MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.01

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020053	ACA	2	6	238450	238455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737057
4502	NC_020053	TGT	2	6	238503	238508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737057
4503	NC_020053	TGCT	2	8	238536	238543	0 %	50 %	25 %	25 %	436737057
4504	NC_020053	TTC	2	6	238551	238556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737057
4505	NC_020053	ATC	2	6	238599	238604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737057
4506	NC_020053	CAA	2	6	238634	238639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737057
4507	NC_020053	TGC	2	6	238788	238793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_020053	ACCA	2	8	238836	238843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_020053	CG	3	6	238968	238973	0 %	0 %	50 %	50 %	436737058
4510	NC_020053	GATC	2	8	239187	239194	25 %	25 %	25 %	25 %	436737058
4511	NC_020053	CT	3	6	239197	239202	0 %	50 %	0 %	50 %	436737058
4512	NC_020053	AAT	2	6	239285	239290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737058
4513	NC_020053	CTT	2	6	239325	239330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737058
4514	NC_020053	ATTAAT	2	12	239341	239352	50 %	50 %	0 %	0 %	436737058
4515	NC_020053	CGA	2	6	239382	239387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737058
4516	NC_020053	ACC	2	6	239401	239406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737058
4517	NC_020053	CGA	2	6	239432	239437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737058
4518	NC_020053	ATG	2	6	239495	239500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737058
4519	NC_020053	TGT	2	6	239546	239551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436737059
4520	NC_020053	CAAT	2	8	239687	239694	50 %	25 %	0 %	25 %	436737059
4521	NC_020053	CCATG	2	10	239715	239724	20 %	20 %	20 %	40 %	436737059
4522	NC_020053	GCT	2	6	239729	239734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737059
4523	NC_020053	AAAT	2	8	239744	239751	75 %	25 %	0 %	0 %	436737059
4524	NC_020053	CAC	2	6	239769	239774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737059
4525	NC_020053	AGC	3	9	239872	239880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737059
4526	NC_020053	CCCA	2	8	239881	239888	25 %	0 %	0 %	75 %	436737059
4527	NC_020053	ACC	2	6	239955	239960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737059
4528	NC_020053	CAT	2	6	240097	240102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737059
4529	NC_020053	CTTC	2	8	240104	240111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_020053	GCT	2	6	240160	240165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_020053	A	7	7	240176	240182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_020053	CGC	2	6	240220	240225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737060
4533	NC_020053	ACAAT	2	10	240386	240395	60 %	20 %	0 %	20 %	436737060
4534	NC_020053	ATCA	2	8	240518	240525	50 %	25 %	0 %	25 %	436737060
4535	NC_020053	TAA	2	6	240557	240562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737060
4536	NC_020053	GTC	2	6	240594	240599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737060
4537	NC_020053	TTC	2	6	240650	240655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737060
4538	NC_020053	TGATT	2	10	240664	240673	20 %	60 %	20 %	0 %	436737060
4539	NC_020053	GAA	2	6	240698	240703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737060
4540	NC_020053	GCA	2	6	240705	240710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737060
4541	NC_020053	TCC	2	6	240713	240718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436737060
4542	NC_020053	GC	3	6	240730	240735	0 %	0 %	50 %	50 %	436737060
4543	NC_020053	TAC	2	6	240811	240816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737060
4544	NC_020053	GCG	2	6	240967	240972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737060
4545	NC_020053	TAT	3	9	241077	241085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_020053	CTA	2	6	241180	241185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_020053	TCA	2	6	241264	241269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_020053	TGA	2	6	241348	241353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_020053	GTC	2	6	241397	241402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_020053	GAA	3	9	241434	241442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_020053	CCA	2	6	241471	241476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_020053	AG	3	6	241507	241512	50 %	0 %	50 %	0 %	436737061
4553	NC_020053	AGC	2	6	241527	241532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737061
4554	NC_020053	GCTTC	2	10	241547	241556	0 %	40 %	20 %	40 %	436737061
4555	NC_020053	CAA	2	6	241637	241642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737061
4556	NC_020053	CG	3	6	241695	241700	0 %	0 %	50 %	50 %	436737061
4557	NC_020053	A	6	6	241746	241751	100 %	0 %	0 %	0 %	436737061
4558	NC_020053	CGAT	2	8	241752	241759	25 %	25 %	25 %	25 %	436737061
4559	NC_020053	ACGG	2	8	241799	241806	25 %	0 %	50 %	25 %	436737061
4560	NC_020053	GAT	2	6	241810	241815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737061
4561	NC_020053	AAC	2	6	241834	241839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737061
4562	NC_020053	TA	3	6	241914	241919	50 %	50 %	0 %	0 %	436737061
4563	NC_020053	CCG	2	6	242025	242030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737061
