MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020053	ATT	2	6	263849	263854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737082
5002	NC_020053	CTC	2	6	263989	263994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737083
5003	NC_020053	GAT	2	6	264036	264041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737083
5004	NC_020053	TAA	2	6	264071	264076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737083
5005	NC_020053	GC	3	6	264102	264107	0 %	0 %	50 %	50 %	436737083
5006	NC_020053	ATA	2	6	264127	264132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737083
5007	NC_020053	TCAAG	2	10	264143	264152	40 %	20 %	20 %	20 %	436737083
5008	NC_020053	GA	3	6	264175	264180	50 %	0 %	50 %	0 %	436737083
5009	NC_020053	GAT	2	6	264245	264250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737083
5010	NC_020053	AAG	2	6	264342	264347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737083
5011	NC_020053	TCA	2	6	264465	264470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737084
5012	NC_020053	TGT	2	6	264539	264544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737084
5013	NC_020053	ATCG	2	8	264561	264568	25 %	25 %	25 %	25 %	436737084
5014	NC_020053	GCGA	2	8	264584	264591	25 %	0 %	50 %	25 %	436737084
5015	NC_020053	CAG	2	6	264596	264601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737084
5016	NC_020053	ATT	2	6	264671	264676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737084
5017	NC_020053	GCTG	2	8	264791	264798	0 %	25 %	50 %	25 %	436737084
5018	NC_020053	AAG	2	6	264866	264871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_020053	TTAA	2	8	264887	264894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_020053	GAA	2	6	264952	264957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020053	ATT	2	6	264989	264994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020053	TAT	2	6	265021	265026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020053	AAT	2	6	265028	265033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_020053	ACT	2	6	265038	265043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_020053	AAT	2	6	265044	265049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_020053	CAA	2	6	265212	265217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_020053	TTA	2	6	265233	265238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_020053	GGA	2	6	265256	265261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_020053	CTG	2	6	265294	265299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_020053	ATT	2	6	265365	265370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737085
5031	NC_020053	CAC	2	6	265384	265389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737085
5032	NC_020053	T	6	6	265430	265435	0 %	100 %	0 %	0 %	436737085
5033	NC_020053	ATT	2	6	265473	265478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737085
5034	NC_020053	GAA	2	6	265580	265585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737085
5035	NC_020053	TG	3	6	265614	265619	0 %	50 %	50 %	0 %	436737085
5036	NC_020053	TTTG	2	8	265799	265806	0 %	75 %	25 %	0 %	436737086
5037	NC_020053	GGA	2	6	265823	265828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737086
5038	NC_020053	ATCG	2	8	265829	265836	25 %	25 %	25 %	25 %	436737086
5039	NC_020053	TGTC	2	8	265968	265975	0 %	50 %	25 %	25 %	436737086
5040	NC_020053	AGT	2	6	266079	266084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737086
5041	NC_020053	GTGA	2	8	266103	266110	25 %	25 %	50 %	0 %	436737086
5042	NC_020053	ACAG	2	8	266159	266166	50 %	0 %	25 %	25 %	436737086
5043	NC_020053	CAA	2	6	266172	266177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737086
5044	NC_020053	GGCT	2	8	266185	266192	0 %	25 %	50 %	25 %	436737086
5045	NC_020053	TGGC	2	8	266310	266317	0 %	25 %	50 %	25 %	436737086
5046	NC_020053	TGC	2	6	266320	266325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737086
5047	NC_020053	ACT	2	6	266400	266405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737087
5048	NC_020053	TTC	2	6	266420	266425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737087
5049	NC_020053	TGGC	2	8	266514	266521	0 %	25 %	50 %	25 %	436737087
5050	NC_020053	TCT	2	6	266586	266591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_020053	TGT	2	6	266598	266603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_020053	TACC	2	8	266605	266612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_020053	TCG	2	6	266616	266621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_020053	ATCG	2	8	266641	266648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_020053	TCA	2	6	266672	266677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_020053	CAC	2	6	266678	266683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_020053	GTT	2	6	266711	266716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020053	TTGC	2	8	266776	266783	0 %	50 %	25 %	25 %	436737088
5059	NC_020053	TCA	2	6	266805	266810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737088
5060	NC_020053	CGG	2	6	266842	266847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737088
5061	NC_020053	C	6	6	266855	266860	0 %	0 %	0 %	100 %	436737088
5062	NC_020053	GAC	2	6	266866	266871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737088
5063	NC_020053	T	7	7	266973	266979	0 %	100 %	0 %	0 %	436737088
5064	NC_020053	TAA	2	6	266990	266995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737088
5065	NC_020053	TCGAT	2	10	267003	267012	20 %	40 %	20 %	20 %	436737088
5066	NC_020053	TCGA	2	8	267087	267094	25 %	25 %	25 %	25 %	436737088
5067	NC_020053	ATA	2	6	267114	267119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737088
5068	NC_020053	CTG	3	9	267357	267365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737088
5069	NC_020053	TCGA	2	8	267380	267387	25 %	25 %	25 %	25 %	436737088
5070	NC_020053	TA	3	6	267408	267413	50 %	50 %	0 %	0 %	436737088
5071	NC_020053	CCACGT	2	12	267506	267517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436737088
5072	NC_020053	CCA	2	6	267571	267576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737088
5073	NC_020053	CTA	2	6	267581	267586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737088
5074	NC_020053	TGTT	3	12	267623	267634	0 %	75 %	25 %	0 %	436737089
5075	NC_020053	CAAT	2	8	267640	267647	50 %	25 %	0 %	25 %	436737089
5076	NC_020053	CGA	2	6	267697	267702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5077	NC_020053	T	7	7	267715	267721	0 %	100 %	0 %	0 %	436737089
5078	NC_020053	TCG	2	6	267738	267743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5079	NC_020053	TTC	2	6	267749	267754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737089
5080	NC_020053	TGT	2	6	267798	267803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737089
