MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020053	CAAA	2	8	290841	290848	75 %	0 %	0 %	25 %	436737114
5502	NC_020053	CAC	2	6	291048	291053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737114
5503	NC_020053	GAT	2	6	291183	291188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737114
5504	NC_020053	TGACT	2	10	291204	291213	20 %	40 %	20 %	20 %	436737114
5505	NC_020053	CTG	2	6	291214	291219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737114
5506	NC_020053	GTTC	2	8	291281	291288	0 %	50 %	25 %	25 %	436737114
5507	NC_020053	TAA	2	6	291349	291354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737114
5508	NC_020053	CTGG	2	8	291410	291417	0 %	25 %	50 %	25 %	436737114
5509	NC_020053	TCA	2	6	291469	291474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737115
5510	NC_020053	TTAGTC	2	12	291523	291534	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436737115
5511	NC_020053	GTG	2	6	291544	291549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737115
5512	NC_020053	TTC	2	6	291573	291578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737115
5513	NC_020053	ATCG	2	8	291600	291607	25 %	25 %	25 %	25 %	436737115
5514	NC_020053	TAT	2	6	291614	291619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737115
5515	NC_020053	GCA	2	6	291634	291639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737115
5516	NC_020053	TAC	2	6	291642	291647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737115
5517	NC_020053	CAG	2	6	291710	291715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737115
5518	NC_020053	GGT	2	6	291718	291723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737115
5519	NC_020053	CAGG	2	8	291847	291854	25 %	0 %	50 %	25 %	436737115
5520	NC_020053	TCGA	2	8	292000	292007	25 %	25 %	25 %	25 %	436737115
5521	NC_020053	TGG	2	6	292018	292023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737115
5522	NC_020053	GCT	2	6	292064	292069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737115
5523	NC_020053	AAG	2	6	292093	292098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737115
5524	NC_020053	ACG	2	6	292159	292164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737115
5525	NC_020053	TTC	2	6	292312	292317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737115
5526	NC_020053	CAGC	2	8	292318	292325	25 %	0 %	25 %	50 %	436737115
5527	NC_020053	CGC	2	6	292376	292381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737115
5528	NC_020053	TAG	3	9	292445	292453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737115
5529	NC_020053	TGAA	2	8	292479	292486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_020053	A	6	6	292493	292498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_020053	TGA	2	6	292540	292545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737116
5532	NC_020053	CTC	2	6	292558	292563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737116
5533	NC_020053	AAGCG	2	10	292573	292582	40 %	0 %	40 %	20 %	436737116
5534	NC_020053	AGC	2	6	292593	292598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737116
5535	NC_020053	TGC	2	6	292606	292611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737116
5536	NC_020053	TTC	2	6	292669	292674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737117
5537	NC_020053	CT	3	6	292694	292699	0 %	50 %	0 %	50 %	436737117
5538	NC_020053	TTC	2	6	292720	292725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737117
5539	NC_020053	CTG	2	6	292740	292745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737117
5540	NC_020053	TCT	2	6	292760	292765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737117
5541	NC_020053	TC	3	6	292803	292808	0 %	50 %	0 %	50 %	436737117
5542	NC_020053	GAT	2	6	292867	292872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737117
5543	NC_020053	CCA	2	6	292880	292885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737117
5544	NC_020053	TAG	2	6	292899	292904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737117
5545	NC_020053	ATTT	2	8	292938	292945	25 %	75 %	0 %	0 %	436737117
5546	NC_020053	AAT	2	6	292948	292953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737117
5547	NC_020053	TCT	2	6	293006	293011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737117
5548	NC_020053	T	6	6	293050	293055	0 %	100 %	0 %	0 %	436737117
5549	NC_020053	GAT	2	6	293074	293079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737117
5550	NC_020053	TGG	2	6	293083	293088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737117
5551	NC_020053	TCGA	2	8	293098	293105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_020053	TACT	2	8	293120	293127	25 %	50 %	0 %	25 %	436737118
5553	NC_020053	CTG	2	6	293154	293159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737118
5554	NC_020053	CTT	2	6	293177	293182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737118
5555	NC_020053	TGC	2	6	293189	293194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737118
5556	NC_020053	ACA	2	6	293212	293217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737118
5557	NC_020053	AGT	2	6	293313	293318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737118
5558	NC_020053	CTT	2	6	293408	293413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737118
5559	NC_020053	TCT	2	6	293434	293439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737118
5560	NC_020053	TCA	3	9	293443	293451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737118
