MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417 plasmid pCYLST.01

Total Repeats: 1178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020050	ATTT	2	8	16	23	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020050	CAAC	2	8	47	54	50 %	0 %	0 %	50 %	436669980
3	NC_020050	AGGA	2	8	174	181	50 %	0 %	50 %	0 %	436669980
4	NC_020050	GCCG	2	8	761	768	0 %	0 %	50 %	50 %	436669980
5	NC_020050	GATG	2	8	949	956	25 %	25 %	50 %	0 %	436669980
6	NC_020050	TGCT	2	8	978	985	0 %	50 %	25 %	25 %	436669980
7	NC_020050	ATCG	2	8	1316	1323	25 %	25 %	25 %	25 %	436669980
8	NC_020050	ACAG	2	8	1370	1377	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
9	NC_020050	ACGA	2	8	2637	2644	50 %	0 %	25 %	25 %	436669980
10	NC_020050	CACC	2	8	3780	3787	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_020050	CCAG	2	8	4307	4314	25 %	0 %	25 %	50 %	436669982
12	NC_020050	CATC	2	8	4335	4342	25 %	25 %	0 %	50 %	436669982
13	NC_020050	TTAT	2	8	4430	4437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020050	CCAG	2	8	4571	4578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020050	CATC	2	8	5639	5646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020050	CTGC	2	8	6437	6444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020050	TGGA	2	8	6744	6751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020050	TAGA	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020050	TTGC	2	8	6957	6964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020050	AAGT	2	8	7110	7117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020050	TGTT	2	8	7137	7144	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020050	TATG	2	8	7396	7403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020050	TCAA	2	8	7445	7452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020050	TAAT	2	8	7541	7548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020050	TAAT	2	8	7974	7981	50 %	50 %	0 %	0 %	436669983
26	NC_020050	ATTT	2	8	8197	8204	25 %	75 %	0 %	0 %	436669983
27	NC_020050	ATCT	2	8	8295	8302	25 %	50 %	0 %	25 %	436669983
28	NC_020050	ACTT	2	8	8370	8377	25 %	50 %	0 %	25 %	436669983
29	NC_020050	AGGT	2	8	9011	9018	25 %	25 %	50 %	0 %	436669984
30	NC_020050	CTCA	2	8	9593	9600	25 %	25 %	0 %	50 %	436669984
31	NC_020050	TAAT	2	8	10599	10606	50 %	50 %	0 %	0 %	436669986
32	NC_020050	TCGC	2	8	10717	10724	0 %	25 %	25 %	50 %	436669986
33	NC_020050	GTTT	2	8	11062	11069	0 %	75 %	25 %	0 %	436669986
34	NC_020050	CTTG	2	8	11142	11149	0 %	50 %	25 %	25 %	436669986
35	NC_020050	GGGA	2	8	11691	11698	25 %	0 %	75 %	0 %	436669986
36	NC_020050	TCAA	4	16	11998	12013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020050	TTGA	2	8	12136	12143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020050	TGAA	2	8	12396	12403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020050	AGGT	2	8	13518	13525	25 %	25 %	50 %	0 %	436669990
40	NC_020050	CTTG	2	8	13599	13606	0 %	50 %	25 %	25 %	436669990
41	NC_020050	TGGG	2	8	13846	13853	0 %	25 %	75 %	0 %	436669990
42	NC_020050	GTCT	2	8	13999	14006	0 %	50 %	25 %	25 %	436669990
43	NC_020050	GATG	2	8	14510	14517	25 %	25 %	50 %	0 %	436669990
44	NC_020050	AGGA	2	8	15267	15274	50 %	0 %	50 %	0 %	436669990
