6	6	316824	316829	100 %	0 %	0 %	0 %	436737134
6030	NC_020053	ACC	2	6	316876	316881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737134
6031	NC_020053	ACA	2	6	316918	316923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737134
6032	NC_020053	GAT	2	6	316976	316981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737134
6033	NC_020053	ATCG	2	8	317095	317102	25 %	25 %	25 %	25 %	436737134
6034	NC_020053	ACC	2	6	317112	317117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737134
6035	NC_020053	TCG	2	6	317128	317133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737134
6036	NC_020053	TTC	2	6	317166	317171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737134
6037	NC_020053	ATCG	2	8	317266	317273	25 %	25 %	25 %	25 %	436737134
6038	NC_020053	CCG	2	6	317310	317315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737135
6039	NC_020053	CACCC	2	10	317320	317329	20 %	0 %	0 %	80 %	436737135
6040	NC_020053	CGC	2	6	317342	317347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737135
6041	NC_020053	GCCA	2	8	317371	317378	25 %	0 %	25 %	50 %	436737135
6042	NC_020053	GCAAAT	2	12	317403	317414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	436737135
6043	NC_020053	ACCC	2	8	317579	317586	25 %	0 %	0 %	75 %	436737135
6044	NC_020053	TGA	2	6	317612	317617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737135
6045	NC_020053	AGCC	2	8	317633	317640	25 %	0 %	25 %	50 %	436737135
6046	NC_020053	CGAT	2	8	317706	317713	25 %	25 %	25 %	25 %	436737135
6047	NC_020053	TCG	2	6	317732	317737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737135
6048	NC_020053	ATG	2	6	318028	318033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737135
6049	NC_020053	CCT	2	6	318064	318069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737135
6050	NC_020053	GCA	2	6	318192	318197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737136
6051	NC_020053	TGC	2	6	318199	318204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737136
6052	NC_020053	T	6	6	318211	318216	0 %	100 %	0 %	0 %	436737136
6053	NC_020053	TCC	2	6	318233	318238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737136
6054	NC_020053	CAT	2	6	318243	318248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737136
6055	NC_020053	CGATC	2	10	318285	318294	20 %	20 %	20 %	40 %	436737136
6056	NC_020053	AAC	2	6	318305	318310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737136
6057	NC_020053	TCGA	2	8	318325	318332	25 %	25 %	25 %	25 %	436737136
6058	NC_020053	TCGA	2	8	318347	318354	25 %	25 %	25 %	25 %	436737136
6059	NC_020053	CCG	2	6	318366	318371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737136
6060	NC_020053	CGAT	2	8	318413	318420	25 %	25 %	25 %	25 %	436737136
6061	NC_020053	A	7	7	318447	318453	100 %	0 %	0 %	0 %	436737136
6062	NC_020053	TTCT	2	8	318489	318496	0 %	75 %	0 %	25 %	436737136
6063	NC_020053	GCC	2	6	318515	318520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737136
6064	NC_020053	GCC	2	6	318539	318544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737136
6065	NC_020053	CAA	2	6	318562	318567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737136
6066	NC_020053	CGC	3	9	318582	318590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737136
6067	NC_020053	CAA	2	6	318600	318605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737136
6068	NC_020053	CCA	2	6	318616	318621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737136
6069	NC_020053	CA	3	6	318639	318644	50 %	0 %	0 %	50 %	436737136
6070	NC_020053	TTCG	2	8	318711	318718	0 %	50 %	25 %	25 %	436737136
6071	NC_020053	TCGA	2	8	318750	318757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_020053	CTCG	2	8	318824	318831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6073	NC_020053	CGAT	2	8	318902	318909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_020053	TTAT	2	8	319011	319018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_020053	GTT	2	6	319140	319145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_020053	CAG	2	6	319200	319205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_020053	AGTC	2	8	319258	319265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6078	NC_020053	AAAG	2	8	319273	319280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_020053	CCA	2	6	319373	319378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_020053	T	8	8	319428	319435	0 %	100 %	0 %	0 %	436737137
6081	NC_020053	CAG	2	6	319497	319502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737137
6082	NC_020053	A	6	6	319510	319515	100 %	0 %	0 %	0 %	436737137
6083	NC_020053	GATCGA	2	12	319562	319573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	436737137
6084	NC_020053	T	6	6	319729	319734	0 %	100 %	0 %	0 %	436737137
6085	NC_020053	TCGATC	2	12	319774	319785	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436737137
6086	NC_020053	CTG	2	6	319932	319937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737137
6087	NC_020053	CGG	2	6	320177	320182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737137
6088	NC_020053	TGA	3	9	320183	320191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737137
6089	NC_020053	CAGT	2	8	320289	320296	25 %	25 %	25 %	25 %	436737138
6090	NC_020053	TCGG	2	8	320308	320315	0 %	25 %	50 %	25 %	436737138
6091	NC_020053	ACT	2	6	320402	320407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737138
6092	NC_020053	ATTT	2	8	320416	320423	25 %	75 %	0 %	0 %	436737138
6093	NC_020053	TCG	2	6	320498	320503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737138
6094	NC_020053	TCA	2	6	320504	320509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737138
6095	NC_020053	CTAG	2	8	320516	320523	25 %	25 %	25 %	25 %	436737138
6096	NC_020053	TAG	2	6	320643	320648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737138
6097	NC_020053	AAC	2	6	320705	320710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737138
6098	NC_020053	TTA	2	6	320786	320791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737138
6099	NC_020053	TC	3	6	320817	320822	0 %	50 %	0 %	50 %	436737138
6100	NC_020053	CGC	2	6	320852	320857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737138
6101	NC_020053	CT	4	8	320863	320870	0 %	50 %	0 %	50 %	436737138
6102	NC_020053	T	6	6	320870	320875	0 %	100 %	0 %	0 %	436737138