5081	NC_020053	CCA	2	6	267851	267856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737089
5082	NC_020053	TTAG	2	8	267885	267892	25 %	50 %	25 %	0 %	436737089
5083	NC_020053	GCC	2	6	267998	268003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737089
5084	NC_020053	TTG	2	6	268043	268048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737089
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5086	NC_020053	GAT	2	6	268195	268200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737089
5087	NC_020053	TTTG	2	8	268207	268214	0 %	75 %	25 %	0 %	436737089
5088	NC_020053	TCA	2	6	268219	268224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737089
5089	NC_020053	AATC	2	8	268235	268242	50 %	25 %	0 %	25 %	436737089
5090	NC_020053	GCT	2	6	268273	268278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5091	NC_020053	GAC	2	6	268292	268297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5092	NC_020053	GGA	2	6	268402	268407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737089
5093	NC_020053	CGAT	2	8	268435	268442	25 %	25 %	25 %	25 %	436737089
5094	NC_020053	CTT	2	6	268498	268503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737089
5095	NC_020053	TAA	2	6	268550	268555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737089
5096	NC_020053	AAGGC	2	10	268581	268590	40 %	0 %	40 %	20 %	436737089
5097	NC_020053	CGG	3	9	268630	268638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737089
5098	NC_020053	TCG	2	6	268659	268664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5099	NC_020053	TAA	2	6	268694	268699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737089
5100	NC_020053	ATG	2	6	268799	268804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737089
5101	NC_020053	TAG	2	6	268880	268885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737089
5102	NC_020053	TAA	2	6	269054	269059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737089
5103	NC_020053	CAT	2	6	269108	269113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737089
5104	NC_020053	TTC	2	6	269147	269152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737089
5105	NC_020053	GCA	2	6	269160	269165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5106	NC_020053	T	6	6	269167	269172	0 %	100 %	0 %	0 %	436737089
5107	NC_020053	TGC	2	6	269238	269243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5108	NC_020053	TCCA	2	8	269262	269269	25 %	25 %	0 %	50 %	436737089
5109	NC_020053	G	6	6	269326	269331	0 %	0 %	100 %	0 %	436737089
5110	NC_020053	T	6	6	269423	269428	0 %	100 %	0 %	0 %	436737089
5111	NC_020053	TAGCTC	2	12	269452	269463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436737089
5112	NC_020053	GAG	2	6	269470	269475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737089
5113	NC_020053	CCA	2	6	269477	269482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737089
5114	NC_020053	TCT	2	6	269511	269516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737089
5115	NC_020053	AGC	2	6	269549	269554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
5116	NC_020053	GCG	2	6	269625	269630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737089
5117	NC_020053	TTGT	2	8	269675	269682	0 %	75 %	25 %	0 %	436737089
5118	NC_020053	GTTT	2	8	269688	269695	0 %	75 %	25 %	0 %	436737089
5119	NC_020053	TCGAGT	2	12	269724	269735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436737089
5120	NC_020053	CTT	2	6	269806	269811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737089
5121	NC_020053	ATG	2	6	270017	270022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737089
5122	NC_020053	ACCC	2	8	270097	270104	25 %	0 %	0 %	75 %	436737089
5123	NC_020053	T	7	7	270205	270211	0 %	100 %	0 %	0 %	436737089
5124	NC_020053	CAG	2	6	270309	270314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737089
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5249	NC_020053	CCAG	2	8	277532	277539	25 %	0 %	25 %	50 %	436737097
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5367	NC_020053	CCCA	2	8	283884	283891	25 %	0 %	0 %	75 %	436737104
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5369	NC_020053	AGAT	2	8	283984	283991	50 %	25 %	25 %	0 %	436737104
5370	NC_020053	GAC	2	6	284018	284023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737104
5371	NC_020053	GAG	2	6	284072	284077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436737104
5372	NC_020053	GCC	2	6	284145	284150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737104
5373	NC_020053	GCT	2	6	284190	284195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737104
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5375	NC_020053	AGT	2	6	284364	284369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737104
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5378	NC_020053	GT	3	6	284479	284484	0 %	50 %	50 %	0 %	436737104
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5406	NC_020053	A	6	6	285742	285747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5417	NC_020053	GATT	2	8	286280	286287	25 %	50 %	25 %	0 %	436737106
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5428	NC_020053	ATCG	2	8	287001	287008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5429	NC_020053	CTGG	2	8	287009	287016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5430	NC_020053	TCA	2	6	287036	287041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5460	NC_020053	AAT	2	6	288263	288268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5461	NC_020053	GTA	2	6	288280	288285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5463	NC_020053	AAT	3	9	288337	288345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5464	NC_020053	AACA	2	8	288375	288382	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5465	NC_020053	ATA	2	6	288414	288419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737110
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5491	NC_020053	TAA	2	6	290255	290260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_020053	A	6	6	290259	290264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_020053	TAA	2	6	290328	290333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737113
5494	NC_020053	TTC	3	9	290375	290383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737113
5495	NC_020053	GATG	2	8	290426	290433	25 %	25 %	50 %	0 %	436737113
5496	NC_020053	AAC	2	6	290463	290468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5497	NC_020053	ATCG	2	8	290594	290601	25 %	25 %	25 %	25 %	436737114
5498	NC_020053	ATC	2	6	290628	290633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737114
5499	NC_020053	CAC	2	6	290757	290762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737114
5500	NC_020053	CAA	2	6	290763	290768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737114

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