5561	NC_020053	ATCT	2	8	293463	293470	25 %	50 %	0 %	25 %	436737118
5562	NC_020053	GATC	2	8	293500	293507	25 %	25 %	25 %	25 %	436737118
5563	NC_020053	AT	3	6	293560	293565	50 %	50 %	0 %	0 %	436737118
5564	NC_020053	CTA	2	6	293615	293620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_020053	CCA	2	6	293649	293654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737119
5566	NC_020053	CTG	2	6	293683	293688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737119
5567	NC_020053	CAG	2	6	293754	293759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737119
5568	NC_020053	CAC	2	6	293841	293846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737119
5569	NC_020053	TGT	2	6	293901	293906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737119
5570	NC_020053	CAG	2	6	293970	293975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737119
5571	NC_020053	TTG	2	6	294025	294030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737119
5572	NC_020053	T	6	6	294096	294101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_020053	AGC	2	6	294124	294129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_020053	TTGC	2	8	294181	294188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5575	NC_020053	AGCA	2	8	294200	294207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_020053	AGCTTT	2	12	294240	294251	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436737120
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5579	NC_020053	CGAT	2	8	294341	294348	25 %	25 %	25 %	25 %	436737120
5580	NC_020053	CAT	2	6	294353	294358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737120
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5582	NC_020053	ACT	2	6	294391	294396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737120
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5584	NC_020053	AAT	2	6	294438	294443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737120
5585	NC_020053	TGG	2	6	294464	294469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737120
5586	NC_020053	GTTG	2	8	294533	294540	0 %	50 %	50 %	0 %	436737120
5587	NC_020053	AGC	2	6	294549	294554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737120
5588	NC_020053	CGA	2	6	294611	294616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737120
5589	NC_020053	TAA	2	6	294671	294676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_020053	ATG	2	6	294682	294687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_020053	GCA	2	6	294704	294709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_020053	AAG	2	6	294774	294779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020053	CCATT	2	10	294847	294856	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5594	NC_020053	AGG	2	6	294879	294884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737121
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5597	NC_020053	CAT	2	6	295058	295063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737121
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5599	NC_020053	AAT	2	6	295203	295208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_020053	GCA	2	6	295226	295231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_020053	AAGT	2	8	295340	295347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_020053	TTG	2	6	295416	295421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737122
5603	NC_020053	CAA	3	9	295460	295468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737122
5604	NC_020053	TTTGA	2	10	295591	295600	20 %	60 %	20 %	0 %	436737122
5605	NC_020053	TATC	2	8	295601	295608	25 %	50 %	0 %	25 %	436737122
5606	NC_020053	GAT	2	6	295614	295619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737122
5607	NC_020053	AAT	2	6	295651	295656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737122
5608	NC_020053	TCC	2	6	295701	295706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737122
5609	NC_020053	CTG	2	6	295763	295768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737122
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5611	NC_020053	A	6	6	295902	295907	100 %	0 %	0 %	0 %	436737122
5612	NC_020053	TCAGT	2	10	295937	295946	20 %	40 %	20 %	20 %	436737122
5613	NC_020053	CT	3	6	296013	296018	0 %	50 %	0 %	50 %	436737122
5614	NC_020053	CAA	2	6	296067	296072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737122
5615	NC_020053	TTG	2	6	296115	296120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737122
5616	NC_020053	AATA	2	8	296162	296169	75 %	25 %	0 %	0 %	436737122
5617	NC_020053	CT	3	6	296177	296182	0 %	50 %	0 %	50 %	436737122
5618	NC_020053	AT	3	6	296247	296252	50 %	50 %	0 %	0 %	436737122
5619	NC_020053	ATT	2	6	296256	296261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737122
5620	NC_020053	TCA	2	6	296326	296331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737122
5621	NC_020053	T	7	7	296352	296358	0 %	100 %	0 %	0 %	436737122
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5623	NC_020053	CTT	2	6	296417	296422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737122
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5997	NC_020053	TATT	3	12	314798	314809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_020053	ATC	2	6	314837	314842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5999	NC_020053	ATG	2	6	314846	314851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_020053	TGT	2	6	314900	314905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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