4564	NC_020053	CCA	2	6	242052	242057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737061
4565	NC_020053	GCGATC	2	12	242063	242074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436737061
4566	NC_020053	CACT	2	8	242084	242091	25 %	25 %	0 %	50 %	436737061
4567	NC_020053	GCA	2	6	242135	242140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737061
4568	NC_020053	CAA	2	6	242246	242251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436737061
4569	NC_020053	ACGC	2	8	242284	242291	25 %	0 %	25 %	50 %	436737061
4570	NC_020053	GGT	2	6	242299	242304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737061
4571	NC_020053	TAA	2	6	242338	242343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737061
4572	NC_020053	TTA	2	6	242474	242479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737061
4573	NC_020053	AGT	2	6	242500	242505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737061
4574	NC_020053	TCG	2	6	242571	242576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737061
4575	NC_020053	TTA	2	6	242609	242614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737061
4576	NC_020053	CAG	2	6	242637	242642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737061
4577	NC_020053	CGAT	2	8	242649	242656	25 %	25 %	25 %	25 %	436737061
4578	NC_020053	CGA	2	6	242671	242676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737061
4579	NC_020053	ATT	2	6	242687	242692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737061
4580	NC_020053	TGG	2	6	242788	242793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737061
4581	NC_020053	CAG	2	6	242900	242905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737061
4582	NC_020053	ATTA	2	8	242928	242935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_020053	TGA	2	6	242993	242998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737062
4584	NC_020053	CTA	2	6	243037	243042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737062
4585	NC_020053	TCG	2	6	243068	243073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737062
4586	NC_020053	AAG	2	6	243212	243217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737062
4587	NC_020053	TCGA	2	8	243224	243231	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4588	NC_020053	TCGA	2	8	243245	243252	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4589	NC_020053	ATTA	2	8	243279	243286	50 %	50 %	0 %	0 %	436737062
4590	NC_020053	GAC	2	6	243342	243347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737062
4591	NC_020053	CCA	3	9	243414	243422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436737062
4592	NC_020053	GATC	2	8	243524	243531	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4593	NC_020053	CTT	2	6	243564	243569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436737062
4594	NC_020053	CT	3	6	243585	243590	0 %	50 %	0 %	50 %	436737062
4595	NC_020053	TCA	2	6	243620	243625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436737062
4596	NC_020053	GCGA	2	8	243728	243735	25 %	0 %	50 %	25 %	436737062
4597	NC_020053	ATT	2	6	243736	243741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436737062
4598	NC_020053	GAA	2	6	243793	243798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737062
4599	NC_020053	CGA	2	6	243891	243896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436737062
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4601	NC_020053	CGAT	3	12	243945	243956	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4602	NC_020053	CGCGG	2	10	243969	243978	0 %	0 %	60 %	40 %	436737062
4603	NC_020053	GCG	3	9	243979	243987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436737062
4604	NC_020053	AGA	2	6	244008	244013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436737062
4605	NC_020053	GCT	2	6	244121	244126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737062
4606	NC_020053	CA	3	6	244221	244226	50 %	0 %	0 %	50 %	436737062
4607	NC_020053	GCC	2	6	244423	244428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436737062
4608	NC_020053	ATG	2	6	244468	244473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737062
4609	NC_020053	CGAT	2	8	244506	244513	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4610	NC_020053	CGAT	2	8	244548	244555	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4611	NC_020053	GCT	2	6	244563	244568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436737062
4612	NC_020053	TCGA	2	8	244604	244611	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4613	NC_020053	AT	3	6	244721	244726	50 %	50 %	0 %	0 %	436737062
4614	NC_020053	TCGA	2	8	244730	244737	25 %	25 %	25 %	25 %	436737062
4615	NC_020053	AATC	2	8	244758	244765	50 %	25 %	0 %	25 %	436737062
4616	NC_020053	TGG	2	6	244863	244868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436737062
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4620	NC_020053	TCGAG	2	10	244997	245006	20 %	20 %	40 %	20 %	436737062
4621	NC_020053	AG	3	6	245005	245010	50 %	0 %	50 %	0 %	436737062
4622	NC_020053	ATC	2	6	245095	245100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_020053	TTC	2	6	245102	245107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_020053	TAA	2	6	245122	245127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436737063
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5000	NC_020053	GAT	2	6	263825	263830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436737082

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