6103	NC_020053	CTT	2	6	320923	320928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737138
6104	NC_020053	T	6	6	320938	320943	0 %	100 %	0 %	0 %	436737138
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6108	NC_020053	TTG	2	6	321152	321157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737138
6109	NC_020053	ATT	2	6	321260	321265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737138
6110	NC_020053	T	6	6	321422	321427	0 %	100 %	0 %	0 %	436737138
6111	NC_020053	ATA	2	6	321438	321443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737138
6112	NC_020053	TAG	2	6	321468	321473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737138
6113	NC_020053	TGC	2	6	321529	321534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737138
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6115	NC_020053	CAT	2	6	321600	321605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737138
6116	NC_020053	T	7	7	321627	321633	0 %	100 %	0 %	0 %	436737138
6117	NC_020053	TTCA	2	8	321685	321692	25 %	50 %	0 %	25 %	436737138
6118	NC_020053	GTC	2	6	321711	321716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737138
6119	NC_020053	TCT	2	6	321746	321751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737138
6120	NC_020053	TAC	2	6	321753	321758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737138
6121	NC_020053	ATG	2	6	321786	321791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737138
6122	NC_020053	CAACT	2	10	321824	321833	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6123	NC_020053	TAG	2	6	321851	321856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_020053	TCAA	3	12	321864	321875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_020053	AAGATT	2	12	321995	322006	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_020053	AT	3	6	322077	322082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_020053	ATG	2	6	322098	322103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_020053	ACA	2	6	322106	322111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_020053	ATC	2	6	322124	322129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_020053	TTA	2	6	322183	322188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_020053	GAG	2	6	322209	322214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_020053	ATCGAG	2	12	322373	322384	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6133	NC_020053	CAAGT	2	10	322408	322417	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6134	NC_020053	ACCC	2	8	322437	322444	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6135	NC_020053	ATCG	2	8	322506	322513	25 %	25 %	25 %	25 %	436737139
6136	NC_020053	GATCG	2	10	322571	322580	20 %	20 %	40 %	20 %	436737139
6137	NC_020053	CAA	2	6	322697	322702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737139
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6139	NC_020053	GCT	2	6	322801	322806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737139
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6141	NC_020053	ACA	2	6	322845	322850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737139
6142	NC_020053	CAAA	2	8	322912	322919	75 %	0 %	0 %	25 %	436737139
6143	NC_020053	AAT	2	6	322946	322951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737139
6144	NC_020053	GCA	2	6	322993	322998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737139
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6146	NC_020053	TAGC	2	8	323063	323070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6147	NC_020053	GCA	2	6	323267	323272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737140
6148	NC_020053	ATC	2	6	323394	323399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737140
6149	NC_020053	TGCC	2	8	323445	323452	0 %	25 %	25 %	50 %	436737140
6150	NC_020053	AT	3	6	323461	323466	50 %	50 %	0 %	0 %	436737140
6151	NC_020053	CAG	2	6	323609	323614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737140
6152	NC_020053	AAC	2	6	323662	323667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6153	NC_020053	CAT	3	9	323698	323706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737141
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6156	NC_020053	ATCG	2	8	323791	323798	25 %	25 %	25 %	25 %	436737141
6157	NC_020053	GCA	2	6	323937	323942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737141
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6161	NC_020053	TTAA	2	8	324146	324153	50 %	50 %	0 %	0 %	436737141
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6168	NC_020053	CGT	2	6	324493	324498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737142
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6185	NC_020053	CACT	2	8	325552	325559	25 %	25 %	0 %	50 %	436737143
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6214	NC_020053	ACT	2	6	327352	327357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6228	NC_020053	A	6	6	327813	327818	100 %	0 %	0 %	0 %	436737144
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6241	NC_020053	CCA	2	6	328224	328229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737144
6242	NC_020053	AGC	2	6	328276	328281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737144
6243	NC_020053	GCG	2	6	328316	328321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737144
6244	NC_020053	GCG	2	6	328337	328342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737144
6245	NC_020053	CTCG	2	8	328357	328364	0 %	25 %	25 %	50 %	436737144
6246	NC_020053	ACA	2	6	328396	328401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737144
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6494	NC_020053	GCG	2	6	340399	340404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737155
6495	NC_020053	TTG	2	6	340405	340410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737155
6496	NC_020053	TTG	2	6	340453	340458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737155
6497	NC_020053	GTT	2	6	340464	340469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737155
6498	NC_020053	CAT	2	6	340557	340562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737155
6499	NC_020053	AGTTTG	2	12	340606	340617	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	436737155
6500	NC_020053	TTG	2	6	340654	340659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737155

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