45	NC_020050	GCTG	2	8	15716	15723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020050	CAAA	2	8	16298	16305	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020050	ACTT	2	8	16490	16497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020050	GATT	2	8	16531	16538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020050	TCTT	2	8	16563	16570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020050	TACC	2	8	17114	17121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020050	AAAG	2	8	17239	17246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020050	CTAT	2	8	17959	17966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020050	TCAG	2	8	18143	18150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020050	AGTG	2	8	18267	18274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020050	GCGG	2	8	18626	18633	0 %	0 %	75 %	25 %	436669992
56	NC_020050	GAAG	2	8	18680	18687	50 %	0 %	50 %	0 %	436669992
57	NC_020050	ACAA	2	8	19425	19432	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020050	TGGC	2	8	19636	19643	0 %	25 %	50 %	25 %	436669993
59	NC_020050	AATA	2	8	19896	19903	75 %	25 %	0 %	0 %	436669993
60	NC_020050	CCAC	2	8	20534	20541	25 %	0 %	0 %	75 %	436669993
61	NC_020050	TGAT	2	8	20823	20830	25 %	50 %	25 %	0 %	436669994
62	NC_020050	GGCA	2	8	21127	21134	25 %	0 %	50 %	25 %	436669994
63	NC_020050	CAAG	2	8	21781	21788	50 %	0 %	25 %	25 %	436669995
64	NC_020050	CTTA	2	8	21962	21969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020050	TTGC	2	8	21996	22003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020050	GAAT	2	8	22034	22041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020050	GGTA	2	8	22645	22652	25 %	25 %	50 %	0 %	436669996
68	NC_020050	TCAA	2	8	22848	22855	50 %	25 %	0 %	25 %	436669996
69	NC_020050	GTTA	2	8	22965	22972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020050	TTAC	2	8	23523	23530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020050	TTGT	2	8	23854	23861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020050	TAAA	2	8	24561	24568	75 %	25 %	0 %	0 %	436669999
73	NC_020050	GAAG	2	8	24740	24747	50 %	0 %	50 %	0 %	436669999
74	NC_020050	TTAA	2	8	25214	25221	50 %	50 %	0 %	0 %	436669999
75	NC_020050	TCTT	2	8	25469	25476	0 %	75 %	0 %	25 %	436670000
76	NC_020050	CGGA	2	8	26613	26620	25 %	0 %	50 %	25 %	436670000
77	NC_020050	TAAT	2	8	26769	26776	50 %	50 %	0 %	0 %	436670000
78	NC_020050	ATTT	2	8	27121	27128	25 %	75 %	0 %	0 %	436670001
79	NC_020050	AAAG	2	8	27463	27470	75 %	0 %	25 %	0 %	436670001
80	NC_020050	ATAA	2	8	27506	27513	75 %	25 %	0 %	0 %	436670001
81	NC_020050	TTGG	2	8	27517	27524	0 %	50 %	50 %	0 %	436670001
82	NC_020050	TGTT	2	8	28638	28645	0 %	75 %	25 %	0 %	436670001
83	NC_020050	AATC	2	8	29191	29198	50 %	25 %	0 %	25 %	436670001
84	NC_020050	AAAT	2	8	29261	29268	75 %	25 %	0 %	0 %	436670001
85	NC_020050	ATTG	2	8	29755	29762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020050	CACC	2	8	30592	30599	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_020050	AATT	2	8	30768	30775	50 %	50 %	0 %	0 %	436670002
88	NC_020050	ATTG	2	8	30882	30889	25 %	50 %	25 %	0 %	436670002
89	NC_020050	AATT	2	8	31070	31077	50 %	50 %	0 %	0 %	436670002
90	NC_020050	GCAA	2	8	31412	31419	50 %	0 %	25 %	25 %	436670003
91	NC_020050	AATA	2	8	31712	31719	75 %	25 %	0 %	0 %	436670003
92	NC_020050	CTCG	2	8	31768	31775	0 %	25 %	25 %	50 %	436670003
93	NC_020050	GTAG	2	8	32376	32383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020050	GAAA	2	8	33098	33105	75 %	0 %	25 %	0 %	436670004
95	NC_020050	TATT	2	8	33425	33432	25 %	75 %	0 %	0 %	436670004
96	NC_020050	ATGT	2	8	33869	33876	25 %	50 %	25 %	0 %	436670005
97	NC_020050	CCAC	2	8	34290	34297	25 %	0 %	0 %	75 %	436670006
98	NC_020050	CACC	2	8	35481	35488	25 %	0 %	0 %	75 %	436670007
99	NC_020050	ATTT	2	8	35730	35737	25 %	75 %	0 %	0 %	436670008
100	NC_020050	TACA	2	8	35755	35762	50 %	25 %	0 %	25 %	436670008
101	NC_020050	CATC	2	8	35953	35960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020050	TATT	2	8	36541	36548	25 %	75 %	0 %	0 %	436670010
103	NC_020050	ACAA	2	8	36626	36633	75 %	0 %	0 %	25 %	436670010
104	NC_020050	TCAA	2	8	36887	36894	50 %	25 %	0 %	25 %	436670010
105	NC_020050	GCTT	2	8	37041	37048	0 %	50 %	25 %	25 %	436670010
106	NC_020050	TTAA	2	8	37248	37255	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
107	NC_020050	AGTA	2	8	37613	37620	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
108	NC_020050	AAAG	2	8	37628	37635	75 %	0 %	25 %	0 %	436670010
109	NC_020050	AATG	2	8	37676	37683	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
110	NC_020050	ATTT	2	8	38105	38112	25 %	75 %	0 %	0 %	436670010
111	NC_020050	AATT	2	8	38329	38336	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
112	NC_020050	GGAA	2	8	38563	38570	50 %	0 %	50 %	0 %	436670010
113	NC_020050	TCAA	2	8	38659	38666	50 %	25 %	0 %	25 %	436670010
114	NC_020050	ATGT	2	8	39264	39271	25 %	50 %	25 %	0 %	436670010
115	NC_020050	CAAG	2	8	39333	39340	50 %	0 %	25 %	25 %	436670010
116	NC_020050	AATG	2	8	39378	39385	50 %	25 %	25 %	0 %	436670010
117	NC_020050	AATT	2	8	39667	39674	50 %	50 %	0 %	0 %	436670010
118	NC_020050	TCTA	2	8	40094	40101	25 %	50 %	0 %	25 %	436670010
119	NC_020050	TGAT	2	8	40216	40223	25 %	50 %	25 %	0 %	436670010
120	NC_020050	ATTT	2	8	40875	40882	25 %	75 %	0 %	0 %	436670011
121	NC_020050	GTTT	2	8	40995	41002	0 %	75 %	25 %	0 %	436670011
122	NC_020050	GAAT	2	8	41088	41095	50 %	25 %	25 %	0 %	436670011
123	NC_020050	ATTA	2	8	41830	41837	50 %	50 %	0 %	0 %	436670011
124	NC_020050	GAAA	2	8	42163	42170	75 %	0 %	25 %	0 %	436670011
125	NC_020050	ATTG	2	8	42694	42701	25 %	50 %	25 %	0 %	436670011
126	NC_020050	CAAA	2	8	43426	43433	75 %	0 %	0 %	25 %	436670011
127	NC_020050	TATC	2	8	44692	44699	25 %	50 %	0 %	25 %	436670011
128	NC_020050	GTTT	2	8	45083	45090	0 %	75 %	25 %	0 %	436670011
129	NC_020050	TGGT	2	8	45311	45318	0 %	50 %	50 %	0 %	436670011
130	NC_020050	CTTT	2	8	46623	46630	0 %	75 %	0 %	25 %	436670011
131	NC_020050	CCGC	2	8	47213	47220	0 %	0 %	25 %	75 %	436670012
132	NC_020050	GTTG	2	8	48787	48794	0 %	50 %	50 %	0 %	436670016
133	NC_020050	TTAA	2	8	49392	49399	50 %	50 %	0 %	0 %	436670016
134	NC_020050	AGCT	2	8	49418	49425	25 %	25 %	25 %	25 %	436670016
135	NC_020050	ATTA	2	8	49836	49843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020050	TCAG	2	8	49863	49870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020050	ATAG	2	8	50021	50028	50 %	25 %	25 %	0 %	436670018
138	NC_020050	TGGG	2	8	50948	50955	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020050	ATGG	2	8	51274	51281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020050	AGTT	2	8	51641	51648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020050	ATGA	2	8	52127	52134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020050	ATTT	2	8	53059	53066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020050	TTGG	2	8	53376	53383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020050	GTCG	2	8	54227	54234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020050	TGAA	2	8	54509	54516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020050	ACCA	2	8	54623	54630	50 %	0 %	0 %	50 %	436670021
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